; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Moc04g36410 (gene) of Bitter gourd (OHB3-1) v2 genome

Gene IDMoc04g36410
OrganismMomordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
Descriptionapidaecins type 14-like isoform X1
Genome locationchr4:27338864..27340234
RNA-Seq ExpressionMoc04g36410
SyntenyMoc04g36410
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_022133549.1 apidaecins type 14-like isoform X1 [Momordica charantia]2.0e-7465.31Show/hide
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XP_022133550.1 apidaecins type 73-like isoform X2 [Momordica charantia]7.7e-7465.16Show/hide
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XP_022134005.1 extensin-like isoform X1 [Momordica charantia]2.4e-5995.12Show/hide
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XP_022134006.1 uncharacterized protein LOC111006390 isoform X2 [Momordica charantia]2.4e-4398.89Show/hide
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XP_031758591.1 mucin-4-like [Xenopus tropicalis]5.2e-2233.07Show/hide
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            TI+     D   +     PT   PT IS ASPP    T++     D   +    F     PT IS ASPP    TI+     D   +    F    
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         PT IS ASPP    TI+     D   +     PT   PT IS ASPP    T++     D   +     PT   PT IS ASPP    TI+     D  
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        P+      T   PT IS ASPP    T++     D   +     PT   PT IS ASP     T++     D   +     PT + PT I    PPP++
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1BVK3 apidaecins type 73-like isoform X23.7e-7465.16Show/hide
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A0A6J1BWA5 apidaecins type 14-like isoform X19.8e-7565.31Show/hide
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A0A6J1BWS1 uncharacterized protein LOC111006390 isoform X21.2e-4398.89Show/hide
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A0A6J1BWU2 extensin-like isoform X11.2e-5995.12Show/hide
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S4RNY5 Uncharacterized protein8.4e-2632.35Show/hide
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        PSPR T+E+  +  PRP      HP+   T++ A+ PSPR T+ +  +  PRP       P+   T++ A+ PSPR T+ +     PRP          +
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        + A+ PSPR TVE+     PRP          ++ A+ PSPR T+E+  +  PRP         T++ A+ PSPR T+E+  H  PRP      HP+   
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         +  A+ PSPR T+E+     PRP         T++ A+ PS R T+E+     PRP          ++ A+ PSPR T+E+  +  PRP      HP+ 
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           +  A+  SPR T+E+     PRP       P+  P +
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATTAAAGGTGATCCAAGACCTAATTGCCCTACAATGTTTCACCCTACAAAGATTTCGGATGCTAGTCCTCCTCCAAGGAAGATGATTGAAGTTGAGGACTATCATGA
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ATGTTTCACCCTACAAAGATTTCGGATGCTAGTCCTCCTTCTCCAAGGAAGACGATTGAAGTTGAGGACTATCGTGATCCAAGACCTAATCGTCCTACAATGTTTCATCC
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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CCTCCTTCTCCAAGGAAGACAGTTGAAGTTGAGGATTATCATGATCCAAGACCTAATCGCCCTACAATGTTTCACCCTACAAAGATTTCGGATGCTAGTCCTCCTTCTCC
AAGGAAGACAATTGAAGTTGAGGACTATCATGATCCAAGACCTAATCGTCCTACAATGTTTCATCCTACAACGATTTCAGATGCTAGTCCTCCTTCTCCAAGGAAGACGA
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ATGCTTCACCCTACAAAAATTCCGAACATTGGCCCTCCTCCACAAGTTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MIKGDPRPNCPTMFHPTKISDASPPPRKMIEVEDYHDPRPNRPTMFHPTKVSDASPPSPRKRIEVEDYHDPRPNRSTMFHPTKISDASPPSAKKTIEVEDYHDPRPNRPT
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