; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Moc09g14230 (gene) of Bitter gourd (OHB3-1) v2 genome

Gene IDMoc09g14230
OrganismMomordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
Descriptionsurvival of motor neuron-related-splicing factor 30
Genome locationchr9:12126628..12134235
RNA-Seq ExpressionMoc09g14230
SyntenyMoc09g14230
Gene Ontology termsGO:0006397 - mRNA processing (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
GO:0003723 - RNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR002999 - Tudor domain
IPR010304 - Survival motor neuron


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7032438.1 Survival of motor neuron-related-splicing factor 30 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.2e-14485.76Show/hide
Query:  MQGGEDVSIEELASNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEE------------------------VISLTEELLATAKQNEISGSNVETGDNS
        MQGGEDVS+EELA+NLSTYKDQLQQVR+LLDDDP NSEYIDMEKELEE                        VI+LTEELL+TAKQNEISGSNVETGD+S
Subjt:  MQGGEDVSIEELASNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEE------------------------VISLTEELLATAKQNEISGSNVETGDNS

Query:  ASISFLQSKETKMEAESLSDHHEKFPIGSKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDSWGNKEEVDPANVREIQQEVNALLEAERMAEATKQAIKRKI
        ASISF Q+K  KMEAES+ D+HEKFPIG+KVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYD WGNKEEVDPANVR IQ EVNALLEAERMAEATKQAIKRKI
Subjt:  ASISFLQSKETKMEAESLSDHHEKFPIGSKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDSWGNKEEVDPANVREIQQEVNALLEAERMAEATKQAIKRKI

Query:  AQAASVDFQSRNLPPKLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSGK
        AQAASVDFQSRNLP +LRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRK+ESIFKSPDDPNGKVGVTGSGK
Subjt:  AQAASVDFQSRNLPPKLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSGK

Query:  GLTEFQKREKHLHLKGATVEMDD
        GLTEFQKREKHLHLKGA+VEMDD
Subjt:  GLTEFQKREKHLHLKGATVEMDD

XP_004142808.1 survival of motor neuron-related-splicing factor 30 isoform X1 [Cucumis sativus]5.3e-14892.31Show/hide
Query:  MQGGEDVSIEELASNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEVISLTEELLATAKQNEISGSNVETGDNSASISFLQSKETKMEAESLSDHHEK
        MQGGEDVSIEELA+NLSTYKDQL QVRQLLDDDP NSEYIDMEKELEEVI+LTEELL+TAKQNE+SGSNVETGD+SASI F QSKE +MEA S+SD+HEK
Subjt:  MQGGEDVSIEELASNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEVISLTEELLATAKQNEISGSNVETGDNSASISFLQSKETKMEAESLSDHHEK

Query:  FPIGSKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDSWGNKEEVDPANVREIQQEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPPKLRIEPDDP
        FPIG+KVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYD WGNKEEVDPANVR IQ EVN LLEAER+AEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLP KLRIEPDDP
Subjt:  FPIGSKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDSWGNKEEVDPANVREIQQEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPPKLRIEPDDP

Query:  EDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGATVEMDD
        EDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQ+AKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGATVEMD+
Subjt:  EDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGATVEMDD

XP_022155149.1 survival of motor neuron-related-splicing factor 30 [Momordica charantia]7.9e-160100Show/hide
Query:  MQGGEDVSIEELASNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEVISLTEELLATAKQNEISGSNVETGDNSASISFLQSKETKMEAESLSDHHEK
        MQGGEDVSIEELASNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEVISLTEELLATAKQNEISGSNVETGDNSASISFLQSKETKMEAESLSDHHEK
Subjt:  MQGGEDVSIEELASNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEVISLTEELLATAKQNEISGSNVETGDNSASISFLQSKETKMEAESLSDHHEK

Query:  FPIGSKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDSWGNKEEVDPANVREIQQEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPPKLRIEPDDP
        FPIGSKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDSWGNKEEVDPANVREIQQEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPPKLRIEPDDP
Subjt:  FPIGSKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDSWGNKEEVDPANVREIQQEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPPKLRIEPDDP

Query:  EDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGATVEMDD
        EDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGATVEMDD
Subjt:  EDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGATVEMDD

XP_022933076.1 survival of motor neuron-related-splicing factor 30 [Cucurbita moschata]2.8e-14992.98Show/hide
Query:  MQGGEDVSIEELASNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEVISLTEELLATAKQNEISGSNVETGDNSASISFLQSKETKMEAESLSDHHEK
        MQGGEDVS+EELA+NLSTYKDQLQQVR+LLDDDP NSEYIDMEKELEEVI+LTEELL+TAKQNEISGSNVETGD+SASISF Q+K  KMEAES+SD+HEK
Subjt:  MQGGEDVSIEELASNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEVISLTEELLATAKQNEISGSNVETGDNSASISFLQSKETKMEAESLSDHHEK

Query:  FPIGSKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDSWGNKEEVDPANVREIQQEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPPKLRIEPDDP
        FPIG+KVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYD WGNKEEVDPANVR IQ EVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLP +LRIEPDDP
Subjt:  FPIGSKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDSWGNKEEVDPANVREIQQEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPPKLRIEPDDP

Query:  EDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGATVEMDD
        EDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRK+ESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGA+VEMDD
Subjt:  EDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGATVEMDD

XP_038876515.1 survival of motor neuron-related-splicing factor 30 [Benincasa hispida]3.7e-14993.65Show/hide
Query:  MQGGEDVSIEELASNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEVISLTEELLATAKQNEISGSNVETGDNSASISFLQSKETKMEAESLSDHHEK
        MQGGEDVSIEELA+NLSTYKDQLQQVRQLLDDDP NSEYIDMEKELEEVI+LTEELL+TAKQNEI GSNVETGD+SASISF Q KE +MEA S+SD+HEK
Subjt:  MQGGEDVSIEELASNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEVISLTEELLATAKQNEISGSNVETGDNSASISFLQSKETKMEAESLSDHHEK

Query:  FPIGSKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDSWGNKEEVDPANVREIQQEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPPKLRIEPDDP
        FPIGSKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYD WGNKEEVDPANVR IQ EVNALLEAER+AEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLP KLRIEPDDP
Subjt:  FPIGSKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDSWGNKEEVDPANVREIQQEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPPKLRIEPDDP

Query:  EDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGATVEMDD
        EDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGATVEMD+
Subjt:  EDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGATVEMDD

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3CE07 survival of motor neuron-related-splicing factor 30 isoform X22.8e-12692.61Show/hide
Query:  EKELEEVISLTEELLATAKQNEISGSNVETGDNSASISFLQSKETKMEAESLSDHHEKFPIGSKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDSWGNKEE
        +KELEEVI+LTEELL+TAKQNE+SGSNVETGD+SASI F Q KE +MEA S+SD+HEKFPIG+KVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYD WGNKEE
Subjt:  EKELEEVISLTEELLATAKQNEISGSNVETGDNSASISFLQSKETKMEAESLSDHHEKFPIGSKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDSWGNKEE

Query:  VDPANVREIQQEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPPKLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKG
        VDPANVR IQ EVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLP KLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKG
Subjt:  VDPANVREIQQEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPPKLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKG

Query:  KSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGATVEMDD
        KSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGATVEMD+
Subjt:  KSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGATVEMDD

A0A445EKP3 Tudor domain-containing protein2.3e-12580.07Show/hide
Query:  MQGGEDVSIEELASNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEVISLTEELLATAKQNEISGSNVETGDNSASISFL-QSKETKMEAESLSDHHE
        MQGGE+VSIEELASNLSTYKDQL QVRQLL D+P NSEY+DME+EL EVI+LTEELLATAKQNEI GSN   G N+++ S L + K+ ++E E   DH +
Subjt:  MQGGEDVSIEELASNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEVISLTEELLATAKQNEISGSNVETGDNSASISFL-QSKETKMEAESLSDHHE

