; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Moc04g33030 (gene) of Bitter gourd (OHB3-1) v2 genome

Gene IDMoc04g33030
OrganismMomordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
Descriptionnuclear pore complex protein NUP1
Genome locationchr4:24862169..24874600
RNA-Seq ExpressionMoc04g33030
SyntenyMoc04g33030
Gene Ontology termsGO:0016973 - poly(A)+ mRNA export from nucleus (biological process)
GO:0071763 - nuclear membrane organization (biological process)
GO:0005635 - nuclear envelope (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_022133602.1 nuclear pore complex protein NUP1 [Momordica charantia]0.0e+00100Show/hide
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XP_022938795.1 nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X2 [Cucurbita moschata]0.0e+0075Show/hide
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        MATERE + YEGGRGGKFQKRP+RRSHTTPYDRPP ALRNS  KGW+S LVDPAQK ITSSAHRLFS+VFRKRLPPPPPSLP+SRE NDE E KNQEEVA
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        ADPPGTQEGTN  FVPSI+SNN H V+DLE+ILKEKTFTR EIDRLTELL SR+ DVPSGVE RKFE+V STP+ISY   E S K PAQ+GV  HMV T 
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        V++ANV DEDVASPAEIAKA+MGSRPPKATPL+M A SQK  D+FA G+ S SSTLSLVPR  GN DV +N FVTPR RGRSALYSMAR+PYSRVRAT S
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        IKN+VATTD+YRA   +SSSQSAWEQGRL+ SNQGALKRRSSVLD+E+GSVGPIRRIR KSNL+F KGLSLP   SSTSI VSGIGSET+Q  QSTKVH 
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          S AGKA YS+ETK NLSKMSAE END +PSSSFP+IPLRSSEMA KILEQLDKLTPPKEKSSE KL  VRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLEDVDS+KY
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        LENV+ I SND +DLTS++ DK E+SS LK K P DKSI+T  G+ SSVP+K   SSSGL VS V PSS TK AFQMS  EDFVDM++E YSNGP +  S
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          RREKVD  LVAV KPSDT+    DK QASI  KPS  SEM KI D  KSD P TTEKS IFSF  ASP S TA+V++PE  +R EKI SSE+PKAA A
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        P+FGFG+K P QK+ + S+PTF FGN VTT TN+QN V  V SEGNVAPT  A   TTFKFGDKATFPI  +  TENGN  +GSPFKF+S LV+EKE AK
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         GSAS+FK+ESS S   SF V KESMS+K  D KS S GL+V TS N+ LSSVS STPTPS+FSFSSP+T SNL NGSL  TPS F SP  +F +NITNQ
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        NSSIKPSL AATS+SE +T+T LSTS+PMPSF AAPIFKFGSSSVPS+     SA +GVGSVETKT Q TT FGN+SGI PS+T  AK  STGSSVFQFG
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        AASTTSDSNK+PE STF P +VP+FGA V  A+SGVA+STQ TPV  FSSSSTSFGL GNTGL+SG+SL GSSAPASNLF+SGA FG  SSSS ANNS S
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        SG+G SSSFFNWQ SSAPSFS+GF STPTGGFSFGL SSSAAS+S+P LFGSS    AST  +FSFTSAATAA SQPA G SNH FTFGSTPPANND A+
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        MEDSMAEDTVQ VA  T  PSFGQQPLTPPPSSGFVFGST  +PL ANPFQFGG QQNVPTPQNP+ FQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDK+NRK+VK
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        VKSKSRKK
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XP_038884353.1 nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X1 [Benincasa hispida]0.0e+0075.86Show/hide
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         SIKN+VATTDAYRA  +SSSSQSAW QGRL+GS QGALKRR+SVLD+EMGSVGPIRRIR KSN +F KGLSLP   SSTSI VSGIGSET+Q  QSTKV
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        H   S+ GK LYS+ETK NLSKMSAE ENDM PSSSFP+IPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSE KL  VRNNSP KLSPSMLHGPALRSLEDVDS+
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        KYLENV+GI SNDA DLTS++NDK EESS LKFK P DKSI+T +G+ SSVP K   S SG  VS V PS QTK AFQMSAHEDFVDM+EEGYSNGP  D
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Query:  ISSGRREKVDGPLVAVSKPSDTDTTAADKSQASIHVKPS--SEMNKITDLGKSDAPATTEKSPIFSFSAASPPSITASVVDPELASRSEKIVSSEIPKAA
        IS  R+EKV+  LVAVSKP++T+    DK QASI  KP   S MNKI D GKSD P TTEKSPIFSF   S PSITA+V+ PE   R EKI SSE+PKAA
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Query:  TAPLFGFGDKSPIQKELITSAPTFAFGNNVTTPTNKQNVVSDVASEGNVAPTQPAPVSTTFKFGDKATFPISGNAVTENGNKNSGSPFKFSSPLVDEKES
        T P+FGFG+K P QKE ++ APTFAF N +TT TN+QN +  V SEGNV PTQ A   TTFKFGDKATFPI  NA TENGNKN GSP  F+SPLV+EKE 
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Query:  AKV-GSASIFKAESS-----FSIPSFAVSKESMSDKVDNKSLSTGLTVSTSENVFLSSVST--STPTPSVFSFSSPSTTSNLNNGSLAPTPSIFSSPVTS
        AK  GSAS+FKAESS      SIPSF V KESMS+K  +KS S G  V TS ++F SSVST  STPT  +FSFSSPST SNLNNGSL  T   F +P T+
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Query:  FANNITNQNSSIKPSLPAATSSSETITSTGLSTSAPMPSFPAAPIFKFGSSSVPSTSTSTMSALTGVGSVETKTTQVTTTFGNLSGIPPSETLA-KASST
        F+NNITNQNSSIKPS  AA S+SE +T+T L TS+ MPSF AAPI KFGSSSVPSTS   +SA +GVGS+E+KT Q  TTFGNLSGIPPS+  A K SST
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Query:  GSSVFQFGAASTTSDSNKRPENSTFLPGNVPAFGAAVSSATSGVAASTQ-TPVMQFSSSSTSFGLAGNTGLSSGSSLFGSSAPASNLFSSGAGFGLASSS
        GSSVFQFGAAST SDSNKRP NSTF P NVP FGA+ S  +SG+A+STQ TPV+QF+SSSTSFGL GNTGL+SGSSLFGSSAPASNLF+SG  FGLASSS
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        S+ NNS SS +G SSSFFNWQPSS PSFSTGF+STPTGGFSFGL+SSSAASNSAP LFGSS+ G+ T  +FSFTSAATA +SQPA GNSNH FTFGSTPP
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Query:  ANNDQASMEDSMAEDTVQAVAPTTPSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTTTPLAANPFQFGG-QQNVPTPQ-NPSRFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKAN
        ANNDQA+MEDSMAEDTVQ V    PSFGQQPLTPPPSSGFVFGST  PL A+PFQFGG QQNVPTPQ NPS FQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDK+N
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        RK+VKVKSKSRKK
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XP_038884354.1 nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X2 [Benincasa hispida]0.0e+0076.09Show/hide
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        KYLENV+GI SNDA DLTS++NDK EESS LKFK P DKSI+T +G+ SSVP K   S SG  VS V PS QTK AFQMSAHEDFVDM+EEGYSNGP  D
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        IS  R+EKV+  LVAVSKP++T+    DK QASI  KP   S MNKI D GKSD P TTEKSPIFSF   S PSITA+V+ PE   R EKI SSE+PKAA
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Query:  TAPLFGFGDKSPIQKELITSAPTFAFGNNVTTPTNKQNVVSDVASEGNVAPTQPAPVSTTFKFGDKATFPISGNAVTENGNKNSGSPFKFSSPLVDEKES
        T P+FGFG+K P QKE ++ APTFAF N +TT TN+QN +  V SEGNV PTQ A   TTFKFGDKATFPI  NA TENGNKN GSP  F+SPLV+EKE 
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Query:  AKV-GSASIFKAE-SSFSIPSFAVSKESMSDKVDNKSLSTGLTVSTSENVFLSSVST--STPTPSVFSFSSPSTTSNLNNGSLAPTPSIFSSPVTSFANN
        AK  GSAS+FKAE SS SIPSF V KESMS+K  +KS S G  V TS ++F SSVST  STPT  +FSFSSPST SNLNNGSL  T   F +P T+F+NN
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Query:  ITNQNSSIKPSLPAATSSSETITSTGLSTSAPMPSFPAAPIFKFGSSSVPSTSTSTMSALTGVGSVETKTTQVTTTFGNLSGIPPSETLA-KASSTGSSV
        ITNQNSSIKPS  AA S+SE +T+T L TS+ MPSF AAPI KFGSSSVPSTS   +SA +GVGS+E+KT Q  TTFGNLSGIPPS+  A K SSTGSSV
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Query:  FQFGAASTTSDSNKRPENSTFLPGNVPAFGAAVSSATSGVAASTQ-TPVMQFSSSSTSFGLAGNTGLSSGSSLFGSSAPASNLFSSGAGFGLASSSSAAN
        FQFGAAST SDSNKRP NSTF P NVP FGA+ S  +SG+A+STQ TPV+QF+SSSTSFGL GNTGL+SGSSLFGSSAPASNLF+SG  FGLASSSS+ N
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Query:  NSNSSGSGMSSSFFNWQPSSAPSFSTGFNSTPTGGFSFGLTSSSAASNSAPALFGSSA-GASTAGIFSFTSAATAASSQPAIGNSNHAFTFGSTPPANND
        NS SS +G SSSFFNWQPSS PSFSTGF+STPTGGFSFGL+SSSAASNSAP LFGSS+ G+ T  +FSFTSAATA +SQPA GNSNH FTFGSTPPANND
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Query:  QASMEDSMAEDTVQAVAPTTPSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTTTPLAANPFQFGG-QQNVPTPQ-NPSRFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKANRKYV
        QA+MEDSMAEDTVQ V    PSFGQQPLTPPPSSGFVFGST  PL A+PFQFGG QQNVPTPQ NPS FQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDK+NRK+V
