; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Moc06g03580 (gene) of Bitter gourd (OHB3-1) v2 genome

Gene IDMoc06g03580
OrganismMomordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
DescriptionMYB transcription factor
Genome locationchr6:2548543..2549465
RNA-Seq ExpressionMoc06g03580
SyntenyMoc06g03580
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
GO:0003824 - catalytic activity (molecular function)
GO:0043565 - sequence-specific DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001005 - SANT/Myb domain
IPR009057 - Homeobox-like domain superfamily
IPR017930 - Myb domain
IPR044676 - MYB-like transcription factor EOBI/EOBII-like, plant


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6587655.1 Transcription factor MYB2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]5.0e-9169.57Show/hide
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        F T +             SDP  FSD VPSWNHG      DF YPIG    + T W+++DDS  G LWNF+GLWQF
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XP_022135411.1 transcription factor JAMYB-like [Momordica charantia]4.3e-143100Show/hide
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XP_022926469.1 transcription factor JAMYB-like [Cucurbita moschata]5.0e-9169.57Show/hide
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        IAQ LPGRTDNEIKNYWRTRVQ+QAKLLNIDTNS EFK+IINRFWIPRLVQQI+ ESSNS  PSSS SS P            QLSD+D       KR  
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        F T +             SDP  FSD VPSWNHG      DF YPIG+     T W+++DDS  G LWNF+GLWQF
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XP_023531056.1 transcription factor JAMYB-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.2e-9069.45Show/hide
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        IAQ LPGRTDNEIKNYWRTRVQ+QAKLLNIDTNS EFK+IINRFWIPRLVQQI+ ESSNS  PSSS SS P           QLSD+D       KR  F
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         T +             SDP  FSD VPSWNHG      DF YPIG+     T W+++DDS  G LWNF+GLWQF
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XP_038901337.1 transcription factor MYB62-like [Benincasa hispida]4.6e-8967.42Show/hide
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        ++SQ+SS  SS V+EDDQ  +RRGPW+ DEDSLLI SISVHGEGRWNLLAIRSGLRRTGKSCRLRWLNYLKPDVKRG+LSP EQLLILDLH RWGNRWSK
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        IAQ LPGRTDNEIKNYWRTRVQ+QAK+LNI+ NSPEFKDII+R WIPRL+ QI+E SS+S PP  ++++S +PQLSDSD            +K     ++
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        E  +    SDPL  SD VPSWNHGGG     +FDYPIG    + T W+++DDS  G LWNF+GLWQF
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BWZ6 transcription factor MYB24-like5.2e-8665.89Show/hide
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        SS  SS+ +EDDQ  +RRGPW+ DEDSLLI SISVHGEGRWNLLAIRSGLRRTGKSCRLRWLNYLKP+V+RG+LSP EQLLILDLH RWGNRWSKIAQ+L
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        PGRTDNEIKNYWRT+VQ+QAK+LNI TNSPEFKDIINR WIPRL+ QI++ SS   P ++++  +PQ SDSD        R  F     ++E  E    S
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        DP  FSD VPSWNHGGG     +F+Y  G    + T W+++DDS  G LWNF+GLWQF
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A0A5D3DYB4 Transcription factor MYB24-like5.2e-8665.89Show/hide
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        SS  SS+ +EDDQ  +RRGPW+ DEDSLLI SISVHGEGRWNLLAIRSGLRRTGKSCRLRWLNYLKP+V+RG+LSP EQLLILDLH RWGNRWSKIAQ+L
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        PGRTDNEIKNYWRT+VQ+QAK+LNI TNSPEFKDIINR WIPRL+ QI++ SS   P ++++  +PQ SDSD        R  F     ++E  E    S
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Query:  DPLLFSDVVPSWNHGGGGD-MGDFDYPIG----EFTSWMEEDDSDCGGLWNFEGLWQF
        DP  FSD VPSWNHGGG     +F+Y  G    + T W+++DDS  G LWNF+GLWQF
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A0A6J1C0P4 transcription factor JAMYB-like2.1e-143100Show/hide
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        FSDVVPSWNHGGGGDMGDFDYPIGEFTSWMEEDDSDCGGLWNFEGLWQF
Subjt:  FSDVVPSWNHGGGGDMGDFDYPIGEFTSWMEEDDSDCGGLWNFEGLWQF

