; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Moc04g12200 (gene) of Bitter gourd (OHB3-1) v2 genome

Gene IDMoc04g12200
OrganismMomordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
DescriptionSerine/arginine repetitive matrix protein 2-like
Genome locationchr4:9239844..9240521
RNA-Seq ExpressionMoc04g12200
SyntenyMoc04g12200
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_021355836.1 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase G-like [Mizuhopecten yessoensis]7.3e-0936.79Show/hide
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        RN+R   +   RN+R+  + + RN+RNR+  + RN+RNR   + RN R+    + RN+RNR     RN R+  + + RN+RNR     RN R+  + + R
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        N+RNR   + RN R+  + + RN+RNR   + RN R+  + + RN+RNR   + RN R+ ++ + RN+RNR   + RN+R+  + + RN+R R
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XP_023142316.1 serine/arginine repetitive matrix protein 2 isoform X1 [Amphiprion ocellaris]6.8e-0739.89Show/hide
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        KGR  R++  +S KGR  R+ +  KRR  R  ++ KRR  R+ +  +RR SR I++ KRR  R+ +  +RR SR I++ KRR  R+ +  KRR SR I++
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         KRR  R+ +  KRR SR I++ KRR  R+ D  KRR+SR  ++ K+R  R+    +RR  R ++  + R RR R   +  ER
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XP_028310650.1 serine/arginine repetitive matrix protein 2-like isoform X2 [Gouania willdenowi]5.8e-0639.62Show/hide
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        KRR  R +++   R  R +D+ K R  R+ D  KGR  R+ D  KRR  R +D  +RR+       RR+R    ERR SR +D+ KRR  R+ D  ERR 
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        SR +D+ KRR  R+ D  +RR+SR +D+ KRR  R+ D  +RR SR ID+ KRR  R+ D  KRR S  +D+ KRR  ++ +  +++  R+ +  K R  
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        R  D  +R   K
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XP_028310651.1 serine/arginine repetitive matrix protein 2-like isoform X3 [Gouania willdenowi]5.8e-0639.62Show/hide
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        KRR  R +++   R  R +D+ K R  R+ D  KGR  R+ D  KRR  R +D  +RR+       RR+R    ERR SR +D+ KRR  R+ D  ERR 
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        SR +D+ KRR  R+ D  +RR+SR +D+ KRR  R+ D  +RR SR ID+ KRR  R+ D  KRR S  +D+ KRR  ++ +  +++  R+ +  K R  
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        R  D  +R   K
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XP_035811460.1 serine/arginine repetitive matrix protein 2 isoform X2 [Amphiprion ocellaris]6.8e-0739.89Show/hide
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        KGR  R++  +S KGR  R+ +  KRR  R  ++ KRR  R+ +  +RR SR I++ KRR  R+ +  +RR SR I++ KRR  R+ +  KRR SR I++
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         KRR  R+ +  KRR SR I++ KRR  R+ D  KRR+SR  ++ K+R  R+    +RR  R ++  + R RR R   +  ER
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A210QKV4 Uncharacterized protein3.5e-0936.79Show/hide