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Query:  KVKSKSRKK
        KVKSKSRKK
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XP_038884355.1 nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X3 [Benincasa hispida]0.0e+0075.63Show/hide
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        MATEREE+RYEGGRGGKFQKRP+RRSHTTPYDRPPTALRNSA KGW+S LVDPAQK ITSSAHRLFS+VFRKRLPPPPPSLPLSRE NDE EN+NQEEVA
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Query:  ADPPGTQEGTNPGFVPSISSNNTHRVTDLEQILKEKTFTRSEIDRLTELLNSRIVDVPSGVEERKFELVPSTPIISYGRHEESQKSPA--QDGVSTHMVS
        ADPP TQEGTN  FVPSI+SNNTH V+DLE+ILKEKTFTR EIDRLTELL SR+ DVPSGVE  K E VPSTP+ISYG+ E   K PA  QDGVS HMVS
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        T V    VLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPL+MA+ SQK  D F+ G+ S S TLSL+PR  GN DV +NGFVTPR RGRSALYSMAR+PYSRVRAT
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Query:  SSIKNTVATTDAYRAAPSSSSSQSAWEQGRLVGSNQGALKRRSSVLDNEMGSVGPIRRIRQKSNLVFSKGLSLPISGSSTSISVSGIGSETAQRFQSTKV
         SIKN+VATTDAYRA  +SSSSQSAW QGRL+GS QGALKRR+SVLD+EMGSVGPIRRIR KSN +F KGLSLP   SSTSI VSGIGSET+Q  QSTKV
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Query:  HQLPSSAGKALYSNETKCNLSKMSAEFENDMSPSSSFPRIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSEAKLF-VRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLEDVDSS
        H   S+ GK LYS+ETK NLSKMSAE ENDM PSSSFP+IPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSE KL  VRNNSP KLSPSMLHGPALRSLEDVDS+
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        KYLENV+GI SNDA DLTS++NDK EESS LKFK P DKSI+T +G+ SSVP K   S SG  VS V PS QTK AFQMSAHEDFVDM+EEGYSNGP  D
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        IS  R+EKV+  LVAVSKP++T+    DK QASI  KP   S MNKI D GKSD P TTEKSPIFSF   S PSITA+V+ PE   R EKI SSE+PKAA
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Query:  TAPLFGFGDKSPIQKELITSAPTFAFGNNVTTPTNKQNVVSDVASEGNVAPTQPAPVSTTFKFGDKATFPISGNAVTENGNKNSGSPFKFSSPLVDEKES
        T P+FGFG+K P QKE ++ APTFAF N +TT TN+QN +  V SEGNV PTQ A   TTFKFGDKATFPI  NA TENGNKN GSP  F+SPLV+EKE 
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Query:  AKV-GSASIFKAESS-----FSIPSFAVSKESMSDKVDNKSLSTGLTVSTSENVFLSSVST--STPTPSVFSFSSPSTTSNLNNGSLAPTPSIFSSPVTS
        AK  GSAS+FKAESS      SIPSF V KESMS+K  +KS S G  V TS ++F SSVST  STPT  +FSFSSPST SNLNNGSL  T   F +P T+
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Query:  FANNITNQNSSIKPSLPAATSSSETITSTGLSTSAPMPSFPAAPIFKFGSSSVPSTSTSTMSALTGVGSVETKTTQVTTTFGNLSGIPPSETLA-KASST
        F+NNITNQNSSIKPS  AA S+SE +T+T L TS+ MPSF AAPI KFGSSSVPSTS   +SA +GVGS+E+KT Q  TTFGNLSGIPPS+  A K SST
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Query:  GSSVFQFGAASTTSDSNKRPENSTFLPGNVPAFGAAVSSATSGVAASTQ-TPVMQFSSSSTSFGLAGNTGLSSGSSLFGSSAPASNLFSSGAGFGLASSS
        GSSVFQFGAAST SDSNKRP NSTF P NVP FGA+ S  +SG+A+STQ TPV+QF+SSSTSFGL GNTGL+SGSSLFGSSAPASNLF+SG  FGLASSS
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Query:  SAANNSNSSGSGMSSSFFNWQPSSAPSFSTGFNSTPTGGFSFGLTSSSAASNSAPALFGSSA-GASTAGIFSFTSAATAASSQPAIGNSNHAFTFGSTPP
        S+ NNS SS +G SSSFFNWQPSS PSFSTGF+STPTGGFSFGL+SSSAASNSAP LFGSS+ G+ T  +FSFTSAATA +SQPA GNSNH FTFGSTPP
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Query:  ANNDQASMEDSMAEDTVQAVAPTTPSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTTTPLAANPFQFGG-QQNVPTPQ-NPSRFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKAN
        ANNDQA+MEDSMAEDTVQ V    PSFGQQPLTPPPSSGFVFGST  PL A+PFQFGG QQNVPTPQ NPS FQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDK+N
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Query:  RKYVKVKSKSRKK
        RK+VKVKSKSRKK
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1BX57 nuclear pore complex protein NUP10.0e+00100Show/hide
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        MATEREEIRYEGGRGGKFQKRPVRRSHTTPYDRPPTALRNSARKGWVSTLVDPAQKFITSSAHRLFSTVFRKRLPPPPPSLPLSREGNDETENKNQEEVA
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        ADPPGTQEGTNPGFVPSISSNNTHRVTDLEQILKEKTFTRSEIDRLTELLNSRIVDVPSGVEERKFELVPSTPIISYGRHEESQKSPAQDGVSTHMVSTR
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Query:  VMSANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLNMAASQKLVDSFASGDLSNSSTLSLVPRPSGNVDVIDNGFVTPRPRGRSALYSMARLPYSRVRATSSI
        VMSANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLNMAASQKLVDSFASGDLSNSSTLSLVPRPSGNVDVIDNGFVTPRPRGRSALYSMARLPYSRVRATSSI
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Query:  KNTVATTDAYRAAPSSSSSQSAWEQGRLVGSNQGALKRRSSVLDNEMGSVGPIRRIRQKSNLVFSKGLSLPISGSSTSISVSGIGSETAQRFQSTKVHQL
        KNTVATTDAYRAAPSSSSSQSAWEQGRLVGSNQGALKRRSSVLDNEMGSVGPIRRIRQKSNLVFSKGLSLPISGSSTSISVSGIGSETAQRFQSTKVHQL
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Query:  PSSAGKALYSNETKCNLSKMSAEFENDMSPSSSFPRIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSEAKLFVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLEDVDSSKYLE
        PSSAGKALYSNETKCNLSKMSAEFENDMSPSSSFPRIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSEAKLFVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLEDVDSSKYLE
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        NVKGIPSNDAQDLTSQRNDKVEESSSLKFKAPKDKSIATSDGMVSSVPTKVAASSSGLPVSSVAPSSQTKWAFQMSAHEDFVDMEEEGYSNGPATDISSG
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Query:  RREKVDGPLVAVSKPSDTDTTAADKSQASIHVKPSSEMNKITDLGKSDAPATTEKSPIFSFSAASPPSITASVVDPELASRSEKIVSSEIPKAATAPLFG
        RREKVDGPLVAVSKPSDTDTTAADKSQASIHVKPSSEMNKITDLGKSDAPATTEKSPIFSFSAASPPSITASVVDPELASRSEKIVSSEIPKAATAPLFG
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        FGDKSPIQKELITSAPTFAFGNNVTTPTNKQNVVSDVASEGNVAPTQPAPVSTTFKFGDKATFPISGNAVTENGNKNSGSPFKFSSPLVDEKESAKVGSA
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Query:  SIFKAESSFSIPSFAVSKESMSDKVDNKSLSTGLTVSTSENVFLSSVSTSTPTPSVFSFSSPSTTSNLNNGSLAPTPSIFSSPVTSFANNITNQNSSIKP
        SIFKAESSFSIPSFAVSKESMSDKVDNKSLSTGLTVSTSENVFLSSVSTSTPTPSVFSFSSPSTTSNLNNGSLAPTPSIFSSPVTSFANNITNQNSSIKP
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Query:  SLPAATSSSETITSTGLSTSAPMPSFPAAPIFKFGSSSVPSTSTSTMSALTGVGSVETKTTQVTTTFGNLSGIPPSETLAKASSTGSSVFQFGAASTTSD
        SLPAATSSSETITSTGLSTSAPMPSFPAAPIFKFGSSSVPSTSTSTMSALTGVGSVETKTTQVTTTFGNLSGIPPSETLAKASSTGSSVFQFGAASTTSD
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Query:  SNKRPENSTFLPGNVPAFGAAVSSATSGVAASTQTPVMQFSSSSTSFGLAGNTGLSSGSSLFGSSAPASNLFSSGAGFGLASSSSAANNSNSSGSGMSSS
        SNKRPENSTFLPGNVPAFGAAVSSATSGVAASTQTPVMQFSSSSTSFGLAGNTGLSSGSSLFGSSAPASNLFSSGAGFGLASSSSAANNSNSSGSGMSSS
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Query:  FFNWQPSSAPSFSTGFNSTPTGGFSFGLTSSSAASNSAPALFGSSAGASTAGIFSFTSAATAASSQPAIGNSNHAFTFGSTPPANNDQASMEDSMAEDTV
        FFNWQPSSAPSFSTGFNSTPTGGFSFGLTSSSAASNSAPALFGSSAGASTAGIFSFTSAATAASSQPAIGNSNHAFTFGSTPPANNDQASMEDSMAEDTV
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Query:  QAVAPTTPSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTTTPLAANPFQFGGQQNVPTPQNPSRFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKANRKYVKVKSKSRKK
        QAVAPTTPSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTTTPLAANPFQFGGQQNVPTPQNPSRFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKANRKYVKVKSKSRKK
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A0A6J1FF52 nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X10.0e+0074.77Show/hide
Query:  MATEREEIRYEGGRGGKFQKRPVRRSHTTPYDRPPTALRNSARKGWVSTLVDPAQKFITSSAHRLFSTVFRKRLPPPPPSLPLSREGNDETENKNQEEVA
        MATERE + YEGGRGGKFQKRP+RRSHTTPYDRPP ALRNS  KGW+S LVDPAQK ITSSAHRLFS+VFRKRLPPPPPSLP+SRE NDE E KNQEEVA
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Query:  ADPPGTQEGTNPGFVPSISSNNTHRVTDLEQILKEKTFTRSEIDRLTELLNSRIVDVPSGVEERKFELVPSTPIISYGRHEESQKSPAQDGVSTHMVSTR
        ADPPGTQEGTN  FVPSI+SNN H V+DLE+ILKEKTFTR EIDRLTELL SR+ DVPSGVE RKFE+V STP+ISY   E S K PAQ+GV  HMV T 
Subjt:  ADPPGTQEGTNPGFVPSISSNNTHRVTDLEQILKEKTFTRSEIDRLTELLNSRIVDVPSGVEERKFELVPSTPIISYGRHEESQKSPAQDGVSTHMVSTR

