; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Moc05g34010 (gene) of Bitter gourd (OHB3-1) v2 genome

Gene IDMoc05g34010
OrganismMomordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
Description50S ribosomal protein L17
Genome locationchr5:25314088..25316256
RNA-Seq ExpressionMoc05g34010
SyntenyMoc05g34010
Gene Ontology termsGO:0006412 - translation (biological process)
GO:0022625 - cytosolic large ribosomal subunit (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domainsIPR000456 - Ribosomal protein L17
IPR036373 - Ribosomal protein L17 superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004137669.1 50S ribosomal protein L17, chloroplastic [Cucumis sativus]4.8e-9285.58Show/hide
Query:  MAFT--TAATNSRWSLTALRAALPSVGVEIHTPARVSFPSATGRVSCRTCSKPIASFSGLCPLNPLISTGLSDFDSFEHNFTIVDSGCRYFAMRHGKRVP
        MA T  TA  N RWS T LR+ALPSVG EI T  RVSFP +  RVS RTCSKPIASFSGLCPLNPLISTG +D++ FEHNF IVD+G R FAMRHGKRVP
Subjt:  MAFT--TAATNSRWSLTALRAALPSVGVEIHTPARVSFPSATGRVSCRTCSKPIASFSGLCPLNPLISTGLSDFDSFEHNFTIVDSGCRYFAMRHGKRVP

Query:  KLNRPPDQRRALLRGLTTQLLKHGRIKTTRARASAMRKYVDKMITLAKEGSLHKRRQALGFVYEKQIVHALFAEVQDRYGERNGGYTRIIRTLPRRGDNA
        KLNRPPDQRRALLRGLTTQLLKHGRIKTTR RASAMRKYVDKMITLAK+GSLHKRRQALGF+YEKQIVHALFAEVQDRYGERNGGYTRIIRTLPRRGDNA
Subjt:  KLNRPPDQRRALLRGLTTQLLKHGRIKTTRARASAMRKYVDKMITLAKEGSLHKRRQALGFVYEKQIVHALFAEVQDRYGERNGGYTRIIRTLPRRGDNA

Query:  PMAYIELV
        PMAYIELV
Subjt:  PMAYIELV

XP_008442307.1 PREDICTED: 50S ribosomal protein L17 [Cucumis melo]7.5e-9385.92Show/hide
Query:  MAFTTAATNSRWSLTALRAALPSVGVEIHTPARVSFPSATGRVSCRTCSKPIASFSGLCPLNPLISTGLSDFDSFEHNFTIVDSGCRYFAMRHGKRVPKL
        MA TTA  N RWS T LR+ALPSVG E  T  RVSFP +  RVS RTCSKPIASFSGLCPLNPLISTG +D++ FEHNF IVD+G R FAMRHGKRVPKL
Subjt:  MAFTTAATNSRWSLTALRAALPSVGVEIHTPARVSFPSATGRVSCRTCSKPIASFSGLCPLNPLISTGLSDFDSFEHNFTIVDSGCRYFAMRHGKRVPKL

Query:  NRPPDQRRALLRGLTTQLLKHGRIKTTRARASAMRKYVDKMITLAKEGSLHKRRQALGFVYEKQIVHALFAEVQDRYGERNGGYTRIIRTLPRRGDNAPM
        NRPPDQRRALLRGLTTQLLKHGRIKTTR RASAMRKYVDKMITLAK+GSLHKRRQALGF+YEKQIVHALFAEVQDRYGERNGGYTRIIRTLPRRGDNAPM
Subjt:  NRPPDQRRALLRGLTTQLLKHGRIKTTRARASAMRKYVDKMITLAKEGSLHKRRQALGFVYEKQIVHALFAEVQDRYGERNGGYTRIIRTLPRRGDNAPM

Query:  AYIELV
        AYIELV
Subjt:  AYIELV

XP_022157331.1 50S ribosomal protein L17, chloroplastic [Momordica charantia]7.9e-111100Show/hide
Query:  MAFTTAATNSRWSLTALRAALPSVGVEIHTPARVSFPSATGRVSCRTCSKPIASFSGLCPLNPLISTGLSDFDSFEHNFTIVDSGCRYFAMRHGKRVPKL
        MAFTTAATNSRWSLTALRAALPSVGVEIHTPARVSFPSATGRVSCRTCSKPIASFSGLCPLNPLISTGLSDFDSFEHNFTIVDSGCRYFAMRHGKRVPKL
Subjt:  MAFTTAATNSRWSLTALRAALPSVGVEIHTPARVSFPSATGRVSCRTCSKPIASFSGLCPLNPLISTGLSDFDSFEHNFTIVDSGCRYFAMRHGKRVPKL

