; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Moc06g03550 (gene) of Bitter gourd (OHB3-1) v2 genome

Gene IDMoc06g03550
OrganismMomordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
DescriptionVQ domain-containing protein
Genome locationchr6:2526895..2528005
RNA-Seq ExpressionMoc06g03550
SyntenyMoc06g03550
Gene Ontology termsGO:0006952 - defense response (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
InterPro domainsIPR008889 - VQ
IPR039607 - VQ motif-containing protein 8/17/18/20/21/25
IPR039832 - VQ motif-containing protein 20


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7021613.1 VQ motif-containing protein 20, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.8e-4571.26Show/hide
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XP_022135386.1 VQ motif-containing protein 20 [Momordica charantia]2.0e-8196.99Show/hide
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XP_023007145.1 VQ motif-containing protein 20-like [Cucurbita maxima]6.2e-4672.99Show/hide
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XP_023531062.1 VQ motif-containing protein 20 [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.0e-4571.26Show/hide
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XP_038876677.1 VQ motif-containing protein 20 [Benincasa hispida]7.1e-5076.19Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LKA6 VQ domain-containing protein4.8e-4470.59Show/hide
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A0A1S3BXM8 VQ motif-containing protein 201.4e-4363.98Show/hide
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A0A6J1C0L6 VQ motif-containing protein 209.9e-8296.99Show/hide
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A0A6J1EZ55 VQ motif-containing protein 20-like2.0e-4571.26Show/hide
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A0A6J1L266 VQ motif-containing protein 20-like3.0e-4672.99Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
F4HWF9 Nuclear speckle RNA-binding protein B3.6e-0432.38Show/hide
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        P PLK+  DSH  I+K   +   P      T            ++PP   PV IYT +P+IIHTHP +FM LVQ+LTG + +   + ++S + ++  + +
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         ++ +
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Q8LGD5 Protein MKS18.0e-0433.33Show/hide
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           EN
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Q9CA36 VQ motif-containing protein 8, chloroplastic1.7e-0635.83Show/hide
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        NG  P  LK+  +SH I+K+SS  S P     ++                   PVIIY HSPK+IHT   DFMALVQ+LTGL   D+    N+       
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        E +  + ++ V   DDN ++
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Q9LS54 VQ motif-containing protein 201.3e-1739.53Show/hide
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                     N  +CG  N            K I     + S+D+ESSSV+TT+EN    G V   + +
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G21320.1 nucleotide binding;nucleic acid binding2.5e-0532.38Show/hide
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        P PLK+  DSH  I+K   +   P      T            ++PP   PV IYT +P+IIHTHP +FM LVQ+LTG + +   + ++S + ++  + +
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AT1G21326.1 VQ motif-containing protein3.9e-0638.3Show/hide
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AT1G68450.1 VQ motif-containing protein1.2e-0735.83Show/hide
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        NG  P  LK+  +SH I+K+SS  S P     ++                   PVIIY HSPK+IHT   DFMALVQ+LTGL   D+    N+       
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Query:  EENKIISSKVVVTSDDNESS
        E +  + ++ V   DDN ++
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AT3G18360.1 VQ motif-containing protein9.0e-1939.53Show/hide
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        PP LK+NKDSH I+K      SPSS SS+             AKP  RHPVIIYTH+P+IIHT+P+DFMALVQKLTG++ SD++ G  +           
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AT3G18690.1 MAP kinase substrate 15.7e-0533.33Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGCCCTCAACAGCTCCATGGGAAGAGGGATAATGGCAGTACCACCGCCAATAATGGCAACGGCAATGGCAATGGATTGTGTCCGCCTCCGTTGAAGATCAATAAGGA
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ATCTTGCCTGGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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DEAGANSPNATKCGEENKIISSKVVVTSDDNESSSVVTTDENCCGSGVVEEEMKFCNKMKGAGAMEVEVHPIQHLAW