Query:  VMSANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLNMAA-SQKLVDSFASGDLSNSSTLSLVPRPSGNVDVIDNGFVTPRPRGRSALYSMARLPYSRVRATSS
        V++ANV DEDVASPAEIAKA+MGSRPPKATPL+M A SQK  D+FA G+ S SSTLSLVPR  GN DV +N FVTPR RGRSALYSMAR+PYSRVRAT S
Subjt:  VMSANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLNMAA-SQKLVDSFASGDLSNSSTLSLVPRPSGNVDVIDNGFVTPRPRGRSALYSMARLPYSRVRATSS

Query:  IKNTVATTDAYRAAPSSSSSQSAWEQGRLVGSNQGALKRRSSVLDNEMGSVGPIRRIRQKSNLVFSKGLSLPISGSSTSISVSGIGSETAQRFQSTKVHQ
        IKN+VATTD+YRA   +SSSQSAWEQGRL+ SNQGALKRRSSVLD+E+GSVGPIRRIR KSNL+F KGLSLP   SSTSI VSGIGSET+Q  QSTKVH 
Subjt:  IKNTVATTDAYRAAPSSSSSQSAWEQGRLVGSNQGALKRRSSVLDNEMGSVGPIRRIRQKSNLVFSKGLSLPISGSSTSISVSGIGSETAQRFQSTKVHQ

Query:  LPSSAGKALYSNETKCNLSKMSAEFENDMSPSSSFPRIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSEAKLF-VRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLEDVDSSKY
          S AGKA YS+ETK NLSKMSAE END +PSSSFP+IPLRSSEMA KILEQLDKLTPPKEKSSE KL  VRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLEDVDS+KY
Subjt:  LPSSAGKALYSNETKCNLSKMSAEFENDMSPSSSFPRIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSEAKLF-VRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLEDVDSSKY

Query:  LENVKGIPSNDAQDLTSQRNDKVEESSSLKFKAPKDKSIATSDGMVSSVPTKVAASSSGLPVSSVAPSSQTKWAFQMSAHEDFVDMEEEGYSNGPATDIS
        LENV+ I SND +DLTS++ DK E+SS LK K P DKSI+T  G+ SSVP+K   SSSGL VS V PSS TK AFQMS  EDFVDM++E YSNGP +  S
Subjt:  LENVKGIPSNDAQDLTSQRNDKVEESSSLKFKAPKDKSIATSDGMVSSVPTKVAASSSGLPVSSVAPSSQTKWAFQMSAHEDFVDMEEEGYSNGPATDIS

Query:  SGRREKVDGPLVAVSKPSDTDTTAADKSQASIHVKPS--SEMNKITDLGKSDAPATTEKSPIFSFSAASPPSITASVVDPELASRSEKIVSSEIPKAATA
          RREKVD  LVAV KPSDT+    DK QASI  KPS  SEM KI D  KSD P TTEKS IFSF  ASP S TA+V++PE  +R EKI SSE+PKAA A
Subjt:  SGRREKVDGPLVAVSKPSDTDTTAADKSQASIHVKPS--SEMNKITDLGKSDAPATTEKSPIFSFSAASPPSITASVVDPELASRSEKIVSSEIPKAATA

Query:  PLFGFGDKSPIQKELITSAPTFAFGNNVTTPTNKQNVVSDVASEGNVAPTQPAPVSTTFKFGDKATFPISGNAVTENGNKNSGSPFKFSSPLVDEKESAK
        P+FGFG+K P QK+ + S+PTF FGN VTT TN+QN V  V SEGNVAPT  A   TTFKFGDKATFPI  +  TENGN  +GSPFKF+S LV+EKE AK
Subjt:  PLFGFGDKSPIQKELITSAPTFAFGNNVTTPTNKQNVVSDVASEGNVAPTQPAPVSTTFKFGDKATFPISGNAVTENGNKNSGSPFKFSSPLVDEKESAK

Query:  VGSASIFKAESS-----FSIPSFAVSKESMSDKV-DNKSLSTGLTVSTSENVFLSSVSTSTPTPSVFSFSSPSTTSNLNNGSLAPTPSIFSSPVTSFANN
         GSAS+FK+ESS      S  SF V KESMS+K  D KS S GL+V TS N+ LSSVS STPTPS+FSFSSP+T SNL NGSL  TPS F SP  +F +N
Subjt:  VGSASIFKAESS-----FSIPSFAVSKESMSDKV-DNKSLSTGLTVSTSENVFLSSVSTSTPTPSVFSFSSPSTTSNLNNGSLAPTPSIFSSPVTSFANN

Query:  ITNQNSSIKPSLPAATSSSETITSTGLSTSAPMPSFPAAPIFKFGSSSVPSTSTSTMSALTGVGSVETKTTQVTTTFGNLSGIPPSET-LAKASSTGSSV
        ITNQNSSIKPSL AATS+SE +T+T LSTS+PMPSF AAPIFKFGSSSVPS+     SA +GVGSVETKT Q TT FGN+SGI PS+T  AK  STGSSV
Subjt:  ITNQNSSIKPSLPAATSSSETITSTGLSTSAPMPSFPAAPIFKFGSSSVPSTSTSTMSALTGVGSVETKTTQVTTTFGNLSGIPPSET-LAKASSTGSSV

Query:  FQFGAASTTSDSNKRPENSTFLPGNVPAFGAAVSSATSGVAASTQ-TPVMQFSSSSTSFGLAGNTGLSSGSSLFGSSAPASNLFSSGAGFGLASSSSAAN
        FQFGAASTTSDSNK+PE STF P +VP+FGA V  A+SGVA+STQ TPV  FSSSSTSFGL GNTGL+SG+SL GSSAPASNLF+SGA FG  SSSS AN
Subjt:  FQFGAASTTSDSNKRPENSTFLPGNVPAFGAAVSSATSGVAASTQ-TPVMQFSSSSTSFGLAGNTGLSSGSSLFGSSAPASNLFSSGAGFGLASSSSAAN

