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Moc06g15910 (gene) of Bitter gourd (OHB3-1) v2 genome

Gene IDMoc06g15910
OrganismMomordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
DescriptionRetrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94
Genome locationchr6:12563535..12563873
RNA-Seq ExpressionMoc06g15910
SyntenyMoc06g15910
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_020205357.1 uncharacterized protein LOC109790584 [Cajanus cajan]6.6e-1148.98Show/hide
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        +V GLT  Y+GVATLI QSDP P FYQAR MLTLEEV   K VA  S++AM+AR  +     + +P +  N GGK++    +    N+   GG GGGK
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XP_020232008.1 uncharacterized protein LOC109812449 [Cajanus cajan]1.1e-1051.95Show/hide
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        +V GLT  Y+GVATLI QSDP P FYQAR MLTLEE    K VA  S++AM+A   +D    + +P +  N GGK++
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XP_021840488.1 keratin, type I cytoskeletal 9-like [Spinacia oleracea]1.6e-1252.59Show/hide
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        +V GLT AY+GV TL+ QS+P PPFYQAR MLTLEE    K  AI +  AMVA   R  +D      +P NRGN GGKK G +R+  G   RGGG GGGK
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           G HG  +   GGG
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XP_021854802.1 uncharacterized protein LOC110794167 [Spinacia oleracea]4.2e-1348.7Show/hide
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        +V GLT+AY+GV TL+ QS+P PPFYQAR MLTLEE    K  A  +  AMVA   R  ++      FP NR N GG+K     +G K RGG  GG    
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        +GG+G N+G  GG H
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XP_022149978.1 uncharacterized protein LOC111018261 [Momordica charantia]1.2e-52100Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A151RAW4 Uncharacterized protein (Fragment)1.6e-1048Show/hide
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        +V GL   Y+GVATLI QSDP P FYQAR MLTLEE    K VA  S++AM+AR  +       +P +  N GGK++       G+ R  N GRGG  GG
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A0A151S5P0 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-944.6e-1048.28Show/hide
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        +V GLT  Y+GVATLI QSDP P FYQAR MLTLEE    K  A  S++AM+A   +D      +P +  N GGK++ + R+ N+G+
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A0A1S2Y1C8 uncharacterized protein LOC1015013732.5e-0851.32Show/hide
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        +V GLT+AY GV TLI QS+P P FYQAR MLTLEE   +K  A  + AAM+A +  D+T       NR    GKK
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A0A6A4Q2R8 Uncharacterized protein3.6e-1046.49Show/hide
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        +V GLT+AY GVATLI QS+P PPFYQAR MLTLEE   +K  A  SN AMVA +  +     +FP +     N GGKK G + H        N+   GG
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Query:  CGGGKAVDGGHGEN
           GK    G G N
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A0A6J1D877 uncharacterized protein LOC1110182615.8e-53100Show/hide
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Query:  HGENNGRSGGGH
        HGENNGRSGGGH
Subjt:  HGENNGRSGGGH

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGTCGTTGGCCTCACAAATGCCTATAGTGGGGTTGCTACATTAATTTGCCAAAGCGACCCATTTCCACCGTTCTATCAAGCCCGTTTGATGCTCACTCTTGAA
GAAGTGAGTTTTGTGAAAAATGTGGCCATCGAATCGAATGCTGCCATGGTTGCTCGAAAGGTCAACGATGTTACCCCCACCTACATTTTCCCTTTAAATCGGGGT
AATTTTGGTGGTAAAAAGACTGGACGTTACCGTCATGGAAACAAGGGTCGTGGTGGGGGATGTGGCGGAGGGAAAGCTGTCGACGGTGGTCATGGCGAGAACAAC
GGGCGCAGTGGTGGTGGACATTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGTCGTTGGCCTCACAAATGCCTATAGTGGGGTTGCTACATTAATTTGCCAAAGCGACCCATTTCCACCGTTCTATCAAGCCCGTTTGATGCTCACTCTTGAA
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GGGCGCAGTGGTGGTGGACATTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MVVGLTNAYSGVATLICQSDPFPPFYQARLMLTLEEVSFVKNVAIESNAAMVARKVNDVTPTYIFPLNRGNFGGKKTGRYRHGNKGRGGGCGGGKAVDGGHGENN
GRSGGGH