CuGenDBv2

Gene ID	Moc04g30680
Organism	Momordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
Description	60S ribosomal protein L30-like
Genome location	chr4:22994679..22996706
RNA-Seq Expression	Moc04g30680
Synteny	Moc04g30680
Gene Ontology terms	GO:0022625 - cytosolic large ribosomal subunit (cellular component) GO:0003723 - RNA binding (molecular function) GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domains	IPR000231 - Ribosomal protein L30e IPR004038 - Ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45 IPR022991 - Ribosomal protein L30e, conserved site IPR029064 - 50S ribosomal protein L30e-like IPR039109 - Ribosomal protein L30/YlxQ

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAG6602049.1 60S ribosomal protein L30, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

6.3e-54

97.32

Show/hide

Query:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG
        MA AKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG
Subjt:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG

Query:  DSDIIKSLPGDQ
        DSDIIKSLP +Q
Subjt:  DSDIIKSLPGDQ

XP_004140311.1 60S ribosomal protein L30 [Cucumis sativus]

3.7e-54

96.43

Show/hide

Query:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG
        MA AKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIR SKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAK+GVHHYNGSNVDLGTACGKY+RVSCLSIIDPG
Subjt:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG

Query:  DSDIIKSLPGDQ
        DSDIIKSLPGDQ
Subjt:  DSDIIKSLPGDQ

XP_008460497.1 PREDICTED: 60S ribosomal protein L30-like [Cucumis melo]

1.3e-54

97.32

Show/hide

Query:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG
        MA AKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAK+GVHHYNGSNVDLGTACGKY+RVSCLSIIDPG
Subjt:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG

Query:  DSDIIKSLPGDQ
        DSDIIKSLPGDQ
Subjt:  DSDIIKSLPGDQ

XP_022141723.1 60S ribosomal protein L30-like [Momordica charantia]

1.2e-55

100

Show/hide

Query:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG
        MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG
Subjt:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG

Query:  DSDIIKSLPGDQ
        DSDIIKSLPGDQ
Subjt:  DSDIIKSLPGDQ

XP_022952815.1 60S ribosomal protein L30-like [Cucurbita moschata]

6.3e-54

97.32

Show/hide

Query:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG
        MA AKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG
Subjt:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG

Query:  DSDIIKSLPGDQ
        DSDIIKSLP +Q
Subjt:  DSDIIKSLPGDQ

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A1S3CCQ4 60S ribosomal protein L30-like

6.2e-55

97.32

Show/hide

Query:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG
        MA AKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAK+GVHHYNGSNVDLGTACGKY+RVSCLSIIDPG
Subjt:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG

Query:  DSDIIKSLPGDQ
        DSDIIKSLPGDQ
Subjt:  DSDIIKSLPGDQ

A0A5D3DSZ7 60S ribosomal protein L30-like

6.2e-55

97.32

Show/hide

Query:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG
        MA AKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAK+GVHHYNGSNVDLGTACGKY+RVSCLSIIDPG
Subjt:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG

Query:  DSDIIKSLPGDQ
        DSDIIKSLPGDQ
Subjt:  DSDIIKSLPGDQ

A0A6J1CLC5 60S ribosomal protein L30-like

5.6e-56

100

Show/hide

Query:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG
        MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG
Subjt:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG

Query:  DSDIIKSLPGDQ
        DSDIIKSLPGDQ
Subjt:  DSDIIKSLPGDQ

A0A6J1FH91 60S ribosomal protein L30-like

6.2e-55

97.32

Show/hide

Query:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG
        MA AKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAK+GVHHYNGSNVDLGTACGKY+RVSCLSIIDPG
Subjt:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG

Query:  DSDIIKSLPGDQ
        DSDIIKSLPGDQ
Subjt:  DSDIIKSLPGDQ

A0A6J1JWW8 60S ribosomal protein L30-like

6.2e-55

97.32

Show/hide

Query:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG
        MA AKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAK+GVHHYNGSNVDLGTACGKY+RVSCLSIIDPG
Subjt:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG

Query:  DSDIIKSLPGDQ
        DSDIIKSLPGDQ
Subjt:  DSDIIKSLPGDQ

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

O49884 60S ribosomal protein L30

1.0e-54

90.18

Show/hide

Query:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG
        M AAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVL+++RSSKGKLII++NNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNG+NVDLGTACGKY+RV CLSI+DPG
Subjt:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG

Query:  DSDIIKSLPGDQ
        DSDIIK+LPGDQ
Subjt:  DSDIIKSLPGDQ

Q8VZ19 60S ribosomal protein L30-2

2.3e-51

83.93

Show/hide

Query:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG
        M   KKTKK+HE IN+RLALVMKSGKYTLGYK+VL+++R SKGKLI++S NCPPLR+SEIEYYAMLAKVGVHHYNG+NVDLGTACGKYFRVSCLSI+DPG
Subjt:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG

Query:  DSDIIKSLPGDQ
        DSDIIKS+PGDQ
Subjt:  DSDIIKSLPGDQ

Q9C8F7 Putative 60S ribosomal protein L30-1

2.8e-52

86.61

Show/hide

Query:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG
        M AAKKTKK+HE IN+RLALVMKSGKYTLGYK+VL+++RSSKGKLI++S+NCPPLR+SEIEYYAMLAKVGVHHYN +NVDLGTACGKYFRVSCLSI+DPG
Subjt:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG

Query:  DSDIIKSLPGDQ
        DSDIIKSLPGDQ
Subjt:  DSDIIKSLPGDQ

Q9LSA3 60S ribosomal protein L30-3

8.9e-51

83.93

Show/hide

Query:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG
        M A KK KK+HE IN+RLALVMKSGKYTLGYK+VL+++RSSKGKLI++S+NCPPLR+SEIEYYAMLAKVGVH YNG+NVDLGTACGKYFRVSCLSI+DPG
Subjt:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG

Query:  DSDIIKSLPGDQ
        DSDIIK+LPGDQ
Subjt:  DSDIIKSLPGDQ

Q9M5M6 60S ribosomal protein L30

3.6e-52

88.29

Show/hide

Query:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG
        M AAKKTKKTHESIN+RLALVMKSGK+TLGYKTVL ++RS+KGKLII++NNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNG+NVDLGTACGKYFRV CLSIID G
Subjt:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG

Query:  DSDIIKSLPGD
        DSDIIKS+PGD
Subjt:  DSDIIKSLPGD

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT1G36240.1 Ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45 family protein

2.0e-53

86.61

Show/hide

Query:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG
        M AAKKTKK+HE IN+RLALVMKSGKYTLGYK+VL+++RSSKGKLI++S+NCPPLR+SEIEYYAMLAKVGVHHYN +NVDLGTACGKYFRVSCLSI+DPG
Subjt:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG

Query:  DSDIIKSLPGDQ
        DSDIIKSLPGDQ
Subjt:  DSDIIKSLPGDQ

AT1G77940.1 Ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45 family protein

1.7e-52

83.93

Show/hide

Query:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG
        M   KKTKK+HE IN+RLALVMKSGKYTLGYK+VL+++R SKGKLI++S NCPPLR+SEIEYYAMLAKVGVHHYNG+NVDLGTACGKYFRVSCLSI+DPG
Subjt:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG

Query:  DSDIIKSLPGDQ
        DSDIIKS+PGDQ
Subjt:  DSDIIKSLPGDQ

AT3G18740.1 Ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45 family protein

6.3e-52

83.93

Show/hide

Query:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG
        M A KK KK+HE IN+RLALVMKSGKYTLGYK+VL+++RSSKGKLI++S+NCPPLR+SEIEYYAMLAKVGVH YNG+NVDLGTACGKYFRVSCLSI+DPG
Subjt:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG

Query:  DSDIIKSLPGDQ
        DSDIIK+LPGDQ
Subjt:  DSDIIKSLPGDQ

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGCGGCGGCGAAGAAGACGAAGAAGACTCATGAGAGCATTAACAACAGGCTCGCCCTTGTGATGAAGAGCGGCAAGTACACACTGGGCTATAAAACCGTCCTACGCAC
TATTCGCAGCTCCAAAGGGAAGCTTATAATCCTATCGAACAACTGCCCGCCGCTGCGTAAGTCTGAAATTGAGTACTACGCGATGCTTGCTAAAGTTGGGGTTCACCACT
ACAACGGAAGCAATGTTGATCTTGGAACCGCCTGTGGCAAGTATTTCCGCGTGTCATGCCTCAGCATTATTGACCCAGGTGACTCTGATATTATCAAGTCGCTTCCTGGT
GATCAGTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPGDSDIIKSLPG
DQ

Moc04g30680 (gene) of Bitter gourd (OHB3-1) v2 genome