Query:  NSNSSGSGMSSSFFNWQPSSAPSFSTGFNSTPTGGFSFGLTSSSAASNSAPALFGSS--AGASTAGIFSFTSAATAASSQPAIGNSNHAFTFGSTPPANN
        NS SSG+G SSSFFNWQ SSAPSFS+GF STPTGGFSFGL SSSAAS+S+P LFGSS    AST  +FSFTSAATAA SQPA G SNH FTFGSTPPANN
Subjt:  NSNSSGSGMSSSFFNWQPSSAPSFSTGFNSTPTGGFSFGLTSSSAASNSAPALFGSS--AGASTAGIFSFTSAATAASSQPAIGNSNHAFTFGSTPPANN

Query:  DQASMEDSMAEDTVQAVAPTT--PSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTT-TPLAANPFQFGG-QQNVPTPQNPSRFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKANR
        D A+MEDSMAEDTVQ VA  T  PSFGQQPLTPPPSSGFVFGST  +PL ANPFQFGG QQNVPTPQNP+ FQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDK+NR
Subjt:  DQASMEDSMAEDTVQAVAPTT--PSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTT-TPLAANPFQFGG-QQNVPTPQNPSRFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKANR

Query:  KYVKVKSKSRKK
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A0A6J1FKS9 nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X20.0e+0075Show/hide
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        MATERE + YEGGRGGKFQKRP+RRSHTTPYDRPP ALRNS  KGW+S LVDPAQK ITSSAHRLFS+VFRKRLPPPPPSLP+SRE NDE E KNQEEVA
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        ADPPGTQEGTN  FVPSI+SNN H V+DLE+ILKEKTFTR EIDRLTELL SR+ DVPSGVE RKFE+V STP+ISY   E S K PAQ+GV  HMV T 
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        V++ANV DEDVASPAEIAKA+MGSRPPKATPL+M A SQK  D+FA G+ S SSTLSLVPR  GN DV +N FVTPR RGRSALYSMAR+PYSRVRAT S
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        IKN+VATTD+YRA   +SSSQSAWEQGRL+ SNQGALKRRSSVLD+E+GSVGPIRRIR KSNL+F KGLSLP   SSTSI VSGIGSET+Q  QSTKVH 
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          S AGKA YS+ETK NLSKMSAE END +PSSSFP+IPLRSSEMA KILEQLDKLTPPKEKSSE KL  VRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLEDVDS+KY
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        LENV+ I SND +DLTS++ DK E+SS LK K P DKSI+T  G+ SSVP+K   SSSGL VS V PSS TK AFQMS  EDFVDM++E YSNGP +  S
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          RREKVD  LVAV KPSDT+    DK QASI  KPS  SEM KI D  KSD P TTEKS IFSF  ASP S TA+V++PE  +R EKI SSE+PKAA A
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        P+FGFG+K P QK+ + S+PTF FGN VTT TN+QN V  V SEGNVAPT  A   TTFKFGDKATFPI  +  TENGN  +GSPFKF+S LV+EKE AK
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         GSAS+FK+ESS S   SF V KESMS+K  D KS S GL+V TS N+ LSSVS STPTPS+FSFSSP+T SNL NGSL  TPS F SP  +F +NITNQ
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        NSSIKPSL AATS+SE +T+T LSTS+PMPSF AAPIFKFGSSSVPS+     SA +GVGSVETKT Q TT FGN+SGI PS+T  AK  STGSSVFQFG
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        AASTTSDSNK+PE STF P +VP+FGA V  A+SGVA+STQ TPV  FSSSSTSFGL GNTGL+SG+SL GSSAPASNLF+SGA FG  SSSS ANNS S
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Query:  SGSGMSSSFFNWQPSSAPSFSTGFNSTPTGGFSFGLTSSSAASNSAPALFGSS--AGASTAGIFSFTSAATAASSQPAIGNSNHAFTFGSTPPANNDQAS
        SG+G SSSFFNWQ SSAPSFS+GF STPTGGFSFGL SSSAAS+S+P LFGSS    AST  +FSFTSAATAA SQPA G SNH FTFGSTPPANND A+
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        MEDSMAEDTVQ VA  T  PSFGQQPLTPPPSSGFVFGST  +PL ANPFQFGG QQNVPTPQNP+ FQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDK+NRK+VK
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Query:  VKSKSRKK
        VKSKSRKK
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A0A6J1JQT4 nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X10.0e+0074.54Show/hide
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        MATEREE+RYEGGRGGKFQKRP+RR+HTTPYDRPP ALRNSA KGW+S LVDPAQK ITSSAHRLFS+VFRKRLPPPPPSLP+ RE NDE E KNQEEVA
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        AD PGTQEGTN  FVPSI+SNN H V+DLE+ILKEKTFTR EIDRLTELL SR+ DVPSGVE RKFE VPSTP+ISY   E S K PAQ+ V  HMV   
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        V++ANV DEDVASPAEIAKA+MGSRPPKATPL+M A SQK  D+FA G+ S SSTLSLVPR  GN DV +N FVTPR RGRSALYSMAR+PYSRVRAT S
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Query:  IKNTVATTDAYRAAPSSSSSQSAWEQGRLVGSNQGALKRRSSVLDNEMGSVGPIRRIRQKSNLVFSKGLSLPISGSSTSISVSGIGSETAQRFQSTKVHQ
        IKN+VATTD+YRA+  +SSSQSAWEQGRL+ SNQGALKRRSSVLD+E+GSVGPIRRIR KSNL+F KGLSLP   SSTSI VSGIGSET Q  QSTKVH 
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        LENV+ I SND +DLTS++NDK E+SS LK + P DKSI+T  G+ SSVP+K   SSSGL VS V PSS TK AFQMS  EDFVDM++E YSNGP    S
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Query:  SGRREKVDGPLVAVSKPSDTDTTAADKSQASIHVKPS--SEMNKITDLGKSDAPATTEKSPIFSFSAASPPSITASVVDPELASRSEKIVSSEIPKAATA
          RREKVD  LVAV KPSD +    DK QASI  KPS  SEM KI D  KSD P TTEKS IFSF  ASP S TA+V++PE  +R EKI  SE+PKAA A
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        P+FGFG+K P QK+ + S+PTF FGN VTT TN+QN V  V SEGNVAPT  A   TTFKFGDKATFPI  +  TENGN  +GSPFKF+S LV+EKE AK
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         GSAS+FK+ESS      SI SF V KE MS+K  D KS S GL+V TS N+ LSSVS STPTPS+FSFSSP+T SNL NGSL  TPS F SP  +F +N
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        ITNQNSSIKPSL AATS+SE +T+T LSTS+PMPSF AAPIFKFGSSSVPST     SA  G GSVETKT Q TT FGN+SGI PS+T  AK  STGSSV
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Query:  FQFGAASTTSDSNKRPENSTFLPGNVPAFGAAVSSATSGVAASTQ-TPVMQFSSSSTSFGLAGNTGLSSGSSLFGSSAPASNLFSSGAGFGLASSSSAAN
        FQFGAASTTSDSNK PE STF P +VP+FGA V  A+SGVA+STQ TPV  FSSSSTSFGL GNTGL+SG+SL GSSAPASNLF+SGA FG  SSSS AN
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Query:  NSNSSGSGMSSSFFNWQPSSAPSFSTGFNSTPTGGFSFGLTSSSAASNSAPALFGSSA--GASTAGIFSFTSAATAASSQPAIGNSNHAFTFGSTPPANN
        NS SSG+G SSSFFNWQ SS PSFS+GF STPTGGFSFGL SSSAAS+SAP LFGSS+   AST  +FSFTSAATAASSQPA GNSNH FTFGSTPPANN
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Query:  DQASMEDSMAEDTVQAVAPTT--PSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTT-TPLAANPFQFGG-QQNVPTPQNPSRFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKANR
        D A+MEDSMAEDTVQ VA  T  PSFGQQPLTPPPSSGF+FGST  +PL ANPFQFGG QQNV TPQNP+ FQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDK+NR
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Query:  KYVKVKSKSRKK
        K+VKVKSKSRKK
Subjt:  KYVKVKSKSRKK

