; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Moc06g04560 (gene) of Bitter gourd (OHB3-1) v2 genome

Gene IDMoc06g04560
OrganismMomordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
DescriptionBasic helix-loop-helix transcription factor
Genome locationchr6:3263834..3267396
RNA-Seq ExpressionMoc06g04560
SyntenyMoc06g04560
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
GO:0043565 - sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR011598 - Myc-type, basic helix-loop-helix (bHLH) domain
IPR036638 - Helix-loop-helix DNA-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_008453552.1 PREDICTED: transcription factor bHLH35 [Cucumis melo]2.5e-9580.24Show/hide
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XP_022922024.1 transcription factor bHLH35-like [Cucurbita moschata]2.2e-9981.38Show/hide
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XP_022987353.1 transcription factor bHLH35-like [Cucurbita maxima]8.3e-9980.97Show/hide
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XP_023515836.1 transcription factor bHLH35-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.2e-9880.57Show/hide
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        MD+ G D   Y+ ++I +P EE+DSWG DE +SGYYDSSSPEGVLSSS+A+KNI SERNRRRKLNERLFALRSVVPNITKMDKASIIKDAI+YIQ+LHEQ
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LU95 BHLH domain-containing protein8.7e-9479.84Show/hide
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        MD IG+DY   +   I +  EE+DSWGL+E  SG YDSSSP+G    SAASKN+ SERNRRRKLNERLFALRSVVPNI+KMDKASIIKDAI+YI DLH+Q
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A0A1S3BWL7 transcription factor bHLH351.2e-9580.24Show/hide
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        MD+IG+DY     T+I +  EE+DSW L+E +S YYDSSSP+G    SAASKNI+SERNRRRKLNERLFALRSVVPNITKMDKASIIKDAI+YI DLH+Q
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A0A6J1C2W6 transcription factor bHLH35-like1.1e-128100Show/hide
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A0A6J1E262 transcription factor bHLH35-like1.1e-9981.38Show/hide
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        MD+ G D   Y+ ++I +P EE+DSWG DE +SGYYDSSSPEGVLSSS+A+KNI SERNRRRKLNERLFALRSVVPNITKMDKASIIKDAI+YIQDLHEQ
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A0A6J1JJ79 transcription factor bHLH35-like4.0e-9980.97Show/hide
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        MD+ G D   Y+ ++I +P EE+DSWG DE +SGYYDSSSPEGVLSSS+A+KNI SERNRRRKLNERLFALRSVVPNITKMDKASIIKDAI+YIQDLHEQ
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        ERR+Q EI E+ESGKFK ITG  FDQELPLLLR KR KTE+ FSY S ASRTSPIEV DLSVTYMG+RT+ VS+TCCKRADSMVKLCEVFESLKLKIITA
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q0JEB7 Transcription factor BHLH65.2e-4338.94Show/hide
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        +GE ++YYWET   L +EE+DS  L       Y+SSSP+G  SSSA                                      A+KNIL ER+RRRKLN
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Query:  ERLFALRSVVPNITKMDKASIIKDAINYIQDLHEQERRIQAEIYEIESGKFKN--------ITGYGFDQE------LPLLLRSKRKKTEQ-FSYDS----
        E+L+ALRSVVPNITKMDKASIIKDAI YIQ L  +E+++  E+  +ES    +          G G D+E       P     + KK ++  S  S    
Subjt:  ERLFALRSVVPNITKMDKASIIKDAINYIQDLHEQERRIQAEIYEIESGKFKN--------ITGYGFDQE------LPLLLRSKRKKTEQ-FSYDS----

Query:  ---AASRTSPIEVLDLSVTYMGERTMVVSLTCCKRADSMVKLCEVFESLKLKIITANITAVSGRLLKTVFIEAEQEERDYLKIKIESAIARL-SLSDPQS
           AA+   P+E+ +L V+ +G+R +VVS+TC KR D+M ++C   E L+L++ITANIT+V+G L+ T+F+E +  +   +K  +E+A+++L +   P S
Subjt:  ---AASRTSPIEVLDLSVTYMGERTMVVSLTCCKRADSMVKLCEVFESLKLKIITANITAVSGRLLKTVFIEAEQEERDYLKIKIESAIARL-SLSDPQS

Query:  PMS
         MS
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Q2HIV9 Transcription factor bHLH351.0e-6256.91Show/hide
Query:  DNIGEDYSYYWETNIVLPAEEID---SWGLDEAISGYYDSSSPEGVLSSSAASKNILSERNRRRKLNERLFALRSVVPNITKMDKASIIKDAINYIQDLH
        D + ++ S YWE +  L  E+ +   SW L+EAISG YDSSSP+G  +SS ASKNI+SERNRR+KLN+RLFALRSVVPNITKMDKASIIKDAI+YI+ L 
Subjt:  DNIGEDYSYYWETNIVLPAEEID---SWGLDEAISGYYDSSSPEGVLSSSAASKNILSERNRRRKLNERLFALRSVVPNITKMDKASIIKDAINYIQDLH

