CuGenDBv2

Gene ID	Moc06g15090
Organism	Momordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
Description	ATP synthase subunit beta, chloroplastic
Genome location	chr6:11784506..11790024
RNA-Seq Expression	Moc06g15090
Synteny	Moc06g15090
Gene Ontology terms	GO:0015986 - ATP synthesis coupled proton transport (biological process) GO:0009535 - chloroplast thylakoid membrane (cellular component) GO:0045261 - proton-transporting ATP synthase complex, catalytic core F(1) (cellular component) GO:0005524 - ATP binding (molecular function) GO:0046933 - proton-transporting ATP synthase activity, rotational mechanism (molecular function) GO:0046961 - proton-transporting ATPase activity, rotational mechanism (molecular function)
InterPro domains	IPR004100 - ATPase, F1/V1/A1 complex, alpha/beta subunit, N-terminal domain IPR036121 - ATPase, F1/V1/A1 complex, alpha/beta subunit, N-terminal domain superfamily

Homology

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GenBank top hits

e value

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AAY44151.1 ATP synthase beta subunit, partial [Dendrosicyos socotranus]

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AAY44153.1 ATP synthase beta subunit, partial [Gurania tubulosa]

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CAB90104.1 ATP synthase beta subunit, partial [Kedrostis nana]

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YP_009456068.1 ATP synthase CF1 beta subunit [Momordica charantia]

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YP_009752082.1 CF1 subunit beta [Dendrosicyos socotranus]

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A0A2I6BZY4 ATP synthase subunit beta, chloroplastic

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A0A6H0EV22 ATP synthase subunit beta, chloroplastic

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A0A6M4SS17 ATP synthase subunit beta, chloroplastic

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Q29S91 ATP synthase subunit beta (Fragment)

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Q9MRB2 ATP synthase subunit beta (Fragment)

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SwissProt top hits

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A4QK25 ATP synthase subunit beta, chloroplastic

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A4QKB2 ATP synthase subunit beta, chloroplastic

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P19366 ATP synthase subunit beta, chloroplastic

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Q6QBP2 ATP synthase subunit beta, chloroplastic

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Q9MS49 ATP synthase subunit beta, chloroplastic

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Arabidopsis top hits

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AT5G08670.1 ATP synthase alpha/beta family protein

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AT5G08680.1 ATP synthase alpha/beta family protein

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AT5G08690.1 ATP synthase alpha/beta family protein

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ATCG00480.1 ATP synthase subunit beta

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Sequences

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CDS sequence

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ATGCCTAATATTTACAACGCTTTGGTAGTTAAGGGTCAAGATACTGCCGGTCAAGAAATTAATGTGACTTGTGAAGTACAACAATTATTAGGAAATAATCGAGTTAGAGC
TGTAGCTATGAGTGCTACAAATGGTCTAATGAGAGGAATTGACGTGATTGACATGAAAGGTCCTCTAAATGTTCCAGTCGGCGGAACGACTCTCGGCCGAATTTTCAACG
TGGAGTCGACTGAGCATAGGGAAGGCTCTCCTAAACCATGCGTCAATTCAACACCACAACTGACTGCGTTTGAGAGCGGGTCACTTAGATCTAACTCAAACAAGTGGGGT
GACGTAGATCGAGCTTCGAACGGATATGGGTATGCGCCAAACACTACGAAAACACTGCTGTCTGCGTTTTGCTGCAGTGAAAGCGCTTTAAATCCACCACCGATGTTGCT
GGATACTACGGAGGAACACGAGTCACCGAGTCTAAGTGGTATGGGTTGTGGGTTACTGCTAATCAGCCAAGACGTCGCCAAAATGCCATTGGAAACGTCGAAGCCGTTGG
ATTGTCGATCTGCACGCCGACGCCGCCAGACCCTACTCATCGCCGCGCCACCTAAGTCTCCGAATCGTCAGATTCTCTCATTAGGGAGGGTAATGCGGGTGGGTAACGAG
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CCCTCCCCCTCTTTCCATTACTGTTGCTATGGATGTAGAAGGTCAAGAACAGGTTATCGGTGATTCCGAGCACGACACAGAGCCATTGAAGCATTTGGATTCGGCCACGG
TCGAAATCCACTGCCAAATTGCGGCTCGGGCAATTTTGGAGAACACTTCACTGGCCACTCTACAAGGTATTTCGTCTCCAAATTTTCCAGATCTTACTTTGACTAAAAAG
CCTTTAGTTTTTTATGATTTAGAACAGGAGAAGACGACGTCGAAAATCGCCAAAATTTTAGTGGCTTTGAATGAAGACACGGAAGAAGATCCCTTGGAGGATGATGGAAA
CGGTAGGGATGCTCAAGAAAGACTGAATGTTGATGGAGAGGATGAGGATCTTGGAGATTTGCCCCAACAAGTTCACGGAGATGAGTTGCATGAGTCACATCAAGATGAGG
AGGAGGTCACTGTTCAAGTGCAAGAAGGAGCATCCGGTCTTGTGGATGTCCCTGATGAGGCCACGGATGAATCATCTTCCTCTTCTTCAAAAGGAGATCCTGTGAGAGTA
AGAGGTAAAGTGGTAAAATTCTCTCCTTTTGTTCTTAACACTCACTATGAGTTGTCGGATATGTTTGATGCAATAGCTAATGAGATTTTGGTGCATCCTACGGACAAACA
ATTGGAGGAGTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

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RGKVVKFSPFVLNTHYELSDMFDAIANEILVHPTDKQLEE

Moc06g15090 (gene) of Bitter gourd (OHB3-1) v2 genome