Query:  KFPIGSKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDSWGNKEEVDPANVREIQQ-EVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPPKLRIEPD
        K+PIGSKVQAVWSEDGEWYDATIEA+T NG++VSYD+WGNKEEVDPAN+R IQ+  V+ALLEAER+AEATKQAIKRKIAQAA++D QSR+LP KLRIEPD
Subjt:  KFPIGSKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDSWGNKEEVDPANVREIQQ-EVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPPKLRIEPD

Query:  DPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGATVEMD
        DPEDVKA+KRKKIHAFKSKMR+EQLEVTQNKRQNAWQQFQS KGK+KKIGFFSGRKRESIFKSPDDP+GKVGVTGSGKGLTEFQKREKH HLK  TVE D
Subjt:  DPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGATVEMD

Query:  D
        +
Subjt:  D

A0A6J1DPE2 survival of motor neuron-related-splicing factor 303.8e-160100Show/hide
Query:  MQGGEDVSIEELASNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEVISLTEELLATAKQNEISGSNVETGDNSASISFLQSKETKMEAESLSDHHEK
        MQGGEDVSIEELASNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEVISLTEELLATAKQNEISGSNVETGDNSASISFLQSKETKMEAESLSDHHEK
Subjt:  MQGGEDVSIEELASNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEVISLTEELLATAKQNEISGSNVETGDNSASISFLQSKETKMEAESLSDHHEK

Query:  FPIGSKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDSWGNKEEVDPANVREIQQEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPPKLRIEPDDP
        FPIGSKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDSWGNKEEVDPANVREIQQEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPPKLRIEPDDP
Subjt:  FPIGSKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDSWGNKEEVDPANVREIQQEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPPKLRIEPDDP

Query:  EDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGATVEMDD
        EDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGATVEMDD
Subjt:  EDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGATVEMDD

A0A6J1EY48 survival of motor neuron-related-splicing factor 301.4e-14992.98Show/hide
Query:  MQGGEDVSIEELASNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEVISLTEELLATAKQNEISGSNVETGDNSASISFLQSKETKMEAESLSDHHEK
        MQGGEDVS+EELA+NLSTYKDQLQQVR+LLDDDP NSEYIDMEKELEEVI+LTEELL+TAKQNEISGSNVETGD+SASISF Q+K  KMEAES+SD+HEK
Subjt:  MQGGEDVSIEELASNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEVISLTEELLATAKQNEISGSNVETGDNSASISFLQSKETKMEAESLSDHHEK

Query:  FPIGSKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDSWGNKEEVDPANVREIQQEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPPKLRIEPDDP
        FPIG+KVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYD WGNKEEVDPANVR IQ EVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLP +LRIEPDDP
Subjt:  FPIGSKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDSWGNKEEVDPANVREIQQEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPPKLRIEPDDP

Query:  EDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGATVEMDD
        EDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRK+ESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGA+VEMDD
Subjt:  EDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGATVEMDD

A0A6J1K7R2 survival of motor neuron-related-splicing factor 301.4e-14992.98Show/hide
Query:  MQGGEDVSIEELASNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEVISLTEELLATAKQNEISGSNVETGDNSASISFLQSKETKMEAESLSDHHEK
        MQGGEDVS+EELA+NLSTYKDQLQQVR+LLDDDP NSEYIDMEKELEEVI+LTEELL+TAKQNEISGSNVETGD+SASISF Q+K  KMEAES+SD+HEK
Subjt:  MQGGEDVSIEELASNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEVISLTEELLATAKQNEISGSNVETGDNSASISFLQSKETKMEAESLSDHHEK

Query:  FPIGSKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDSWGNKEEVDPANVREIQQEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPPKLRIEPDDP
        FPIG+KVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYD WGNKEEVDPANVR IQ EVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLP +LRIEPDDP
Subjt:  FPIGSKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDSWGNKEEVDPANVREIQQEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPPKLRIEPDDP

Query:  EDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGATVEMDD
        EDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRK+ESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGA+VEMDD
Subjt:  EDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGATVEMDD

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O75940 Survival of motor neuron-related-splicing factor 305.0e-1628.87Show/hide
Query:  EELASNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEVISLTEELLATAKQNEISGSNVETGDNSASISFLQSKETKMEAESLSDHHEKFPIGSKVQA
        E+LA  L++YK QLQQV   L  +  N + + ++K+L+EVI LT++LL+T     ++ S+          SF  ++ T             + +G K  A
Subjt:  EELASNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEVISLTEELLATAKQNEISGSNVETGDNSASISFLQSKETKMEAESLSDHHEKFPIGSKVQA

Query:  VWSEDGEWYDATI-EAHTVNG-FYVSYDSWGNKEEVDPANVREIQQEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPPKLRIEPDDPEDVKATK
        VWSEDG+ Y+A I E    NG   +++  +GN E     N++ +++   A  ++     + K+ I ++                            +  K
Subjt:  VWSEDGEWYDATI-EAHTVNG-FYVSYDSWGNKEEVDPANVREIQQEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPPKLRIEPDDPEDVKATK

Query:  RKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQS-AKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSG---KGLTEFQKREKH
        +KK  A K   RI++LE  +  ++  WQQF + A  K+KK     G+ + SIF SP+   GKVGV   G   K +T++Q   K+
Subjt:  RKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQS-AKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSG---KGLTEFQKREKH

Q3T045 Survival of motor neuron-related-splicing factor 306.5e-1629.23Show/hide
Query:  EELASNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEVISLTEELLATAKQNEISGSNVETGDNSASISFLQSKETKMEAESLSDHHEKFPIGSKVQA
        E+LA  L++YK QLQQV   L  +  N + + ++K+L+EVI LT++LL+T     ++ S     DN AS     S                + +G K  A
Subjt:  EELASNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEVISLTEELLATAKQNEISGSNVETGDNSASISFLQSKETKMEAESLSDHHEKFPIGSKVQA

Query:  VWSEDGEWYDATI-EAHTVNG-FYVSYDSWGNKEEVDPANVREIQQEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPPKLRIEPDDPEDVKATK
        +WSEDG+ Y+A I E    NG   +++  +GN E     N++ +++   A  ++     + K+ I ++                            +  K
Subjt:  VWSEDGEWYDATI-EAHTVNG-FYVSYDSWGNKEEVDPANVREIQQEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPPKLRIEPDDPEDVKATK

Query:  RKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQS-AKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSG---KGLTEFQKREKH
        +KK  A K   RI++LE  +  ++  WQQF + A  K+KK     G+ + SIF SP+   GKVGV   G   K +T++Q   K+
Subjt:  RKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQS-AKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSG---KGLTEFQKREKH

Q5R591 Survival of motor neuron-related-splicing factor 306.5e-1628.52Show/hide
Query:  EELASNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEVISLTEELLATAKQNEISGSNVETGDNSASISFLQSKETKMEAESLSDHHEKFPIGSKVQA
        E+LA  L++YK QLQQV   L  +  N + + ++K+L+EVI LT++LL+T     ++ S+          SF  ++ T             + +G K  A
Subjt:  EELASNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEVISLTEELLATAKQNEISGSNVETGDNSASISFLQSKETKMEAESLSDHHEKFPIGSKVQA

Query:  VWSEDGEWYDATI-EAHTVNG-FYVSYDSWGNKEEVDPANVREIQQEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPPKLRIEPDDPEDVKATK
        +WSEDG+ Y+A I E    NG   +++  +GN E     N++ +++   A  ++     + K+ I ++                            +  K
Subjt:  VWSEDGEWYDATI-EAHTVNG-FYVSYDSWGNKEEVDPANVREIQQEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPPKLRIEPDDPEDVKATK

Query:  RKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQS-AKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSG---KGLTEFQKREKH
        +KK  A K   RI++LE  +  ++  WQQF + A  K+KK     G+ + SIF SP+   GKVGV   G   K +T++Q   K+
Subjt:  RKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQS-AKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSG---KGLTEFQKREKH

