; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Moc07g00680 (gene) of Bitter gourd (OHB3-1) v2 genome

Gene IDMoc07g00680
OrganismMomordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
DescriptionPollen Ole e 1 allergen and extensin family protein
Genome locationchr7:426035..427251
RNA-Seq ExpressionMoc07g00680
SyntenyMoc07g00680
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0039837.1 extensin [Cucumis melo var. makuwa]2.8e-17082.01Show/hide
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XP_004140544.1 leucine-rich repeat extensin-like protein 3 [Cucumis sativus]3.9e-17281.27Show/hide
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XP_008459888.1 PREDICTED: extensin [Cucumis melo]2.8e-17082.01Show/hide
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XP_023515622.1 formin-2-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]6.8e-16978.16Show/hide
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        PSPP G Q+QKP
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XP_038906532.1 leucine-rich repeat extensin-like protein 5 [Benincasa hispida]2.0e-17383.76Show/hide
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        DP ISLLLL  LTS F+++FGLT     SVTRITVVGAVYCDTCLSN+ SK SYFLPGVDVHLQCKFRA+APKMAEQM+FSVNRTTDKYG YRLEIPSVD
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        TWIPH+P FSPPPPP FD RDPRTWIPHIPPFSP PPPAFDPRDPRTWIP+IPPFFPPPPPAFDLRDPRTWIPH+PPSPP  PQ+QKP
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KAD5 Uncharacterized protein1.9e-17281.27Show/hide
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                          PPLPPLPPLPP P+FP PTCPNPPSLPFPFPPLPPL PSPPSP  PS PPPPPPFSLSDPRTWIPY+SP SPPPP P  PPP
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A0A1S3CB81 extensin1.3e-17082.01Show/hide
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A0A5D3DMB9 Extensin1.3e-17082.01Show/hide
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                    PPLPPLPPLPP P+FPLPTCPNPPSLPFPFPPLPPL PSPPSPP PS PPPPPPFSLSDPRTWIPY+SP SPPPP P  PPPFSLSDP
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A0A6J1GPH0 formin-2-like2.8e-16877.67Show/hide
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        MDP ISLLL   L S F+++FGLT ET ASV RI+VVGAVYCDTCLSN+ SK SYFLPGVDVHLQCKFRA+APKMAEQMSFSVNRTTDKYG YRLEIPSV
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        DG NCVDGMTMQSFCQA LIG+SSEVCNVPGL T +EEIS+KSKQDNLCIFSLNALSYRP+KK+ SLCG++K+++PDPLTSSKFFLPFFPPY+FPFPFP 
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Query:  -------PLPPLPPLPPFPYFPLPTCPNPPSLPFPFPPLPPLLPSPPSPPAPSPPPPPPPFSLSDPRTWIPYISP-------------------------
               PLPPLPPLPP PYFPLP+CPNPPSLPFPFPPLPP  PSP SPP PS PPPPPPFSLSDPRTWIPY+SP                         
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Query:  ----LSPPPPSPYPPPPFSLSDPRTWIPHVPSFSPPPPPPFDLRDPRTWIPHIPPFSPPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPFFPPPPPAFDLRDPRTWIPHIP
            +SPPPP P PPPPFSLSDPRTWIPHVP FSPPPPP FD RDPRTWIPHIPPF+ PPPPAFDPRDPRTWIPHIPPFF PPPPAFDLRDPRTWIPH P
Subjt:  ----LSPPPPSPYPPPPFSLSDPRTWIPHVPSFSPPPPPPFDLRDPRTWIPHIPPFSPPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPFFPPPPPAFDLRDPRTWIPHIP