Query:  NRPPDQRRALLRGLTTQLLKHGRIKTTRARASAMRKYVDKMITLAKEGSLHKRRQALGFVYEKQIVHALFAEVQDRYGERNGGYTRIIRTLPRRGDNAPM
        NRPPDQRRALLRGLTTQLLKHGRIKTTRARASAMRKYVDKMITLAKEGSLHKRRQALGFVYEKQIVHALFAEVQDRYGERNGGYTRIIRTLPRRGDNAPM
Subjt:  NRPPDQRRALLRGLTTQLLKHGRIKTTRARASAMRKYVDKMITLAKEGSLHKRRQALGFVYEKQIVHALFAEVQDRYGERNGGYTRIIRTLPRRGDNAPM

Query:  AYIELV
        AYIELV
Subjt:  AYIELV

XP_022971252.1 50S ribosomal protein L17, chloroplastic [Cucurbita maxima]1.8e-9184.13Show/hide
Query:  MAFT--TAATNSRWSLTALRAALPSVGVEIHTPARVSFPSATGRVSCRTCSKPIASFSGLCPLNPLISTGLSDFDSFEHNFTIVDSGCRYFAMRHGKRVP
        MA T  TA  NSRWS +++R+ALPSV V + TP+RVSFPS+ GRVS RTCSK IASFSGLCPLNPLIS G SD++SFE NFTIVD+G R FAMRHGKRVP
Subjt:  MAFT--TAATNSRWSLTALRAALPSVGVEIHTPARVSFPSATGRVSCRTCSKPIASFSGLCPLNPLISTGLSDFDSFEHNFTIVDSGCRYFAMRHGKRVP

Query:  KLNRPPDQRRALLRGLTTQLLKHGRIKTTRARASAMRKYVDKMITLAKEGSLHKRRQALGFVYEKQIVHALFAEVQDRYGERNGGYTRIIRTLPRRGDNA
        KLNRPPDQRRALLRGLTTQLLKHGRIKTTRARASA+RKYVDKMITLAK+GSLHKRRQALGF+YEKQIVHALFAEV+DRYGERNGGYTRI+RTLPRRGDNA
Subjt:  KLNRPPDQRRALLRGLTTQLLKHGRIKTTRARASAMRKYVDKMITLAKEGSLHKRRQALGFVYEKQIVHALFAEVQDRYGERNGGYTRIIRTLPRRGDNA

Query:  PMAYIELV
        PMA+IELV
Subjt:  PMAYIELV

XP_038906261.1 50S ribosomal protein L17, chloroplastic [Benincasa hispida]1.0e-9486.89Show/hide
Query:  MAFTTAATNSRWSLTALRAALPSVGVEIHTPARVSFPSATGRVSCRTCSKPIASFSGLCPLNPLISTGLSDFDSFEHNFTIVDSGCRYFAMRHGKRVPKL
        MA TTA  N RWS T LR+ALPSV  EI TP+RVSFP +  RV+ RTCSKPIASFSGLCPLNPLISTGL D++ FEHNF IVDSG R+FAMRHGKRVPKL
Subjt:  MAFTTAATNSRWSLTALRAALPSVGVEIHTPARVSFPSATGRVSCRTCSKPIASFSGLCPLNPLISTGLSDFDSFEHNFTIVDSGCRYFAMRHGKRVPKL

Query:  NRPPDQRRALLRGLTTQLLKHGRIKTTRARASAMRKYVDKMITLAKEGSLHKRRQALGFVYEKQIVHALFAEVQDRYGERNGGYTRIIRTLPRRGDNAPM
        NRPPDQRRALLRGLTTQLLKHGRIKTTR RASAMRKYVDKMITLAK+GSLHKRRQALGF+YEKQIVHALFAEVQDRYGERNGGYTRIIRTLPRRGDNAPM
Subjt:  NRPPDQRRALLRGLTTQLLKHGRIKTTRARASAMRKYVDKMITLAKEGSLHKRRQALGFVYEKQIVHALFAEVQDRYGERNGGYTRIIRTLPRRGDNAPM

