; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Moc08g41540 (gene) of Bitter gourd (OHB3-1) v2 genome

Gene IDMoc08g41540
OrganismMomordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
DescriptionGDSL esterase/lipase
Genome locationchr8:31823242..31827032
RNA-Seq ExpressionMoc08g41540
SyntenyMoc08g41540
Gene Ontology termsGO:0016788 - hydrolase activity, acting on ester bonds (molecular function)
InterPro domainsIPR001087 - GDSL lipase/esterase
IPR035669 - GDSL lipase/esterase-like, plant
IPR036514 - SGNH hydrolase superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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A0A6J1KFS3 acetylajmalan esterase-like1.8e-14584.35Show/hide
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Q3MKY2 Acetylajmalan esterase2.0e-6945.76Show/hide
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Q8RXT9 GDSL esterase/lipase At1g285901.6e-6644.82Show/hide
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Q94F40 GDSL esterase/lipase At1g286001.7e-6544.15Show/hide
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Q9FXJ1 GDSL esterase/lipase At1g285706.0e-6644.52Show/hide
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          P TN SL  QL        ++C++  DC + + ++L L+GEIGGNDYNYA F GK I+E+K++VP V++TI +A+ ++I  G    +VPG FP+GC  
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Query:  IYLTGFQTNDTTAYDEL-HCLKGLNSLASYHNDQIKQAIEVLKRENPHTVIVYGDYYNALLWILRHAFVLGFDEASLQKSCCGIGGNYNFNL
         YL+ +QT++   YD L  CLK LN  + YH++Q++  +  L++  PH  I+Y DYYN LL + +     GF    L  +CC +GG +NF L
Subjt:  IYLTGFQTNDTTAYDEL-HCLKGLNSLASYHNDQIKQAIEVLKRENPHTVIVYGDYYNALLWILRHAFVLGFDEASLQKSCCGIGGNYNFNL

Q9SHP6 GDSL esterase/lipase At1g286101.5e-6443.96Show/hide
Query:  DAIYQLGDSISDTGNLI-----RENPNTTFSRLPYGETFFHGATGRCSNGLLMLDYFALDTGLPLVNP-YLNKNALKNRGVNFAVAGSTALSSETLFRNK
        ++I   GDSI+DTGNL+        P T F  LPYGETFFH  TGR  NG +++D+ A   GLP V P Y +KN    +GVNFAVAG+TAL +  L +  
Subjt:  DAIYQLGDSISDTGNLI-----RENPNTTFSRLPYGETFFHGATGRCSNGLLMLDYFALDTGLPLVNP-YLNKNALKNRGVNFAVAGSTALSSETLFRNK

Query:  IFSPVTNSSLDRQLGWMHSHFESICLNERDCVEKLGSALFLVGEIGGNDYNYALFQGKTIQEVKDMVPDVVQTIKNAVEKVISYGATRVIVPGNFPIGCL
        I+ P +N SL  QL        ++C +  DC + +G+A  ++GEIGGND+N+A F  KT  EVK++VP V+  I +A+ +++  G    +VPGNFP+GC 
Subjt:  IFSPVTNSSLDRQLGWMHSHFESICLNERDCVEKLGSALFLVGEIGGNDYNYALFQGKTIQEVKDMVPDVVQTIKNAVEKVISYGATRVIVPGNFPIGCL

Query:  PIYLTGFQTNDTTAYDEL-HCLKGLNSLASYHNDQIKQAIEVLKRENPHTVIVYGDYYNALLWILRHAFVLGFDEASLQKSCCGIGGNYNFNLIKICG
          YLT +QT++   YD L  CL  LN  + Y+N++++  +  L +  PH  I+YGDY+NALL + +     GF +  L  +CCG+GG YNF L K CG
Subjt:  PIYLTGFQTNDTTAYDEL-HCLKGLNSLASYHNDQIKQAIEVLKRENPHTVIVYGDYYNALLWILRHAFVLGFDEASLQKSCCGIGGNYNFNLIKICG