A0A6J1EF71 transcription factor JAMYB-like2.4e-9169.57Show/hide
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        ++SQ+SSCSSS VVED Q GLRRGPWT DEDSLL+ SISVHGEGRWNLLAIRSGLRRTGKSCRLRWLNYLKPDVKRG+LSP EQLLILDLH RWGNRWSK
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Query:  IAQELPGRTDNEIKNYWRTRVQRQAKLLNIDTNSPEFKDIINRFWIPRLVQQIHEESSNSSPPSSSSSSSP------------QLSDSDE------KRPR
        IAQ LPGRTDNEIKNYWRTRVQ+QAKLLNIDTNS EFK+IINRFWIPRLVQQI+ ESSNS  PSSS SS P            QLSD+D       KR  
Subjt:  IAQELPGRTDNEIKNYWRTRVQRQAKLLNIDTNSPEFKDIINRFWIPRLVQQIHEESSNSSPPSSSSSSSP------------QLSDSDE------KRPR

Query:  FVTAEEDEKVTG------SDPLLFSDVVPSWNHGGGGDMGDFDYPIGE----FTSWMEEDDSDCGGLWNFEGLWQF
        F T +             SDP  FSD VPSWNHG      DF YPIG+     T W+++DDS  G LWNF+GLWQF
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A0A6J1I942 transcription factor MYB62-like6.8e-8666.79Show/hide
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        +SQ+SS SSS VVED+Q GLRRGPWT DEDSLL+ SISVHGEGRWNLLAIRSGLRRTGKSCRLRWLNYLKPDVKRG+LSP EQLLILDLH RWGNRWSKI
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Query:  AQELPGRTDNEIKNYWRTRVQRQAKLLNIDTNSPEFKDIINRFWIPRLVQQIHEESSNSSPPSSSSSSSP-----------QLSDSD------------E
        AQ LPGRTDNEIKNYWRTRVQ+QAKLLNIDTNS EFK+IIN FWIPRLV QI+ ESSNS  PSSS SS P           QLSD+D            +
Subjt:  AQELPGRTDNEIKNYWRTRVQRQAKLLNIDTNSPEFKDIINRFWIPRLVQQIHEESSNSSPPSSSSSSSP-----------QLSDSD------------E

Query:  KRPRFVTAEEDEKVTGSDPLLFSDVVPSWNHGGGGDMGDFDYPIGE----FTSWMEEDDSDCGGLWNFEGLWQF
              ++E  +    SDP  FSD VPSWNH        F+YPIG      T W+++DD+  G LWNF+GLWQF
Subjt:  KRPRFVTAEEDEKVTGSDPLLFSDVVPSWNHGGGGDMGDFDYPIGE----FTSWMEEDDSDCGGLWNFEGLWQF

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q10MB4 Transcription factor MYB27.0e-5661.11Show/hide
Query:  EDDQIG--LRRGPWTADEDSLLIRSISVHGEGRWNLLAIRSGLRRTGKSCRLRWLNYLKPDVKRGSLSPHEQLLILDLHCRWGNRWSKIAQELPGRTDNE
        E++ +G  LRRGPWT +ED LL+  I+ HGEGRWN LA  +GL+RTGKSCRLRWLNYL+PD++RG+++P EQLLIL+LH RWGNRWSKIAQ LPGRTDNE
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Query:  IKNYWRTRVQRQAKLLNIDTNSPEFKDIINRFWIPRLVQQIHEESSNSSPPSSSSSSSPQLS
        IKNYWRTRVQ+ AK L  D NS +FKD++   W+PRLV++I   ++         + +P LS
Subjt:  IKNYWRTRVQRQAKLLNIDTNSPEFKDIINRFWIPRLVQQIHEESSNSSPPSSSSSSSPQLS

Q2QZJ8 Transcription factor JAMYB2.3e-5450.43Show/hide
Query:  LRRGPWTADEDSLLIRSISVHGEGRWNLLAIRSGLRRTGKSCRLRWLNYLKPDVKRGSLSPHEQLLILDLHCRWGNRWSKIAQELPGRTDNEIKNYWRTR
        LRRGPWT DED  LI  IS HGEGRWN LA  +GL+RTGKSCRLRWLNYL+PDVKRG+ +  EQLLILDLH RWGNRWSKIAQ LPGRTDNEIKNYWRTR
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Query:  VQRQAKLLNIDTNSPEFKDIINRFWIPRLVQQIHEES---------SNSSPPSSSSSSSPQLSDSDEKRPRFVTAEEDEKVTGSDPLLFSDVVPSWNHGG
        VQ+ AK LN D NS  FKD +   W+PRL ++IH  +         SN+     S  +   +++  +  P  VT+   +  T     L    +    HG 
Subjt:  VQRQAKLLNIDTNSPEFKDIINRFWIPRLVQQIHEES---------SNSSPPSSSSSSSPQLSDSDEKRPRFVTAEEDEKVTGSDPLLFSDVVPSWNHGG

Query:  GGDMGDFDYPIGEFTSWMEEDDSDCGGLWNFE
           M   D        WM+E D +    W+ E
Subjt:  GGDMGDFDYPIGEFTSWMEEDDSDCGGLWNFE

