; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Moc04g29350 (gene) of Bitter gourd (OHB3-1) v2 genome

Gene IDMoc04g29350
OrganismMomordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
DescriptionProtein SIS2
Genome locationchr4:21797175..21799899
RNA-Seq ExpressionMoc04g29350
SyntenyMoc04g29350
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6601944.1 hypothetical protein SDJN03_07177, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.0e-4478.1Show/hide
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KAG7032638.1 hypothetical protein SDJN02_06688 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]4.7e-4578.83Show/hide
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XP_022146328.1 uncharacterized protein LOC111015566 [Momordica charantia]1.1e-65100Show/hide
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XP_022961614.1 uncharacterized protein LOC111462310 [Cucurbita moschata]5.2e-4477.94Show/hide
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XP_023525740.1 uncharacterized protein LOC111789252 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.0e-4479.26Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3CQ37 uncharacterized protein LOC1035034023.8e-4074.07Show/hide
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A0A6J1CYA7 uncharacterized protein LOC1110155665.2e-66100Show/hide
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A0A6J1FJ66 uncharacterized protein LOC1114447533.4e-4176.3Show/hide
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A0A6J1HEK5 uncharacterized protein LOC1114623102.5e-4477.94Show/hide
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A0A6J1JTZ0 uncharacterized protein LOC1114874915.8e-4176.3Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G31560.1 high chlorophyll fluorescence 1532.9e-1641.84Show/hide
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        ARL +S      P+ P  ++ P    +P    PA  F+       C  R +R   + TRAG STSSY+ AF+IP +LI  TV T++KI D LD+ FLE++
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         LN+AI +A E+ ++   +IS +    +P L RTRNRPKRE
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGAGCGCCAGGCTCCTTATCTCATTCCAAATCCGAACCTTTCCCATTCCCCCTCTCCCCGTCGCTCCTCCGCGGTTGTTCTTCAGACCCTCCACTCCCTCG
CCGGCGCTCAGATTCTCCTGCGACCCCAGACCCCTGCGCCTGCGACTGCTGACCACTCGTGCCGGCGCCAGCACCAGCAGCTACATCTTCGCCTTCTCCATCCCC
TTCTCTCTCATTCTCATCACTGTTCTCACCGCTCTTAAAATCGGCGATAACCTCGACAAGAAATTTCTCGAGGAGGTTACTCTGAATGAAGCCATTATGGAAGCA
GATGAGGAGAACAAAGATGATAATTCAGAAATATCCTTCGAACCAAAACCTGCTCTTCCACGAACTCGCAACCGCCCTAAAAGGGAAGCTGAGGTATTGCATTTT
TTACCTCATCGTCTTCTTCCTTCTTCTCTCGGGTTGACACTTGAGAATACTGGAGCTGCCGATTCTCAACCTGAGGAGCAGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCGAGCGCCAGGCTCCTTATCTCATTCCAAATCCGAACCTTTCCCATTCCCCCTCTCCCCGTCGCTCCTCCGCGGTTGTTCTTCAGACCCTCCACTCCCTCG
CCGGCGCTCAGATTCTCCTGCGACCCCAGACCCCTGCGCCTGCGACTGCTGACCACTCGTGCCGGCGCCAGCACCAGCAGCTACATCTTCGCCTTCTCCATCCCC
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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