; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Moc04g39720 (gene) of Bitter gourd (OHB3-1) v2 genome

Gene IDMoc04g39720
OrganismMomordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
DescriptionDUF2062 domain-containing protein
Genome locationchr4:29463999..29467382
RNA-Seq ExpressionMoc04g39720
SyntenyMoc04g39720
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR018639 - Domain of unknown function DUF2062


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6578321.1 hypothetical protein SDJN03_22769, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.6e-7882.61Show/hide
Query:  MASAGFARQTSWFSRKIVDPLLKILQRGAEPKQLAFSAALGLTLGLFPICGVTVFLCGFAIALLGSLCHAPTVMLANFIATPIELSLVVPFLRFGEAISG
        MA+ G  R TSWF++KIVDPLL+ILQRGAEPKQLAFSAALG TLGLFPICGV VFLCGFAIA LG LCHAPTVMLANF+ TPIELSLVVPFLRFGEAISG
Subjt:  MASAGFARQTSWFSRKIVDPLLKILQRGAEPKQLAFSAALGLTLGLFPICGVTVFLCGFAIALLGSLCHAPTVMLANFIATPIELSLVVPFLRFGEAISG

Query:  GPRFPFTPDALKKIFTGQASYEVLLSIAHLLLGWLVAAPFILCTGYLLFLPCFKILVSKFSTVSSSPRKPTNSHSDAKLKARDI
        GPRFPFTPDALKK+FTGQAS+EVLLSIAH+LLGWLVA PFIL  GY+LFLPCFKILV KFST +SSP+K  +SHS+ +LK RDI
Subjt:  GPRFPFTPDALKKIFTGQASYEVLLSIAHLLLGWLVAAPFILCTGYLLFLPCFKILVSKFSTVSSSPRKPTNSHSDAKLKARDI

XP_004138658.1 uncharacterized protein LOC101220662 [Cucumis sativus]7.4e-8487.5Show/hide
Query:  MASAGFARQTSWFSRKIVDPLLKILQRGAEPKQLAFSAALGLTLGLFPICGVTVFLCGFAIALLGSLCHAPTVMLANFIATPIELSLVVPFLRFGEAISG
        MA+ G AR TSWF++KIVDPLL+ILQRGAEPKQLAFSAALG+TLGLFPICGVTVFLCGFAIA LGSLCHAPTVMLANFIATPIELSLVVPFLRFGEAISG
Subjt:  MASAGFARQTSWFSRKIVDPLLKILQRGAEPKQLAFSAALGLTLGLFPICGVTVFLCGFAIALLGSLCHAPTVMLANFIATPIELSLVVPFLRFGEAISG

Query:  GPRFPFTPDALKKIFTGQASYEVLLSIAHLLLGWLVAAPFILCTGYLLFLPCFKILVSKFSTVSSSPRKPTNSHSDAKLKARDI
        GPRFPFTPDALKK+FTG+AS+EVLLSIAHLLLGWLVAAPFIL  GYLLFLPCFKILV KFSTV+SSP+KP +SH+D KLK RD+
Subjt:  GPRFPFTPDALKKIFTGQASYEVLLSIAHLLLGWLVAAPFILCTGYLLFLPCFKILVSKFSTVSSSPRKPTNSHSDAKLKARDI

XP_008441199.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103485404 [Cucumis melo]8.2e-8386.96Show/hide
Query:  MASAGFARQTSWFSRKIVDPLLKILQRGAEPKQLAFSAALGLTLGLFPICGVTVFLCGFAIALLGSLCHAPTVMLANFIATPIELSLVVPFLRFGEAISG
        MA+ G AR TSWFS+KIVDPLL+ILQRGAEPKQLAFSAALG+TLGLFPICGVTVFLCGFAIA LGSLCHAPTVMLANFIATPIELSLVVPFLRFGEAISG
Subjt:  MASAGFARQTSWFSRKIVDPLLKILQRGAEPKQLAFSAALGLTLGLFPICGVTVFLCGFAIALLGSLCHAPTVMLANFIATPIELSLVVPFLRFGEAISG