Q9C9G7 Transcription factor MYB622.9e-5461.01Show/hide
Query:  EDDQIGLRRGPWTADEDSLLIRSISVHGEGRWNLLAIRSGLRRTGKSCRLRWLNYLKPDVKRGSLSPHEQLLILDLHCRWGNRWSKIAQELPGRTDNEIK
        E +   LRRGPWT +ED+LL   I  +GEGRWN +A  +GL+RTGKSCRLRWLNYLKPD++RG+L+P EQLLIL+LH +WGNRWSKIAQ LPGRTDNEIK
Subjt:  EDDQIGLRRGPWTADEDSLLIRSISVHGEGRWNLLAIRSGLRRTGKSCRLRWLNYLKPDVKRGSLSPHEQLLILDLHCRWGNRWSKIAQELPGRTDNEIK

Query:  NYWRTRVQRQAKLLNIDTNSPEFKDIINRFWIPRLVQQIHEESSNSSP---PSSSSSSS
        NYWRTRVQ+QA+ LNI++NS +F D +  FW+PRL++++ + SS ++    P +++++S
Subjt:  NYWRTRVQRQAKLLNIDTNSPEFKDIINRFWIPRLVQQIHEESSNSSP---PSSSSSSS

Q9FGY3 Transcription factor MYB783.6e-5262.58Show/hide
Query:  DDQIGLRRGPWTADEDSLLIRSISVHGEGRWNLLAIRSGLRRTGKSCRLRWLNYLKPDVKRGSLSPHEQLLILDLHCRWGNRWSKIAQELPGRTDNEIKN
        ++++ +RRGPWT +ED  LI  I+ HGEGRWN LA  + L+RTGKSCRLRWLNYL+PDV+RG+++  EQLLIL+LH RWGNRWSKIAQ LPGRTDNEIKN
Subjt:  DDQIGLRRGPWTADEDSLLIRSISVHGEGRWNLLAIRSGLRRTGKSCRLRWLNYLKPDVKRGSLSPHEQLLILDLHCRWGNRWSKIAQELPGRTDNEIKN

Query:  YWRTRVQRQAKLLNIDTNSPEFKDIINRFWIPRLVQQIHEESSNSSPPSSSSSSS
        YWRTRVQ+ AK L  D NS +FKD +   W+PRLV++I   S  S   SS  ++S
Subjt:  YWRTRVQRQAKLLNIDTNSPEFKDIINRFWIPRLVQQIHEESSNSSPPSSSSSSS

Q9LDE1 Transcription factor MYB1082.5e-5360.65Show/hide
Query:  DDQIGLRRGPWTADEDSLLIRSISVHGEGRWNLLAIRSGLRRTGKSCRLRWLNYLKPDVKRGSLSPHEQLLILDLHCRWGNRWSKIAQELPGRTDNEIKN
        +D++ L+RGPWTA+ED  L+  I+ +GEGRWN L+  +GL+RTGKSCRLRWLNYL+PDV+RG+++  EQLLIL+LH RWGNRWSKIAQ LPGRTDNEIKN
Subjt:  DDQIGLRRGPWTADEDSLLIRSISVHGEGRWNLLAIRSGLRRTGKSCRLRWLNYLKPDVKRGSLSPHEQLLILDLHCRWGNRWSKIAQELPGRTDNEIKN

Query:  YWRTRVQRQAKLLNIDTNSPEFKDIINRFWIPRLVQQIHEESSNSSPPSSSSSSS
        YWRTRVQ+ AK L  D NS +FKD +   W+PRLV++I   S++S+  +++++++
Subjt:  YWRTRVQRQAKLLNIDTNSPEFKDIINRFWIPRLVQQIHEESSNSSPPSSSSSSS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G25340.1 myb domain protein 1166.1e-5562.03Show/hide
Query:  RRGPWTADEDSLLIRSISVHGEGRWNLLAIRSGLRRTGKSCRLRWLNYLKPDVKRGSLSPHEQLLILDLHCRWGNRWSKIAQELPGRTDNEIKNYWRTRV
        R+GPWT +ED+LL   IS +GEGRWNLLA  SGL+R GKSCRLRWLNYLKPD+KRG+L+P EQLLIL+LH +WGNRWSKI++ LPGRTDN+IKNYWRTRV
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Query:  QRQAKLLNIDTNSPEFKDIINRFWIPRLVQQIHEES-SNSSPPSSSSSSSPQLSDSDE
        Q+QA+ LNID+NS +F +++  FW PRL+ +I + S +N+   ++     P L DS +
Subjt:  QRQAKLLNIDTNSPEFKDIINRFWIPRLVQQIHEES-SNSSPPSSSSSSSPQLSDSDE