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        RN+R   +   RN+R+  + + RN+RNR+  + RN+RNR   + RN R+    + RN+RNR     RN R+  + + RN+RNR     RN R+  + + R
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        N+RNR   + RN R+  + + RN+RNR   + RN R+  + + RN+RNR   + RN R+ ++ + RN+RNR   + RN+R+  + + RN+R R
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A0A3Q1BUU2 Serine/arginine repetitive matrix protein 2-like3.3e-0739.89Show/hide
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        KGR  R++  +S KGR  R+ +  KRR  R  ++ KRR  R+ +  +RR SR I++ KRR  R+ +  +RR SR I++ KRR  R+ +  KRR SR I++
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         KRR  R+ +  KRR SR I++ KRR  R+ D  KRR+SR  ++ K+R  R+    +RR  R ++  + R RR R   +  ER
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A0A672YTQ7 cwf21 domain-containing protein1.4e-0537.19Show/hide
Query:  DFWKRRNRREINLWTSRNRRDIDLWKGRNRRNRDSWKGRNRRNRDSWKRRNIRDIDSWKRRNRRNRDSWERRNSRDIDLWKRRNRRNRDSWERRNSRDID
        D  K R  R   +   R  R  ++ KGR  R+R+  KGR  R+RD  K R  R  +  K R  R+R+  + R SR  D+ K R  R+RD  + R SR  D
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Query:  LWKRRNRRNRDSWKRRNSRDIDLWKRRNRRNRDSWKRRNSRDIDLWKRRNRRNRDSWKRRNSRDIDLWKRRNRRNRDSWKRRNRRDIDLWKGRNRRERD
        + K R  R+RD  K R SR  ++ K R  R+R+  K R SR  +L K R  ++R+  K R SR  ++ K R  R+RD  + R  R  ++ KGR  R R+
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGATTTTTGGAAGAGGAGGAATAGAAGGGAGATCAATTTATGGACGAGCAGGAATAGAAGGGATATCGATTTGTGGAAGGGGAGGAATAGAAGGAATAGGGACTCGTG
GAAGGGGAGGAACAGAAGGAATAGGGATTCGTGGAAGAGGAGGAACATAAGGGATATCGATTCGTGGAAGCGGAGGAATAGAAGGAATAGGGATTCGTGGGAGAGGAGGA
ACAGTAGGGATATCGATTTGTGGAAGCGGAGGAATAGAAGGAATAGGGATTCGTGGGAGAGGAGGAACAGTAGGGATATCGATTTGTGGAAGCGGAGGAATAGAAGGAAT
AGGGATTCGTGGAAGAGGAGGAACAGTAGGGATATCGATTTGTGGAAGCGGAGGAATAGAAGGAATAGGGATTCGTGGAAGAGGAGGAACAGTAGGGATATCGATTTGTG
GAAGCGGAGGAATAGAAGGAATAGGGATTCGTGGAAGAGGAGGAACAGTAGGGATATCGATTTGTGGAAGCGGAGGAATAGAAGGAATAGGGATTCGTGGAAGAGGAGGA
ATAGAAGGGATATCGATCTGTGGAAGGGGAGGAATAGAAGGGAAAGGGATTCGTGGGAGAGGAGTGAAAGGAAATGGAAGAATATTAGAAGAAACTTCCCGAGCTGCTTC
ACTCACATCGATGCTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGATTTTTGGAAGAGGAGGAATAGAAGGGAGATCAATTTATGGACGAGCAGGAATAGAAGGGATATCGATTTGTGGAAGGGGAGGAATAGAAGGAATAGGGACTCGTG
GAAGGGGAGGAACAGAAGGAATAGGGATTCGTGGAAGAGGAGGAACATAAGGGATATCGATTCGTGGAAGCGGAGGAATAGAAGGAATAGGGATTCGTGGGAGAGGAGGA
ACAGTAGGGATATCGATTTGTGGAAGCGGAGGAATAGAAGGAATAGGGATTCGTGGGAGAGGAGGAACAGTAGGGATATCGATTTGTGGAAGCGGAGGAATAGAAGGAAT
AGGGATTCGTGGAAGAGGAGGAACAGTAGGGATATCGATTTGTGGAAGCGGAGGAATAGAAGGAATAGGGATTCGTGGAAGAGGAGGAACAGTAGGGATATCGATTTGTG
GAAGCGGAGGAATAGAAGGAATAGGGATTCGTGGAAGAGGAGGAACAGTAGGGATATCGATTTGTGGAAGCGGAGGAATAGAAGGAATAGGGATTCGTGGAAGAGGAGGA
ATAGAAGGGATATCGATCTGTGGAAGGGGAGGAATAGAAGGGAAAGGGATTCGTGGGAGAGGAGTGAAAGGAAATGGAAGAATATTAGAAGAAACTTCCCGAGCTGCTTC
ACTCACATCGATGCTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDFWKRRNRREINLWTSRNRRDIDLWKGRNRRNRDSWKGRNRRNRDSWKRRNIRDIDSWKRRNRRNRDSWERRNSRDIDLWKRRNRRNRDSWERRNSRDIDLWKRRNRRN
RDSWKRRNSRDIDLWKRRNRRNRDSWKRRNSRDIDLWKRRNRRNRDSWKRRNSRDIDLWKRRNRRNRDSWKRRNRRDIDLWKGRNRRERDSWERSERKWKNIRRNFPSCF
THIDA