; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Moc06g20110 (gene) of Bitter gourd (OHB3-1) v2 genome

Gene IDMoc06g20110
OrganismMomordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
DescriptionPhotosystem II CP47 reaction center protein
Genome locationchr6:15766368..15766857
RNA-Seq ExpressionMoc06g20110
SyntenyMoc06g20110
Gene Ontology termsGO:0009767 - photosynthetic electron transport chain (biological process)
GO:0018298 - protein-chromophore linkage (biological process)
GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
GO:0009521 - photosystem (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0043229 - intracellular organelle (cellular component)
GO:0016168 - chlorophyll binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000932 - Photosystem antenna protein-like
IPR036001 - Photosystem antenna protein-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
ART87556.1 PsbB, partial [Tsuga heterophylla]1.5e-0643.75Show/hide
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CAC87862.1 thylakoid structural protein, partial [Abies alba]1.5e-0643.75Show/hide
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KAB1668955.1 hypothetical protein ES319_1Z090200v1, partial [Gossypium barbadense]3.8e-0778.95Show/hide
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TYG86043.1 hypothetical protein ES288_A13G103400v1 [Gossypium darwinii]3.8e-0778.95Show/hide
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YP_009132482.1 photosystem II CP47 chlorophyll apoprotein [Abies koreana]1.5e-0643.75Show/hide
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A0A5D2DY64 Uncharacterized protein1.9e-0778.95Show/hide
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E1CH36 Photosystem II CP47 reaction center protein7.1e-0743.75Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A9LYC6 Photosystem II CP47 reaction center protein2.1e-0896.43Show/hide
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P41624 Photosystem II CP47 reaction center protein1.9e-0943.75Show/hide
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Q70XY1 Photosystem II CP47 reaction center protein1.2e-0843.75Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
ATCG00680.1 photosystem II reaction center protein B1.5e-0996.43Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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