; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Moc07g02780 (gene) of Bitter gourd (OHB3-1) v2 genome

Gene IDMoc07g02780
OrganismMomordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
Descriptionvesicle transport protein GOT1
Genome locationchr7:2424468..2428874
RNA-Seq ExpressionMoc07g02780
SyntenyMoc07g02780
Gene Ontology termsGO:0016192 - vesicle-mediated transport (biological process)
GO:0000139 - Golgi membrane (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR007305 - Vesicle transport protein, Got1/SFT2-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_022150442.1 vesicle transport protein GOT1 [Momordica charantia]1.5e-70100Show/hide
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XP_023547455.1 vesicle transport protein GOT1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.9e-6594.78Show/hide
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XP_038886555.1 vesicle transport protein GOT1 [Benincasa hispida]3.0e-6694.81Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KAR8 Uncharacterized protein1.2e-6592.59Show/hide
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A0A1S3BD64 vesicle transport protein GOT1B isoform X25.5e-6694.07Show/hide
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A0A6J1DA27 vesicle transport protein GOT17.4e-71100Show/hide
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A0A6J1ENZ4 vesicle transport protein GOT1 isoform X12.7e-6594.03Show/hide
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A0A6J1JPU2 vesicle transport protein GOT1 isoform X16.1e-6594.78Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q2YDE3 Vesicle transport protein GOT1B7.0e-2646.22Show/hide
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        LT+ +K+G+GL GFG FF F G+ILFFD+ LLA+GN+ ++ G+A ++G   T+  F  +   K +  FL G+F + + WP+IG++FEI+G F+LF GF+P
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         + GF+ ++PVLG +L  P
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Q6NMM1 Vesicle transport protein GOT14.7e-3051.91Show/hide
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        E+ + KK+GLGL GFG FFTFLGVI  FD+GL+A+GNI +L GV L +G       FT R N+KG+ SF LG   +   WPI G+L E +G  VLF GFW
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        P++  FL +IP+LGW+L  P I  L   +RG
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Q9CR60 Vesicle transport protein GOT1B3.1e-2647.06Show/hide
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        LT+ +K+G+GL GFG FF F G+ILFFD+ LLA+GN+ ++ G+A ++G   T+  F  R   K +  FL G+F + + WP+IG++FEI+G F+LF GF+P
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         + GF+ ++PVLG +L  P
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Q9DCQ3 Vesicle transport protein GOT1A1.2e-2044.35Show/hide
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        +TE +K+G+G+ GFG FF   G++L+FD  LLA GN+ +LTG++L++G R T+  F  R   KG++ FL G+  + +RWP++G+L E +G   LF GF+P
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         + GFL   + IP L
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Q9Y3E0 Vesicle transport protein GOT1B7.0e-2646.22Show/hide
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        LT+ +K+G+GL GFG FF F G+ILFFD+ LLA+GN+ ++ G+A ++G   T+  F  +   K +  FL G+F + + WP+IG++FEI+G F+LF GF+P
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         + GF+ ++PVLG +L  P
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G05785.1 Got1/Sft2-like vescicle transport protein family4.9e-5170.68Show/hide
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        GFW ++K FL QIP +GWI+ YP+M+LE L RG
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AT1G05785.2 Got1/Sft2-like vescicle transport protein family4.9e-5170.68Show/hide
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        M YE+TEQKKVGLGLIGFG  FTFLGVIL+FDRGLLALGN+FWL GV LLLGW+STW +FT+  N +G+  F+LGLF IFVRWPIIGI+ EI+G  VLFG
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AT3G49420.1 Got1/Sft2-like vescicle transport protein family7.7e-3652.85Show/hide
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AT5G01430.1 Got1/Sft2-like vescicle transport protein family7.7e-3652.85Show/hide
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AT5G01430.2 Got1/Sft2-like vescicle transport protein family7.7e-3652.85Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCTACGAATTGACTGAGCAAAAAAAAGTTGGACTTGGGCTGATTGGTTTTGGCTTCTTTTTCACATTTTTGGGTGTAATCCTGTTCTTTGACAGGGGATTGCTTGC
TTTAGGAAATATATTTTGGTTAACTGGAGTAGCACTTTTACTTGGTTGGCGTTCTACGTGGAATCTTTTTACCAGTCGAGCAAATTACAAGGGTTCTGCATCTTTTCTTC
TTGGGCTCTTCTTCATTTTTGTTCGCTGGCCCATAATTGGAATACTCTTCGAGATATTCGGCTGTTTCGTTCTCTTTGGTGGTTTCTGGCCCTCCATCAAAGGATTCTTG
TACCAGATTCCAGTTCTTGGGTGGATACTTCCGTACCCCATCATGATTCTTGAAAGCCTGTGGAGAGGAACTGGTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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YQIPVLGWILPYPIMILESLWRGTG