Query:  GPRFPFTPDALKKIFTGQASYEVLLSIAHLLLGWLVAAPFILCTGYLLFLPCFKILVSKFSTVSSSPRKPTNSHSDAKLKARDI
        GPRFPFTPDALKK+FTG+AS+EVLLSIAHLLLGWLVAAPFIL  GYLLFLPCFKILV KFSTV+SSP+K  +SH+D +LK RD+
Subjt:  GPRFPFTPDALKKIFTGQASYEVLLSIAHLLLGWLVAAPFILCTGYLLFLPCFKILVSKFSTVSSSPRKPTNSHSDAKLKARDI

XP_022152470.1 uncharacterized protein LOC111020189 [Momordica charantia]3.2e-95100Show/hide
Query:  MASAGFARQTSWFSRKIVDPLLKILQRGAEPKQLAFSAALGLTLGLFPICGVTVFLCGFAIALLGSLCHAPTVMLANFIATPIELSLVVPFLRFGEAISG
        MASAGFARQTSWFSRKIVDPLLKILQRGAEPKQLAFSAALGLTLGLFPICGVTVFLCGFAIALLGSLCHAPTVMLANFIATPIELSLVVPFLRFGEAISG
Subjt:  MASAGFARQTSWFSRKIVDPLLKILQRGAEPKQLAFSAALGLTLGLFPICGVTVFLCGFAIALLGSLCHAPTVMLANFIATPIELSLVVPFLRFGEAISG

Query:  GPRFPFTPDALKKIFTGQASYEVLLSIAHLLLGWLVAAPFILCTGYLLFLPCFKILVSKFSTVSSSPRKPTNSHSDAKLKARDI
        GPRFPFTPDALKKIFTGQASYEVLLSIAHLLLGWLVAAPFILCTGYLLFLPCFKILVSKFSTVSSSPRKPTNSHSDAKLKARDI
Subjt:  GPRFPFTPDALKKIFTGQASYEVLLSIAHLLLGWLVAAPFILCTGYLLFLPCFKILVSKFSTVSSSPRKPTNSHSDAKLKARDI

XP_038886058.1 uncharacterized protein LOC120076335 [Benincasa hispida]2.9e-8084.78Show/hide
Query:  MASAGFARQTSWFSRKIVDPLLKILQRGAEPKQLAFSAALGLTLGLFPICGVTVFLCGFAIALLGSLCHAPTVMLANFIATPIELSLVVPFLRFGEAISG
        MA+ G AR TSWF++KIVDPLL+ILQRGAEPKQLAFSAALG+TLGLFPICGVTVFLCGFAIA LGSLCHAPTVMLANFIATPIELSLVVPFLRFGEAISG
Subjt:  MASAGFARQTSWFSRKIVDPLLKILQRGAEPKQLAFSAALGLTLGLFPICGVTVFLCGFAIALLGSLCHAPTVMLANFIATPIELSLVVPFLRFGEAISG

Query:  GPRFPFTPDALKKIFTGQASYEVLLSIAHLLLGWLVAAPFILCTGYLLFLPCFKILVSKFSTVSSSPRKPTNSHSDAKLKARDI
        G RFPFTPDA KK+FTGQAS+EVLLSIAH+LLGWLVAAPFIL  GY LFLPCFKILV KF TV+SSP+K  +SHS+ KLK RD+
Subjt:  GPRFPFTPDALKKIFTGQASYEVLLSIAHLLLGWLVAAPFILCTGYLLFLPCFKILVSKFSTVSSSPRKPTNSHSDAKLKARDI

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LSU8 DUF2062 domain-containing protein3.6e-8487.5Show/hide
Query:  MASAGFARQTSWFSRKIVDPLLKILQRGAEPKQLAFSAALGLTLGLFPICGVTVFLCGFAIALLGSLCHAPTVMLANFIATPIELSLVVPFLRFGEAISG
        MA+ G AR TSWF++KIVDPLL+ILQRGAEPKQLAFSAALG+TLGLFPICGVTVFLCGFAIA LGSLCHAPTVMLANFIATPIELSLVVPFLRFGEAISG
Subjt:  MASAGFARQTSWFSRKIVDPLLKILQRGAEPKQLAFSAALGLTLGLFPICGVTVFLCGFAIALLGSLCHAPTVMLANFIATPIELSLVVPFLRFGEAISG

