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Moc04g03340 (gene) of Bitter gourd (OHB3-1) v2 genome

Gene IDMoc04g03340
OrganismMomordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
DescriptionChlorophyll a-b binding protein, chloroplastic
Genome locationchr4:2087072..2088143
RNA-Seq ExpressionMoc04g03340
SyntenyMoc04g03340
Gene Ontology termsGO:0009416 - response to light stimulus (biological process)
GO:0009768 - photosynthesis, light harvesting in photosystem I (biological process)
GO:0018298 - protein-chromophore linkage (biological process)
GO:0009522 - photosystem I (cellular component)
GO:0009523 - photosystem II (cellular component)
GO:0009535 - chloroplast thylakoid membrane (cellular component)
GO:0016168 - chlorophyll binding (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001344 - Chlorophyll A-B binding protein, plant and chromista
IPR022796 - Chlorophyll A-B binding protein
IPR023329 - Chlorophyll a/b binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004144543.1 chlorophyll a-b binding protein 151, chloroplastic [Cucumis sativus]4.2e-14996.6Show/hide
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XP_022928240.1 chlorophyll a-b binding protein 151, chloroplastic [Cucurbita moschata]7.2e-14996.23Show/hide
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XP_038887832.1 chlorophyll a-b binding protein 151, chloroplastic [Benincasa hispida]1.0e-15098.11Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K565 Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic2.1e-14996.6Show/hide
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A0A1S3CG37 Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic9.2e-15096.98Show/hide
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A0A5D3D6Y9 Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic9.2e-15096.98Show/hide
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A0A6J1C312 Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic2.3e-153100Show/hide
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A0A6J1JQB2 Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic3.5e-14996.23Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P12062 Chlorophyll a-b binding protein 37, chloroplastic3.3e-14491.7Show/hide
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P27494 Chlorophyll a-b binding protein 36, chloroplastic6.2e-14390.19Show/hide
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P27518 Chlorophyll a-b binding protein 151, chloroplastic1.4e-14793.58Show/hide
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Q9S7J7 Chlorophyll a-b binding protein 2.2, chloroplastic1.8e-14288.68Show/hide
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Q9SHR7 Chlorophyll a-b binding protein 2.1, chloroplastic1.4e-14289.77Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G29930.1 chlorophyll A/B binding protein 13.2e-11877.99Show/hide
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        VIHSRWAMLGALGCVFPE+LA+NGV+FGE+VWFKAGSQIFS+GGLDYLGNP+L+HAQSILAIWA QV+LMG VEGYRV G GPLGE  D +YPGGSFDPL
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Query:  GLADDPDAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPIENLLDHIADPVANNAWAYATNFVPGK
        GLA DP+AFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPIENL DH+ADPV NNAWA+ATNFVPGK
Subjt:  GLADDPDAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPIENLLDHIADPVANNAWAYATNFVPGK

AT2G05070.1 photosystem II light harvesting complex gene 2.21.3e-14388.68Show/hide
Query:  MATSAIQQSAFAGQPALKQSNELVRRVGAVGGGRFTMRRTVKSAPQSIWYGPDRPKYLGPFSEQTPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
        MATSAIQQS+FAGQ ALK S++L+++VG +GGGR TMRRTVKS PQSIWYGPDRPKYLGPFSE TPSYLTGE+PGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
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Query:  HSRWAMLGALGCVFPEILAKNGVQFGESVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPNLIHAQSILAIWACQVVLMGFVEGYRVGGGPLGEGLDPIYPGGSFDPLGLA
        HSRWAMLGALGC FPEIL+KNGV+FGE+VWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPNLIHAQSILAIWA QVVLMGF+EGYR+GGGPLGEGLDP+YPGG+FDPL LA
Subjt:  HSRWAMLGALGCVFPEILAKNGVQFGESVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPNLIHAQSILAIWACQVVLMGFVEGYRVGGGPLGEGLDPIYPGGSFDPLGLA

Query:  DDPDAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPIENLLDHIADPVANNAWAYATNFVPGK
        +DP+AF+ELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPIENL DH+ADPVANNAW+YATNFVPGK
Subjt:  DDPDAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPIENLLDHIADPVANNAWAYATNFVPGK