A0A6J1K059 nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X20.0e+0074.77Show/hide
Query:  MATEREEIRYEGGRGGKFQKRPVRRSHTTPYDRPPTALRNSARKGWVSTLVDPAQKFITSSAHRLFSTVFRKRLPPPPPSLPLSREGNDETENKNQEEVA
        MATEREE+RYEGGRGGKFQKRP+RR+HTTPYDRPP ALRNSA KGW+S LVDPAQK ITSSAHRLFS+VFRKRLPPPPPSLP+ RE NDE E KNQEEVA
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Query:  ADPPGTQEGTNPGFVPSISSNNTHRVTDLEQILKEKTFTRSEIDRLTELLNSRIVDVPSGVEERKFELVPSTPIISYGRHEESQKSPAQDGVSTHMVSTR
        AD PGTQEGTN  FVPSI+SNN H V+DLE+ILKEKTFTR EIDRLTELL SR+ DVPSGVE RKFE VPSTP+ISY   E S K PAQ+ V  HMV   
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Query:  VMSANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLNMAA-SQKLVDSFASGDLSNSSTLSLVPRPSGNVDVIDNGFVTPRPRGRSALYSMARLPYSRVRATSS
        V++ANV DEDVASPAEIAKA+MGSRPPKATPL+M A SQK  D+FA G+ S SSTLSLVPR  GN DV +N FVTPR RGRSALYSMAR+PYSRVRAT S
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Query:  IKNTVATTDAYRAAPSSSSSQSAWEQGRLVGSNQGALKRRSSVLDNEMGSVGPIRRIRQKSNLVFSKGLSLPISGSSTSISVSGIGSETAQRFQSTKVHQ
        IKN+VATTD+YRA+  +SSSQSAWEQGRL+ SNQGALKRRSSVLD+E+GSVGPIRRIR KSNL+F KGLSLP   SSTSI VSGIGSET Q  QSTKVH 
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        LENV+ I SND +DLTS++NDK E+SS LK + P DKSI+T  G+ SSVP+K   SSSGL VS V PSS TK AFQMS  EDFVDM++E YSNGP    S
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Query:  SGRREKVDGPLVAVSKPSDTDTTAADKSQASIHVKPS--SEMNKITDLGKSDAPATTEKSPIFSFSAASPPSITASVVDPELASRSEKIVSSEIPKAATA
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Query:  VGSASIFKAE-SSFSIPSFAVSKESMSDKV-DNKSLSTGLTVSTSENVFLSSVSTSTPTPSVFSFSSPSTTSNLNNGSLAPTPSIFSSPVTSFANNITNQ
         GSAS+FK+E SS SI SF V KE MS+K  D KS S GL+V TS N+ LSSVS STPTPS+FSFSSP+T SNL NGSL  TPS F SP  +F +NITNQ
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Query:  NSSIKPSLPAATSSSETITSTGLSTSAPMPSFPAAPIFKFGSSSVPSTSTSTMSALTGVGSVETKTTQVTTTFGNLSGIPPSET-LAKASSTGSSVFQFG
        NSSIKPSL AATS+SE +T+T LSTS+PMPSF AAPIFKFGSSSVPST     SA  G GSVETKT Q TT FGN+SGI PS+T  AK  STGSSVFQFG
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Query:  AASTTSDSNKRPENSTFLPGNVPAFGAAVSSATSGVAASTQ-TPVMQFSSSSTSFGLAGNTGLSSGSSLFGSSAPASNLFSSGAGFGLASSSSAANNSNS
        AASTTSDSNK PE STF P +VP+FGA V  A+SGVA+STQ TPV  FSSSSTSFGL GNTGL+SG+SL GSSAPASNLF+SGA FG  SSSS ANNS S
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Query:  SGSGMSSSFFNWQPSSAPSFSTGFNSTPTGGFSFGLTSSSAASNSAPALFGSSA--GASTAGIFSFTSAATAASSQPAIGNSNHAFTFGSTPPANNDQAS
        SG+G SSSFFNWQ SS PSFS+GF STPTGGFSFGL SSSAAS+SAP LFGSS+   AST  +FSFTSAATAASSQPA GNSNH FTFGSTPPANND A+
Subjt:  SGSGMSSSFFNWQPSSAPSFSTGFNSTPTGGFSFGLTSSSAASNSAPALFGSSA--GASTAGIFSFTSAATAASSQPAIGNSNHAFTFGSTPPANNDQAS

Query:  MEDSMAEDTVQAVAPTT--PSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTT-TPLAANPFQFGG-QQNVPTPQNPSRFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKANRKYVK
        MEDSMAEDTVQ VA  T  PSFGQQPLTPPPSSGF+FGST  +PL ANPFQFGG QQNV TPQNP+ FQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDK+NRK+VK
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Query:  VKSKSRKK
        VKSKSRKK
Subjt:  VKSKSRKK

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9CAF4 Nuclear pore complex protein NUP12.2e-10634.65Show/hide
Query:  GRGGKFQKRPVRRSHTTPYDRPPTALRNSA-------RKGWVSTLVDPAQKFITSSAHRLFSTVFRKRL---------PPPPPSLPLSREGNDETENKNQ
        G GGKF+K   RRS  TPYDRP T++RN+          GW+S LVDPAQ+ IT SA RLF ++ RKRL         P     LP  R  N ET+  ++
Subjt:  GRGGKFQKRPVRRSHTTPYDRPPTALRNSA-------RKGWVSTLVDPAQKFITSSAHRLFSTVFRKRL---------PPPPPSLPLSREGNDETENKNQ

Query:  EEVA----ADPPGTQEGTNPGFVPSISSNNTHRVTDLEQILKEKTFTRSEIDRLTELLNSRIVDVPSGVEERKFELVPSTPIISYGRHEESQKSPAQDGV
        E+V+     +     E TN    P          TDLE+IL+ KTFTRSE+DRLT LL S+  D  +  EE++ E+     ++ +    E  ++   +G 
Subjt:  EEVA----ADPPGTQEGTNPGFVPSISSNNTHRVTDLEQILKEKTFTRSEIDRLTELLNSRIVDVPSGVEERKFELVPSTPIISYGRHEESQKSPAQDGV

Query:  STHMVSTRVMSANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATP--LNMAASQKLVDSFASGDL---SNSSTLSLVPRPSGNVDVIDNGFVTPRPRGRSALYSMA
           +VST   S   LDE +ASPA++AKAYMGSRP + TP  L +       DS           S T+SLV +PSG    ++NGFVTPR RGRSA+YSMA
Subjt:  STHMVSTRVMSANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATP--LNMAASQKLVDSFASGDL---SNSSTLSLVPRPSGNVDVIDNGFVTPRPRGRSALYSMA

Query:  RLPYSRVRATSSIKNTVATTDAYRAAPSSSSSQSAWEQGRLVGSNQG---ALKRRSSVLDNEMGSVGPIRRIRQKSNLVFSKGLSLPISGSSTSISVSGI
        R PYSR +++  I +       ++A+PS       WE+    GS QG    LKRRSSVLDN++GSVGP+RRIRQKSNL  S+ L+LP+S S  S+  +G 
Subjt:  RLPYSRVRATSSIKNTVATTDAYRAAPSSSSSQSAWEQGRLVGSNQG---ALKRRSSVLDNEMGSVGPIRRIRQKSNLVFSKGLSLPISGSSTSISVSGI

Query:  GSETAQRFQSTKVHQLPSSAGKALYSNETKCNLSKMSAEFENDMSPSSSFPRIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSEAKLFVRNNSPMKLSPSMLHG
                                   E   + SK SAE   D+ P SSF  +P +SSEMASKIL+QLDKL   +EK           SP KLSPSML G
Subjt:  GSETAQRFQSTKVHQLPSSAGKALYSNETKCNLSKMSAEFENDMSPSSSFPRIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSEAKLFVRNNSPMKLSPSMLHG

Query:  PALRSLEDVDSSKYLENVKGIPSNDAQDLTSQRNDKVEESSSLKFKAPKDKSIATSDGMV---SSVPTKVAASSSGLPV-SSVAPSSQTKWAFQMSAHED
        PAL+SL++V++ K+L N+    +N + D + Q+ +   ES S +  A  +K+    DG     SS    +      +P+ +S+      K +F+MSAHED
Subjt:  PALRSLEDVDSSKYLENVKGIPSNDAQDLTSQRNDKVEESSSLKFKAPKDKSIATSDGMV---SSVPTKVAASSSGLPV-SSVAPSSQTKWAFQMSAHED

Query:  FVDMEEE-GYSNGPATDISSGRREKVDGPLVAV-----------SKPSDTDTTAADKSQASIHVKPSSEMNKITDLG-KSDAPATTEKSPIFSFSAASPP
        F++++++ G ++ P          +V+   +++           + PS +  +  D SQ + +    +E NK      ++   +     P   F   +  
Subjt:  FVDMEEE-GYSNGPATDISSGRREKVDGPLVAV-----------SKPSDTDTTAADKSQASIHVKPSSEMNKITDLG-KSDAPATTEKSPIFSFSAASPP

Query:  SITASVVDPELASRSEKIVSSEIPK--AATAPLFGF------------GDKSPIQKELITSAPTFAFGNNVTTPTNKQNVVSDVASEGNVAPTQPAPVST
        S  +S       +  EK +  E PK  AA  P   F            G  + I+ E  TS+  F        PT  +   S+ AS G  + T  AP   
Subjt:  SITASVVDPELASRSEKIVSSEIPK--AATAPLFGF------------GDKSPIQKELITSAPTFAFGNNVTTPTNKQNVVSDVASEGNVAPTQPAPVST