Query:  AYIELV
        AYIELV
Subjt:  AYIELV

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L9N9 Uncharacterized protein2.3e-9285.58Show/hide
Query:  MAFT--TAATNSRWSLTALRAALPSVGVEIHTPARVSFPSATGRVSCRTCSKPIASFSGLCPLNPLISTGLSDFDSFEHNFTIVDSGCRYFAMRHGKRVP
        MA T  TA  N RWS T LR+ALPSVG EI T  RVSFP +  RVS RTCSKPIASFSGLCPLNPLISTG +D++ FEHNF IVD+G R FAMRHGKRVP
Subjt:  MAFT--TAATNSRWSLTALRAALPSVGVEIHTPARVSFPSATGRVSCRTCSKPIASFSGLCPLNPLISTGLSDFDSFEHNFTIVDSGCRYFAMRHGKRVP

Query:  KLNRPPDQRRALLRGLTTQLLKHGRIKTTRARASAMRKYVDKMITLAKEGSLHKRRQALGFVYEKQIVHALFAEVQDRYGERNGGYTRIIRTLPRRGDNA
        KLNRPPDQRRALLRGLTTQLLKHGRIKTTR RASAMRKYVDKMITLAK+GSLHKRRQALGF+YEKQIVHALFAEVQDRYGERNGGYTRIIRTLPRRGDNA
Subjt:  KLNRPPDQRRALLRGLTTQLLKHGRIKTTRARASAMRKYVDKMITLAKEGSLHKRRQALGFVYEKQIVHALFAEVQDRYGERNGGYTRIIRTLPRRGDNA

Query:  PMAYIELV
        PMAYIELV
Subjt:  PMAYIELV

A0A1S3B652 50S ribosomal protein L173.6e-9385.92Show/hide
Query:  MAFTTAATNSRWSLTALRAALPSVGVEIHTPARVSFPSATGRVSCRTCSKPIASFSGLCPLNPLISTGLSDFDSFEHNFTIVDSGCRYFAMRHGKRVPKL
        MA TTA  N RWS T LR+ALPSVG E  T  RVSFP +  RVS RTCSKPIASFSGLCPLNPLISTG +D++ FEHNF IVD+G R FAMRHGKRVPKL
Subjt:  MAFTTAATNSRWSLTALRAALPSVGVEIHTPARVSFPSATGRVSCRTCSKPIASFSGLCPLNPLISTGLSDFDSFEHNFTIVDSGCRYFAMRHGKRVPKL

Query:  NRPPDQRRALLRGLTTQLLKHGRIKTTRARASAMRKYVDKMITLAKEGSLHKRRQALGFVYEKQIVHALFAEVQDRYGERNGGYTRIIRTLPRRGDNAPM
        NRPPDQRRALLRGLTTQLLKHGRIKTTR RASAMRKYVDKMITLAK+GSLHKRRQALGF+YEKQIVHALFAEVQDRYGERNGGYTRIIRTLPRRGDNAPM
Subjt:  NRPPDQRRALLRGLTTQLLKHGRIKTTRARASAMRKYVDKMITLAKEGSLHKRRQALGFVYEKQIVHALFAEVQDRYGERNGGYTRIIRTLPRRGDNAPM

Query:  AYIELV
        AYIELV
Subjt:  AYIELV

A0A6J1DXR7 50S ribosomal protein L17, chloroplastic3.8e-111100Show/hide
Query:  MAFTTAATNSRWSLTALRAALPSVGVEIHTPARVSFPSATGRVSCRTCSKPIASFSGLCPLNPLISTGLSDFDSFEHNFTIVDSGCRYFAMRHGKRVPKL
        MAFTTAATNSRWSLTALRAALPSVGVEIHTPARVSFPSATGRVSCRTCSKPIASFSGLCPLNPLISTGLSDFDSFEHNFTIVDSGCRYFAMRHGKRVPKL
Subjt:  MAFTTAATNSRWSLTALRAALPSVGVEIHTPARVSFPSATGRVSCRTCSKPIASFSGLCPLNPLISTGLSDFDSFEHNFTIVDSGCRYFAMRHGKRVPKL