Q6DEY1 Survival of motor neuron-related-splicing factor 301.3e-1629.23Show/hide
Query:  EELASNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEVISLTEELLATAKQNEISGSNVETGDNSASISFLQSKETKMEAESLSDHHEKFPIGSKVQA
        E+LA  L+ YK QLQQV   L  +  N + + ++K+L+EVI LT++LL        S    ET D++               +  +   + + +G K  A
Subjt:  EELASNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEVISLTEELLATAKQNEISGSNVETGDNSASISFLQSKETKMEAESLSDHHEKFPIGSKVQA

Query:  VWSEDGEWYDATI-EAHTVNG-FYVSYDSWGNKEEVDPANVREIQQEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPPKLRIEPDDPEDVKATK
        VWS+DG+WY+A I E    NG   +++  +GN E     N+R +++   A  ++  +  + K+ I      AA  ++                       
Subjt:  VWSEDGEWYDATI-EAHTVNG-FYVSYDSWGNKEEVDPANVREIQQEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPPKLRIEPDDPEDVKATK

Query:  RKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQS-AKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSG---KGLTEFQKREKH
         KK  A K   RI++LE  +  ++  WQQF + A  K+KK     G+ + SIF SP+   GKVGV   G   K +T++Q   K+
Subjt:  RKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQS-AKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSG---KGLTEFQKREKH

Q8BGT7 Survival of motor neuron-related-splicing factor 308.5e-1628.87Show/hide
Query:  EELASNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEVISLTEELLATAKQNEISGSNVETGDNSASISFLQSKETKMEAESLSDHHEKFPIGSKVQA
        E+LA  L++YK QLQQV   L  +  N + + ++K+L+EVI LT++LL+T     ++ S+          SF  ++ T             + +G K  A
Subjt:  EELASNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEVISLTEELLATAKQNEISGSNVETGDNSASISFLQSKETKMEAESLSDHHEKFPIGSKVQA

Query:  VWSEDGEWYDATI-EAHTVNG-FYVSYDSWGNKEEVDPANVREIQQEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPPKLRIEPDDPEDVKATK
        VWSEDG+ Y+A I E    NG   +++  +GN E     N++ +++   A  ++     + K+ I ++                            +  K
Subjt:  VWSEDGEWYDATI-EAHTVNG-FYVSYDSWGNKEEVDPANVREIQQEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPPKLRIEPDDPEDVKATK

Query:  RKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQS-AKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSG---KGLTEFQKREKH
        +KK  A K   RI++LE  +  ++  WQQF + A  K+KK     G+ + SIF SP+   GKVGV   G   K +T++Q   K+
Subjt:  RKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQS-AKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSG---KGLTEFQKREKH

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G02570.1 nucleic acid binding;RNA binding5.3e-10667Show/hide
Query:  GGEDVSIEELASNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEVISLTEELLATAKQNEISGSNVETGDNSASISFLQSKETKMEAESLSD---HHE
        G E++SIE+LAS++STYK+QL+QVRQLL +DP NSEY DMEKEL+EVI+LTEE+LATAKQNEIS S  + G ++ +       E   E   L +   H  
Subjt:  GGEDVSIEELASNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEVISLTEELLATAKQNEISGSNVETGDNSASISFLQSKETKMEAESLSD---HHE

Query:  KFPIGSKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDSWGNKEEVDPANVREIQQEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPPKLRIEPDD
        KFP+G+KVQAV+S+DGEWYDATIEAHT NG++V+YD WGNKEEVDP NVR I+Q  NA++EAER+A+ATK A+KRKI +AAS D+Q++ LP KL+I+P+D
Subjt:  KFPIGSKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDSWGNKEEVDPANVREIQQEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPPKLRIEPDD

Query:  PEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGATVEMDD
        PEDVK  KRKKIHAFKSK R EQLEV QNK+QN WQQFQ+ K K+KK+GFF+GRK+ESIFKSP+DP GKVGVTGSGKGLT+FQKREKHLHLK    E  D
Subjt:  PEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGATVEMDD

AT2G02570.2 nucleic acid binding;RNA binding5.3e-10667Show/hide
Query:  GGEDVSIEELASNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEVISLTEELLATAKQNEISGSNVETGDNSASISFLQSKETKMEAESLSD---HHE
        G E++SIE+LAS++STYK+QL+QVRQLL +DP NSEY DMEKEL+EVI+LTEE+LATAKQNEIS S  + G ++ +       E   E   L +   H  
Subjt:  GGEDVSIEELASNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEVISLTEELLATAKQNEISGSNVETGDNSASISFLQSKETKMEAESLSD---HHE

