; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Moc06g12980 (gene) of Bitter gourd (OHB3-1) v2 genome

Gene IDMoc06g12980
OrganismMomordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
DescriptionTubulin beta chain
Genome locationchr6:10107982..10111352
RNA-Seq ExpressionMoc06g12980
SyntenyMoc06g12980
Gene Ontology termsGO:0000278 - mitotic cell cycle (biological process)
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GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
GO:0003729 - mRNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR037103 - Tubulin/FtsZ-like, C-terminal domain
IPR036525 - Tubulin/FtsZ, GTPase domain superfamily
IPR023123 - Tubulin, C-terminal
IPR018316 - Tubulin/FtsZ, 2-layer sandwich domain
IPR017975 - Tubulin, conserved site
IPR008280 - Tubulin/FtsZ, C-terminal
IPR003008 - Tubulin/FtsZ, GTPase domain
IPR002453 - Beta tubulin
IPR000217 - Tubulin


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6590152.1 Tubulin beta-6 chain, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.1e-25597.99Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P29514 Tubulin beta-6 chain4.5e-25596.62Show/hide
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P93176 Tubulin beta chain5.5e-25395.29Show/hide
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Q43594 Tubulin beta-1 chain5.5e-25395.74Show/hide
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Q76FS3 Tubulin beta-6 chain3.2e-25395.5Show/hide
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Q9ZRB2 Tubulin beta-1 chain2.9e-25496.4Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
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AT5G23860.1 tubulin beta 82.9e-24994.2Show/hide
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AT5G23860.2 tubulin beta 82.9e-24994.2Show/hide
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AT5G62690.1 tubulin beta chain 25.9e-25093.95Show/hide
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        VLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRF GQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQ YR+LTVPELTQQMWDSKNMM
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        EGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATA EEG YE+EEE E ++
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AT5G62700.1 tubulin beta chain 35.9e-25093.95Show/hide
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        EGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATA EEG YE+EEE E ++
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Sequences Show/hide sequences
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