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G28570.1 SGNH hydrolase-type esterase superfamily protein4.2e-6744.52Show/hide
Query:  FDAIYQLGDSISDTGNLIRENPNTTFSR---LPYGETFFHGATGRCSNGLLMLDYFALDTGLPLVNP-YLNKNALKNRGVNFAVAGSTALSSETLFRNKI
        F +I   GDSI+DTGNL+  +  T   +   LPYGETFFH  TGR SNG L++D+ A   G PLV P Y ++NA   +GVNFAV G+TAL    L    I
Subjt:  FDAIYQLGDSISDTGNLIRENPNTTFSR---LPYGETFFHGATGRCSNGLLMLDYFALDTGLPLVNP-YLNKNALKNRGVNFAVAGSTALSSETLFRNKI

Query:  FSPVTNSSLDRQLGWMHSHFESICLNERDCVEKLGSALFLVGEIGGNDYNYALFQGKTIQEVKDMVPDVVQTIKNAVEKVISYGATRVIVPGNFPIGCLP
          P TN SL  QL        ++C++  DC + + ++L L+GEIGGNDYNYA F GK I+E+K++VP V++TI +A+ ++I  G    +VPG FP+GC  
Subjt:  FSPVTNSSLDRQLGWMHSHFESICLNERDCVEKLGSALFLVGEIGGNDYNYALFQGKTIQEVKDMVPDVVQTIKNAVEKVISYGATRVIVPGNFPIGCLP

Query:  IYLTGFQTNDTTAYDEL-HCLKGLNSLASYHNDQIKQAIEVLKRENPHTVIVYGDYYNALLWILRHAFVLGFDEASLQKSCCGIGGNYNFNL
         YL+ +QT++   YD L  CLK LN  + YH++Q++  +  L++  PH  I+Y DYYN LL + +     GF    L  +CC +GG +NF L
Subjt:  IYLTGFQTNDTTAYDEL-HCLKGLNSLASYHNDQIKQAIEVLKRENPHTVIVYGDYYNALLWILRHAFVLGFDEASLQKSCCGIGGNYNFNL

AT1G28580.1 GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein1.0e-6544.48Show/hide
Query:  FDAIYQLGDSISDTGNLI-----RENPNTTFSRLPYGETFFHGATGRCSNGLLMLDYFALDTGLPLVNP-YLNKNALKNRGVNFAVAGSTALSSETLFRN
        F +I   GDSI+DTGNL+     ++ P+  F   PYGE FFH  TGR SNG L++D+ A   GLPLV P Y + NA   +GVNFAV G+TAL    L   
Subjt:  FDAIYQLGDSISDTGNLI-----RENPNTTFSRLPYGETFFHGATGRCSNGLLMLDYFALDTGLPLVNP-YLNKNALKNRGVNFAVAGSTALSSETLFRN

Query:  KIFSPVTNSSLDRQLGWMHSHFESICLNERDCVEKLGSALFLVGEIGGNDYNYALFQGKTIQEVKDMVPDVVQTIKNAVEKVISYGATRVIVPGNFPIGC
         I  P TN SL  QL        SIC +  DC + + +AL L+GEIGGNDYNYA F  K I+E+K+++P V+ TI +A+ ++I  G    +VPG FP+GC
Subjt:  KIFSPVTNSSLDRQLGWMHSHFESICLNERDCVEKLGSALFLVGEIGGNDYNYALFQGKTIQEVKDMVPDVVQTIKNAVEKVISYGATRVIVPGNFPIGC

Query:  LPIYLTGFQTNDTTAYDEL-HCLKGLNSLASYHNDQIKQAIEVLKRENPHTVIVYGDYYNALLWILRHAFVLGFDEASLQKSCCGIGGNYNFNLIKICG
          +YLT  QT++   YD L  CLK LN     H +Q++  +  L++  PH  I+Y DYYNAL  + +     GF    L  +CCG GG YN+ + + CG
Subjt:  LPIYLTGFQTNDTTAYDEL-HCLKGLNSLASYHNDQIKQAIEVLKRENPHTVIVYGDYYNALLWILRHAFVLGFDEASLQKSCCGIGGNYNFNLIKICG

