; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Moc04g33390 (gene) of Bitter gourd (OHB3-1) v2 genome

Gene IDMoc04g33390
OrganismMomordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
DescriptionRibosomal protein S14
Genome locationchr4:25147771..25149586
RNA-Seq ExpressionMoc04g33390
SyntenyMoc04g33390
Gene Ontology termsGO:0006412 - translation (biological process)
GO:0005739 - mitochondrion (cellular component)
GO:0015935 - small ribosomal subunit (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domainsIPR001209 - Ribosomal protein S14
IPR018271 - Ribosomal protein S14, conserved site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7032953.1 Ribosomal protein S14, mitochondrial, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]4.1e-4695.05Show/hide
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XP_022134507.1 uncharacterized protein LOC111006733 [Momordica charantia]6.7e-49100Show/hide
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XP_022938933.1 uncharacterized protein LOC111444996 [Cucurbita moschata]1.4e-4696.04Show/hide
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XP_023550870.1 uncharacterized protein LOC111808878 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.8e-4695.05Show/hide
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XP_038884392.1 ribosomal protein S14, mitochondrial [Benincasa hispida]1.4e-4695.05Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LSR8 Uncharacterized protein1.3e-4286.14Show/hide
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A0A1S4E169 ribosomal protein S14, mitochondrial2.0e-4387.13Show/hide
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A0A5D3CKB3 Ribosomal protein S142.0e-4387.13Show/hide
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A0A6J1C264 uncharacterized protein LOC1110067333.3e-49100Show/hide
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A0A6J1FKA4 uncharacterized protein LOC1114449966.8e-4796.04Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P05716 Ribosomal protein S14, mitochondrial4.0e-3673.47Show/hide
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P14875 Ribosomal protein S14, mitochondrial4.7e-3773.47Show/hide
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P26873 Ribosomal protein S14, mitochondrial3.9e-3169.15Show/hide
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P46752 Ribosomal protein S14, mitochondrial6.8e-2056.52Show/hide
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P49387 Ribosomal protein S14, mitochondrial2.9e-3470.41Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G34520.1 mitochondrial ribosomal protein S144.1e-3670.71Show/hide
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ATCG00330.1 chloroplast ribosomal protein S144.7e-0838.89Show/hide
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        R++L  K+ L +R   K +   PSL    + +   KL   PRNS+ TRL  RC  TGRPRA Y+ F +S  + R++    L+ G  +SSW
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CAATGATGTGCGAGAAGAGCAGCGTTATAAGCTGTCGAAGTTGCCCAGAAACAGTTCATTTACTCGACTGAGGAATCGCTGCATTTTCACCGGCCGGCCTAGGGCTGTCT
ACCAGCTTTTCCGTGTTTCTCGTATCGTTTTCCGTGATCTGGCGTCCAAAGGTCTTATAATGGGTGTCAAGAAATCCTCCTGGTTGATGGTAGAAAAGGCTTTTGTTATT
GGGGATCGATTAGCATTGTTGCGTTCTTATACTTCTACGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTCGGGGGACAAGCGGAACATTCTTGATCACTACCGCCGACAGCTCGCTGCGAAGTTTGAGTTGAAGCGGAAGCTTTACAAAGCCGTTTGCAATGATCCGAGTCTTCC
CAATGATGTGCGAGAAGAGCAGCGTTATAAGCTGTCGAAGTTGCCCAGAAACAGTTCATTTACTCGACTGAGGAATCGCTGCATTTTCACCGGCCGGCCTAGGGCTGTCT
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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