Query:  TFKFGDKATFPISGNAVT---ENGNKNSGSPFKFSSPLVDEKESAKVGSASIFKAESSFSIPSFAVSKESMSDKVDNKSLSTGLTVSTSENVFLSSVSTS
             + + F    NAVT    NG+  S   F                  SI    S  S+     + +S +   ++ S+   L  S   N   +S S  
Subjt:  TFKFGDKATFPISGNAVT---ENGNKNSGSPFKFSSPLVDEKESAKVGSASIFKAESSFSIPSFAVSKESMSDKVDNKSLSTGLTVSTSENVFLSSVSTS

Query:  TPTPSVFSFSSPSTTSNLNNGSLAPTPSIFSSPVTSFANNITNQNSSIKPSLPAATSS------SETITSTGLSTSAPMPSFPAAPIFKFGSSSV-----
        + T S F F  P+          AP    FS+P  S ++   ++ + +K +    TS+      +    STG+   A      + P F FGSSSV     
Subjt:  TPTPSVFSFSSPSTTSNLNNGSLAPTPSIFSSPVTSFANNITNQNSSIKPSLPAATSS------SETITSTGLSTSAPMPSFPAAPIFKFGSSSV-----

Query:  --PSTST-----STMSALTGVGSVETKTTQVT--------TTFGN---------LSGIPPSETLAKASSTGSSVFQFGAASTTSDSNKRPENST-FLPGN
          PST+      S+ S + GV S  T  T+ +        T  GN          +    S     ++STGSSVF F A S+ S ++ + + S  F  GN
Subjt:  --PSTST-----STMSALTGVGSVETKTTQVT--------TTFGN---------LSGIPPSETLAKASSTGSSVFQFGAASTTSDSNKRPENST-FLPGN

Query:  VPAFGAAVSSATSGVAASTQTPVMQFSS--SSTSFGLAGNTGLSSGSSLFGSSAPASNLFSSGAGFGLASSSSAANNSNSSGSGMSSSFF--NWQ-----
             A   +  SG   STQ+   QF S  S+ SFGL+GN+ L+S SS FG S     +F+S +   L+S++S+A    SS S MSS  F  +WQ     
Subjt:  VPAFGAAVSSATSGVAASTQTPVMQFSS--SSTSFGLAGNTGLSSGSSLFGSSAPASNLFSSGAGFGLASSSSAANNSNSSGSGMSSSFF--NWQ-----

Query:  PSSAPSFSTGF--NSTPTGGFSFGLTSSSAASNSAPALFGSSAG--ASTAGIFSFTSAATAASSQPAIGNSN--HAFTFGSTPPA-------------NN
        P+S P FS+ F  +STPT  FSFG +S++  S++   +FG+S     S + IF F S       QP  GNS       FG++ P              NN
Subjt:  PSSAPSFSTGF--NSTPTGGFSFGLTSSSAASNSAPALFGSSAG--ASTAGIFSFTSAATAASSQPAIGNSN--HAFTFGSTPPA-------------NN

Query:  DQASMEDSMAEDTVQA--VAPTTPSFGQQPLTPPPSSGFVFG---STTTPLAANPFQFGGQQNVPTPQNPSRFQASGSLDFNASAGGSFSLGA-GGGDKA
         Q SMEDSMAEDT QA   +   P FGQ  ++  P   F FG   +T  P  ANPFQFGGQ    T QN S FQAS SL+F    GGSFSLG+ GGGDK+
Subjt:  DQASMEDSMAEDTVQA--VAPTTPSFGQQPLTPPPSSGFVFG---STTTPLAANPFQFGGQQNVPTPQNPSRFQASGSLDFNASAGGSFSLGA-GGGDKA

Query:  NRKYVKVKSKSRKK
         R+  K K  +RKK
Subjt:  NRKYVKVKSKSRKK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G10650.1 BEST Arabidopsis thaliana protein match is: nucleoporin-related (TAIR:AT5G20200.1)1.6e-10734.65Show/hide
Query:  GRGGKFQKRPVRRSHTTPYDRPPTALRNSA-------RKGWVSTLVDPAQKFITSSAHRLFSTVFRKRL---------PPPPPSLPLSREGNDETENKNQ
        G GGKF+K   RRS  TPYDRP T++RN+          GW+S LVDPAQ+ IT SA RLF ++ RKRL         P     LP  R  N ET+  ++
Subjt:  GRGGKFQKRPVRRSHTTPYDRPPTALRNSA-------RKGWVSTLVDPAQKFITSSAHRLFSTVFRKRL---------PPPPPSLPLSREGNDETENKNQ

Query:  EEVA----ADPPGTQEGTNPGFVPSISSNNTHRVTDLEQILKEKTFTRSEIDRLTELLNSRIVDVPSGVEERKFELVPSTPIISYGRHEESQKSPAQDGV
        E+V+     +     E TN    P          TDLE+IL+ KTFTRSE+DRLT LL S+  D  +  EE++ E+     ++ +    E  ++   +G 
Subjt:  EEVA----ADPPGTQEGTNPGFVPSISSNNTHRVTDLEQILKEKTFTRSEIDRLTELLNSRIVDVPSGVEERKFELVPSTPIISYGRHEESQKSPAQDGV

Query:  STHMVSTRVMSANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATP--LNMAASQKLVDSFASGDL---SNSSTLSLVPRPSGNVDVIDNGFVTPRPRGRSALYSMA
           +VST   S   LDE +ASPA++AKAYMGSRP + TP  L +       DS           S T+SLV +PSG    ++NGFVTPR RGRSA+YSMA
Subjt:  STHMVSTRVMSANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATP--LNMAASQKLVDSFASGDL---SNSSTLSLVPRPSGNVDVIDNGFVTPRPRGRSALYSMA

Query:  RLPYSRVRATSSIKNTVATTDAYRAAPSSSSSQSAWEQGRLVGSNQG---ALKRRSSVLDNEMGSVGPIRRIRQKSNLVFSKGLSLPISGSSTSISVSGI
        R PYSR +++  I +       ++A+PS       WE+    GS QG    LKRRSSVLDN++GSVGP+RRIRQKSNL  S+ L+LP+S S  S+  +G 
Subjt:  RLPYSRVRATSSIKNTVATTDAYRAAPSSSSSQSAWEQGRLVGSNQG---ALKRRSSVLDNEMGSVGPIRRIRQKSNLVFSKGLSLPISGSSTSISVSGI

Query:  GSETAQRFQSTKVHQLPSSAGKALYSNETKCNLSKMSAEFENDMSPSSSFPRIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSEAKLFVRNNSPMKLSPSMLHG
                                   E   + SK SAE   D+ P SSF  +P +SSEMASKIL+QLDKL   +EK           SP KLSPSML G
Subjt:  GSETAQRFQSTKVHQLPSSAGKALYSNETKCNLSKMSAEFENDMSPSSSFPRIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSEAKLFVRNNSPMKLSPSMLHG

Query:  PALRSLEDVDSSKYLENVKGIPSNDAQDLTSQRNDKVEESSSLKFKAPKDKSIATSDGMV---SSVPTKVAASSSGLPV-SSVAPSSQTKWAFQMSAHED
        PAL+SL++V++ K+L N+    +N + D + Q+ +   ES S +  A  +K+    DG     SS    +      +P+ +S+      K +F+MSAHED
Subjt:  PALRSLEDVDSSKYLENVKGIPSNDAQDLTSQRNDKVEESSSLKFKAPKDKSIATSDGMV---SSVPTKVAASSSGLPV-SSVAPSSQTKWAFQMSAHED

Query:  FVDMEEE-GYSNGPATDISSGRREKVDGPLVAV-----------SKPSDTDTTAADKSQASIHVKPSSEMNKITDLG-KSDAPATTEKSPIFSFSAASPP
        F++++++ G ++ P          +V+   +++           + PS +  +  D SQ + +    +E NK      ++   +     P   F   +  
Subjt:  FVDMEEE-GYSNGPATDISSGRREKVDGPLVAV-----------SKPSDTDTTAADKSQASIHVKPSSEMNKITDLG-KSDAPATTEKSPIFSFSAASPP

Query:  SITASVVDPELASRSEKIVSSEIPK--AATAPLFGF------------GDKSPIQKELITSAPTFAFGNNVTTPTNKQNVVSDVASEGNVAPTQPAPVST
        S  +S       +  EK +  E PK  AA  P   F            G  + I+ E  TS+  F        PT  +   S+ AS G  + T  AP   
Subjt:  SITASVVDPELASRSEKIVSSEIPK--AATAPLFGF------------GDKSPIQKELITSAPTFAFGNNVTTPTNKQNVVSDVASEGNVAPTQPAPVST

Query:  TFKFGDKATFPISGNAVT---ENGNKNSGSPFKFSSPLVDEKESAKVGSASIFKAESSFSIPSFAVSKESMSDKVDNKSLSTGLTVSTSENVFLSSVSTS
             + + F    NAVT    NG+  S   F                  SI    S  S+     + +S +   ++ S+   L  S   N   +S S  
Subjt:  TFKFGDKATFPISGNAVT---ENGNKNSGSPFKFSSPLVDEKESAKVGSASIFKAESSFSIPSFAVSKESMSDKVDNKSLSTGLTVSTSENVFLSSVSTS

