CuGenDBv2

Gene ID	Moc06g36150
Organism	Momordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
Description	protein SAMBA isoform X2
Genome location	chr6:27772224..27774142
RNA-Seq Expression	Moc06g36150
Synteny	Moc06g36150
Gene Ontology terms	GO:0046621 - negative regulation of organ growth (biological process) GO:0010997 - anaphase-promoting complex binding (molecular function)
InterPro domains	IPR037547 - Protein SAMBA

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

XP_004136198.1 protein SAMBA isoform X2 [Cucumis sativus]

9.3e-41

89.9

Show/hide

Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQGGSFLKKTEEKRR
        MN+ SPANSS+STTAVAGRCSTNAA+S+DDFRFP+NLIS+PERKDEAM+ALKSNIMAALNKEVKSLDDD+WMFEGPRSRINLMSRQGG+FLKKTEEKRR
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQGGSFLKKTEEKRR

XP_008466003.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103503566 isoform X2 [Cucumis melo]

6.0e-40

88.89

Show/hide

Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQGGSFLKKTEEKRR
        MN+ SPANSS STTAVAGRCSTNAA+S+DDFRFP+NLIS+PERKDEAM+ALKSNIMAALNKEVKSLDDD+WMFEGPRSRINLMSRQGG+FLKKT+EKRR
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQGGSFLKKTEEKRR

XP_022131248.1 protein SAMBA isoform X2 [Momordica charantia]

5.3e-44

100

Show/hide

Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQGGSFLKKTEEKRR
        MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQGGSFLKKTEEKRR
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQGGSFLKKTEEKRR

XP_022149251.1 protein SAMBA-like isoform X2 [Momordica charantia]

6.4e-42

95.96

Show/hide

Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQGGSFLKKTEEKRR
        MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDE MSALKSNIMAALNKEVKSLDDD+WMFEGPRS INLMSRQGG FLKKTEEKRR
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQGGSFLKKTEEKRR

XP_038888368.1 protein SAMBA isoform X2 [Benincasa hispida]

1.9e-41

92.93

Show/hide

Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQGGSFLKKTEEKRR
        MN+SSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMS+DDFRFPANLIS+PERKDEAM+ALKSNIMAALNKEVKSLDDD+WMFEGPRSRINLMS+QGG FLKKTEEKRR
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQGGSFLKKTEEKRR

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0LK11 Uncharacterized protein

4.5e-41

89.9

Show/hide

Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQGGSFLKKTEEKRR
        MN+ SPANSS+STTAVAGRCSTNAA+S+DDFRFP+NLIS+PERKDEAM+ALKSNIMAALNKEVKSLDDD+WMFEGPRSRINLMSRQGG+FLKKTEEKRR
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQGGSFLKKTEEKRR

A0A1S3CQ76 uncharacterized protein LOC103503566 isoform X2

2.9e-40

88.89

Show/hide

Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQGGSFLKKTEEKRR
        MN+ SPANSS STTAVAGRCSTNAA+S+DDFRFP+NLIS+PERKDEAM+ALKSNIMAALNKEVKSLDDD+WMFEGPRSRINLMSRQGG+FLKKT+EKRR
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQGGSFLKKTEEKRR

A0A6J1BST3 protein SAMBA isoform X2

2.5e-44

100

Show/hide

Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQGGSFLKKTEEKRR
        MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQGGSFLKKTEEKRR
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQGGSFLKKTEEKRR

A0A6J1D7T9 protein SAMBA-like isoform X2

3.1e-42

95.96

Show/hide

Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQGGSFLKKTEEKRR
        MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDE MSALKSNIMAALNKEVKSLDDD+WMFEGPRS INLMSRQGG FLKKTEEKRR
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQGGSFLKKTEEKRR

A0A6J1HGF1 protein SAMBA isoform X2

4.2e-39

88.89

Show/hide

Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQGGSFLKKTEEKRR
        MN+SSPANSSISTT VAGRC+TNAAMS+DDFRFPANL+S+ ERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDD+WMFEGPRSRINLMSRQG  FLKKTEEK R
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQGGSFLKKTEEKRR

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

Q9C613 Protein SAMBA

1.2e-22

61.86

Show/hide

Query:  MNSSSPANSSISTTAVA-GRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQGGSFLKKTEE
        MN +SPA+S +STTAVA G  S+ AA  +DDF FP ++ S+ ERKDEAM  LK+++M  L+KEVKSL++DSWMFEGPRSRI+L+SR+ G+FLKK  E
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVA-GRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQGGSFLKKTEE

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT1G32310.1 unknown protein

8.4e-24

61.86

Show/hide

Query:  MNSSSPANSSISTTAVA-GRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQGGSFLKKTEE
        MN +SPA+S +STTAVA G  S+ AA  +DDF FP ++ S+ ERKDEAM  LK+++M  L+KEVKSL++DSWMFEGPRSRI+L+SR+ G+FLKK  E
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVA-GRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQGGSFLKKTEE

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGAATAGCTCCTCACCAGCTAATTCTTCCATTTCTACCACAGCGGTTGCCGGAAGATGTAGCACCAATGCAGCAATGTCAGTTGATGATTTTCGCTTCCCCGCAAATTT
AATTTCGATACCAGAGCGCAAGGACGAGGCCATGAGCGCTCTTAAATCTAATATAATGGCTGCGCTGAACAAGGAGGTCAAATCCCTGGATGATGATAGCTGGATGTTTG
AAGGTCCTCGCTCCCGTATCAATCTTATGTCACGACAAGGTGGTTCTTTCCTCAAAAAGACAGAAGAGAAGAGAAGATAA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQGGSFLKKTEEKRR

Moc06g36150 (gene) of Bitter gourd (OHB3-1) v2 genome