Query:  GPRFPFTPDALKKIFTGQASYEVLLSIAHLLLGWLVAAPFILCTGYLLFLPCFKILVSKFSTVSSSPRKPTNSHSDAKLKARDI
        GPRFPFTPDALKK+FTG+AS+EVLLSIAHLLLGWLVAAPFIL  GYLLFLPCFKILV KFSTV+SSP+KP +SH+D KLK RD+
Subjt:  GPRFPFTPDALKKIFTGQASYEVLLSIAHLLLGWLVAAPFILCTGYLLFLPCFKILVSKFSTVSSSPRKPTNSHSDAKLKARDI

A0A1S3B2V5 uncharacterized protein LOC1034854044.0e-8386.96Show/hide
Query:  MASAGFARQTSWFSRKIVDPLLKILQRGAEPKQLAFSAALGLTLGLFPICGVTVFLCGFAIALLGSLCHAPTVMLANFIATPIELSLVVPFLRFGEAISG
        MA+ G AR TSWFS+KIVDPLL+ILQRGAEPKQLAFSAALG+TLGLFPICGVTVFLCGFAIA LGSLCHAPTVMLANFIATPIELSLVVPFLRFGEAISG
Subjt:  MASAGFARQTSWFSRKIVDPLLKILQRGAEPKQLAFSAALGLTLGLFPICGVTVFLCGFAIALLGSLCHAPTVMLANFIATPIELSLVVPFLRFGEAISG

Query:  GPRFPFTPDALKKIFTGQASYEVLLSIAHLLLGWLVAAPFILCTGYLLFLPCFKILVSKFSTVSSSPRKPTNSHSDAKLKARDI
        GPRFPFTPDALKK+FTG+AS+EVLLSIAHLLLGWLVAAPFIL  GYLLFLPCFKILV KFSTV+SSP+K  +SH+D +LK RD+
Subjt:  GPRFPFTPDALKKIFTGQASYEVLLSIAHLLLGWLVAAPFILCTGYLLFLPCFKILVSKFSTVSSSPRKPTNSHSDAKLKARDI

A0A6J1DE06 uncharacterized protein LOC1110201891.5e-95100Show/hide
Query:  MASAGFARQTSWFSRKIVDPLLKILQRGAEPKQLAFSAALGLTLGLFPICGVTVFLCGFAIALLGSLCHAPTVMLANFIATPIELSLVVPFLRFGEAISG
        MASAGFARQTSWFSRKIVDPLLKILQRGAEPKQLAFSAALGLTLGLFPICGVTVFLCGFAIALLGSLCHAPTVMLANFIATPIELSLVVPFLRFGEAISG
Subjt:  MASAGFARQTSWFSRKIVDPLLKILQRGAEPKQLAFSAALGLTLGLFPICGVTVFLCGFAIALLGSLCHAPTVMLANFIATPIELSLVVPFLRFGEAISG

Query:  GPRFPFTPDALKKIFTGQASYEVLLSIAHLLLGWLVAAPFILCTGYLLFLPCFKILVSKFSTVSSSPRKPTNSHSDAKLKARDI
        GPRFPFTPDALKKIFTGQASYEVLLSIAHLLLGWLVAAPFILCTGYLLFLPCFKILVSKFSTVSSSPRKPTNSHSDAKLKARDI
Subjt:  GPRFPFTPDALKKIFTGQASYEVLLSIAHLLLGWLVAAPFILCTGYLLFLPCFKILVSKFSTVSSSPRKPTNSHSDAKLKARDI