Query:  TPTPSVFSFSSPSTTSNLNNGSLAPTPSIFSSPVTSFANNITNQNSSIKPSLPAATSS------SETITSTGLSTSAPMPSFPAAPIFKFGSSSV-----
        + T S F F  P+          AP    FS+P  S ++   ++ + +K +    TS+      +    STG+   A      + P F FGSSSV     
Subjt:  TPTPSVFSFSSPSTTSNLNNGSLAPTPSIFSSPVTSFANNITNQNSSIKPSLPAATSS------SETITSTGLSTSAPMPSFPAAPIFKFGSSSV-----

Query:  --PSTST-----STMSALTGVGSVETKTTQVT--------TTFGN---------LSGIPPSETLAKASSTGSSVFQFGAASTTSDSNKRPENST-FLPGN
          PST+      S+ S + GV S  T  T+ +        T  GN          +    S     ++STGSSVF F A S+ S ++ + + S  F  GN
Subjt:  --PSTST-----STMSALTGVGSVETKTTQVT--------TTFGN---------LSGIPPSETLAKASSTGSSVFQFGAASTTSDSNKRPENST-FLPGN

Query:  VPAFGAAVSSATSGVAASTQTPVMQFSS--SSTSFGLAGNTGLSSGSSLFGSSAPASNLFSSGAGFGLASSSSAANNSNSSGSGMSSSFF--NWQ-----
             A   +  SG   STQ+   QF S  S+ SFGL+GN+ L+S SS FG S     +F+S +   L+S++S+A    SS S MSS  F  +WQ     
Subjt:  VPAFGAAVSSATSGVAASTQTPVMQFSS--SSTSFGLAGNTGLSSGSSLFGSSAPASNLFSSGAGFGLASSSSAANNSNSSGSGMSSSFF--NWQ-----

Query:  PSSAPSFSTGF--NSTPTGGFSFGLTSSSAASNSAPALFGSSAG--ASTAGIFSFTSAATAASSQPAIGNSN--HAFTFGSTPPA-------------NN
        P+S P FS+ F  +STPT  FSFG +S++  S++   +FG+S     S + IF F S       QP  GNS       FG++ P              NN
Subjt:  PSSAPSFSTGF--NSTPTGGFSFGLTSSSAASNSAPALFGSSAG--ASTAGIFSFTSAATAASSQPAIGNSN--HAFTFGSTPPA-------------NN

Query:  DQASMEDSMAEDTVQA--VAPTTPSFGQQPLTPPPSSGFVFG---STTTPLAANPFQFGGQQNVPTPQNPSRFQASGSLDFNASAGGSFSLGA-GGGDKA
         Q SMEDSMAEDT QA   +   P FGQ  ++  P   F FG   +T  P  ANPFQFGGQ    T QN S FQAS SL+F    GGSFSLG+ GGGDK+
Subjt:  DQASMEDSMAEDTVQA--VAPTTPSFGQQPLTPPPSSGFVFG---STTTPLAANPFQFGGQQNVPTPQNPSRFQASGSLDFNASAGGSFSLGA-GGGDKA

Query:  NRKYVKVKSKSRKK
         R+  K K  +RKK
Subjt:  NRKYVKVKSKSRKK

AT4G31430.1 unknown protein3.1e-0727.31Show/hide
Query:  KRPVRRSHTTPYDRPPTALRNSARKGWVSTLVDPAQKFITSSAHRLFSTVFRKRLPPPPPSLPLSREGNDETENKNQEEVAA--DPPGTQEGTNPGFVPS
        +RPV+RS   P   P           W+S LV      I S A +  S+V          S   S E  D + + + +E     +P  T+E       PS
Subjt:  KRPVRRSHTTPYDRPPTALRNSARKGWVSTLVDPAQKFITSSAHRLFSTVFRKRLPPPPPSLPLSREGNDETENKNQEEVAA--DPPGTQEGTNPGFVPS

Query:  ISSNNTHRVTDLEQILKEKTFTRSEIDRLTELLNSRIVD---VPSGVEERKFEL----------VPSTPIISYGRHEESQKSPAQDGVSTHMVSTRVMSA
        I   ++ RV  +EQ+L ++TF R E DRL +++ +R+VD   VPS +E    +           + +T ++   +  E +KS    G S+   +T     
Subjt:  ISSNNTHRVTDLEQILKEKTFTRSEIDRLTELLNSRIVD---VPSGVEERKFEL----------VPSTPIISYGRHEESQKSPAQDGVSTHMVSTRVMSA

Query:  NVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATP
           ++   SP ++AK+YM +R P  +P
Subjt:  NVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATP

AT4G31430.3 unknown protein3.1e-0727.31Show/hide
Query:  KRPVRRSHTTPYDRPPTALRNSARKGWVSTLVDPAQKFITSSAHRLFSTVFRKRLPPPPPSLPLSREGNDETENKNQEEVAA--DPPGTQEGTNPGFVPS
        +RPV+RS   P   P           W+S LV      I S A +  S+V          S   S E  D + + + +E     +P  T+E       PS
Subjt:  KRPVRRSHTTPYDRPPTALRNSARKGWVSTLVDPAQKFITSSAHRLFSTVFRKRLPPPPPSLPLSREGNDETENKNQEEVAA--DPPGTQEGTNPGFVPS

Query:  ISSNNTHRVTDLEQILKEKTFTRSEIDRLTELLNSRIVD---VPSGVEERKFEL----------VPSTPIISYGRHEESQKSPAQDGVSTHMVSTRVMSA
        I   ++ RV  +EQ+L ++TF R E DRL +++ +R+VD   VPS +E    +           + +T ++   +  E +KS    G S+   +T     
Subjt:  ISSNNTHRVTDLEQILKEKTFTRSEIDRLTELLNSRIVD---VPSGVEERKFEL----------VPSTPIISYGRHEESQKSPAQDGVSTHMVSTRVMSA

Query:  NVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATP
           ++   SP ++AK+YM +R P  +P
Subjt:  NVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATP

AT5G20200.1 nucleoporin-related9.7e-1723.79Show/hide
Query:  GGRGGKFQKRPVRRSHTTPYDRPPTALRNSARKGWVSTLVDPAQKFITSSAHRLFSTVFRKRLPPP----PPSLPLSREG---NDETEN-------KNQE
        GG GGK +++  RR   TPY RP        R+ W+S +VDPA + I+  A R+    F      P    PP      +G   N+  +N        N+ 
Subjt:  GGRGGKFQKRPVRRSHTTPYDRPPTALRNSARKGWVSTLVDPAQKFITSSAHRLFSTVFRKRLPPP----PPSLPLSREG---NDETEN-------KNQE

Query:  EVAADPPGTQEGT---NPGFVPSISS--------NNTHRVTDLEQILKEKTFTRSEIDRLTELLNSRIVDVPS-GVEERKFELVPSTPIISYGRHEESQK
        E A+   G   GT   N G   SIS+        N+   +++LE++++ KTF+++EIDRL E+++SR +D+P    +ER  E+    P+    +   S  
Subjt:  EVAADPPGTQEGT---NPGFVPSISS--------NNTHRVTDLEQILKEKTFTRSEIDRLTELLNSRIVDVPS-GVEERKFELVPSTPIISYGRHEESQK

Query:  SPAQDGVSTHMVSTRVMSA-------------NVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLNMAASQKLVDSFASGDLSNSSTLSLVPRPS----GNVDVI
          A++ +     ++ + +               + DE   SPAE+AKAYMG +   ++     A  +      S  +  SS  S   +PS    G     
Subjt:  SPAQDGVSTHMVSTRVMSA-------------NVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLNMAASQKLVDSFASGDLSNSSTLSLVPRPS----GNVDVI

Query:  DNGFVTPRPRGRS-ALYSMARLPYSRVRATSSIKNTVATTDAYRAAPSSSSSQSAWEQGRLVGSNQGALKRRSSVLDNEMGSVGPIRRIRQKSNLVFSKG
         +GF TP+ R  S  L +  R PYSR   ++S    +   +      SS    +     + V    G L +       + G  GP RR RQ         
Subjt:  DNGFVTPRPRGRS-ALYSMARLPYSRVRATSSIKNTVATTDAYRAAPSSSSSQSAWEQGRLVGSNQGALKRRSSVLDNEMGSVGPIRRIRQKSNLVFSKG

Query:  LSLPISGSSTSISVSGIGSETAQRFQSTKVHQLPSSAGKALYSNETKCNLSKMSAEFENDMSPSSSFPRIPLRSSEMASKILEQLDKL---TPPKEKSSE
             S + + +S     S  A RF+++ + +  S AG++ Y + ++        E E           +P  SS++A  IL+ L++    + PK K++E
Subjt:  LSLPISGSSTSISVSGIGSETAQRFQSTKVHQLPSSAGKALYSNETKCNLSKMSAEFENDMSPSSSFPRIPLRSSEMASKILEQLDKL---TPPKEKSSE

