; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Moc04g38660 (gene) of Bitter gourd (OHB3-1) v2 genome

Gene IDMoc04g38660
OrganismMomordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
Descriptionthylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic
Genome locationchr4:28872464..28874390
RNA-Seq ExpressionMoc04g38660
SyntenyMoc04g38660
Gene Ontology termsGO:0009534 - chloroplast thylakoid (cellular component)
InterPro domainsIPR001646 - Pentapeptide repeat
IPR044213 - Thylakoid lumenal 15kDa protein 1-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_022955559.1 thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic isoform X2 [Cucurbita moschata]1.3e-10089.91Show/hide
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XP_023552471.1 thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.8e-10090.37Show/hide
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A0A6J1BVE7 thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic isoform X22.2e-10997.71Show/hide
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A0A6J1BVJ8 thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic isoform X18.8e-114100Show/hide
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A0A6J1GU31 thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic isoform X11.9e-10089.45Show/hide
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A0A6J1GWM1 thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic isoform X26.5e-10189.91Show/hide
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A0A6J1JKT4 thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic isoform X22.1e-9989.45Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
B1WVN5 Pentapeptide repeat protein Rfr329.9e-1442.86Show/hide
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        + + LC  ADGVNP TG +TR++L C
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O22160 Thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic3.3e-7872.44Show/hide
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Q8H1Q1 Thylakoid lumenal protein TL20.3, chloroplastic1.9e-0930.96Show/hide
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Q8Z4G9 Secreted effector protein PipB25.8e-0635.51Show/hide
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                  S AN++ A  +G+T  R    G+T++GA
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Q9SE95 FH protein interacting protein FIP21.4e-0737.84Show/hide
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        R  D  G  F    L + +F ++ LR A   G  L  A+  DA L G     ADLR A    A++T ANL  ANLEGA   G    N +F+G+ ++ A  
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          V LRE   E
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G12250.1 Pentapeptide repeat-containing protein1.4e-1030.96Show/hide
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AT1G12250.2 Pentapeptide repeat-containing protein4.0e-1032.93Show/hide
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        +ANL+NA L  ++ T  +   G+ IEGADF+D  +   Q++ LCK A G NP TG  TR +L C
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AT2G44920.1 Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein5.2e-5868.62Show/hide
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AT2G44920.2 Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein2.4e-7972.44Show/hide
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         YLCKVADGVN TTGNATRDTLLCN
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AT5G55000.2 potassium channel tetramerisation domain-containing protein / pentapeptide repeat-containing protein9.9e-0937.84Show/hide
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        R  D  G  F    L + +F ++ LR A   G  L  A+  DA L G     ADLR A    A++T ANL  ANLEGA   G    N +F+G+ ++ A  
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          V LRE   E
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTCTGCTCAACGCCTCCTTATGTTGTTCCACTTCCAGAATTCCTCCCGCGCCTCACCTTCATCTTCCTCCCTCCATTTCCGCCCACCCTACGCCGCCGGTT
CTAAAGCAGCAATTGGAAGCCTCGCGGAATTTGATACTTTCCGTCGGAGAATCCGCCTCCAAAGCCACCTTCCTCGCTTTGCTTTCCGCCTCTTTGTTCCTCGCG
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GATCTCAGAGGTGCTGACTTTTCCCTGGCCAATGTTACAAAGGCTAATTTAAGCAATGCCAACCTAGAAGGTGCACTCGCCACGGGAAATACTTCGTTTCGTGGA
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ACCCGGGATACGTTGCTCTGCAATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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TRDTLLCN