A0A6J1FI05 uncharacterized protein LOC111445511 isoform X14.2e-7782.78Show/hide
Query:  MASAGFARQTSWFSRKIVDPLLKILQRGAEPKQLAFSAALGLTLGLFPICGVTVFLCGFAIALLGSLCHAPTVMLANFIATPIELSLVVPFLRFGEAISG
        MA+ G  R TSWF++KIVDPLL+ILQRGAEPKQLAFSAALG TLGLFPICGV VFLCGFAIA LG LCHAPTVMLANF+ TPIELSLVVPFLRFGEAISG
Subjt:  MASAGFARQTSWFSRKIVDPLLKILQRGAEPKQLAFSAALGLTLGLFPICGVTVFLCGFAIALLGSLCHAPTVMLANFIATPIELSLVVPFLRFGEAISG

Query:  GPRFPFTPDALKKIFTGQASYEVLLSIAHLLLGWLVAAPFILCTGYLLFLPCFKILVSKFSTVSSSPRKPTNSHSDAKLK
        GPRFPFTPDALKK+FTGQAS+EVLLSIAH+LLGWLVA PFIL  GY+LFLPCFKILV KFST +SSP+K  +SHS+ +LK
Subjt:  GPRFPFTPDALKKIFTGQASYEVLLSIAHLLLGWLVAAPFILCTGYLLFLPCFKILVSKFSTVSSSPRKPTNSHSDAKLK

A0A6J1JYI3 uncharacterized protein LOC1114894505.5e-7782.78Show/hide
Query:  MASAGFARQTSWFSRKIVDPLLKILQRGAEPKQLAFSAALGLTLGLFPICGVTVFLCGFAIALLGSLCHAPTVMLANFIATPIELSLVVPFLRFGEAISG
        MA+ G  R TSWF++KIVDPLL+ILQRGAEPKQLAFSAALG TLGLFPICGV VFLCGFAIA LG LCHAPTVMLANF+ TPIELSLVVPFLRFGEAISG
Subjt:  MASAGFARQTSWFSRKIVDPLLKILQRGAEPKQLAFSAALGLTLGLFPICGVTVFLCGFAIALLGSLCHAPTVMLANFIATPIELSLVVPFLRFGEAISG

Query:  GPRFPFTPDALKKIFTGQASYEVLLSIAHLLLGWLVAAPFILCTGYLLFLPCFKILVSKFSTVSSSPRKPTNSHSDAKLK
        GPRFPFTPDALKK+FTGQAS+EVLLSIAH+LLGWLVA PFIL  GY+LFLPCFKILV KFST +SSP+K  +SHS+ +LK
Subjt:  GPRFPFTPDALKKIFTGQASYEVLLSIAHLLLGWLVAAPFILCTGYLLFLPCFKILVSKFSTVSSSPRKPTNSHSDAKLK

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G33490.1 unknown protein2.4e-6474.38Show/hide
Query:  WFSRKIVDPLLKILQRGAEPKQLAFSAALGLTLGLFPICGVTVFLCGFAIALLGSLCHAPTVMLANFIATPIELSLVVPFLRFGEAISGGPRFPFTPDAL
        WF +KI +PL++IL+RGAEPKQLAFSAALG+T+G+FPICGVTV LCG AIA LGSLCHAPTVMLANFIATPIELSLVVPFLR GE I+GGP FP T DAL
Subjt:  WFSRKIVDPLLKILQRGAEPKQLAFSAALGLTLGLFPICGVTVFLCGFAIALLGSLCHAPTVMLANFIATPIELSLVVPFLRFGEAISGGPRFPFTPDAL

Query:  KKIFTGQASYEVLLSIAHLLLGWLVAAPFILCTGYLLFLPCFKILVSKFSTVSSSPRKPT
        KK+FTGQAS +V LSI + LLGWL+AAPF++   Y++FLPCFKILV KFS+V S+ + PT
Subjt:  KKIFTGQASYEVLLSIAHLLLGWLVAAPFILCTGYLLFLPCFKILVSKFSTVSSSPRKPT

