; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Moc04g37830 (gene) of Bitter gourd (OHB3-1) v2 genome

Gene IDMoc04g37830
OrganismMomordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
DescriptionTPRXL protein
Genome locationchr4:28353081..28359568
RNA-Seq ExpressionMoc04g37830
SyntenyMoc04g37830
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8646577.1 hypothetical protein Csa_005771 [Cucumis sativus]5.0e-7273.04Show/hide
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XP_038885974.1 putative protein TPRXL [Benincasa hispida]1.1e-7173.82Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K7T8 Uncharacterized protein1.9e-7272.53Show/hide
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A0A1S4E178 Uncharacterized protein8.4e-7373.08Show/hide
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A0A5A7UC51 Putative serine-rich protein8.4e-7373.08Show/hide
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A0A6J1BX95 Uncharacterized protein9.1e-112100Show/hide
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A0A6J1K022 uncharacterized serine-rich protein C215.13-like5.3e-5972.54Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G06930.1 unknown protein7.9e-0737.72Show/hide
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        SS   +S  S       RRRS+           F+ G   + G SNS  S+ C+  AS  +   R C
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AT2G40475.1 unknown protein2.4e-1641.24Show/hide
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        S    SSS  SSSS P     + R+  S + S   E      D +E   S+SPTSTLC+    SS         + S+K A  S++ HGS+ ++
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AT3G56260.2 unknown protein3.1e-1145.4Show/hide
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Query:  --SSSPKLNFFKRRRSISDTPSLPFEYSFDDGDGDEPGSSNSPTSTLCFG-----GASSSRAS
          SSSP  +  KR      +P L   Y  D+         +SPTSTLC       G SSS  S
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AT5G01790.1 unknown protein6.9e-1140.62Show/hide
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        L +K Q+   F+   P   +  +  SAA  SFR+ YY GA+GA+PF WES PGTPKH  SE  ++PPLTPPPS+++ S    +  SK +   +L+ I  R
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Query:  L----------APRRSRNSPSSFSSASL
        L          A + S +SP S S   L
Subjt:  L----------APRRSRNSPSSFSSASL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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GAGCTTAAGCAGAATGGAAAATTCGAGCATCGTGGGATGAAACGCAGCAAATTGGAGCTTTTTATTGGGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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ELKQNGKFEHRGMKRSKLELFIG