Query:  PSPPHGPQDQKP
        PSPP G Q+QKP
Subjt:  PSPPHGPQDQKP

A0A6J1JLM5 extensin-like5.5e-16477.32Show/hide
Query:  MDPAISLLLLLSLTSVFSDVFGLTPETSASVTRITVVGAVYCDTCLSNTFSKQSYFLPGVDVHLQCKFRAIAPKMAEQMSFSVNRTTDKYGAYRLEIPSV
        MDP ISLLL   L S F+++FGLT ET  SVTRI+VVGAVYCDTCLSN+ SK SYFLPGVDVHLQCKFRA+APKMAEQMSFSVNRTTDKYG YRLEIPSV
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Query:  DGINCVDGMTMQSFCQARLIGSSSEVCNVPGLTTTAEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPLKKDTSLCGNKKQESPDPLTSSKFFLPFFPPYAFPFPFP-
        DG NCVDGMTMQSFCQA LIG+S EVCNVPGL T +EEIS+KSKQDNLCIFSLNALSYRPLKK+ SLCG++K+++PDPLTSSKFFLPFFPPY+FPFPFP 
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Query:  -------PLPPLPPLPPFPYFPLPTCPNPPSLPFPFPPLPPLLPSPPSPPAPSPPPPPPPFSLSDPRTWIPYISPLSPPPP----SPYPPPPFSLSDPRT
               PLPPLPPLPP PY P P+CP PPSLPFPFPPLPP  PS  SPP PS PPPPPPFSLSDPRTWIPY+SP SPPPP    SP PPPPFSLSDPRT
Subjt:  -------PLPPLPPLPPFPYFPLPTCPNPPSLPFPFPPLPPLLPSPPSPPAPSPPPPPPPFSLSDPRTWIPYISPLSPPPP----SPYPPPPFSLSDPRT

Query:  WIPHVPSFSP-----------------------PPPPPFDLRDPRTWIPHIPPFSPPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPFFPPPPPAFDLRDPRTWIPHIPPS
        WIPHVP FSP                       PPPP FD RDPRTWIPHIPPF+ PPPPAFDPRDPRTWIPHIPPFF PPPPAFDLRDPRTWIPH PPS
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Query:  PPHGPQDQKP
        PP G Q+QKP
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9FPQ6 Vegetative cell wall protein gp11.4e-0442.57Show/hide
Query:  SPDPLTSSKFFLPFFPPYAFPFPFPPLPPLPPLPPFPYFPLPTCPNPPSLPFPFPPLP-PLLPSPPSPPAPSPPPPPPPFSLSDPRTWIPYISPLSPPPP
        SP P + S    P  P  + P P PPLPP  P PP P  P+P  P+PP  P P PP P P  PSPP PP+P+PP P PP   S         SP  P PP
Subjt:  SPDPLTSSKFFLPFFPPYAFPFPFPPLPPLPPLPPFPYFPLPTCPNPPSLPFPFPPLP-PLLPSPPSPPAPSPPPPPPPFSLSDPRTWIPYISPLSPPPP

Query:  SPYPPPPFSLSDPRTWIPHVPSFSPPPPPPFDLRDPRTWIPHIPPFSPPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPFFPPPPPAFDLRDPRTWIPHIPPSPPHGPQDQ
        SP PP P S + P    P  PS SPP PP             +PP   PP PA  P  P+   P  PP  PPPPP        T +P  PPSPP  P   
Subjt:  SPYPPPPFSLSDPRTWIPHVPSFSPPPPPPFDLRDPRTWIPHIPPFSPPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPFFPPPPPAFDLRDPRTWIPHIPPSPPHGPQDQ

Query:  KP
         P
Subjt:  KP

Q9T0K5 Leucine-rich repeat extensin-like protein 32.5e-0441.01Show/hide
Query:  SPDPLTSSKFFLPFFPPYAFPFPFPPLPPL--PPLPPFPYFPLPTCPNPPSLPFPFPPLPPLLPSPPSPPAPSPP---PPPPPFSLSDPRTWIP-----Y
        +P  LTS     P  P Y+ P P PP PP+  PP PP P  P P    PP  P P PP P   P PPSPP P PP   PPPPP     P  + P     Y
Subjt:  SPDPLTSSKFFLPFFPPYAFPFPFPPLPPL--PPLPPFPYFPLPTCPNPPSLPFPFPPLPPLLPSPPSPPAPSPP---PPPPPFSLSDPRTWIP-----Y