Query:  EQERRIQAEIYEIESGKFKNIT-GYGFDQELPLLLRSKRKKTEQFSYDSAASRTSPIEVLDLSVTYMGERTMVVSLTCCKRADSMVKLCEVFESLKLKII
         +E++++AEI E+ES    +++    FD++L + + SK+ K      DS +S TS IEVL+L VT+MGERTMVVS+TC KR D+MVKLCEVFESL LKI+
Subjt:  EQERRIQAEIYEIESGKFKNIT-GYGFDQELPLLLRSKRKKTEQFSYDSAASRTSPIEVLDLSVTYMGERTMVVSLTCCKRADSMVKLCEVFESLKLKII

Query:  TANITAVSGRLLKTVFIEAEQEERDYLKIKIESAIARLSLSDPQSP
        T+N+T+ SG +  TVFIEA++EE++ L++KIE+ I   + ++ QSP
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Q700E3 Transcription factor bHLH271.0e-4646.02Show/hide
Query:  MDNIGEDYSYYWETNIVLPAEEI--DSWGLDEAISGYYDSSSPEGVLSSSAASKNILSERNRRRKLNERLFALRSVVPNITKMDKASIIKDAINYIQDLH
        M+++  +Y  YWET +    +E+  DSW ++EA SG  +SSSP+G  +S A+SKN++SERNRR+KLN+RLFALRSVVPNI+K+DKAS+IKD+I+Y+Q+L 
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Query:  EQERRIQAEIYEIESGKF---KNITGYGFD------QELPLLLRSKRKKTEQFSYDSAASRTSPIEVLDLSVTYMGERTMVVSLTCCKRADSMVKLCEVF
        +QE+ ++AEI E+ES        +  Y  +      Q+       + KK +Q  Y S   +  PIEVL++ VT+MGE+T+VV +TC K+ ++MV+LC+V 
Subjt:  EQERRIQAEIYEIESGKF---KNITGYGFD------QELPLLLRSKRKKTEQFSYDSAASRTSPIEVLDLSVTYMGERTMVVSLTCCKRADSMVKLCEVF

Query:  ESLKLKIITANITAVSGRLLKTVFIE
        ESL L I+T N ++ + RL  T+F++
Subjt:  ESLKLKIITANITAVSGRLLKTVFIE

Q9LNJ5 Transcription factor bHLH131.6e-1228Show/hide
Query:  EEIDSWGLDEAISGYYDSSSPEGVLSSSAASKNILSERNRRRKLNERLFALRSVVPNITKMDKASIIKDAINYIQDLHEQERRIQAEIYEIESGKFKNIT
        E  D+ G DE+ +              + A  ++ +ER RR KLN+R +ALRSVVPNI+KMDKAS++ DA++YI +LH + + ++AE   +         
Subjt:  EEIDSWGLDEAISGYYDSSSPEGVLSSSAASKNILSERNRRRKLNERLFALRSVVPNITKMDKASIIKDAINYIQDLHEQERRIQAEIYEIESGKFKNIT

Query:  GYGFDQELPLLLRSKRKKTEQFSYDSAASRTSPIEVLDLSVTYMGERTMVVSLTCCKRADSMVKLCEVFESLKLKIITANITAVSGRLLKTVFIEAEQEE
          G+    P+ L S                       D++V   GE  + V + C   +    ++   FE  K+++I +N+      +L T  +++E   
Subjt:  GYGFDQELPLLLRSKRKKTEQFSYDSAASRTSPIEVLDLSVTYMGERTMVVSLTCCKRADSMVKLCEVFESLKLKIITANITAVSGRLLKTVFIEAEQEE

Query:  RDYLKIKIESAIARLSLSDPQSPMS
         +  K K+ SA++R   +  QS  S
Subjt:  RDYLKIKIESAIARLSLSDPQSPMS

Q9ZVX2 Transcription factor ABORTED MICROSPORES9.5e-1329.21Show/hide
Query:  LDEAISGYYDSSSPEGVLSSSAASKNILSERNRRRKLNERLFALRSVVPNITKMDKASIIKDAINYIQDLHEQERRIQAEI---YEIESGKFKNITGYGF
        +D+     Y   S +G     + +KN+++ER RR+KLN+RL+ALRS+VP ITK+D+ASI+ DAINY+++L  + + +Q E+    E E G  +   G   
Subjt:  LDEAISGYYDSSSPEGVLSSSAASKNILSERNRRRKLNERLFALRSVVPNITKMDKASIIKDAINYIQDLHEQERRIQAEI---YEIESGKFKNITGYGF

Query:  DQEL-----PLLLRSKRKKTEQFSYDSAASRTSPIEV-LDLSVTYMGERTMVVSLTCCKRADSMVKLCEVFESLKLKIITANITAVSGRLLKTVFIEAEQ
        +  +     P L  +    + +   D   S     E+   + V  +  R   V + C  +     +L E  +SL L++  AN T     +     +E   
Subjt:  DQEL-----PLLLRSKRKKTEQFSYDSAASRTSPIEV-LDLSVTYMGERTMVVSLTCCKRADSMVKLCEVFESLKLKIITANITAVSGRLLKTVFIEAEQ