AT4G10140.1 unknown protein2.9e-6267.05Show/hide
Query:  RQTSWFSRKIVDPLLKILQRGAEPKQLAFSAALGLTLGLFPICGVTVFLCGFAIALLGSLCHAPTVMLANFIATPIELSLVVPFLRFGEAISGGPRFPFT
        R  +WF++KI DPLL+IL+RG EPKQLAFSAALG+TLG+FPICGV V LCG A ALLGS CHAPTVMLAN IATP+EL+LVVPFLR GE ++GGP FP T
Subjt:  RQTSWFSRKIVDPLLKILQRGAEPKQLAFSAALGLTLGLFPICGVTVFLCGFAIALLGSLCHAPTVMLANFIATPIELSLVVPFLRFGEAISGGPRFPFT

Query:  PDALKKIFTGQASYEVLLSIAHLLLGWLVAAPFILCTGYLLFLPCFKILVSKFSTVSSSPRKPTNSHSDAKLKARD
         DALKK+FTGQAS EV LSI + LLGWLVA PF   T Y++ LPCF ILV KF  V+S+ + PT+  ++   K RD
Subjt:  PDALKKIFTGQASYEVLLSIAHLLLGWLVAAPFILCTGYLLFLPCFKILVSKFSTVSSSPRKPTNSHSDAKLKARD


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCATCAGCAGGATTTGCCCGTCAGACAAGTTGGTTTAGCCGGAAGATCGTCGATCCTCTCCTCAAAATCCTCCAGAGGGGTGCAGAGCCAAAACAATTGGCATTCTC
GGCAGCTCTCGGCCTAACCCTGGGATTGTTTCCTATATGCGGGGTCACTGTCTTCCTATGTGGGTTTGCAATTGCATTGCTTGGATCTCTTTGTCATGCTCCAACAGTGA
TGCTTGCTAACTTTATTGCTACTCCCATAGAATTGAGTTTGGTGGTGCCTTTCTTGCGCTTTGGTGAAGCCATTTCTGGGGGACCTCGTTTCCCATTTACACCTGATGCT
TTGAAGAAAATTTTTACTGGCCAAGCTTCGTATGAAGTGCTATTGAGTATTGCTCATTTGTTGTTGGGATGGCTTGTCGCTGCACCCTTCATTTTGTGCACTGGATATCT
ACTGTTTTTACCATGTTTCAAGATTTTGGTCAGTAAGTTCAGCACTGTTTCTTCAAGCCCAAGGAAGCCAACTAATTCACACTCTGATGCTAAACTGAAGGCGAGGGATA
TCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCATCAGCAGGATTTGCCCGTCAGACAAGTTGGTTTAGCCGGAAGATCGTCGATCCTCTCCTCAAAATCCTCCAGAGGGGTGCAGAGCCAAAACAATTGGCATTCTC
GGCAGCTCTCGGCCTAACCCTGGGATTGTTTCCTATATGCGGGGTCACTGTCTTCCTATGTGGGTTTGCAATTGCATTGCTTGGATCTCTTTGTCATGCTCCAACAGTGA
TGCTTGCTAACTTTATTGCTACTCCCATAGAATTGAGTTTGGTGGTGCCTTTCTTGCGCTTTGGTGAAGCCATTTCTGGGGGACCTCGTTTCCCATTTACACCTGATGCT
TTGAAGAAAATTTTTACTGGCCAAGCTTCGTATGAAGTGCTATTGAGTATTGCTCATTTGTTGTTGGGATGGCTTGTCGCTGCACCCTTCATTTTGTGCACTGGATATCT
ACTGTTTTTACCATGTTTCAAGATTTTGGTCAGTAAGTTCAGCACTGTTTCTTCAAGCCCAAGGAAGCCAACTAATTCACACTCTGATGCTAAACTGAAGGCGAGGGATA
TCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MASAGFARQTSWFSRKIVDPLLKILQRGAEPKQLAFSAALGLTLGLFPICGVTVFLCGFAIALLGSLCHAPTVMLANFIATPIELSLVVPFLRFGEAISGGPRFPFTPDA
LKKIFTGQASYEVLLSIAHLLLGWLVAAPFILCTGYLLFLPCFKILVSKFSTVSSSPRKPTNSHSDAKLKARDI