AT2G05100.1 photosystem II light harvesting complex gene 2.19.8e-14489.77Show/hide
Query:  MATSAIQQSAFAGQPALKQSNELVRRVGAVGGGRFTMRRTVKSAPQSIWYGPDRPKYLGPFSEQTPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
        MATSAIQQS+FAGQ ALK SNEL+R+VG  GGGR TMRRTVKS PQSIWYGPDRPKYLGPFSE TPSYLTGE+PGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
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Query:  HSRWAMLGALGCVFPEILAKNGVQFGESVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPNLIHAQSILAIWACQVVLMGFVEGYRVGGGPLGEGLDPIYPGGSFDPLGLA
        HSRWAMLGALGC FPEIL+KNGV+FGE+VWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPNLIHAQSILAIWA QVVLMGF+EGYR+GGGPLGEGLDP+YPGG+FDPL LA
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Query:  DDPDAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPIENLLDHIADPVANNAWAYATNFVPG
        +DP+AF+ELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPIENL DH+ADPVANNAW+YATNFVPG
Subjt:  DDPDAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPIENLLDHIADPVANNAWAYATNFVPG

AT2G34420.1 photosystem II light harvesting complex gene B1B23.2e-11876.49Show/hide
Query:  ATSAIQQSAFAGQPALKQSNELVRRVGAVGGGRFTMRRTV---KSAPQSIWYGPDRPKYLGPFSEQTPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELE
        +T A+   AFAG+     ++++      +G GR TMR+TV   K    S WYG DR KYLGPFS + PSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFA+NRELE
Subjt:  ATSAIQQSAFAGQPALKQSNELVRRVGAVGGGRFTMRRTV---KSAPQSIWYGPDRPKYLGPFSEQTPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELE

Query:  VIHSRWAMLGALGCVFPEILAKNGVQFGESVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPNLIHAQSILAIWACQVVLMGFVEGYRVGG-GPLGEGLDPIYPGGSFDPL
        VIHSRWAMLGALGCVFPE+LA+NGV+FGE+VWFKAGSQIFS+GGLDYLGNP+L+HAQSILAIWA QV+LMG VEGYRV G GPLGE  D +YPGGSFDPL
Subjt:  VIHSRWAMLGALGCVFPEILAKNGVQFGESVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPNLIHAQSILAIWACQVVLMGFVEGYRVGG-GPLGEGLDPIYPGGSFDPL

Query:  GLADDPDAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPIENLLDHIADPVANNAWAYATNFVPGK
        GLA DP+AFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGP+ENL DH+ADPV NNAWA+ATNFVPGK
Subjt:  GLADDPDAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPIENLLDHIADPVANNAWAYATNFVPGK

AT3G27690.1 photosystem II light harvesting complex gene 2.33.7e-14389.1Show/hide
Query:  MATSAIQQSAFAGQPALKQSNELVRRVGAV-GGGRFTMRRTVKSAPQSIWYGPDRPKYLGPFSEQTPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
        MATSAIQ S+FAGQ  LK SN+L+R++GA  GGGR  MRRTVKS PQSIWYGPDRPKYLGPFSE TPSYLTGE+PGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
Subjt:  MATSAIQQSAFAGQPALKQSNELVRRVGAV-GGGRFTMRRTVKSAPQSIWYGPDRPKYLGPFSEQTPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV

Query:  IHSRWAMLGALGCVFPEILAKNGVQFGESVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPNLIHAQSILAIWACQVVLMGFVEGYRVGGGPLGEGLDPIYPGGSFDPLGL
        IHSRWAMLGALGC FPEIL+KNGV+FGE+VWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPNLIHAQSILAIWACQVVLMGF+EGYR+GGGPLGEGLDP+YPGG+FDPL L
Subjt:  IHSRWAMLGALGCVFPEILAKNGVQFGESVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPNLIHAQSILAIWACQVVLMGFVEGYRVGGGPLGEGLDPIYPGGSFDPLGL

Query:  ADDPDAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPIENLLDHIADPVANNAWAYATNFVPGK
        A+DP+AF+ELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPIENL DHIADPVANNAWAYATNFVPGK
Subjt:  ADDPDAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPIENLLDHIADPVANNAWAYATNFVPGK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCACCTCTGCCATCCAACAGTCTGCCTTTGCCGGCCAGCCTGCCTTGAAGCAGTCCAATGAGCTCGTCCGGAGGGTTGGCGCTGTCGGTGGCGGCCGCTTCACCAT
GCGCCGAACTGTCAAGAGTGCTCCACAAAGCATATGGTACGGCCCAGACCGCCCAAAATACTTGGGACCATTCTCTGAACAAACACCATCTTACCTGACTGGAGAGTTCC
CTGGTGACTACGGATGGGATACGGCCGGTCTATCAGCAGATCCCGAGACTTTTGCGAAGAACCGTGAGCTTGAGGTGATCCACTCCCGATGGGCCATGCTTGGTGCATTA
GGTTGTGTCTTCCCTGAAATCCTTGCAAAGAATGGTGTCCAGTTTGGTGAATCAGTTTGGTTCAAGGCTGGTTCTCAGATCTTCTCTGAGGGTGGTCTTGATTATTTGGG
CAACCCCAACCTCATCCATGCCCAGAGTATCCTTGCAATCTGGGCTTGCCAGGTTGTGCTTATGGGCTTTGTCGAAGGTTACCGGGTTGGTGGCGGTCCCCTCGGTGAAG
GACTCGACCCAATTTACCCTGGAGGTTCCTTCGACCCACTTGGATTGGCAGATGACCCAGATGCATTTGCTGAGTTGAAGGTGAAGGAACTAAAGAATGGACGCCTCGCA
ATGTTCTCCATGTTTGGATTCTTCGTTCAGGCTATTGTCACGGGAAAAGGTCCGATTGAGAATCTCTTAGACCACATCGCAGATCCTGTTGCCAACAACGCATGGGCTTA
CGCCACCAACTTTGTCCCCGGAAAATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCCACCTCTGCCATCCAACAGTCTGCCTTTGCCGGCCAGCCTGCCTTGAAGCAGTCCAATGAGCTCGTCCGGAGGGTTGGCGCTGTCGGTGGCGGCCGCTTCACCAT
GCGCCGAACTGTCAAGAGTGCTCCACAAAGCATATGGTACGGCCCAGACCGCCCAAAATACTTGGGACCATTCTCTGAACAAACACCATCTTACCTGACTGGAGAGTTCC
CTGGTGACTACGGATGGGATACGGCCGGTCTATCAGCAGATCCCGAGACTTTTGCGAAGAACCGTGAGCTTGAGGTGATCCACTCCCGATGGGCCATGCTTGGTGCATTA
GGTTGTGTCTTCCCTGAAATCCTTGCAAAGAATGGTGTCCAGTTTGGTGAATCAGTTTGGTTCAAGGCTGGTTCTCAGATCTTCTCTGAGGGTGGTCTTGATTATTTGGG
CAACCCCAACCTCATCCATGCCCAGAGTATCCTTGCAATCTGGGCTTGCCAGGTTGTGCTTATGGGCTTTGTCGAAGGTTACCGGGTTGGTGGCGGTCCCCTCGGTGAAG
GACTCGACCCAATTTACCCTGGAGGTTCCTTCGACCCACTTGGATTGGCAGATGACCCAGATGCATTTGCTGAGTTGAAGGTGAAGGAACTAAAGAATGGACGCCTCGCA
ATGTTCTCCATGTTTGGATTCTTCGTTCAGGCTATTGTCACGGGAAAAGGTCCGATTGAGAATCTCTTAGACCACATCGCAGATCCTGTTGCCAACAACGCATGGGCTTA
CGCCACCAACTTTGTCCCCGGAAAATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MATSAIQQSAFAGQPALKQSNELVRRVGAVGGGRFTMRRTVKSAPQSIWYGPDRPKYLGPFSEQTPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVIHSRWAMLGAL
GCVFPEILAKNGVQFGESVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPNLIHAQSILAIWACQVVLMGFVEGYRVGGGPLGEGLDPIYPGGSFDPLGLADDPDAFAELKVKELKNGRLA
MFSMFGFFVQAIVTGKGPIENLLDHIADPVANNAWAYATNFVPGK