; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Moc08g15840 (gene) of Bitter gourd (OHB3-1) v2 genome

Gene IDMoc08g15840
OrganismMomordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
DescriptionCCHC-type domain-containing protein
Genome locationchr8:12188888..12189154
RNA-Seq ExpressionMoc08g15840
SyntenyMoc08g15840
Gene Ontology termsGO:0006468 - protein phosphorylation (biological process)
GO:0015074 - DNA integration (biological process)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0003676 - nucleic acid binding (molecular function)
GO:0004672 - protein kinase activity (molecular function)
GO:0005524 - ATP binding (molecular function)
GO:0008270 - zinc ion binding (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
AFB73911.1 polyprotein [Citrus sinensis]3.1e-2468.35Show/hide
Query:  MAAKYEIENFNGTNFSLWKMKMKAILRKDNCLAAINARPTNVTYDKWNEMDGNAVANLHLALVDKLLSSLGEENCERDL
        MAAKYEIE FNG NFSLWKMKMKA+LRK+NCLAAI  RP  +T DKWNE+DGNA+++LHLAL D +LSS+ E+N  +++
Subjt:  MAAKYEIENFNGTNFSLWKMKMKAILRKDNCLAAINARPTNVTYDKWNEMDGNAVANLHLALVDKLLSSLGEENCERDL

AFB73912.1 polyprotein [Citrus sinensis]1.6e-2367.09Show/hide
Query:  MAAKYEIENFNGTNFSLWKMKMKAILRKDNCLAAINARPTNVTYDKWNEMDGNAVANLHLALVDKLLSSLGEENCERDL
        MAAKYEIE FNG NFSLWKMKMKA+LRK+NCLAAI  RP  +T DKWNE+D NA+++LHLAL D +LSS+ E+N  +++
Subjt:  MAAKYEIENFNGTNFSLWKMKMKAILRKDNCLAAINARPTNVTYDKWNEMDGNAVANLHLALVDKLLSSLGEENCERDL

KAF2291302.1 hypothetical protein GH714_022364 [Hevea brasiliensis]1.8e-2467.9Show/hide
Query:  MAAKYEIENFNGTNFSLWKMKMKAILRKDNCLAAINARPTNVTYDKWNEMDGNAVANLHLALVDKLLSSLGEENCERDLGT
        MAAKYEIE FNG+NFSLWK+KM+AILRKDNCLAAI  RPT +T D+W EMD NA+ANLHLA+ D +LSS+ E   ++  GT
Subjt:  MAAKYEIENFNGTNFSLWKMKMKAILRKDNCLAAINARPTNVTYDKWNEMDGNAVANLHLALVDKLLSSLGEENCERDLGT

KAF2294513.1 hypothetical protein GH714_012115 [Hevea brasiliensis]3.5e-2365.82Show/hide
Query:  MAAKYEIENFNGTNFSLWKMKMKAILRKDNCLAAINARPTNVTYDKWNEMDGNAVANLHLALVDKLLSSLGEENCERDL
        MAAKYEIE FNG+NFSLWK+K++AILRKDNCLAAI  RPT +T D+W EMD NA+ANLHLA+ D +LSS+ E+   +++
Subjt:  MAAKYEIENFNGTNFSLWKMKMKAILRKDNCLAAINARPTNVTYDKWNEMDGNAVANLHLALVDKLLSSLGEENCERDL

KAF2314531.1 hypothetical protein GH714_027382 [Hevea brasiliensis]3.5e-2365.82Show/hide
Query:  MAAKYEIENFNGTNFSLWKMKMKAILRKDNCLAAINARPTNVTYDKWNEMDGNAVANLHLALVDKLLSSLGEENCERDL
        MAAKYEIE FNG+NFSLWK+K++AILRKDNCLAAI  RPT +T D+W EMD NA+ANLHLA+ D +LSS+ E+   +++
Subjt:  MAAKYEIENFNGTNFSLWKMKMKAILRKDNCLAAINARPTNVTYDKWNEMDGNAVANLHLALVDKLLSSLGEENCERDL