Query:  NRPPDQRRALLRGLTTQLLKHGRIKTTRARASAMRKYVDKMITLAKEGSLHKRRQALGFVYEKQIVHALFAEVQDRYGERNGGYTRIIRTLPRRGDNAPM
        NRPPDQRRALLRGLTTQLLKHGRIKTTRARASAMRKYVDKMITLAKEGSLHKRRQALGFVYEKQIVHALFAEVQDRYGERNGGYTRIIRTLPRRGDNAPM
Subjt:  NRPPDQRRALLRGLTTQLLKHGRIKTTRARASAMRKYVDKMITLAKEGSLHKRRQALGFVYEKQIVHALFAEVQDRYGERNGGYTRIIRTLPRRGDNAPM

Query:  AYIELV
        AYIELV
Subjt:  AYIELV

A0A6J1GDC0 50S ribosomal protein L17, chloroplastic1.3e-9083.17Show/hide
Query:  MAFT--TAATNSRWSLTALRAALPSVGVEIHTPARVSFPSATGRVSCRTCSKPIASFSGLCPLNPLISTGLSDFDSFEHNFTIVDSGCRYFAMRHGKRVP
        MA T  TA  NSRWS +++R+ALP V V + TP+RVSFPS+ GR S RTCSK IASFSGLCPLNPLIS G SD++SFE NFTIVD+G R FAMRHGKRVP
Subjt:  MAFT--TAATNSRWSLTALRAALPSVGVEIHTPARVSFPSATGRVSCRTCSKPIASFSGLCPLNPLISTGLSDFDSFEHNFTIVDSGCRYFAMRHGKRVP

Query:  KLNRPPDQRRALLRGLTTQLLKHGRIKTTRARASAMRKYVDKMITLAKEGSLHKRRQALGFVYEKQIVHALFAEVQDRYGERNGGYTRIIRTLPRRGDNA
        KLNRPPDQRRALLRGLTTQLLKHGRIKTTRARASA+RKYVDKMITLAK+GSLHKRRQALGF+YEKQIVHALFAEV+DRYGERNGGYTRI+RTLPRRGDNA
Subjt:  KLNRPPDQRRALLRGLTTQLLKHGRIKTTRARASAMRKYVDKMITLAKEGSLHKRRQALGFVYEKQIVHALFAEVQDRYGERNGGYTRIIRTLPRRGDNA

Query:  PMAYIELV
        PMA+IELV
Subjt:  PMAYIELV

A0A6J1I1G7 50S ribosomal protein L17, chloroplastic8.9e-9284.13Show/hide
Query:  MAFT--TAATNSRWSLTALRAALPSVGVEIHTPARVSFPSATGRVSCRTCSKPIASFSGLCPLNPLISTGLSDFDSFEHNFTIVDSGCRYFAMRHGKRVP
        MA T  TA  NSRWS +++R+ALPSV V + TP+RVSFPS+ GRVS RTCSK IASFSGLCPLNPLIS G SD++SFE NFTIVD+G R FAMRHGKRVP
Subjt:  MAFT--TAATNSRWSLTALRAALPSVGVEIHTPARVSFPSATGRVSCRTCSKPIASFSGLCPLNPLISTGLSDFDSFEHNFTIVDSGCRYFAMRHGKRVP

Query:  KLNRPPDQRRALLRGLTTQLLKHGRIKTTRARASAMRKYVDKMITLAKEGSLHKRRQALGFVYEKQIVHALFAEVQDRYGERNGGYTRIIRTLPRRGDNA
        KLNRPPDQRRALLRGLTTQLLKHGRIKTTRARASA+RKYVDKMITLAK+GSLHKRRQALGF+YEKQIVHALFAEV+DRYGERNGGYTRI+RTLPRRGDNA
Subjt:  KLNRPPDQRRALLRGLTTQLLKHGRIKTTRARASAMRKYVDKMITLAKEGSLHKRRQALGFVYEKQIVHALFAEVQDRYGERNGGYTRIIRTLPRRGDNA