AT1G28590.1 GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein1.1e-6744.82Show/hide
Query:  FDAIYQLGDSISDTGNLI-----RENPNTTFSRLPYGETFFHGATGRCSNGLLMLDYFALDTGLPLVNPYLN-KNALKNRGVNFAVAGSTALSSETLFRN
        F +I   GDSI+DTGNL+      + P + F   PYGETFFH  TGR S+G L++D+ A   G PLV P+   +NA   +GVNFAVAG+TAL    L   
Subjt:  FDAIYQLGDSISDTGNLI-----RENPNTTFSRLPYGETFFHGATGRCSNGLLMLDYFALDTGLPLVNPYLN-KNALKNRGVNFAVAGSTALSSETLFRN

Query:  KIFSPVTNSSLDRQLGWMHSHFESICLNERDCVEKLGSALFLVGEIGGNDYNYALFQGKTIQEVKDMVPDVVQTIKNAVEKVISYGATRVIVPGNFPIGC
         I S +TN SL  QL        ++C +  DC + + +AL L+GEIGGNDYN+ALFQ K ++EV+++VP V+ TI +A+ +++  G    +VPGNFPIG 
Subjt:  KIFSPVTNSSLDRQLGWMHSHFESICLNERDCVEKLGSALFLVGEIGGNDYNYALFQGKTIQEVKDMVPDVVQTIKNAVEKVISYGATRVIVPGNFPIGC

Query:  LPIYLTGFQTNDTTAYDEL-HCLKGLNSLASYHNDQIKQAIEVLKRENPHTVIVYGDYYNALLWILRHAFVLGFDEASLQKSCCGIGGNYNFNLIKICG
           YLT ++T++   YD L  CLK LN  + Y+N Q+++ +  L++  PH  I+Y DYYNALL + +     GF    L  +CCG+GG+YNFN  + CG
Subjt:  LPIYLTGFQTNDTTAYDEL-HCLKGLNSLASYHNDQIKQAIEVLKRENPHTVIVYGDYYNALLWILRHAFVLGFDEASLQKSCCGIGGNYNFNLIKICG

AT1G28600.1 GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein1.2e-6644.15Show/hide
Query:  FDAIYQLGDSISDTGNLI-----RENPNTTFSRLPYGETFFHGATGRCSNGLLMLDYFALDTGLPLVNPYL-NKNALKNRGVNFAVAGSTALSSETLFRN
        F +I   GDSI+DTGNL+      + P T F   PYGETFFH  TGR  +G +++D+ A   GLP V PY  +KN   ++GVNFAVAG+TAL S  L + 
Subjt:  FDAIYQLGDSISDTGNLI-----RENPNTTFSRLPYGETFFHGATGRCSNGLLMLDYFALDTGLPLVNPYL-NKNALKNRGVNFAVAGSTALSSETLFRN

Query:  KIFSPVTNSSLDRQLGWMHSHFESICLNERDCVEKLGSALFLVGEIGGNDYNYALFQGKTIQEVKDMVPDVVQTIKNAVEKVISYGATRVIVPGNFPIGC
         I  P TN SL  QL        ++C +  DC + +G+AL L+GEIGGNDYN+  F  K ++EV+++VP V+ +I + + ++I  G    +VPG FPIGC
Subjt:  KIFSPVTNSSLDRQLGWMHSHFESICLNERDCVEKLGSALFLVGEIGGNDYNYALFQGKTIQEVKDMVPDVVQTIKNAVEKVISYGATRVIVPGNFPIGC