Query:  ISPLSPPPPSPYPPPPFSL--SDPRTWIPHVPSFSPPPPPPFDLRDPRTWIPHIPPFSPPPP--------PAFDPRDPRTWIPHIPP----FFPPPPPAF
         SP  PPPPSP P P +      P    P  P FSPPPP P+    P       PP SPPPP        P   P  P T +   PP      PPPPP  
Subjt:  ISPLSPPPPSPYPPPPFSL--SDPRTWIPHVPSFSPPPPPPFDLRDPRTWIPHIPPFSPPPP--------PAFDPRDPRTWIPHIPP----FFPPPPPAF

Query:  DLRDPRTWIPHIPPSPP
        +   P   I + PP PP
Subjt:  DLRDPRTWIPHIPPSPP

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G26960.1 Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein6.8e-3442.86Show/hide
Query:  LLLLLSLTSVFSDVFGLTPETSASVTRITVVGAVYCDTCLSNTFSKQSYFLPGVDVHLQCKFRAIAPKMAEQMSFSVNRTTDKYGAYRLEIPSVDGINCV
        LL  L + S+ S      P+  A    IT++G VYCD C  N+FSK SYF+ GV+V + C+F+A +    E ++FS NRTT+++G Y++ I S+D   C 
Subjt:  LLLLLSLTSVFSDVFGLTPETSASVTRITVVGAVYCDTCLSNTFSKQSYFLPGVDVHLQCKFRAIAPKMAEQMSFSVNRTTDKYGAYRLEIPSVDGINCV

Query:  DGMTMQSFCQARLIGS---SSEVCNVPGLTTTAEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPLKKDTSLCGNK
        D  ++ S CQA LIG    S   CN+PG  TT +++  KS+Q N C++  NAL++RP K+D +LCG K
Subjt:  DGMTMQSFCQARLIGS---SSEVCNVPGLTTTAEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPLKKDTSLCGNK

AT4G13340.1 Leucine-rich repeat (LRR) family protein1.8e-0541.01Show/hide
Query:  SPDPLTSSKFFLPFFPPYAFPFPFPPLPPL--PPLPPFPYFPLPTCPNPPSLPFPFPPLPPLLPSPPSPPAPSPP---PPPPPFSLSDPRTWIP-----Y
        +P  LTS     P  P Y+ P P PP PP+  PP PP P  P P    PP  P P PP P   P PPSPP P PP   PPPPP     P  + P     Y
Subjt:  SPDPLTSSKFFLPFFPPYAFPFPFPPLPPL--PPLPPFPYFPLPTCPNPPSLPFPFPPLPPLLPSPPSPPAPSPP---PPPPPFSLSDPRTWIP-----Y

Query:  ISPLSPPPPSPYPPPPFSL--SDPRTWIPHVPSFSPPPPPPFDLRDPRTWIPHIPPFSPPPP--------PAFDPRDPRTWIPHIPP----FFPPPPPAF
         SP  PPPPSP P P +      P    P  P FSPPPP P+    P       PP SPPPP        P   P  P T +   PP      PPPPP  
Subjt:  ISPLSPPPPSPYPPPPFSL--SDPRTWIPHVPSFSPPPPPPFDLRDPRTWIPHIPPFSPPPP--------PAFDPRDPRTWIPHIPP----FFPPPPPAF

Query:  DLRDPRTWIPHIPPSPP
        +   P   I + PP PP
Subjt:  DLRDPRTWIPHIPPSPP

AT5G13140.1 Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein4.6e-5448.82Show/hide
Query:  TRITVVGAVYCDTCLSNTFSKQSYFLPGVDVHLQCKFRAIAPKMAEQMSFSVNRTTDKYGAYRLEIPSVDGINCVDGMTMQSFCQARLIGSSSE---VCN
        +RITVVG VYCDTC  NTFS+QSYFL GV+VH+ C+F+A +PK AE+++ SVNRTT++ G Y+LEIP VDGI+CVDG+ + S C A+++ +SS+    C+
Subjt:  TRITVVGAVYCDTCLSNTFSKQSYFLPGVDVHLQCKFRAIAPKMAEQMSFSVNRTTDKYGAYRLEIPSVDGINCVDGMTMQSFCQARLIGSSSE---VCN