AT1G48000.1 myb domain protein 1123.6e-5550Show/hide
Query:  QIGLRRGPWTADEDSLLIRSISVHGEGRWNLLAIRSGLRRTGKSCRLRWLNYLKPDVKRGSLSPHEQLLILDLHCRWGNRWSKIAQELPGRTDNEIKNYW
        +I +RRGPWT +ED  L+  IS+HGEGRWN L+  +GL RTGKSCRLRWLNYL+PD++RG +S  EQ +IL+LH RWGNRWSKIAQ LPGRTDNEIKNYW
Subjt:  QIGLRRGPWTADEDSLLIRSISVHGEGRWNLLAIRSGLRRTGKSCRLRWLNYLKPDVKRGSLSPHEQLLILDLHCRWGNRWSKIAQELPGRTDNEIKNYW

Query:  RTRVQRQAKLLNIDTNSPEFKDIINRFWIPRLVQQIH-----EESSNSSPPSSSSSSSPQLSDSDEKRPRFVTAEEDEKVTGSDPLLFSDVVPSWNHG--
        RTRVQ+ AKLL  D NS +FKD I   W+PRL+++I      + +SN   P +SS ++   S S  +  R           G D + F  +    N G  
Subjt:  RTRVQRQAKLLNIDTNSPEFKDIINRFWIPRLVQQIH-----EESSNSSPPSSSSSSSPQLSDSDEKRPRFVTAEEDEKVTGSDPLLFSDVVPSWNHG--

Query:  -GGGDMGDFDYPIGEFTSWM
          GGD  +      E   W+
Subjt:  -GGGDMGDFDYPIGEFTSWM

AT1G68320.1 myb domain protein 622.1e-5561.01Show/hide
Query:  EDDQIGLRRGPWTADEDSLLIRSISVHGEGRWNLLAIRSGLRRTGKSCRLRWLNYLKPDVKRGSLSPHEQLLILDLHCRWGNRWSKIAQELPGRTDNEIK
        E +   LRRGPWT +ED+LL   I  +GEGRWN +A  +GL+RTGKSCRLRWLNYLKPD++RG+L+P EQLLIL+LH +WGNRWSKIAQ LPGRTDNEIK
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Query:  NYWRTRVQRQAKLLNIDTNSPEFKDIINRFWIPRLVQQIHEESSNSSP---PSSSSSSS
        NYWRTRVQ+QA+ LNI++NS +F D +  FW+PRL++++ + SS ++    P +++++S
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AT3G06490.1 myb domain protein 1081.8e-5460.65Show/hide
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        +D++ L+RGPWTA+ED  L+  I+ +GEGRWN L+  +GL+RTGKSCRLRWLNYL+PDV+RG+++  EQLLIL+LH RWGNRWSKIAQ LPGRTDNEIKN
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Query:  YWRTRVQRQAKLLNIDTNSPEFKDIINRFWIPRLVQQIHEESSNSSPPSSSSSSS
        YWRTRVQ+ AK L  D NS +FKD +   W+PRLV++I   S++S+  +++++++
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AT5G49620.1 myb domain protein 782.6e-5362.58Show/hide
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        ++++ +RRGPWT +ED  LI  I+ HGEGRWN LA  + L+RTGKSCRLRWLNYL+PDV+RG+++  EQLLIL+LH RWGNRWSKIAQ LPGRTDNEIKN
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Query:  YWRTRVQRQAKLLNIDTNSPEFKDIINRFWIPRLVQQIHEESSNSSPPSSSSSSS
        YWRTRVQ+ AK L  D NS +FKD +   W+PRLV++I   S  S   SS  ++S
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TTCCATCTCCGTCCATGGCGAAGGCCGATGGAACTTGCTCGCCATTCGTTCAGGGCTGAGACGGACGGGGAAGAGTTGCCGTTTGAGATGGTTGAATTATCTGAAACCCG
ACGTCAAAAGAGGGAGCCTTTCTCCTCATGAGCAGCTTTTGATTCTTGATCTCCACTGCAGATGGGGTAACAGGTGGTCAAAGATAGCCCAAGAGTTACCAGGAAGAACG
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CCCCAGATTGGTTCAACAAATTCACGAAGAGTCTTCTAATTCCTCGCCGCCTTCTTCTTCTTCTTCCTCTTCACCACAACTTTCGGATTCGGATGAGAAACGGCCCCGTT
TTGTAACCGCAGAAGAAGACGAAAAAGTCACCGGTTCTGATCCATTATTATTCTCCGACGTTGTTCCGTCATGGAATCACGGCGGCGGCGGAGATATGGGGGATTTTGAT
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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DNEIKNYWRTRVQRQAKLLNIDTNSPEFKDIINRFWIPRLVQQIHEESSNSSPPSSSSSSSPQLSDSDEKRPRFVTAEEDEKVTGSDPLLFSDVVPSWNHGGGGDMGDFD
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