Query:  LPIYLTGFQTNDTTAYD-ELHCLKGLNSLASYHNDQIKQAIEVLKRENPHTVIVYGDYYNALLWILRHAFVLGFDEASLQKSCCGIGGNYNFNLIKICG
          +YLT ++T++   YD    CLK LN    YH++++K  +  L++  PH  I+Y DYYN+LL I +     GF E     +CCGIGG YNFN  + CG
Subjt:  LPIYLTGFQTNDTTAYD-ELHCLKGLNSLASYHNDQIKQAIEVLKRENPHTVIVYGDYYNALLWILRHAFVLGFDEASLQKSCCGIGGNYNFNLIKICG

AT1G28650.1 GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein1.0e-6543.14Show/hide
Query:  FDAIYQLGDSISDTGNLIREN-----PNTTFSRLPYGETFFHGATGRCSNGLLMLDYFALDTGLPLVNPYL-NKNALKNRGVNFAVAGSTALSSETLFRN
        + +I   GDSI+DTGN +  +     P   F  LPYGE+FFH  +GR S+G L++D+ A   GLP V PY  ++N   N+G+NFAV G+TAL    L + 
Subjt:  FDAIYQLGDSISDTGNLIREN-----PNTTFSRLPYGETFFHGATGRCSNGLLMLDYFALDTGLPLVNPYL-NKNALKNRGVNFAVAGSTALSSETLFRN

Query:  KIFSPVTNSSLDRQLGWMHSHFESICLNE-RDCVEKLGSALFLVGEIGGNDYNYALFQGKTIQEVKDMVPDVVQTIKNAVEKVISYGATRVIVPGNFPIG
         I S  TN SL  QL        ++C +  RDC E LG +L L+GEIGGNDYNY  F+GK+I E+K++VP +++ I +A+  +I  G    +VPGNFPIG
Subjt:  KIFSPVTNSSLDRQLGWMHSHFESICLNE-RDCVEKLGSALFLVGEIGGNDYNYALFQGKTIQEVKDMVPDVVQTIKNAVEKVISYGATRVIVPGNFPIG

Query:  CLPIYLTGFQTNDTTAYDELHCLKGLNSLASYHNDQIKQAIEVLKRENPHTVIVYGDYYNALLWILRHAFVLGFDEASLQKSCCGIGGNYNFNLIKICG
        C   YLT FQT          C+  LN    +HN+Q+K  ++ L++  PH  I+Y DYYN+L  + +     GF    L  +CCG+GG YNF + K CG
Subjt:  CLPIYLTGFQTNDTTAYDELHCLKGLNSLASYHNDQIKQAIEVLKRENPHTVIVYGDYYNALLWILRHAFVLGFDEASLQKSCCGIGGNYNFNLIKICG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTCGATGCAATATACCAACTCGGGGACTCAATCTCCGACACTGGAAATCTCATCCGTGAAAATCCTAATACTACCTTCTCTCGCCTTCCCTATGGTGAAACC
TTCTTCCATGGAGCCACTGGCCGCTGCTCTAACGGCTTACTCATGCTCGATTACTTCGCTTTGGATACGGGACTTCCGTTGGTGAATCCTTATCTTAACAAAAAT
GCTTTGAAGAATCGTGGAGTGAATTTTGCAGTGGCTGGTTCTACCGCTTTGTCTTCCGAGACTCTTTTCCGCAATAAAATCTTTTCTCCAGTTACCAATTCTTCT
CTCGATCGTCAGCTTGGTTGGATGCACTCTCATTTTGAATCTATTTGTCTAAATGAAAGAGATTGCGTTGAGAAGTTAGGGAGTGCTTTGTTCTTGGTGGGCGAG
ATTGGCGGGAATGATTATAATTATGCTTTGTTCCAAGGTAAAACTATTCAAGAGGTGAAAGATATGGTGCCAGATGTTGTTCAAACCATAAAGAATGCAGTTGAG
AAAGTGATAAGTTATGGTGCTACTCGAGTCATTGTTCCTGGAAACTTTCCAATTGGATGTTTACCCATCTATCTCACCGGATTCCAAACCAATGATACAACCGCT
TATGATGAACTTCATTGTTTGAAGGGTTTGAATAGTTTGGCCAGTTATCACAATGATCAAATCAAGCAAGCTATTGAAGTACTCAAAAGGGAGAATCCACATACT
GTTATCGTATATGGCGACTACTATAATGCATTGCTTTGGATTCTTCGCCATGCTTTTGTGCTCGGATTTGATGAAGCTTCTTTGCAAAAATCATGCTGTGGGATT
GGAGGGAACTACAATTTTAACCTCATAAAGATTTGCGGACTTCCTGATATCTTGAACCAAATTTATTTCGGATCTGAAATGACCAGAGGGTCGTCGTGGTCGCCA
GTGGTTGTGGGCGTGGAGCGGTCGTCGGTATATTCTGAAACGGCAGTGGTGCCGGACACCGGTGGTCGGCGTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTTCGATGCAATATACCAACTCGGGGACTCAATCTCCGACACTGGAAATCTCATCCGTGAAAATCCTAATACTACCTTCTCTCGCCTTCCCTATGGTGAAACC
TTCTTCCATGGAGCCACTGGCCGCTGCTCTAACGGCTTACTCATGCTCGATTACTTCGCTTTGGATACGGGACTTCCGTTGGTGAATCCTTATCTTAACAAAAAT
GCTTTGAAGAATCGTGGAGTGAATTTTGCAGTGGCTGGTTCTACCGCTTTGTCTTCCGAGACTCTTTTCCGCAATAAAATCTTTTCTCCAGTTACCAATTCTTCT
CTCGATCGTCAGCTTGGTTGGATGCACTCTCATTTTGAATCTATTTGTCTAAATGAAAGAGATTGCGTTGAGAAGTTAGGGAGTGCTTTGTTCTTGGTGGGCGAG
ATTGGCGGGAATGATTATAATTATGCTTTGTTCCAAGGTAAAACTATTCAAGAGGTGAAAGATATGGTGCCAGATGTTGTTCAAACCATAAAGAATGCAGTTGAG
AAAGTGATAAGTTATGGTGCTACTCGAGTCATTGTTCCTGGAAACTTTCCAATTGGATGTTTACCCATCTATCTCACCGGATTCCAAACCAATGATACAACCGCT
TATGATGAACTTCATTGTTTGAAGGGTTTGAATAGTTTGGCCAGTTATCACAATGATCAAATCAAGCAAGCTATTGAAGTACTCAAAAGGGAGAATCCACATACT
GTTATCGTATATGGCGACTACTATAATGCATTGCTTTGGATTCTTCGCCATGCTTTTGTGCTCGGATTTGATGAAGCTTCTTTGCAAAAATCATGCTGTGGGATT
GGAGGGAACTACAATTTTAACCTCATAAAGATTTGCGGACTTCCTGATATCTTGAACCAAATTTATTTCGGATCTGAAATGACCAGAGGGTCGTCGTGGTCGCCA
GTGGTTGTGGGCGTGGAGCGGTCGTCGGTATATTCTGAAACGGCAGTGGTGCCGGACACCGGTGGTCGGCGTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MFDAIYQLGDSISDTGNLIRENPNTTFSRLPYGETFFHGATGRCSNGLLMLDYFALDTGLPLVNPYLNKNALKNRGVNFAVAGSTALSSETLFRNKIFSPVTNSS
LDRQLGWMHSHFESICLNERDCVEKLGSALFLVGEIGGNDYNYALFQGKTIQEVKDMVPDVVQTIKNAVEKVISYGATRVIVPGNFPIGCLPIYLTGFQTNDTTA
YDELHCLKGLNSLASYHNDQIKQAIEVLKRENPHTVIVYGDYYNALLWILRHAFVLGFDEASLQKSCCGIGGNYNFNLIKICGLPDILNQIYFGSEMTRGSSWSP
VVVGVERSSVYSETAVVPDTGGRR