Query:  VPGLTTTAEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPLKKDTSLCGN-------KKQESPDPLTSSKFFLPFFPPYAFPFPFPPLPPLPPLPPFPYFPLPTCPNP
        +P   T   E+S+KSKQD +CI+SL+ALSY+P  K+TSLCGN       K ++       SKFF P+  PY FP+P+P LPPLP LPPFP FP       
Subjt:  VPGLTTTAEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPLKKDTSLCGN-------KKQESPDPLTSSKFFLPFFPPYAFPFPFPPLPPLPPLPPFPYFPLPTCPNP

Query:  PSLPFPFPPLPPLLPSPPSPPAPSPPPPPPPFSLSDPRTWIPYISPLSPPPPSP
        PSLPF  P L                   P F   +P TWIPY+    P   +P
Subjt:  PSLPFPFPPLPPLLPSPPSPPAPSPPPPPPPFSLSDPRTWIPYISPLSPPPPSP

AT5G41050.1 Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein2.5e-3644.64Show/hide
Query:  ISLLLLLSLTSVFSDVFGLTPETSASVTRITVVGAVYCDTCLSNTFSKQSYFLPGVDVHLQCKFRAIAPKMAEQMSFSVNRTTDKYGAYRLEIPSVDGIN
        I LLLLL L S+ S    L   ++    +ITV+G VYCD C +N+FS  SYF+PGV+V + C+F + + +  E ++FS NRTT++ G Y+L+I S++G+ 
Subjt:  ISLLLLLSLTSVFSDVFGLTPETSASVTRITVVGAVYCDTCLSNTFSKQSYFLPGVDVHLQCKFRAIAPKMAEQMSFSVNRTTDKYGAYRLEIPSVDGIN

