; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Moc04g06060 (gene) of Bitter gourd (OHB3-1) v2 genome

Gene IDMoc04g06060
OrganismMomordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
DescriptionNEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like
Genome locationchr4:4138321..4142575
RNA-Seq ExpressionMoc04g06060
SyntenyMoc04g06060
Gene Ontology termsGO:0045116 - protein neddylation (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0005524 - ATP binding (molecular function)
GO:0019788 - NEDD8 transferase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR000608 - Ubiquitin-conjugating enzyme E2
IPR016135 - Ubiquitin-conjugating enzyme/RWD-like
IPR023313 - Ubiquitin-conjugating enzyme, active site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6572017.1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.2e-9693.09Show/hide
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KAG6588622.1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.3e-9096.99Show/hide
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KAG7022419.1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.3e-9096.99Show/hide
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XP_022136196.1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like [Momordica charantia]2.6e-91100Show/hide
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XP_038888942.1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like [Benincasa hispida]4.9e-9098.17Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K481 UBC core domain-containing protein7.6e-8996.95Show/hide
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A0A5D3CPZ9 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like3.1e-9096.99Show/hide
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A0A6J1C2V1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like1.3e-91100Show/hide
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A0A6J1EZ82 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like1.5e-8996.95Show/hide
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A0A6J1JMG9 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like1.5e-8996.95Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A3KN22 NEDD8-conjugating enzyme Ubc123.3e-5764.07Show/hide
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Q6DCZ9 NEDD8-conjugating enzyme Ubc122.0e-5764.07Show/hide
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Q6P8D9 NEDD8-conjugating enzyme Ubc122.0e-5764.07Show/hide
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Q9SDY5 NEDD8-conjugating enzyme Ubc124.8e-8079.46Show/hide
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Q9ZU75 Probable NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like6.5e-7783.13Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G18600.1 Ubiquitin-conjugating enzyme family protein4.6e-7883.13Show/hide
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AT3G08690.1 ubiquitin-conjugating enzyme 111.9e-2338.64Show/hide
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         +  L T PN +DPL  + A + + +   +ES
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AT3G08690.2 ubiquitin-conjugating enzyme 111.9e-2338.64Show/hide
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AT4G36800.1 RUB1 conjugating enzyme 13.4e-8179.46Show/hide
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AT4G36800.2 RUB1 conjugating enzyme 13.4e-8179.46Show/hide
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        VYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINT+IYGLFHLFT+PN EDPLNHDAAAVLRDNPKLFE+N ++     + +G+ F P CI
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAAACTGGAGATAGCTTCCACACATCTCTATTCTCTGGTCCGGTGGTCCCGTAAACGGCGCAGTGTCGCAGTAAATCGACCGAGCTGTCACTCACCGTCCTTCGTGGC
GCTCTCTGATTGGCCGTCCCGTCCGAACAAGCTTTGTAATAAGACGGATGACGCCGGTCCTCGGTCGAAACTCGAAAGCGAAGGGAGCCCGGCTTTGGCCTGCACAGCTT
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ATACGGCACCAGATATCTGGTGTTTGCTATCATGATCAGTTAGGCCGTAAGTCTGCTATTTCAAGTCACTGGTTCAAAAGTGCATTTTATGACCATCAGTGTTATGATTT
GATTGGGCAGTTTAAGTCCTTGGTGTTTGAGGGAACGATGATTAAGCTTTTTAAGGTGAAGGAAAAGCAGAGAGAGATTGCAGAGAATGCCAATGGGAAACCCCCTGTCA
AGAAGCAAAGTGCAGGAGAGTTGCGTCTTCAAAAAGATATCAGTGAATTGAACCTACCGAAAACGTGTAGTATATCATTTCCTAATGGCAAGGATGACTTGATGAACTTT
GAGGTCACTATTCATCCTGATGAAGGATATTATCTAGGTGGTACGTTTCTATTCTCTTTCCAAGTTTCCCCTGTCTACCCTCACGAGCCACCAAAAGTGAAGTGCAAGAC
AAAGGTGTATCATCCTAATATTGACTTGGAAGGAAATGTCTGCCTCAATATTTTAAGAGAGGACTGGAAGCCCGTTCTGAATATCAACACCATAATATACGGATTATTTC
ATCTTTTCACGCAACCAAATCATGAAGATCCCCTCAATCATGATGCTGCTGCTGTTTTGAGGGATAACCCCAAGTTGTTCGAATCCAATCACCAGAAGATACATCATTTG
AAGCATGGACTTGGCGAGGTCTTCGAGCCTTTCTGTATTGGTTTCAAATTCTCTCAAAGTGTATTGCTGGAAGTTGGACTGGAAACTGAACCTCTTATCTGTACCCTTTT
TCTCAATGCCCATTCTGATTCTGTTGCTGCAATGATTGTGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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