; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Moc04g36310 (gene) of Bitter gourd (OHB3-1) v2 genome

Gene IDMoc04g36310
OrganismMomordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
Descriptionmini zinc finger protein 2-like
Genome locationchr4:27273188..27273475
RNA-Seq ExpressionMoc04g36310
SyntenyMoc04g36310
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000976 - transcription regulatory region sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR006456 - ZF-HD homeobox protein, Cys/His-rich dimerisation domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
OMO61911.1 hypothetical protein COLO4_33302 [Corchorus olitorius]8.9e-4188.3Show/hide
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XP_016902406.1 PREDICTED: mini zinc finger protein 2 [Cucumis melo]2.8e-4292.71Show/hide
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XP_022134197.1 mini zinc finger protein 2-like [Momordica charantia]1.7e-47100Show/hide
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XP_034707877.1 mini zinc finger protein 2-like [Vitis riparia]5.8e-4087.23Show/hide
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XP_038890678.1 mini zinc finger protein 2-like [Benincasa hispida]4.0e-4190.62Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1R3GV65 ZF-HD dimerization-type domain-containing protein4.3e-4188.3Show/hide
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A0A1S4E2E9 mini zinc finger protein 21.3e-4292.71Show/hide
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A0A5D3CUT9 Mini zinc finger protein 21.3e-4292.71Show/hide
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A0A6J1BYZ4 mini zinc finger protein 2-like8.1e-48100Show/hide
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A0A6J1JL94 mini zinc finger protein 2-like2.8e-4088.3Show/hide
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        MRKRQVV+RREE SR+  ASS TVRSVRYGECQKNHAAGVGGYAVDGCREFMASGDEGT+  L CAACGCHRNFHRRQVGTEVVCDCSS PSNG
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
B8BIU8 Mini zinc finger protein 11.1e-2270Show/hide
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        VRY ECQ+NHAA +GG+AVDGCREFMASG EGT+  L CAACGCHR+FHRR+V      CDCSS  S+GT
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Q2Q493 Mini zinc finger protein 31.4e-2563.44Show/hide
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        M+KRQVV+++ + S    +SS    +VRY ECQKNHAA +GGYAVDGCREFMASG +     LTCAACGCHRNFHRR+V TEVVC+ S P +N
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Q2RB28 Mini zinc finger protein 11.1e-2270Show/hide
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        VRY ECQ+NHAA +GG+AVDGCREFMASG EGT+  L CAACGCHR+FHRR+V      CDCSS  S+GT
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Q9CA51 Mini zinc finger protein 12.2e-2658.59Show/hide
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        M+KRQ+V+++   + NT         ++SS  + +VRY ECQKNHAA +GGYAVDGCREFMA+G EGT   L CAACGCHRNFHR++V TEVVC+ S P
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Q9LJW5 Mini zinc finger protein 21.1e-3678.79Show/hide
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        MRKRQVVLRR   EEPSR+++ ASS TVR+VRYGECQKNHAA VGGYAVDGCREFMAS G+EGT   LTCAACGCHR+FHRR++ TEVVCDC+SPPS G
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G18835.1 mini zinc finger1.0e-2663.44Show/hide
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        M+KRQVV+++ + S    +SS    +VRY ECQKNHAA +GGYAVDGCREFMASG +     LTCAACGCHRNFHRR+V TEVVC+ S P +N
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AT1G74660.1 mini zinc finger 11.6e-2758.59Show/hide
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AT3G28917.1 mini zinc finger 27.5e-3878.79Show/hide
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AT3G50890.1 homeobox protein 281.5e-1765.45Show/hide
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        +  +Y ECQKNHAA  GG+ VDGC EFMA G+EGT G L CAAC CHR+FHR++V
Subjt:  RSVRYGECQKNHAAGVGGYAVDGCREFMASGDEGTSGELTCAACGCHRNFHRRQV

AT4G24660.1 homeobox protein 223.3e-1767.31Show/hide
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        +RY EC KNHA  +GG+AVDGC EFM SG++GT   L CAACGCHRNFHR++
Subjt:  VRYGECQKNHAAGVGGYAVDGCREFMASGDEGTSGELTCAACGCHRNFHRRQ


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGGAAGCGTCAAGTTGTGCTTAGAAGAGAAGAGCCCTCAAGAAACACAGCGGCTTCATCCTTCACAGTGAGGAGTGTTAGATACGGGGAGTGCCAGAAGAATCATGC
CGCCGGGGTCGGAGGGTACGCCGTGGACGGGTGCCGAGAATTCATGGCGAGCGGTGATGAAGGGACGAGCGGCGAGCTGACTTGCGCCGCCTGCGGTTGCCACCGGAACT
TCCATAGACGACAGGTCGGAACCGAGGTAGTTTGTGATTGCTCTTCACCTCCCTCGAATGGAACTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAGGAAGCGTCAAGTTGTGCTTAGAAGAGAAGAGCCCTCAAGAAACACAGCGGCTTCATCCTTCACAGTGAGGAGTGTTAGATACGGGGAGTGCCAGAAGAATCATGC
CGCCGGGGTCGGAGGGTACGCCGTGGACGGGTGCCGAGAATTCATGGCGAGCGGTGATGAAGGGACGAGCGGCGAGCTGACTTGCGCCGCCTGCGGTTGCCACCGGAACT
TCCATAGACGACAGGTCGGAACCGAGGTAGTTTGTGATTGCTCTTCACCTCCCTCGAATGGAACTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MRKRQVVLRREEPSRNTAASSFTVRSVRYGECQKNHAAGVGGYAVDGCREFMASGDEGTSGELTCAACGCHRNFHRRQVGTEVVCDCSSPPSNGT