Query:  CVDGM---TMQSFCQARLIGSSSEVCNVPGLTTTAEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPLKKDTSLCG
        C       ++ + CQA LIG S + CNVPG  TT E++  KSK  NLC++   AL++RPL+K+  LCG
Subjt:  CVDGM---TMQSFCQARLIGSSSEVCNVPGLTTTAEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPLKKDTSLCG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGATCCAGCAATCTCTCTCCTTCTCCTACTTTCTCTAACATCTGTCTTCTCTGATGTCTTTGGCCTAACACCCGAAACCTCAGCTTCGGTCACTCGAATCACGGTAGT
GGGTGCGGTTTATTGTGATACATGTTTAAGCAACACTTTCTCCAAACAGAGCTACTTCTTGCCTGGTGTGGATGTCCATTTGCAGTGCAAATTCAGAGCAATTGCTCCAA
AAATGGCAGAGCAGATGAGCTTCTCAGTCAACAGAACAACAGATAAATATGGAGCGTATAGATTGGAAATTCCATCTGTGGATGGAATTAATTGTGTTGATGGTATGACA
ATGCAGTCGTTTTGCCAGGCAAGATTAATAGGGAGCTCATCTGAGGTCTGCAATGTCCCAGGCTTGACGACTACAGCGGAAGAGATATCGGTCAAGTCTAAGCAAGATAA
TCTCTGTATATTCAGCTTAAATGCTTTAAGTTACAGGCCATTGAAGAAGGATACAAGTCTATGTGGGAATAAGAAACAGGAATCTCCAGATCCCTTGACCTCCTCAAAGT
TCTTTCTCCCTTTCTTCCCTCCTTATGCCTTCCCTTTCCCCTTTCCTCCTCTGCCTCCACTTCCTCCATTGCCCCCTTTTCCATATTTTCCTCTCCCTACTTGTCCAAAC
CCACCATCTCTACCATTTCCTTTTCCACCTTTACCTCCTCTACTTCCTTCACCTCCAAGCCCACCCGCACCCTCTCCTCCGCCTCCACCACCTCCATTTAGTCTCAGTGA
TCCTAGAACCTGGATACCCTATATTTCTCCACTTTCGCCTCCCCCACCTTCACCATATCCCCCACCTCCATTTAGTCTCAGCGATCCAAGGACCTGGATACCCCATGTTC
CTTCATTTTCCCCTCCCCCACCTCCTCCTTTCGATCTCCGGGACCCGAGAACCTGGATTCCCCATATTCCTCCATTTTCTCCTCCCCCACCTCCTGCATTTGATCCTAGA
GATCCAAGAACATGGATTCCCCATATTCCTCCCTTTTTCCCTCCCCCACCTCCAGCATTCGACCTTAGAGACCCCAGAACATGGATTCCCCATATCCCCCCATCCCCTCC
GCATGGCCCTCAAGACCAGAAGCCCTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGATCCAGCAATCTCTCTCCTTCTCCTACTTTCTCTAACATCTGTCTTCTCTGATGTCTTTGGCCTAACACCCGAAACCTCAGCTTCGGTCACTCGAATCACGGTAGT
GGGTGCGGTTTATTGTGATACATGTTTAAGCAACACTTTCTCCAAACAGAGCTACTTCTTGCCTGGTGTGGATGTCCATTTGCAGTGCAAATTCAGAGCAATTGCTCCAA
AAATGGCAGAGCAGATGAGCTTCTCAGTCAACAGAACAACAGATAAATATGGAGCGTATAGATTGGAAATTCCATCTGTGGATGGAATTAATTGTGTTGATGGTATGACA
ATGCAGTCGTTTTGCCAGGCAAGATTAATAGGGAGCTCATCTGAGGTCTGCAATGTCCCAGGCTTGACGACTACAGCGGAAGAGATATCGGTCAAGTCTAAGCAAGATAA
TCTCTGTATATTCAGCTTAAATGCTTTAAGTTACAGGCCATTGAAGAAGGATACAAGTCTATGTGGGAATAAGAAACAGGAATCTCCAGATCCCTTGACCTCCTCAAAGT
TCTTTCTCCCTTTCTTCCCTCCTTATGCCTTCCCTTTCCCCTTTCCTCCTCTGCCTCCACTTCCTCCATTGCCCCCTTTTCCATATTTTCCTCTCCCTACTTGTCCAAAC
CCACCATCTCTACCATTTCCTTTTCCACCTTTACCTCCTCTACTTCCTTCACCTCCAAGCCCACCCGCACCCTCTCCTCCGCCTCCACCACCTCCATTTAGTCTCAGTGA
TCCTAGAACCTGGATACCCTATATTTCTCCACTTTCGCCTCCCCCACCTTCACCATATCCCCCACCTCCATTTAGTCTCAGCGATCCAAGGACCTGGATACCCCATGTTC
CTTCATTTTCCCCTCCCCCACCTCCTCCTTTCGATCTCCGGGACCCGAGAACCTGGATTCCCCATATTCCTCCATTTTCTCCTCCCCCACCTCCTGCATTTGATCCTAGA
GATCCAAGAACATGGATTCCCCATATTCCTCCCTTTTTCCCTCCCCCACCTCCAGCATTCGACCTTAGAGACCCCAGAACATGGATTCCCCATATCCCCCCATCCCCTCC
GCATGGCCCTCAAGACCAGAAGCCCTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDPAISLLLLLSLTSVFSDVFGLTPETSASVTRITVVGAVYCDTCLSNTFSKQSYFLPGVDVHLQCKFRAIAPKMAEQMSFSVNRTTDKYGAYRLEIPSVDGINCVDGMT
MQSFCQARLIGSSSEVCNVPGLTTTAEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPLKKDTSLCGNKKQESPDPLTSSKFFLPFFPPYAFPFPFPPLPPLPPLPPFPYFPLPTCPN
PPSLPFPFPPLPPLLPSPPSPPAPSPPPPPPPFSLSDPRTWIPYISPLSPPPPSPYPPPPFSLSDPRTWIPHVPSFSPPPPPPFDLRDPRTWIPHIPPFSPPPPPAFDPR
DPRTWIPHIPPFFPPPPPAFDLRDPRTWIPHIPPSPPHGPQDQKP