Query:  PMAYIELV
        PMA+IELV
Subjt:  PMAYIELV

SwissProt top hitse value%identityAlignment
A2CC52 50S ribosomal protein L172.0e-4068.97Show/hide
Query:  MRHGKRVPKLNRPPDQRRALLRGLTTQLLKHGRIKTTRARASAMRKYVDKMITLAKEGSLHKRRQALGFVYEKQIVHALFAEVQDRYGERNGGYTRIIRT
        MRH  RVPKL RP DQR+A+LRGLTTQL++ GR+ TT+ARA A+R   ++MITLAK GSL  RR+A+G++Y+KQ+VHALF + QDRYG+R GGYTRIIRT
Subjt:  MRHGKRVPKLNRPPDQRRALLRGLTTQLLKHGRIKTTRARASAMRKYVDKMITLAKEGSLHKRRQALGFVYEKQIVHALFAEVQDRYGERNGGYTRIIRT

Query:  LPRRGDNAPMAYIELV
        +PRRGDNA MA IELV
Subjt:  LPRRGDNAPMAYIELV

B1XJI3 50S ribosomal protein L171.2e-4068.1Show/hide
Query:  MRHGKRVPKLNRPPDQRRALLRGLTTQLLKHGRIKTTRARASAMRKYVDKMITLAKEGSLHKRRQALGFVYEKQIVHALFAEVQDRYGERNGGYTRIIRT
        MRHG RVP+L RP DQR+ALLR LTTQL++HG++KTT+ARA A+R  VD+MITLAK+GSL  RR+ALG++Y+K +VHALFA+ +DRYG+R GGY+R++RT
Subjt:  MRHGKRVPKLNRPPDQRRALLRGLTTQLLKHGRIKTTRARASAMRKYVDKMITLAKEGSLHKRRQALGFVYEKQIVHALFAEVQDRYGERNGGYTRIIRT

Query:  LPRRGDNAPMAYIELV
        + RRGDNA MA IELV
Subjt:  LPRRGDNAPMAYIELV

O80363 50S ribosomal protein L17, chloroplastic1.8e-7368.63Show/hide
Query:  AATNSRWSLTALRAALPSVGVEIHTPARVSFPSATGRVSC---RTCSKPIASFSGLCPLNPLISTGLSDFDSFEHNFTIVDSGCRYFAMRHGKRVPKLNR
        A+ ++ WS++ L++ALPS+     +  R S   +  R+     ++ S+ + SF GL PL+PL+S    D  SFEH+FT++D+G R FAMRHG++VPKLNR
Subjt:  AATNSRWSLTALRAALPSVGVEIHTPARVSFPSATGRVSC---RTCSKPIASFSGLCPLNPLISTGLSDFDSFEHNFTIVDSGCRYFAMRHGKRVPKLNR

Query:  PPDQRRALLRGLTTQLLKHGRIKTTRARASAMRKYVDKMITLAKEGSLHKRRQALGFVYEKQIVHALFAEVQDRYGERNGGYTRIIRTLPRRGDNAPMAY
        PPDQRRALLRGLTTQLLKHGRIKTT+ARA A+RKYVDKMIT+AK+GSLHKRRQALGF+YEKQIVHALFAEV DRYGERNGGYTRIIRTLPRRGDNAPMAY
Subjt:  PPDQRRALLRGLTTQLLKHGRIKTTRARASAMRKYVDKMITLAKEGSLHKRRQALGFVYEKQIVHALFAEVQDRYGERNGGYTRIIRTLPRRGDNAPMAY

Query:  IELV
        IELV
Subjt:  IELV

P82194 50S ribosomal protein L17, chloroplastic8.1e-5885.71Show/hide
Query:  IVDSGCRYFAMRHGKRVPKLNRPPDQRRALLRGLTTQLLKHGRIKTTRARASAMRKYVDKMITLAKEGSLHKRRQALGFVYEKQIVHALFAEVQDRYGER
        ++D+G R+FAM+HG+++ +L+RP DQRRALLRGLTTQLLKHGRIKTTRA+ASAMRKYVDKMITLAKEGSLHKRRQALGF+YEKQIVHALFAEV +RYG+R
Subjt:  IVDSGCRYFAMRHGKRVPKLNRPPDQRRALLRGLTTQLLKHGRIKTTRARASAMRKYVDKMITLAKEGSLHKRRQALGFVYEKQIVHALFAEVQDRYGER