Query:  AKLFVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLEDVDSSKYLENVKGIPSNDAQDLTSQRNDKVEESSSLKFKAPKDKSIATSDGMVSSVPTKVAASSSGLPVSSVA
                  +KL+ S  H  + +++E   SS  + NVK       +D +++ ++ ++   S    +   K  AT+ G + +   K A++++G+   + A
Subjt:  AKLFVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLEDVDSSKYLENVKGIPSNDAQDLTSQRNDKVEESSSLKFKAPKDKSIATSDGMVSSVPTKVAASSSGLPVSSVA

Query:  PSS----------QTKWAFQMSAHEDFVDMEEEG-----YSNG------PATDISSGRREKVDGPLVAVSKPSDTDTTAADKSQASIHVKPSSEMNKITD
         SS          + K +   S H++     ++      YS G      P     S    K   P ++V+KP       +  +        SS+      
Subjt:  PSS----------QTKWAFQMSAHEDFVDMEEEG-----YSNG------PATDISSGRREKVDGPLVAVSKPSDTDTTAADKSQASIHVKPSSEMNKITD

Query:  LGKSDAPATTEKSPIFSFSAASPPSITASVVDPELASRSEKIVSS--EIPKAATAPLFGF------GDKSP-------IQKELITSAPTFAFGNNVTTPT
                TT   P       + PSI      P +AS     +++  E  K    P F F      GDKSP       + +E+++      FG   T  +
Subjt:  LGKSDAPATTEKSPIFSFSAASPPSITASVVDPELASRSEKIVSS--EIPKAATAPLFGF------GDKSP-------IQKELITSAPTFAFGNNVTTPT

Query:  NKQNVVS
         K   +S
Subjt:  NKQNVVS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCTCTTCTCTCTTCTCTTCTTCGACATGATATCCCAGACATTGTGGGTCGTACTGATGACTGGACTCATTATTACCTTAAAGAGATCGACGTCTGTTTGGGGGTCCA
CCCTAGTGTTCAGGTCAGAACCGGATACCGGGTTCGAGCTCGATTCGTGAAGAACCGTTGTGCAAACTCTTGCATAAACAACGTCGTTGCTCACCCTTGTTGCCCGAGGG
TTTCATCCCGACCTATTAGCTTGAGAGAAGACCTTAACTCTGCGTTGCTTGCGTTTATGGCAACAGAGCGGGAGGAGATTCGCTACGAAGGAGGAAGAGGTGGGAAGTTT
CAGAAGAGGCCTGTCAGGAGGTCGCATACGACGCCGTATGATCGGCCGCCGACTGCTCTGAGGAACTCTGCTCGGAAAGGATGGGTCTCCACGCTCGTCGATCCGGCGCA
GAAGTTCATCACCTCCAGTGCCCACAGGCTGTTTTCTACTGTGTTTCGTAAACGCCTTCCTCCACCGCCGCCGTCATTGCCACTTTCGCGAGAGGGCAATGATGAGACGG
AAAATAAGAATCAGGAAGAAGTTGCAGCTGATCCTCCTGGCACTCAAGAAGGCACTAATCCTGGTTTTGTTCCAAGCATCAGTTCTAATAACACACACCGGGTGACTGAC
CTTGAGCAAATTTTGAAGGAGAAGACCTTTACAAGATCCGAGATTGATCGCTTGACTGAACTTCTGAATTCAAGAATTGTCGATGTTCCAAGTGGGGTTGAAGAGAGGAA
ATTTGAACTGGTCCCTTCAACGCCCATTATCAGTTATGGGAGACATGAAGAATCTCAAAAAAGTCCAGCTCAAGATGGAGTTAGCACTCACATGGTTTCAACTCGTGTTA
TGAGTGCAAATGTCCTTGATGAAGATGTCGCTTCACCTGCAGAGATTGCAAAAGCATACATGGGCAGCAGGCCTCCAAAAGCAACTCCATTGAATATGGCGGCAAGTCAA
AAACTTGTGGATAGTTTCGCTTCTGGCGATCTTTCGAACTCCTCTACTTTATCTCTTGTGCCAAGGCCCTCTGGCAATGTTGACGTTATTGATAATGGTTTTGTCACTCC
AAGACCTCGAGGCAGATCTGCTCTTTATAGTATGGCTCGATTGCCATATTCTAGAGTTCGTGCAACCTCTAGCATAAAGAATACTGTAGCCACTACAGATGCTTACAGGG
CAGCGCCATCATCATCATCATCTCAATCAGCATGGGAGCAAGGGAGACTTGTGGGGTCTAATCAAGGGGCTTTAAAACGCAGGAGTTCAGTGTTAGATAATGAAATGGGA
TCTGTTGGTCCTATTCGCAGAATTCGCCAGAAATCCAATCTTGTTTTCTCAAAAGGTTTGAGTTTACCAATTTCAGGCAGTTCCACATCTATTTCCGTAAGCGGAATTGG
TTCTGAGACTGCTCAACGTTTTCAGTCTACAAAGGTTCATCAGTTGCCATCTTCTGCTGGGAAGGCACTTTATTCGAATGAAACCAAGTGTAATTTGTCCAAAATGTCTG
CAGAGTTTGAAAATGATATGTCTCCTAGTTCAAGTTTTCCTCGAATTCCCCTCAGGTCAAGTGAGATGGCCTCAAAAATATTGGAGCAGCTTGATAAATTAACCCCTCCA
AAGGAAAAATCTTCTGAAGCAAAGCTGTTTGTGAGGAATAACTCACCCATGAAGTTGTCACCATCAATGTTGCATGGGCCAGCTCTTAGAAGCCTGGAAGATGTAGATTC
ATCGAAGTATTTGGAAAATGTTAAAGGCATTCCGTCTAATGATGCCCAGGATCTTACTTCTCAAAGAAATGACAAGGTTGAGGAAAGTAGTTCGTTAAAATTTAAAGCAC
CTAAAGATAAATCTATTGCTACAAGTGATGGTATGGTTTCTTCAGTGCCTACCAAGGTTGCCGCATCCAGTTCTGGTCTGCCAGTTTCATCTGTTGCCCCTTCCTCACAA
ACAAAATGGGCTTTCCAGATGAGTGCACATGAGGATTTTGTGGATATGGAGGAGGAAGGATATTCTAATGGGCCAGCAACTGATATATCAAGTGGGAGGCGAGAAAAAGT
TGATGGCCCATTAGTGGCGGTGAGCAAACCAAGTGATACTGATACCACTGCCGCAGATAAATCTCAGGCTTCAATTCATGTTAAACCGTCATCTGAAATGAACAAAATCA
CTGACCTAGGAAAATCTGATGCTCCTGCGACTACTGAAAAGAGCCCCATCTTTTCCTTTTCGGCAGCATCTCCACCTAGTATTACAGCCAGTGTGGTTGATCCTGAATTA
GCCTCGAGATCTGAAAAAATTGTTTCATCTGAAATACCAAAAGCAGCTACTGCTCCTTTATTTGGCTTTGGAGATAAGTCGCCAATACAGAAGGAATTGATTACCTCTGC
CCCCACCTTTGCGTTTGGAAACAATGTTACCACCCCAACAAATAAACAAAATGTTGTTTCTGATGTGGCTTCTGAAGGCAATGTTGCACCAACTCAACCAGCTCCTGTTT
CTACCACATTTAAATTTGGTGATAAAGCTACATTTCCTATTTCAGGAAATGCTGTTACAGAAAATGGAAATAAGAATTCAGGGTCTCCGTTTAAGTTTTCATCACCTCTA
GTTGATGAAAAAGAAAGTGCTAAAGTAGGCAGTGCTTCAATTTTTAAAGCAGAGAGTTCTTTCAGCATCCCATCATTTGCAGTTTCAAAAGAATCTATGTCGGATAAAGT
CGATAATAAGAGTTTGAGCACTGGCCTGACAGTTAGTACATCTGAAAATGTGTTTCTCTCATCTGTGTCAACCTCAACACCAACTCCGAGTGTATTTTCTTTTAGCTCGC
CTAGCACTACTTCAAATCTTAATAATGGATCTCTTGCTCCTACCCCATCTATTTTTTCTTCCCCAGTTACCTCTTTCGCTAATAATATAACAAATCAGAATTCATCCATC
AAACCCTCTCTCCCTGCTGCCACTAGCAGTAGTGAAACCATCACCTCTACTGGTCTTTCTACGTCTGCTCCTATGCCTTCTTTTCCAGCTGCACCGATTTTCAAATTTGG
AAGCTCTAGTGTTCCTTCAACTTCCACTTCAACTATGTCGGCCCTGACTGGAGTTGGTTCTGTTGAAACCAAAACCACGCAGGTGACAACAACCTTTGGTAATTTAAGTG
GCATTCCTCCTAGTGAGACCTTGGCTAAAGCGTCAAGTACTGGAAGTAGTGTTTTTCAATTTGGAGCTGCATCTACTACTTCGGATTCTAATAAACGACCAGAAAATTCA
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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