; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Moc03g33780 (gene) of Bitter gourd (OHB3-1) v2 genome

Gene IDMoc03g33780
OrganismMomordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
Descriptionhomeobox protein knotted-1-like 1
Genome locationchr3:24077633..24078832
RNA-Seq ExpressionMoc03g33780
SyntenyMoc03g33780
Gene Ontology termsGO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR005540 - KNOX1
IPR005541 - KNOX2


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6596993.1 Homeobox protein knotted-1-like 2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.3e-4471.74Show/hide
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KAG7028461.1 Homeobox protein knotted-1-like 2 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.3e-4572.46Show/hide
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XP_022137557.1 protein KNATM [Momordica charantia]5.1e-7094.77Show/hide
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XP_022945492.1 homeobox protein KNOX3 [Cucurbita moschata]1.3e-4471.74Show/hide
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XP_023539616.1 homeobox protein KNOX3 [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.6e-4471.01Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3TM14 homeobox protein knotted-1-like 13.8e-2349.38Show/hide
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               E YC AL KLKEAM E Q KSMAFIN+MHSQLREI     PA S+    P+ SSS
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A0A6J1C8K6 protein KNATM2.4e-7094.77Show/hide
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A0A6J1G133 homeobox protein KNOX36.1e-4571.74Show/hide
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A0A6J1IFV6 homeobox protein KNOX3-like6.7e-4467.57Show/hide
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V7C3D2 Uncharacterized protein3.5e-2451.3Show/hide
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          E YC AL KLKEAM E Q KSMAFIN+MHSQLREI   +  A    T+SSS+
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
F4HXU3 Protein KNATM1.1e-0641.18Show/hide
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        +Q++    +E+   E EIL++RISSHPLYGLL+ +HLNCLKV   GD D   +   A D+ + +   +    +    SELD+FM+
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P46640 Homeobox protein knotted-1-like 22.2e-0429.37Show/hide
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         QL+ +   PA++ A       SS +
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G14760.1 KNOX Arabidopsis thaliana meinox7.7e-0841.18Show/hide
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AT1G14760.2 KNOX Arabidopsis thaliana meinox9.3e-1437.8Show/hide
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        AME+   ++  F++++++QL +I  +S
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AT1G14760.3 KNOX Arabidopsis thaliana meinox5.9e-0829.92Show/hide
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        AME+   ++  F++++++QL +I  +S
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AT1G70510.1 KNOTTED-like from Arabidopsis thaliana 21.6e-0529.37Show/hide
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        +++ +I+SHPLY  L++T+++C KVG    M+   +  ++ ++     R +  L+    D    +LDE+M ETYC  L K K  +     ++  FIN + 
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Query:  SQLREI---PATSAAAHKPTTSSSSD
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGTCTGATCTGAGCAATTCTACAGAAGGAGAACAAAAAGTGCTACAAGATGAAGAGGAAAAAGAAGGCTGGGAAGGGGAAATTCTGCGGAGGAGAATTTCCAGCCA
CCCTTTATACGGGCTATTAGTTGAAACTCACCTCAACTGTTTGAAGGTTGGAGGAATAGGTGACATGGACAGAGGTTATTTAGCTACGGATGTGATCAAACAGCAAGATA
ACAATATCAGATGCTTAAACACGCTTAACCAATCAGAGCTAGATCGCTTCATGATCAAACTAGACGAGTATATGCAGGAAACCTATTGTTTTGCATTGAGCAAGCTGAAA
GAAGCAATGGAGGAATCTCAGATAAAATCTATGGCATTTATCAACAGCATGCACTCGCAGTTAAGGGAGATCCCAGCCACCAGTGCGGCAGCCCACAAACCCACCACCTC
ATCTTCCAGTGACACAAACTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAGTCTGATCTGAGCAATTCTACAGAAGGAGAACAAAAAGTGCTACAAGATGAAGAGGAAAAAGAAGGCTGGGAAGGGGAAATTCTGCGGAGGAGAATTTCCAGCCA
CCCTTTATACGGGCTATTAGTTGAAACTCACCTCAACTGTTTGAAGGTTGGAGGAATAGGTGACATGGACAGAGGTTATTTAGCTACGGATGTGATCAAACAGCAAGATA
ACAATATCAGATGCTTAAACACGCTTAACCAATCAGAGCTAGATCGCTTCATGATCAAACTAGACGAGTATATGCAGGAAACCTATTGTTTTGCATTGAGCAAGCTGAAA
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ATCTTCCAGTGACACAAACTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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EAMEESQIKSMAFINSMHSQLREIPATSAAAHKPTTSSSSDTN