Query:  NGGYTRIIRTLPRRGDNAPMAYIELV
        NGGYTRIIRTLPRRGDNAPMAYIELV
Subjt:  NGGYTRIIRTLPRRGDNAPMAYIELV

Q9M385 50S ribosomal protein L17, chloroplastic5.6e-7571.84Show/hide
Query:  MAFTTAATNSRWSLTALRAALPSVGVEIHTPARVSFPSATGRVSCRTCSKPIASFSGLCPLNPLISTGLSDFDSFEHNFTIVDSGCRYFAMRHGKRVPKL
        MA  T + +  WS+++L++ALPS    +  P+  S    T R+   + S P  SFSGL P+NPL+S GL D+ SFE+ F IVD G R +AMRHG+RVPKL
Subjt:  MAFTTAATNSRWSLTALRAALPSVGVEIHTPARVSFPSATGRVSCRTCSKPIASFSGLCPLNPLISTGLSDFDSFEHNFTIVDSGCRYFAMRHGKRVPKL

Query:  NRPPDQRRALLRGLTTQLLKHGRIKTTRARASAMRKYVDKMITLAKEGSLHKRRQALGFVYEKQIVHALFAEVQDRYGERNGGYTRIIRTLPRRGDNAPM
        NRPPDQR+ALLRGLTTQLLKHGRIKTTRARASAMRK+VDKMITLAK+GSLHKRRQALG++YEKQIVHALFAEV DRYGERNGGYTRIIRTLPRRGDNAPM
Subjt:  NRPPDQRRALLRGLTTQLLKHGRIKTTRARASAMRKYVDKMITLAKEGSLHKRRQALGFVYEKQIVHALFAEVQDRYGERNGGYTRIIRTLPRRGDNAPM

Query:  AYIELV
        AYIELV
Subjt:  AYIELV

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G54210.1 Ribosomal protein L17 family protein4.0e-7671.84Show/hide
Query:  MAFTTAATNSRWSLTALRAALPSVGVEIHTPARVSFPSATGRVSCRTCSKPIASFSGLCPLNPLISTGLSDFDSFEHNFTIVDSGCRYFAMRHGKRVPKL
        MA  T + +  WS+++L++ALPS    +  P+  S    T R+   + S P  SFSGL P+NPL+S GL D+ SFE+ F IVD G R +AMRHG+RVPKL
Subjt:  MAFTTAATNSRWSLTALRAALPSVGVEIHTPARVSFPSATGRVSCRTCSKPIASFSGLCPLNPLISTGLSDFDSFEHNFTIVDSGCRYFAMRHGKRVPKL

Query:  NRPPDQRRALLRGLTTQLLKHGRIKTTRARASAMRKYVDKMITLAKEGSLHKRRQALGFVYEKQIVHALFAEVQDRYGERNGGYTRIIRTLPRRGDNAPM
        NRPPDQR+ALLRGLTTQLLKHGRIKTTRARASAMRK+VDKMITLAK+GSLHKRRQALG++YEKQIVHALFAEV DRYGERNGGYTRIIRTLPRRGDNAPM
Subjt:  NRPPDQRRALLRGLTTQLLKHGRIKTTRARASAMRKYVDKMITLAKEGSLHKRRQALGFVYEKQIVHALFAEVQDRYGERNGGYTRIIRTLPRRGDNAPM

Query:  AYIELV
        AYIELV
Subjt:  AYIELV

AT5G09770.1 Ribosomal protein L17 family protein1.0e-2350Show/hide
Query:  KLNRPPDQRRALLRGLTTQLLKHGRIKTTRARASAMRKYVDKMITLAKEGSLHKRRQALGFVYEKQIVHALFAEVQDRYGERNGGYTRIIRTLPRRGDNA
        KL RP   R ++LR + +QL+KH RI+TT  +A  +R+  D MI L KEGSL   R+A GFV    ++H +F E+  RY +R GGYTR++RT  R GD A
Subjt:  KLNRPPDQRRALLRGLTTQLLKHGRIKTTRARASAMRKYVDKMITLAKEGSLHKRRQALGFVYEKQIVHALFAEVQDRYGERNGGYTRIIRTLPRRGDNA