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6A6KQL2 CCHC-type domain-containing protein8.9e-2567.9Show/hide
Query:  MAAKYEIENFNGTNFSLWKMKMKAILRKDNCLAAINARPTNVTYDKWNEMDGNAVANLHLALVDKLLSSLGEENCERDLGT
        MAAKYEIE FNG+NFSLWK+KM+AILRKDNCLAAI  RPT +T D+W EMD NA+ANLHLA+ D +LSS+ E   ++  GT
Subjt:  MAAKYEIENFNGTNFSLWKMKMKAILRKDNCLAAINARPTNVTYDKWNEMDGNAVANLHLALVDKLLSSLGEENCERDLGT

A0A6A6L306 Uncharacterized protein1.7e-2365.82Show/hide
Query:  MAAKYEIENFNGTNFSLWKMKMKAILRKDNCLAAINARPTNVTYDKWNEMDGNAVANLHLALVDKLLSSLGEENCERDL
        MAAKYEIE FNG+NFSLWK+K++AILRKDNCLAAI  RPT +T D+W EMD NA+ANLHLA+ D +LSS+ E+   +++
Subjt:  MAAKYEIENFNGTNFSLWKMKMKAILRKDNCLAAINARPTNVTYDKWNEMDGNAVANLHLALVDKLLSSLGEENCERDL

A0A6A6MLA0 CCHC-type domain-containing protein1.7e-2365.82Show/hide
Query:  MAAKYEIENFNGTNFSLWKMKMKAILRKDNCLAAINARPTNVTYDKWNEMDGNAVANLHLALVDKLLSSLGEENCERDL
        MAAKYEIE FNG+NFSLWK+K++AILRKDNCLAAI  RPT +T D+W EMD NA+ANLHLA+ D +LSS+ E+   +++
Subjt:  MAAKYEIENFNGTNFSLWKMKMKAILRKDNCLAAINARPTNVTYDKWNEMDGNAVANLHLALVDKLLSSLGEENCERDL

H6U1E9 Polyprotein1.5e-2468.35Show/hide
Query:  MAAKYEIENFNGTNFSLWKMKMKAILRKDNCLAAINARPTNVTYDKWNEMDGNAVANLHLALVDKLLSSLGEENCERDL
        MAAKYEIE FNG NFSLWKMKMKA+LRK+NCLAAI  RP  +T DKWNE+DGNA+++LHLAL D +LSS+ E+N  +++
Subjt:  MAAKYEIENFNGTNFSLWKMKMKAILRKDNCLAAINARPTNVTYDKWNEMDGNAVANLHLALVDKLLSSLGEENCERDL

H6U1F0 Polyprotein7.6e-2467.09Show/hide
Query:  MAAKYEIENFNGTNFSLWKMKMKAILRKDNCLAAINARPTNVTYDKWNEMDGNAVANLHLALVDKLLSSLGEENCERDL
        MAAKYEIE FNG NFSLWKMKMKA+LRK+NCLAAI  RP  +T DKWNE+D NA+++LHLAL D +LSS+ E+N  +++
Subjt:  MAAKYEIENFNGTNFSLWKMKMKAILRKDNCLAAINARPTNVTYDKWNEMDGNAVANLHLALVDKLLSSLGEENCERDL

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGGCAAAGTACGAGATTGAGAATTTCAACGGGACTAATTTCTCGTTGTGGAAGATGAAGATGAAGGCTATCTTGAGAAAAGATAACTGCCTTGCAGCCATCAATGC
GAGACCGACGAATGTCACATATGATAAGTGGAACGAGATGGATGGGAATGCTGTTGCAAATCTTCATCTAGCTCTAGTAGATAAATTGTTGTCAAGCCTAGGAGAAGAAA
ACTGCGAAAGAGATTTGGGAACATCTCGGAAAGTTGTACGAAGCTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCGGCAAAGTACGAGATTGAGAATTTCAACGGGACTAATTTCTCGTTGTGGAAGATGAAGATGAAGGCTATCTTGAGAAAAGATAACTGCCTTGCAGCCATCAATGC
GAGACCGACGAATGTCACATATGATAAGTGGAACGAGATGGATGGGAATGCTGTTGCAAATCTTCATCTAGCTCTAGTAGATAAATTGTTGTCAAGCCTAGGAGAAGAAA
ACTGCGAAAGAGATTTGGGAACATCTCGGAAAGTTGTACGAAGCTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAAKYEIENFNGTNFSLWKMKMKAILRKDNCLAAINARPTNVTYDKWNEMDGNAVANLHLALVDKLLSSLGEENCERDLGTSRKVVRS