; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Moc06g13090 (gene) of Bitter gourd (OHB3-1) v2 genome

Gene IDMoc06g13090
OrganismMomordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
Descriptionserine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A
Genome locationchr6:10232494..10235816
RNA-Seq ExpressionMoc06g13090
SyntenyMoc06g13090
Gene Ontology termsGO:0003723 - RNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000504 - RNA recognition motif domain
IPR012677 - Nucleotide-binding alpha-beta plait domain superfamily
IPR035979 - RNA-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_008450302.1 PREDICTED: serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A isoform X1 [Cucumis melo]8.4e-12586.99Show/hide
Query:  MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGRGRDRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRQFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMD
        MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRY GRG  RDLPTSLLVRNL HDCRPEDLRR FGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKH MD
Subjt:  MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGRGRDRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRQFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMD

Query:  GCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSRTNSGRFHDRRRSPPRYSRSPRYSRSPAPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYTSPPPKQRACSRSVSPR
        GCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGS TNSGRFHDRRRSP RYSRSPRYSRSPA R  RYSRSPAPRHARSRSRSYDY SPPPKQRA SRSVSPR
Subjt:  GCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSRTNSGRFHDRRRSPPRYSRSPRYSRSPAPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYTSPPPKQRACSRSVSPR

Query:  DRRDSRERSYPRQPSRGRSYSQSPRLNGSRSRSQSPARGGSRSQSPARGRSRSR--------SVSRSRSPRRSPRHEEEYRSDPNGDRSPSQ
        DR DSRERS+PRQ SRGRSYS+SPRL+GSRSRS SP RG  RS SP RGRS SR        S SRSRSP+ SPRHEEEYRS+PNGDRSP Q
Subjt:  DRRDSRERSYPRQPSRGRSYSQSPRLNGSRSRSQSPARGGSRSQSPARGRSRSR--------SVSRSRSPRRSPRHEEEYRSDPNGDRSPSQ

XP_008450303.1 PREDICTED: serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A isoform X2 [Cucumis melo]1.5e-12185.96Show/hide
Query:  MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGRGRDRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRQFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMD
        MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRY GRG  RDLPTSLLVRNL HDCRPEDLRR FGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKH MD
Subjt:  MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGRGRDRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRQFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMD

Query:  GCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSRTNSGRFHDRRRSPPRYSRSPRYSRSPAPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYTSPPPKQRACSRSVSPR
        GCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERG    SGRFHDRRRSP RYSRSPRYSRSPA R  RYSRSPAPRHARSRSRSYDY SPPPKQRA SRSVSPR
Subjt:  GCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSRTNSGRFHDRRRSPPRYSRSPRYSRSPAPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYTSPPPKQRACSRSVSPR

Query:  DRRDSRERSYPRQPSRGRSYSQSPRLNGSRSRSQSPARGGSRSQSPARGRSRSR--------SVSRSRSPRRSPRHEEEYRSDPNGDRSPSQ
        DR DSRERS+PRQ SRGRSYS+SPRL+GSRSRS SP RG  RS SP RGRS SR        S SRSRSP+ SPRHEEEYRS+PNGDRSP Q
Subjt:  DRRDSRERSYPRQPSRGRSYSQSPRLNGSRSRSQSPARGGSRSQSPARGRSRSR--------SVSRSRSPRRSPRHEEEYRSDPNGDRSPSQ

XP_022153263.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A isoform X1 [Momordica charantia]4.4e-150100Show/hide
Query:  MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGRGRDRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRQFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMD
        MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGRGRDRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRQFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMD
Subjt:  MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGRGRDRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRQFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMD

Query:  GCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSRTNSGRFHDRRRSPPRYSRSPRYSRSPAPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYTSPPPKQRACSRSVSPR
        GCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSRTNSGRFHDRRRSPPRYSRSPRYSRSPAPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYTSPPPKQRACSRSVSPR
Subjt:  GCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSRTNSGRFHDRRRSPPRYSRSPRYSRSPAPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYTSPPPKQRACSRSVSPR

Query:  DRRDSRERSYPRQPSRGRSYSQSPRLNGSRSRSQSPARGGSRSQSPARGRSRSRSVSRSRSPRRSPRHEEEYRSDPNGDRSPSQ
        DRRDSRERSYPRQPSRGRSYSQSPRLNGSRSRSQSPARGGSRSQSPARGRSRSRSVSRSRSPRRSPRHEEEYRSDPNGDRSPSQ
Subjt:  DRRDSRERSYPRQPSRGRSYSQSPRLNGSRSRSQSPARGGSRSQSPARGRSRSRSVSRSRSPRRSPRHEEEYRSDPNGDRSPSQ

XP_022153264.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A isoform X2 [Momordica charantia]3.0e-14698.59Show/hide
Query:  MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGRGRDRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRQFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMD
        MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGRGRDRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRQFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMD
Subjt:  MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGRGRDRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRQFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMD

Query:  GCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSRTNSGRFHDRRRSPPRYSRSPRYSRSPAPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYTSPPPKQRACSRSVSPR
        GCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERG    SGRFHDRRRSPPRYSRSPRYSRSPAPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYTSPPPKQRACSRSVSPR
Subjt:  GCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSRTNSGRFHDRRRSPPRYSRSPRYSRSPAPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYTSPPPKQRACSRSVSPR

Query:  DRRDSRERSYPRQPSRGRSYSQSPRLNGSRSRSQSPARGGSRSQSPARGRSRSRSVSRSRSPRRSPRHEEEYRSDPNGDRSPSQ
        DRRDSRERSYPRQPSRGRSYSQSPRLNGSRSRSQSPARGGSRSQSPARGRSRSRSVSRSRSPRRSPRHEEEYRSDPNGDRSPSQ
Subjt:  DRRDSRERSYPRQPSRGRSYSQSPRLNGSRSRSQSPARGGSRSQSPARGRSRSRSVSRSRSPRRSPRHEEEYRSDPNGDRSPSQ

XP_038879567.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A isoform X1 [Benincasa hispida]1.1e-12487.67Show/hide
Query:  MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGRGRDRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRQFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMD
        MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRY GRG  RDLPTSLLVRNL HDCRPEDLRR FGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMD
Subjt:  MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGRGRDRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRQFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMD

Query:  GCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSRTNSGRFHDRRRSPPRYSRSPRYSRSPAPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYTSPPPKQRACSRSVSPR
        GCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGS TNSGR HDRRRSPPRYSRSPRYSRSPA RHARYSRSP PRHAR+RSRSYDY SPPPKQ+A SRSVSPR
Subjt:  GCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSRTNSGRFHDRRRSPPRYSRSPRYSRSPAPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYTSPPPKQRACSRSVSPR

Query:  DRRDSRERSYPRQPSRGRSYSQSPRLNGSRSRSQSPARGGSRSQSPARGRSRSR--------SVSRSRSPRRSPRHEEEYRSDPNGDRSPSQ
        DR DSRERS+PRQ SRGR  S+SPRL+GSRSRSQSPAR GSRS SP RGRS SR        S SRSRSPR SPRH EEYRS+PNGDRSPSQ
Subjt:  DRRDSRERSYPRQPSRGRSYSQSPRLNGSRSRSQSPARGGSRSQSPARGRSRSR--------SVSRSRSPRRSPRHEEEYRSDPNGDRSPSQ

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LZX6 RRM domain-containing protein2.1e-12184.75Show/hide
Query:  IMRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGRGRDRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRQFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQM
        +MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRY GRG  RDLPTSLLVRNL HDCRPEDLRR FGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKH M
Subjt:  IMRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGRGRDRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRQFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQM

Query:  DGCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSRTNSGRFHDRRRSPPRYSRSPRYSRSPAPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYTSPPPKQRACSRSVSP
        DGCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERG    SGR+HDRRRSPP   RSPRYSRSPA R  RYSRSPAPRHARSRSRSYDY S PPKQRA SRS+SP
Subjt:  DGCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSRTNSGRFHDRRRSPPRYSRSPRYSRSPAPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYTSPPPKQRACSRSVSP

Query:  RDRRDSRERSYPRQPSRGRSYSQSPRLNGSRSRSQSPARGGSRSQSPARGRSRS----------RSVSRSRSPRRSPRHEEEYRSDPNGDRSPSQ
        RDR DSRERS+PRQ SRGRSYS+SPRL+GSRSRSQSP + GSRS SP RGRS S          RS SRSRSPRRSPRHEEEYRS+PNGDRSPSQ
Subjt:  RDRRDSRERSYPRQPSRGRSYSQSPRLNGSRSRSQSPARGGSRSQSPARGRSRS----------RSVSRSRSPRRSPRHEEEYRSDPNGDRSPSQ

A0A1S3BNX5 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A isoform X14.1e-12586.99Show/hide
Query:  MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGRGRDRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRQFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMD
        MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRY GRG  RDLPTSLLVRNL HDCRPEDLRR FGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKH MD
Subjt:  MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGRGRDRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRQFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMD

Query:  GCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSRTNSGRFHDRRRSPPRYSRSPRYSRSPAPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYTSPPPKQRACSRSVSPR
        GCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGS TNSGRFHDRRRSP RYSRSPRYSRSPA R  RYSRSPAPRHARSRSRSYDY SPPPKQRA SRSVSPR
Subjt:  GCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSRTNSGRFHDRRRSPPRYSRSPRYSRSPAPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYTSPPPKQRACSRSVSPR

Query:  DRRDSRERSYPRQPSRGRSYSQSPRLNGSRSRSQSPARGGSRSQSPARGRSRSR--------SVSRSRSPRRSPRHEEEYRSDPNGDRSPSQ
        DR DSRERS+PRQ SRGRSYS+SPRL+GSRSRS SP RG  RS SP RGRS SR        S SRSRSP+ SPRHEEEYRS+PNGDRSP Q
Subjt:  DRRDSRERSYPRQPSRGRSYSQSPRLNGSRSRSQSPARGGSRSQSPARGRSRSR--------SVSRSRSPRRSPRHEEEYRSDPNGDRSPSQ

A0A1S3BPL2 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A isoform X27.2e-12285.96Show/hide
Query:  MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGRGRDRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRQFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMD
        MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRY GRG  RDLPTSLLVRNL HDCRPEDLRR FGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKH MD
Subjt:  MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGRGRDRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRQFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMD

Query:  GCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSRTNSGRFHDRRRSPPRYSRSPRYSRSPAPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYTSPPPKQRACSRSVSPR
        GCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERG    SGRFHDRRRSP RYSRSPRYSRSPA R  RYSRSPAPRHARSRSRSYDY SPPPKQRA SRSVSPR
Subjt:  GCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSRTNSGRFHDRRRSPPRYSRSPRYSRSPAPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYTSPPPKQRACSRSVSPR

Query:  DRRDSRERSYPRQPSRGRSYSQSPRLNGSRSRSQSPARGGSRSQSPARGRSRSR--------SVSRSRSPRRSPRHEEEYRSDPNGDRSPSQ
        DR DSRERS+PRQ SRGRSYS+SPRL+GSRSRS SP RG  RS SP RGRS SR        S SRSRSP+ SPRHEEEYRS+PNGDRSP Q
Subjt:  DRRDSRERSYPRQPSRGRSYSQSPRLNGSRSRSQSPARGGSRSQSPARGRSRSR--------SVSRSRSPRRSPRHEEEYRSDPNGDRSPSQ

A0A6J1DH06 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A isoform X12.1e-150100Show/hide
Query:  MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGRGRDRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRQFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMD
        MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGRGRDRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRQFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMD
Subjt:  MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGRGRDRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRQFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMD

Query:  GCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSRTNSGRFHDRRRSPPRYSRSPRYSRSPAPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYTSPPPKQRACSRSVSPR
        GCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSRTNSGRFHDRRRSPPRYSRSPRYSRSPAPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYTSPPPKQRACSRSVSPR
Subjt:  GCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSRTNSGRFHDRRRSPPRYSRSPRYSRSPAPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYTSPPPKQRACSRSVSPR

Query:  DRRDSRERSYPRQPSRGRSYSQSPRLNGSRSRSQSPARGGSRSQSPARGRSRSRSVSRSRSPRRSPRHEEEYRSDPNGDRSPSQ
        DRRDSRERSYPRQPSRGRSYSQSPRLNGSRSRSQSPARGGSRSQSPARGRSRSRSVSRSRSPRRSPRHEEEYRSDPNGDRSPSQ
Subjt:  DRRDSRERSYPRQPSRGRSYSQSPRLNGSRSRSQSPARGGSRSQSPARGRSRSRSVSRSRSPRRSPRHEEEYRSDPNGDRSPSQ

A0A6J1DIJ4 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A isoform X21.4e-14698.59Show/hide
Query:  MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGRGRDRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRQFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMD
        MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGRGRDRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRQFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMD
Subjt:  MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGRGRDRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRQFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMD

Query:  GCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSRTNSGRFHDRRRSPPRYSRSPRYSRSPAPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYTSPPPKQRACSRSVSPR
        GCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERG    SGRFHDRRRSPPRYSRSPRYSRSPAPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYTSPPPKQRACSRSVSPR
Subjt:  GCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSRTNSGRFHDRRRSPPRYSRSPRYSRSPAPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYTSPPPKQRACSRSVSPR

Query:  DRRDSRERSYPRQPSRGRSYSQSPRLNGSRSRSQSPARGGSRSQSPARGRSRSRSVSRSRSPRRSPRHEEEYRSDPNGDRSPSQ
        DRRDSRERSYPRQPSRGRSYSQSPRLNGSRSRSQSPARGGSRSQSPARGRSRSRSVSRSRSPRRSPRHEEEYRSDPNGDRSPSQ
Subjt:  DRRDSRERSYPRQPSRGRSYSQSPRLNGSRSRSQSPARGGSRSQSPARGRSRSRSVSRSRSPRRSPRHEEEYRSDPNGDRSPSQ

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O75494 Serine/arginine-rich splicing factor 102.3e-2440.32Show/hide
Query:  TSLLVRNLRHDCRPEDLRRQFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMDGCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSRTNSGR
        TSL VRN+  D R EDLRR+FG++G I D+Y+P D+YT  PRGF +VQ+ D  DA DA H +D   + GR++ + FA+ +RK P+ M+A+E  +  +S R
Subjt:  TSLLVRNLRHDCRPEDLRRQFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMDGCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSRTNSGR

Query:  FHD-------------RRRSPPRYSRSPRYSRSPAPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYTSPPPKQRACSRSVS-PRDRRDSRERSYPRQPSRGRSYSQS
        + D             RRRS  R S    Y RS +PR++R    P  R  RSRS S D      + R+ SRS S  R R  S+ +   +  SR RS S +
Subjt:  FHD-------------RRRSPPRYSRSPRYSRSPAPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYTSPPPKQRACSRSVS-PRDRRDSRERSYPRQPSRGRSYSQS

Query:  PRLNGSRSRSQSPARGG------SRSQSPARGRSRSRSVSRSRSPRRS
             S++ S++  + G      SR + P R +S+SRS SRSRS  RS
Subjt:  PRLNGSRSRSQSPARGG------SRSQSPARGRSRSRSVSRSRSPRRS

Q1PDV2 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL284.0e-2942.8Show/hide
Query:  RGRSYTP-----SPPRGYGRRGRSPSP-RGRYGGRGRDRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRQFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADA
        R RSY+P     SPPR   R+G   +  R R   R  +   P+ LL+RNL  D RP DLR  F +FG +KDIYLP++YYTGEPRGFGFV+Y    DAA+A
Subjt:  RGRSYTP-----SPPRGYGRRGRSPSP-RGRYGGRGRDRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRQFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADA

Query:  KHQMDGCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSRTNSGRFHDRRRSPPRYSRSPRYSRSPAPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYTSPPPKQRACSR
          +M+  V+ GRE+ +VFAEENRK P +MR     S  +        RSP R  RS   SRSP  R +R+          S+ R  D  SP  + R+ SR
Subjt:  KHQMDGCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSRTNSGRFHDRRRSPPRYSRSPRYSRSPAPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYTSPPPKQRACSR

Query:  SVSPRDRRDSRERSYPRQPSRGRSYSQSPRLNGSRSRSQSPAR
        S  PR+ R+ + R+  R P   R  +       SRSRS+S +R
Subjt:  SVSPRDRRDSRERSYPRQPSRGRSYSQSPRLNGSRSRSQSPAR

Q8L3X8 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL303.1e-2943.53Show/hide
Query:  RSYTP---SPP-RGYGRRGRSPSP-------RGRYGGRGRDRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRQFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADA
        R Y+P   SPP RGYG RGRSP P        G  GG GR      SLLVRN+  DCRPE+LR  F +FG ++D+Y+P+DYY+G+PRGF FV++VD  DA
Subjt:  RSYTP---SPP-RGYGRRGRSPSP-------RGRYGGRGRDRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRQFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADA

Query:  ADAKHQMDGCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARER-GSRTNSGRFHDRRRSPPRYSRSPRYSRSPAPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYTSPPPKQR
         +A+  M+     GRE+TVV A E+RK+P +MR + R  SR  SG    R RS  R SRS   SRS +PR    SRS      R RSRSY   SP P++ 
Subjt:  ADAKHQMDGCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARER-GSRTNSGRFHDRRRSPPRYSRSPRYSRSPAPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYTSPPPKQR

Query:  ACSRSVSPRDRRDSR--ERSYPRQPSRGRSYSQSPRLNGSRSRSQSPARGGSRSQSPARGRSRSRSVSRSRSPRRSPR
           R   PR   D     RSY        + +     NG     + P       +   R  SRS S SRSRS   SPR
Subjt:  ACSRSVSPRDRRDSR--ERSYPRQPSRGRSYSQSPRLNGSRSRSQSPARGGSRSQSPARGRSRSRSVSRSRSPRRSPR

Q9LHP2 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A9.5e-7963.7Show/hide
Query:  MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGRGRDRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRQFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMD
        MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGR+GG  RD DLPTSLLVRNLRHDCR EDLRR F QFG +KDIYLP+DYYTG+PRGFGF+Q++DPADAA+AKHQMD
Subjt:  MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGRGRDRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRQFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMD

Query:  GCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSRTNSGRFHDRRRSPPRYSRSPRYSRSPAPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYTSPPPKQRACSRSVSPR
        G +LLGRELTVVFAEENRKKP++MR R+RG R+N  RF DRRRSPPRYSRSP                P  R  RSRSRS  Y SPP K R  SRSVSP+
Subjt:  GCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSRTNSGRFHDRRRSPPRYSRSPRYSRSPAPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYTSPPPKQRACSRSVSPR

Query:  DRRDSRERSYPRQPSRGRSYSQSPRLNGSRSRSQSPARGGSRSQSPARG----RSRSRSVSRSRS----PRRSPRHEEEYRSDPNGDRSPSQ
        DRR  +E          RSYS+SP  NGSR RS SP R  S S+SP R     ++RS +  ++RS    PR+S       R   NGDRSPSQ
Subjt:  DRRDSRERSYPRQPSRGRSYSQSPRLNGSRSRSQSPARGGSRSQSPARG----RSRSRSVSRSRS----PRRSPRHEEEYRSDPNGDRSPSQ

Q9SEU4 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL333.8e-8065.51Show/hide
Query:  MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGRGRDRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRQFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMD
        MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYG  GR RDLPTSLLVRNLRHDCR EDLR+ F QFG +KDIYLP+DYYTG+PRGFGFVQ++DPADAADAKH MD
Subjt:  MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGRGRDRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRQFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMD

Query:  GCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSRTNSGRFHDRRRSPPRYSRSPRYSRSPAPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYTSPPPKQRACSRSVSPR
        G +LLGRELTVVFAEENRKKP++MRARERG     GRF DRRR+PPRY     YSR         SRSP PR  RSRSRS DY SPPP+ R   RS+SPR
Subjt:  GCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSRTNSGRFHDRRRSPPRYSRSPRYSRSPAPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYTSPPPKQRACSRSVSPR

Query:  DRR-DSRERSYPRQPSRGRSYSQSPRLNGSRSRSQSPARGGSRSQSPARGRSRSRSVSRSRSP----RRSPRHEEEYRSDPNGDRSP
        + R D R           RSYS+SP  +GSR RS +P RG SRS SP+  RS SRS  RSRSP     RS          P   RSP
Subjt:  DRR-DSRERSYPRQPSRGRSYSQSPRLNGSRSRSQSPARGGSRSQSPARGRSRSRSVSRSRSP----RRSPRHEEEYRSDPNGDRSP

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G55310.1 SC35-like splicing factor 332.7e-8165.51Show/hide
Query:  MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGRGRDRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRQFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMD
        MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYG  GR RDLPTSLLVRNLRHDCR EDLR+ F QFG +KDIYLP+DYYTG+PRGFGFVQ++DPADAADAKH MD
Subjt:  MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGRGRDRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRQFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMD

Query:  GCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSRTNSGRFHDRRRSPPRYSRSPRYSRSPAPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYTSPPPKQRACSRSVSPR
        G +LLGRELTVVFAEENRKKP++MRARERG     GRF DRRR+PPRY     YSR         SRSP PR  RSRSRS DY SPPP+ R   RS+SPR
Subjt:  GCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSRTNSGRFHDRRRSPPRYSRSPRYSRSPAPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYTSPPPKQRACSRSVSPR

Query:  DRR-DSRERSYPRQPSRGRSYSQSPRLNGSRSRSQSPARGGSRSQSPARGRSRSRSVSRSRSP----RRSPRHEEEYRSDPNGDRSP
        + R D R           RSYS+SP  +GSR RS +P RG SRS SP+  RS SRS  RSRSP     RS          P   RSP
Subjt:  DRR-DSRERSYPRQPSRGRSYSQSPRLNGSRSRSQSPARGGSRSQSPARGRSRSRSVSRSRSP----RRSPRHEEEYRSDPNGDRSP

AT1G55310.2 SC35-like splicing factor 331.5e-7969.08Show/hide
Query:  MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGRGRDRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRQFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMD
        MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYG  GR RDLPTSLLVRNLRHDCR EDLR+ F QFG +KDIYLP+DYYTG+PRGFGFVQ++DPADAADAKH MD
Subjt:  MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGRGRDRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRQFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMD

Query:  GCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSRTNSGRFHDRRRSPPRYSRSPRYSRSPAPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYTSPPPKQRACSRSVSPR
        G +LLGRELTVVFAEENRKKP++MRARERG     GRF DRRR+PPRY     YSR         SRSP PR  RSRSRS DY SPPP+ R   RS+SPR
Subjt:  GCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSRTNSGRFHDRRRSPPRYSRSPRYSRSPAPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYTSPPPKQRACSRSVSPR

Query:  DRR-DSRERSYPRQPSRGRSYSQSPRLNGSRSRSQSPARGGSRSQSPAR
        + R D R           RSYS+SP  +GSR RS +P RG SRS SP +
Subjt:  DRR-DSRERSYPRQPSRGRSYSQSPRLNGSRSRSQSPARGGSRSQSPAR

AT1G55310.3 SC35-like splicing factor 334.8e-7862.54Show/hide
Query:  MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGRGRDRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRQFGQFGAIKDIYLPKDYYTG------------EPRGFGFVQYVD
        MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYG  GR RDLPTSLLVRNLRHDCR EDLR+ F QFG +KDIYLP+DYYTG            +PRGFGFVQ++D
Subjt:  MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGRGRDRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRQFGQFGAIKDIYLPKDYYTG------------EPRGFGFVQYVD

Query:  PADAADAKHQMDGCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSRTNSGRFHDRRRSPPRYSRSPRYSRSPAPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYTSPPP
        PADAADAKH MDG +LLGRELTVVFAEENRKKP++MRARERG      RF DRRR+PPRY     YSR         SRSP PR  RSRSRS DY SPPP
Subjt:  PADAADAKHQMDGCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSRTNSGRFHDRRRSPPRYSRSPRYSRSPAPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYTSPPP

Query:  KQRACSRSVSPRDRR-DSRERSYPRQPSRGRSYSQSPRLNGSRSRSQSPARGGSRSQSPARGRSRSRSVSRSRSP----RRSPRHEEEYRSDPNGDRSP
        + R   RS+SPR+ R D R           RSYS+SP  +GSR RS +P RG SRS SP+  RS SRS  RSRSP     RS          P   RSP
Subjt:  KQRACSRSVSPRDRR-DSRERSYPRQPSRGRSYSQSPRLNGSRSRSQSPARGGSRSQSPARGRSRSRSVSRSRSP----RRSPRHEEEYRSDPNGDRSP

AT3G13570.1 SC35-like splicing factor 30A6.7e-8063.7Show/hide
Query:  MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGRGRDRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRQFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMD
        MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGR+GG  RD DLPTSLLVRNLRHDCR EDLRR F QFG +KDIYLP+DYYTG+PRGFGF+Q++DPADAA+AKHQMD
Subjt:  MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGRGRDRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRQFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMD

Query:  GCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSRTNSGRFHDRRRSPPRYSRSPRYSRSPAPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYTSPPPKQRACSRSVSPR
        G +LLGRELTVVFAEENRKKP++MR R+RG R+N  RF DRRRSPPRYSRSP                P  R  RSRSRS  Y SPP K R  SRSVSP+
Subjt:  GCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSRTNSGRFHDRRRSPPRYSRSPRYSRSPAPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYTSPPPKQRACSRSVSPR

Query:  DRRDSRERSYPRQPSRGRSYSQSPRLNGSRSRSQSPARGGSRSQSPARG----RSRSRSVSRSRS----PRRSPRHEEEYRSDPNGDRSPSQ
        DRR  +E          RSYS+SP  NGSR RS SP R  S S+SP R     ++RS +  ++RS    PR+S       R   NGDRSPSQ
Subjt:  DRRDSRERSYPRQPSRGRSYSQSPRLNGSRSRSQSPARGGSRSQSPARG----RSRSRSVSRSRS----PRRSPRHEEEYRSDPNGDRSPSQ

AT3G55460.1 SC35-like splicing factor 302.2e-3043.53Show/hide
Query:  RSYTP---SPP-RGYGRRGRSPSP-------RGRYGGRGRDRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRQFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADA
        R Y+P   SPP RGYG RGRSP P        G  GG GR      SLLVRN+  DCRPE+LR  F +FG ++D+Y+P+DYY+G+PRGF FV++VD  DA
Subjt:  RSYTP---SPP-RGYGRRGRSPSP-------RGRYGGRGRDRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRQFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADA

Query:  ADAKHQMDGCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARER-GSRTNSGRFHDRRRSPPRYSRSPRYSRSPAPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYTSPPPKQR
         +A+  M+     GRE+TVV A E+RK+P +MR + R  SR  SG    R RS  R SRS   SRS +PR    SRS      R RSRSY   SP P++ 
Subjt:  ADAKHQMDGCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARER-GSRTNSGRFHDRRRSPPRYSRSPRYSRSPAPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYTSPPPKQR

Query:  ACSRSVSPRDRRDSR--ERSYPRQPSRGRSYSQSPRLNGSRSRSQSPARGGSRSQSPARGRSRSRSVSRSRSPRRSPR
           R   PR   D     RSY        + +     NG     + P       +   R  SRS S SRSRS   SPR
Subjt:  ACSRSVSPRDRRDSR--ERSYPRQPSRGRSYSQSPRLNGSRSRSQSPARGGSRSQSPARGRSRSRSVSRSRSPRRSPR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCCATGTTCGGTTGATCGAGTCGAGCTACAGCGAGATTCTTGGACATTTGTTACTGTACAAATTATGAGGGGTAGGAGTTATACTCCATCGCCGCCAAGGGGT
TATGGGAGAAGGGGACGGAGCCCTAGCCCTAGGGGGCGCTATGGTGGACGTGGAAGGGACAGGGACCTTCCCACTAGCCTTCTAGTTCGTAATCTTCGCCATGAC
TGCAGGCCCGAGGATCTTCGTAGACAATTTGGACAGTTTGGTGCTATTAAGGACATATACCTTCCGAAGGATTATTATACTGGAGAACCACGTGGTTTCGGTTTT
GTTCAATATGTAGATCCTGCCGATGCTGCTGATGCTAAACACCAGATGGATGGCTGTGTTCTTCTTGGTAGGGAGTTGACTGTGGTATTTGCTGAGGAAAACAGG
AAGAAACCATCTGATATGAGGGCAAGGGAGAGAGGAAGTCGCACAAACAGTGGACGATTTCATGATCGAAGAAGGTCTCCTCCACGATATTCTCGTTCGCCTCGT
TACTCTCGTTCCCCGGCTCCACGCCATGCAAGGTATTCTCGTTCACCAGCTCCACGCCATGCAAGGTCTAGGTCCCGTAGTTATGATTACACTTCCCCACCACCA
AAACAAAGGGCATGCTCTAGGTCGGTGTCCCCCCGTGACAGACGGGACAGTCGAGAGAGGTCATACCCTCGGCAGCCTAGCCGAGGTAGGTCATACTCCCAGTCT
CCACGTCTCAATGGTTCAAGAAGTAGAAGCCAGAGTCCAGCGAGGGGCGGTAGCCGAAGTCAGAGTCCAGCGAGAGGCCGAAGTCGGAGCAGAAGTGTCAGCCGG
AGCAGAAGTCCACGACGAAGTCCGAGGCATGAAGAAGAGTACAGAAGTGATCCAAATGGAGATAGGAGCCCTAGTCAGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCCATGTTCGGTTGATCGAGTCGAGCTACAGCGAGATTCTTGGACATTTGTTACTGTACAAATTATGAGGGGTAGGAGTTATACTCCATCGCCGCCAAGGGGT
TATGGGAGAAGGGGACGGAGCCCTAGCCCTAGGGGGCGCTATGGTGGACGTGGAAGGGACAGGGACCTTCCCACTAGCCTTCTAGTTCGTAATCTTCGCCATGAC
TGCAGGCCCGAGGATCTTCGTAGACAATTTGGACAGTTTGGTGCTATTAAGGACATATACCTTCCGAAGGATTATTATACTGGAGAACCACGTGGTTTCGGTTTT
GTTCAATATGTAGATCCTGCCGATGCTGCTGATGCTAAACACCAGATGGATGGCTGTGTTCTTCTTGGTAGGGAGTTGACTGTGGTATTTGCTGAGGAAAACAGG
AAGAAACCATCTGATATGAGGGCAAGGGAGAGAGGAAGTCGCACAAACAGTGGACGATTTCATGATCGAAGAAGGTCTCCTCCACGATATTCTCGTTCGCCTCGT
TACTCTCGTTCCCCGGCTCCACGCCATGCAAGGTATTCTCGTTCACCAGCTCCACGCCATGCAAGGTCTAGGTCCCGTAGTTATGATTACACTTCCCCACCACCA
AAACAAAGGGCATGCTCTAGGTCGGTGTCCCCCCGTGACAGACGGGACAGTCGAGAGAGGTCATACCCTCGGCAGCCTAGCCGAGGTAGGTCATACTCCCAGTCT
CCACGTCTCAATGGTTCAAGAAGTAGAAGCCAGAGTCCAGCGAGGGGCGGTAGCCGAAGTCAGAGTCCAGCGAGAGGCCGAAGTCGGAGCAGAAGTGTCAGCCGG
AGCAGAAGTCCACGACGAAGTCCGAGGCATGAAGAAGAGTACAGAAGTGATCCAAATGGAGATAGGAGCCCTAGTCAGTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MPCSVDRVELQRDSWTFVTVQIMRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGRGRDRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRQFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGF
VQYVDPADAADAKHQMDGCVLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSRTNSGRFHDRRRSPPRYSRSPRYSRSPAPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYTSPPP
KQRACSRSVSPRDRRDSRERSYPRQPSRGRSYSQSPRLNGSRSRSQSPARGGSRSQSPARGRSRSRSVSRSRSPRRSPRHEEEYRSDPNGDRSPSQ