Query:  PMAYIELV
        PMAYIE +
Subjt:  PMAYIELV

AT5G64650.1 Ribosomal protein L17 family protein5.1e-2349.07Show/hide
Query:  KLNRPPDQRRALLRGLTTQLLKHGRIKTTRARASAMRKYVDKMITLAKEGSLHKRRQALGFVYEKQIVHALFAEVQDRYGERNGGYTRIIRTLPRRGDNA
        KL RP   R ++LR + +QL++H RI+TT  +A  +R+  D MI L KEGSL   R+A GFV    ++H +F E+  RY +R GGYTR++RT  R GD A
Subjt:  KLNRPPDQRRALLRGLTTQLLKHGRIKTTRARASAMRKYVDKMITLAKEGSLHKRRQALGFVYEKQIVHALFAEVQDRYGERNGGYTRIIRTLPRRGDNA

Query:  PMAYIELV
        PMAYIE +
Subjt:  PMAYIELV


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGTTTACAACGGCAGCGACCAACAGCCGATGGAGCTTAACAGCATTGAGGGCAGCGCTACCTTCTGTGGGAGTAGAGATTCATACTCCCGCTCGCGTCAGCTTCCC
GTCGGCCACTGGTCGAGTCAGTTGCAGAACCTGCAGCAAACCGATCGCCTCTTTTTCGGGTCTATGCCCTTTGAACCCTCTCATTTCTACTGGTTTATCAGATTTTGACA
GCTTTGAACATAATTTTACAATTGTTGATAGTGGTTGTCGATATTTTGCCATGAGACATGGCAAGCGGGTACCTAAGCTCAATAGGCCTCCTGACCAACGGCGTGCACTA
TTGCGAGGGCTCACTACCCAACTCCTTAAGCATGGTCGGATCAAAACCACCAGAGCGAGAGCAAGTGCTATGCGTAAGTATGTTGACAAAATGATAACATTAGCAAAGGA
AGGTTCTTTGCATAAAAGGAGACAGGCTTTAGGGTTCGTCTACGAAAAACAAATTGTCCATGCTTTATTTGCAGAAGTCCAAGATAGGTATGGGGAGAGAAATGGTGGAT
ATACCAGAATTATTAGAACACTGCCAAGGCGAGGGGACAATGCGCCTATGGCATACATTGAACTTGTCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCGTTTACAACGGCAGCGACCAACAGCCGATGGAGCTTAACAGCATTGAGGGCAGCGCTACCTTCTGTGGGAGTAGAGATTCATACTCCCGCTCGCGTCAGCTTCCC
GTCGGCCACTGGTCGAGTCAGTTGCAGAACCTGCAGCAAACCGATCGCCTCTTTTTCGGGTCTATGCCCTTTGAACCCTCTCATTTCTACTGGTTTATCAGATTTTGACA
GCTTTGAACATAATTTTACAATTGTTGATAGTGGTTGTCGATATTTTGCCATGAGACATGGCAAGCGGGTACCTAAGCTCAATAGGCCTCCTGACCAACGGCGTGCACTA
TTGCGAGGGCTCACTACCCAACTCCTTAAGCATGGTCGGATCAAAACCACCAGAGCGAGAGCAAGTGCTATGCGTAAGTATGTTGACAAAATGATAACATTAGCAAAGGA
AGGTTCTTTGCATAAAAGGAGACAGGCTTTAGGGTTCGTCTACGAAAAACAAATTGTCCATGCTTTATTTGCAGAAGTCCAAGATAGGTATGGGGAGAGAAATGGTGGAT
ATACCAGAATTATTAGAACACTGCCAAGGCGAGGGGACAATGCGCCTATGGCATACATTGAACTTGTCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAFTTAATNSRWSLTALRAALPSVGVEIHTPARVSFPSATGRVSCRTCSKPIASFSGLCPLNPLISTGLSDFDSFEHNFTIVDSGCRYFAMRHGKRVPKLNRPPDQRRAL
LRGLTTQLLKHGRIKTTRARASAMRKYVDKMITLAKEGSLHKRRQALGFVYEKQIVHALFAEVQDRYGERNGGYTRIIRTLPRRGDNAPMAYIELV