Query:  EE
         E
Subjt:  EE

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G29930.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein3.7e-5245.42Show/hide
Query:  MDNIGEDYSYYWETNIVLPAEEI--DSWGLDEAISGYYDSSSPEGVLSSSAASKNILSERNRRRKLNERLFALRSVVPNITKMDKASIIKDAINYIQDLH
        M+++  +Y  YWET +    +E+  DSW ++EA SG  +SSSP+G  +S A+SKN++SERNRR+KLN+RLFALRSVVPNI+K+DKAS+IKD+I+Y+Q+L 
Subjt:  MDNIGEDYSYYWETNIVLPAEEI--DSWGLDEAISGYYDSSSPEGVLSSSAASKNILSERNRRRKLNERLFALRSVVPNITKMDKASIIKDAINYIQDLH

Query:  EQERRIQAEIYEIESGKF---KNITGYGFD------QELPLLLRSKRKKTEQFSYDSAASRTSPIEVLDLSVTYMGERTMVVSLTCCKRADSMVKLCEVF
        +QE+ ++AEI E+ES        +  Y  +      Q+       + KK +Q  Y S   +  PIEVL++ VT+MGE+T+VV +TC K+ ++MV+LC+V 
Subjt:  EQERRIQAEIYEIESGKF---KNITGYGFD------QELPLLLRSKRKKTEQFSYDSAASRTSPIEVLDLSVTYMGERTMVVSLTCCKRADSMVKLCEVF

Query:  ESLKLKIITANITAVSGRLLKTVFIEAEQEERDYLKIKIESAIARLSLSDP
        ESL L I+T N ++ + RL  T+F++A++EE   ++ KI+ AIA  + +DP
Subjt:  ESLKLKIITANITAVSGRLLKTVFIEAEQEERDYLKIKIESAIARLSLSDP

AT5G57150.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein1.1e-6457.96Show/hide
Query:  DNIGEDYSYYWETNIVLPAE--EIDSWGLDEAISGYYDSSSPEGVLSSSAASKNILSERNRRRKLNERLFALRSVVPNITKMDKASIIKDAINYIQDLHE
        D + ++ S YWE +  L  E  E DSW L+EAISG YDSSSP+G  +SS ASKNI+SERNRR+KLN+RLFALRSVVPNITKMDKASIIKDAI+YI+ L  
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        +E++++AEI E+ES    +++    FD++L + + SK+ K      DS +S TS IEVL+L VT+MGERTMVVS+TC KR D+MVKLCEVFESL LKI+T
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        +N+T+ SG +  TVFIEA++EE++ L++KIE+ I   + ++ QSP
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AT5G57150.2 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein4.5e-5859.17Show/hide
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        D + ++ S YWE +  L  E+ +   SW L+EAISG YDSSSP+G  +SS ASKNI+SERNRR+KLN+RLFALRSVVPNITKMDKASIIKDAI+YI+ L 
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Query:  EQERRIQAEIYEIESGKFKNIT-GYGFDQELPLLLRSKRKKTEQFSYDSAASRTSPIEVLDLSVTYMGERTMVVSLTCCKRADSMVKLCEVFESLKLKII
         +E++++AEI E+ES    +++    FD++L + + SK+ K      DS +S TS IEVL+L VT+MGERTMVVS+TC KR D+MVKLCEVFESL LKI+
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        T+N+T+ SG +  TVFIE
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AT5G57150.3 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein4.5e-5859.17Show/hide
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        D + ++ S YWE +  L  E+ +   SW L+EAISG YDSSSP+G  +SS ASKNI+SERNRR+KLN+RLFALRSVVPNITKMDKASIIKDAI+YI+ L 
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         +E++++AEI E+ES    +++    FD++L + + SK+ K      DS +S TS IEVL+L VT+MGERTMVVS+TC KR D+MVKLCEVFESL LKI+
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        T+N+T+ SG +  TVFIE
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AT5G57150.4 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein4.5e-5859.17Show/hide
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        T+N+T+ SG +  TVFIE
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TCGTCCCCAATATTACTAAGATGGACAAGGCTTCGATCATAAAGGATGCGATTAATTACATCCAGGATTTGCACGAACAAGAGAGGAGGATTCAGGCTGAAATTTACGAG
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TGCTTCAAGAACTTCCCCCATTGAAGTGCTAGATCTGAGTGTGACATATATGGGGGAGAGAACAATGGTGGTGAGTTTGACATGCTGCAAAAGAGCAGATTCAATGGTTA
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDNIGEDYSYYWETNIVLPAEEIDSWGLDEAISGYYDSSSPEGVLSSSAASKNILSERNRRRKLNERLFALRSVVPNITKMDKASIIKDAINYIQDLHEQERRIQAEIYE
IESGKFKNITGYGFDQELPLLLRSKRKKTEQFSYDSAASRTSPIEVLDLSVTYMGERTMVVSLTCCKRADSMVKLCEVFESLKLKIITANITAVSGRLLKTVFIEAEQEE
RDYLKIKIESAIARLSLSDPQSPMSI