; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Moc04g00390 (gene) of Bitter gourd (OHB3-1) v2 genome

Gene IDMoc04g00390
OrganismMomordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
DescriptionTransmembrane protein
Genome locationchr4:277482..278252
RNA-Seq ExpressionMoc04g00390
SyntenyMoc04g00390
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_023553637.1 uncharacterized protein LOC111811128 [Cucurbita pepo subsp. pepo]7.1e-8190.64Show/hide
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A0A0A0K424 Uncharacterized protein9.0e-8292.94Show/hide
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A0A1S3BHA3 uncharacterized protein LOC1034896445.3e-8293.53Show/hide
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A0A5A7U7C4 Putative transmembrane protein5.3e-8293.53Show/hide
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A0A6J1D3M6 uncharacterized protein LOC1110167281.0e-88100Show/hide
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A0A6J1GKU6 uncharacterized protein LOC1114548733.4e-8190.64Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G12870.1 unknown protein7.6e-6573.1Show/hide
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        +  T   IME+K  HPLHQIA+ PTHKLLLKQWLKEEELI  R+S KE+QIDSVR+EIT L+I FF+FHS ++LLLF+AS+     A   ACKRSWIPSL
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        C+LL SLGIIWAVRYK++VE+HLEKLLEREKED  LL KCV+ELK+KG+EFDLLKEVDALRRAKSLRVE+K
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AT5G56120.1 unknown protein3.5e-2540.88Show/hide
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        HPL +I+E+P H LLLK W +EE+L   R+ LKE++++S+++EI  L   F VFH     L++++S  D        A CK+ WIPS  SL  SL +++ 
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        V+ K  V   + + + RE+ D   L++CV EL+ KG  FDL KE  + +R KS  VE K
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGATGAAAACAAGACGGCCTTAACGATCATGGAATCAAAGCCACCACACCCACTTCACCAAATTGCCGAAAATCCAACCCACAAACTTCTTCTCAAGCAGTGG
CTCAAGGAAGAGGAACTGATATTCGGCAGAATTTCTTTGAAAGAAACCCAGATCGACTCGGTTCGAAAAGAAATCACGATGCTCCACATTTTGTTCTTCGTGTTC
CACTCCACAGCTATACTCCTCCTCTTCAACGCCTCCACGAAGGACGTCCATGGCGCAGCCTGCAAGAGGTCGTGGATTCCGTCGCTGTGTTCTCTGTTATTCTCT
CTGGGTATCATCTGGGCCGTCAGATACAAGACTGACGTTGAGGCCCACTTGGAGAAATTGTTAGAGAGGGAAAAAGAGGACAGAAATTTGCTGTCCAAGTGTGTG
GACGAGTTGAAGAGGAAAGGAGTTGAATTCGATCTGTTGAAGGAGGTTGATGCGCTACGGAGGGCGAAGAGCTTGCGGGTGGAAGCTAAGGCTAGCTTTATATAC
AAGGGGATGGGAGACTGGCGATTGGTGATTGGGCATTCAAGTGATGCCACCTCTGTCGTTGTTCGTTCTGAACTTGGATGCTGTTTGAGCGCAGATTACTCTGGT
CTGCACTTGTATTTTGTTGCTTTTGTGGAATTATTTGGATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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LHLYFVAFVELFG