Query:  KFPIGSKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDSWGNKEEVDPANVREIQQEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPPKLRIEPDD
        KFP+G+KVQAV+S+DGEWYDATIEAHT NG++V+YD WGNKEEVDP NVR I+Q  NA++EAER+A+ATK A+KRKI +AAS D+Q++ LP KL+I+P+D
Subjt:  KFPIGSKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDSWGNKEEVDPANVREIQQEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPPKLRIEPDD

Query:  PEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGATVEMDD
        PEDVK  KRKKIHAFKSK R EQLEV QNK+QN WQQFQ+ K K+KK+GFF+GRK+ESIFKSP+DP GKVGVTGSGKGLT+FQKREKHLHLK    E  D
Subjt:  PEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGATVEMDD

AT2G02570.3 nucleic acid binding;RNA binding4.1e-9863.67Show/hide
Query:  GGEDVSIEELASNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEVISLTEELLATAKQNEISGSNVETGDNSASISFLQSKETKMEAESLSD---HHE
        G E++SIE+LAS++STYK+QL+QVRQLL +DP NSEY DMEKEL+EVI+LTEE+LATAKQNEIS S  + G ++ +       E   E   L +   H  
Subjt:  GGEDVSIEELASNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEVISLTEELLATAKQNEISGSNVETGDNSASISFLQSKETKMEAESLSD---HHE

Query:  KFPIGSKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDSWGNKEEVDPANVREIQQEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPPKLRIEPDD
        KFP+G+KVQAV+S+DGEWYDATIEAHT NG++V+YD WGNKEEVDP NVR I+Q  NA++EAER+A+ATK A+KRKI +AAS D+Q++ LP KL+I+P+D
Subjt:  KFPIGSKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDSWGNKEEVDPANVREIQQEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPPKLRIEPDD

Query:  PEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGATVEMDD
        PEDVK  KRKKIH            V QNK+QN WQQFQ+ K K+KK+GFF+GRK+ESIFKSP+DP GKVGVTGSGKGLT+FQKREKHLHLK    E  D
Subjt:  PEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGATVEMDD

AT2G02570.4 nucleic acid binding;RNA binding5.3e-10667Show/hide
Query:  GGEDVSIEELASNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEVISLTEELLATAKQNEISGSNVETGDNSASISFLQSKETKMEAESLSD---HHE
        G E++SIE+LAS++STYK+QL+QVRQLL +DP NSEY DMEKEL+EVI+LTEE+LATAKQNEIS S  + G ++ +       E   E   L +   H  
Subjt:  GGEDVSIEELASNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEVISLTEELLATAKQNEISGSNVETGDNSASISFLQSKETKMEAESLSD---HHE

Query:  KFPIGSKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDSWGNKEEVDPANVREIQQEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPPKLRIEPDD
        KFP+G+KVQAV+S+DGEWYDATIEAHT NG++V+YD WGNKEEVDP NVR I+Q  NA++EAER+A+ATK A+KRKI +AAS D+Q++ LP KL+I+P+D
Subjt:  KFPIGSKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDSWGNKEEVDPANVREIQQEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPPKLRIEPDD

Query:  PEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGATVEMDD
        PEDVK  KRKKIHAFKSK R EQLEV QNK+QN WQQFQ+ K K+KK+GFF+GRK+ESIFKSP+DP GKVGVTGSGKGLT+FQKREKHLHLK    E  D
Subjt:  PEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGATVEMDD


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCAAGGAGGAGAAGACGTAAGCATCGAAGAGTTGGCTTCTAATCTCTCTACCTACAAAGACCAGCTTCAGCAGGTCAGACAGCTATTAGATGATGATCCCAGCAACTC
TGAATACATTGATATGGAAAAGGAGCTTGAAGAGGTTATCTCTCTGACGGAAGAACTACTTGCAACAGCAAAGCAAAATGAGATTTCTGGATCAAACGTAGAAACTGGTG
ACAACAGTGCATCAATAAGTTTCCTGCAGTCTAAAGAAACTAAGATGGAAGCTGAAAGCCTGTCCGATCATCATGAGAAATTTCCTATTGGATCAAAAGTTCAAGCTGTT
TGGAGTGAGGATGGGGAATGGTATGATGCTACGATTGAAGCCCATACTGTAAATGGTTTCTATGTTTCTTATGATAGTTGGGGGAACAAAGAAGAGGTGGACCCTGCCAA
TGTAAGGGAAATCCAACAGGAAGTTAATGCTTTACTTGAAGCAGAAAGAATGGCTGAAGCTACGAAGCAGGCTATCAAGCGCAAGATTGCGCAAGCTGCTTCTGTTGACT
TCCAATCACGAAATTTACCACCAAAGCTTCGTATTGAACCTGACGATCCTGAGGATGTTAAAGCCACCAAACGCAAGAAAATACATGCTTTCAAGTCAAAGATGCGCATA
GAACAGCTTGAAGTTACCCAAAATAAACGGCAGAATGCTTGGCAGCAGTTTCAGTCAGCAAAAGGCAAGTCTAAAAAGATTGGTTTCTTCTCGGGGCGCAAGAGGGAGAG
CATTTTCAAGTCTCCGGATGATCCGAATGGAAAGGTTGGCGTGACTGGAAGTGGTAAGGGTTTGACTGAGTTTCAGAAGAGGGAAAAGCACTTGCATCTTAAAGGTGCAA
CGGTGGAGATGGATGATTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCAAGGAGGAGAAGACGTAAGCATCGAAGAGTTGGCTTCTAATCTCTCTACCTACAAAGACCAGCTTCAGCAGGTCAGACAGCTATTAGATGATGATCCCAGCAACTC
TGAATACATTGATATGGAAAAGGAGCTTGAAGAGGTTATCTCTCTGACGGAAGAACTACTTGCAACAGCAAAGCAAAATGAGATTTCTGGATCAAACGTAGAAACTGGTG
ACAACAGTGCATCAATAAGTTTCCTGCAGTCTAAAGAAACTAAGATGGAAGCTGAAAGCCTGTCCGATCATCATGAGAAATTTCCTATTGGATCAAAAGTTCAAGCTGTT
TGGAGTGAGGATGGGGAATGGTATGATGCTACGATTGAAGCCCATACTGTAAATGGTTTCTATGTTTCTTATGATAGTTGGGGGAACAAAGAAGAGGTGGACCCTGCCAA
TGTAAGGGAAATCCAACAGGAAGTTAATGCTTTACTTGAAGCAGAAAGAATGGCTGAAGCTACGAAGCAGGCTATCAAGCGCAAGATTGCGCAAGCTGCTTCTGTTGACT
TCCAATCACGAAATTTACCACCAAAGCTTCGTATTGAACCTGACGATCCTGAGGATGTTAAAGCCACCAAACGCAAGAAAATACATGCTTTCAAGTCAAAGATGCGCATA
GAACAGCTTGAAGTTACCCAAAATAAACGGCAGAATGCTTGGCAGCAGTTTCAGTCAGCAAAAGGCAAGTCTAAAAAGATTGGTTTCTTCTCGGGGCGCAAGAGGGAGAG
CATTTTCAAGTCTCCGGATGATCCGAATGGAAAGGTTGGCGTGACTGGAAGTGGTAAGGGTTTGACTGAGTTTCAGAAGAGGGAAAAGCACTTGCATCTTAAAGGTGCAA
CGGTGGAGATGGATGATTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MQGGEDVSIEELASNLSTYKDQLQQVRQLLDDDPSNSEYIDMEKELEEVISLTEELLATAKQNEISGSNVETGDNSASISFLQSKETKMEAESLSDHHEKFPIGSKVQAV
WSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDSWGNKEEVDPANVREIQQEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPPKLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRI
EQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKRESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGATVEMDD