; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Moc04g09700 (gene) of Bitter gourd (OHB3-1) v2 genome

Gene IDMoc04g09700
OrganismMomordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
DescriptionTropomyosin-like
Genome locationchr4:7168875..7172949
RNA-Seq ExpressionMoc04g09700
SyntenyMoc04g09700
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_022142007.1 uncharacterized protein LOC111012242 [Momordica charantia]9.2e-69100Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFAKASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVK
        MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFAKASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVK
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFAKASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVK

Query:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEIDKRDKDIKLLEAIIQTLGANK
        EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEIDKRDKDIKLLEAIIQTLGANK
Subjt:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEIDKRDKDIKLLEAIIQTLGANK
XP_022963475.1 uncharacterized protein LOC111463800 isoform X1 [Cucurbita moschata]6.2e-6593.92Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFAKASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVK
        MEDKGKGTDRWSGAVAN+TEMASNLESLQK+L+KKAVYVDDETFA+ASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHV+
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFAKASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVK

Query:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEIDKRDKDIKLLEAIIQTLGANK
        EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEI+KRDKDIKLLEAIIQTLG  +
Subjt:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEIDKRDKDIKLLEAIIQTLGANK
XP_022963476.1 uncharacterized protein LOC111463800 isoform X2 [Cucurbita moschata]2.1e-6595.89Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFAKASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVK
        MEDKGKGTDRWSGAVAN+TEMASNLESLQK+L+KKAVYVDDETFA+ASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHV+
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFAKASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVK

Query:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEIDKRDKDIKLLEAIIQTLGA
        EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEI+KRDKDIKLLEAIIQTLGA
Subjt:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEIDKRDKDIKLLEAIIQTLGA
XP_022967634.1 uncharacterized protein LOC111467076 isoform X1 [Cucurbita maxima]1.4e-6493.92Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFAKASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVK
        MEDKGKGTDRWS AVAN+TEMASNLESLQK+L+KKAVYVDDETFA+ASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHV+
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFAKASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVK

Query:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEIDKRDKDIKLLEAIIQTLGANK
        EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEI+KRDKDIKLLEAIIQTLG  K
Subjt:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEIDKRDKDIKLLEAIIQTLGANK
XP_038886855.1 uncharacterized protein LOC120077075 isoform X1 [Benincasa hispida]3.6e-6594.59Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFAKASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVK
        MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFA+ASLCS+QARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQ+AAELHV+
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFAKASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVK

Query:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEIDKRDKDIKLLEAIIQTLGANK
        EVTRELENTTKVFQLHMDELR KQEEIDKRDKDIKLLEAIIQTLG  +
Subjt:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEIDKRDKDIKLLEAIIQTLGANK
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1CLE5 uncharacterized protein LOC1110122424.5e-69100Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFAKASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVK
        MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFAKASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVK
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFAKASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVK

Query:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEIDKRDKDIKLLEAIIQTLGANK
        EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEIDKRDKDIKLLEAIIQTLGANK
Subjt:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEIDKRDKDIKLLEAIIQTLGANK
A0A6J1HG82 uncharacterized protein LOC111463800 isoform X21.0e-6595.89Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFAKASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVK
        MEDKGKGTDRWSGAVAN+TEMASNLESLQK+L+KKAVYVDDETFA+ASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHV+
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFAKASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVK

Query:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEIDKRDKDIKLLEAIIQTLGA
        EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEI+KRDKDIKLLEAIIQTLGA
Subjt:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEIDKRDKDIKLLEAIIQTLGA
A0A6J1HI40 uncharacterized protein LOC111463800 isoform X13.0e-6593.92Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFAKASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVK
        MEDKGKGTDRWSGAVAN+TEMASNLESLQK+L+KKAVYVDDETFA+ASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHV+
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFAKASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVK

Query:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEIDKRDKDIKLLEAIIQTLGANK
        EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEI+KRDKDIKLLEAIIQTLG  +
Subjt:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEIDKRDKDIKLLEAIIQTLGANK
A0A6J1HV17 uncharacterized protein LOC111467076 isoform X26.7e-6595.21Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFAKASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVK
        MEDKGKGTDRWS AVAN+TEMASNLESLQK+L+KKAVYVDDETFA+ASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHV+
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFAKASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVK

Query:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEIDKRDKDIKLLEAIIQTLGA
        EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEI+KRDKDIKLLEAIIQTLGA
Subjt:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEIDKRDKDIKLLEAIIQTLGA
A0A6J1HXA5 uncharacterized protein LOC111467076 isoform X16.7e-6593.92Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFAKASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVK
        MEDKGKGTDRWS AVAN+TEMASNLESLQK+L+KKAVYVDDETFA+ASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHV+
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFAKASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVK

Query:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEIDKRDKDIKLLEAIIQTLGANK
        EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEI+KRDKDIKLLEAIIQTLG  K
Subjt:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEIDKRDKDIKLLEAIIQTLGANK
SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G64180.1 unknown protein3.8e-5273.83Show/hide
Query:  MEDKGKGTD-RWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFAKASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHV
        ME++  G+D RW G++ N+TEMASNL+SLQKLLLKKAV+V+++TF++ASL SEQARTIKVLEQRV+TLERELDAAITAAAHARSEKRQAE++QKAAE   
Subjt:  MEDKGKGTD-RWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFAKASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHV

Query:  KEVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEIDKRDKDIKLLEAIIQTLGANK
        ++VT+ELENTTKVF+LHM+ELR  QE+I KRD +IKLLEAIIQTLG  +
Subjt:  KEVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEIDKRDKDIKLLEAIIQTLGANK

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGGACAAGGGTAAAGGAACGGACAGATGGAGCGGTGCTGTAGCCAATCTCACAGAGATGGCTTCCAATTTGGAATCACTCCAGAAGCTTCTACTGAAGAAAGCCGT
ATATGTGGACGACGAGACGTTTGCCAAAGCTTCGTTGTGCTCCGAACAAGCAAGAACGATCAAGGTTCTCGAACAAAGGGTTGAGACTTTGGAAAGGGAACTTGATGCTG
CCATCACTGCTGCTGCTCATGCTCGTTCAGAAAAACGTCAGGCTGAGGCAGCTCAAAAGGCTGCTGAACTACATGTGAAGGAGGTCACTAGAGAGCTCGAGAACACCACA
AAGGTATTTCAACTGCATATGGATGAATTGCGGGCAAAGCAAGAGGAAATTGACAAACGTGATAAGGATATTAAGCTCTTGGAAGCAATAATTCAGACTCTTGGTGCCAA
TAAATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAGGACAAGGGTAAAGGAACGGACAGATGGAGCGGTGCTGTAGCCAATCTCACAGAGATGGCTTCCAATTTGGAATCACTCCAGAAGCTTCTACTGAAGAAAGCCGT
ATATGTGGACGACGAGACGTTTGCCAAAGCTTCGTTGTGCTCCGAACAAGCAAGAACGATCAAGGTTCTCGAACAAAGGGTTGAGACTTTGGAAAGGGAACTTGATGCTG
CCATCACTGCTGCTGCTCATGCTCGTTCAGAAAAACGTCAGGCTGAGGCAGCTCAAAAGGCTGCTGAACTACATGTGAAGGAGGTCACTAGAGAGCTCGAGAACACCACA
AAGGTATTTCAACTGCATATGGATGAATTGCGGGCAAAGCAAGAGGAAATTGACAAACGTGATAAGGATATTAAGCTCTTGGAAGCAATAATTCAGACTCTTGGTGCCAA
TAAATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFAKASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVKEVTRELENTT
KVFQLHMDELRAKQEEIDKRDKDIKLLEAIIQTLGANK