; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Moc09g18580 (gene) of Bitter gourd (OHB3-1) v2 genome

Gene IDMoc09g18580
OrganismMomordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
Descriptiondisease resistance protein RGA2
Genome locationchr9:14511952..14512464
RNA-Seq ExpressionMoc09g18580
SyntenyMoc09g18580
Gene Ontology termsGO:0006952 - defense response (biological process)
GO:0020037 - heme binding (molecular function)
GO:0043531 - ADP binding (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR002182 - NB-ARC
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase
IPR042197 - Apoptotic protease-activating factors, helical domain
IPR044974 - Disease resistance protein, plants


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8646395.1 hypothetical protein Csa_016171 [Cucumis sativus]4.6e-7280Show/hide
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XP_022147051.1 putative disease resistance protein RGA4 [Momordica charantia]1.5e-7584.39Show/hide
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XP_022153775.1 putative disease resistance protein RGA4 [Momordica charantia]5.3e-6881.14Show/hide
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XP_031745107.1 putative disease resistance protein RGA4 [Cucumis sativus]4.6e-7280Show/hide
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XP_038897566.1 putative disease resistance protein RGA4 [Benincasa hispida]2.2e-7482.35Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1D168 putative disease resistance protein RGA47.4e-7684.39Show/hide
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A0A6J1DHT2 putative disease resistance protein RGA42.5e-6881.14Show/hide
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        LGKEILV CGGVPLVIR IGRLL S TSE+EWMSFK NELL+ +QQ   DN+  MTSILKL Y+HL  NLK CFA
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A0A6J1DP92 putative disease resistance protein RGA42.0e-6575.9Show/hide
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A0A6J1GPK9 putative disease resistance protein RGA49.0e-6672.94Show/hide
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        ME+L  +LQ+++ GKKY+LVMDD+WNESE+KW ELK LLMGGARGSKI+ITKRDS +A EI +MTSL TL+GL ES+SWSLF+ VAF +G EP NP L +
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A0A6J1JVS7 putative disease resistance protein RGA32.4e-6673.53Show/hide
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        ME+L  +LQ+++ GKKY+LVMDD+WNESE+KW ELK LLMGGARGSKI+ITKRDS +A EI +MTSL TL+GL ES+SWSLF+ VAF +G EP NP L +
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q7XA39 Putative disease resistance protein RGA42.2e-3243.53Show/hide
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        + +  ++LQE++ GK+Y+LV+DDVWN+  EKW +L+ +L  GARG+ IL T R  KV + I      + L  L   +S  LF   AF + KE ANPNL  
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        +GKEI+ KCGGVPL  + +G LL  K  E EW   ++NE+  + Q ++ +   L+L Y HL  +L+QCFA
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Q7XA40 Putative disease resistance protein RGA35.7e-3343.11Show/hide
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        L ++LQE++ GK+Y LV+DDVWNE +EKW  L+ +L  GA G+ ILIT R  K+ + I     L+ L  L + + W LF+  AF    E  +P L ++GK
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        EI+ KCGGVPL  + +G LL  K  E EW   +++E+  + Q +N +   L+L Y HL  +L+QCFA
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Q7XA42 Putative disease resistance protein RGA12.2e-2940.36Show/hide
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        L ++LQE++ GK+Y LV+DDVWNE + KW  L+ +L  GA G+ +L T R  KV + I      + L  L   + W LF   AF   +E  NPNL  +GK
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        EI+ KCGGVPL  + +G +L  K  E EW   +++ +  + Q ++ +   L+L Y HL  +L+QCF
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Q7XBQ9 Disease resistance protein RGA21.1e-2839.52Show/hide
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        L ++LQE++ GK+Y+LV+DDVWNE ++KW  L+ +L  GA G+ +L T R  KV + I      + L  L + + W LF   AF   +E  NPNL  +GK
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        EI+ K GGVPL  + +G +L  K  E  W   +++ +  + Q ++ +   L+L Y  L  +LKQCFA
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Q9LRR5 Putative disease resistance protein At3g144605.5e-2030.41Show/hide
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        + +L  +L++ + GK+++LV+DD W+ES+ +W   +        GSKI++T R S++ + +     ++ ++ +     W L    AF        N  L 
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         +GK I  +C G+PL  R I   L SK + ++W +   N         N +  +LKL YD L P LK+CFA
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G07040.1 NB-ARC domain-containing disease resistance protein6.9e-1832.39Show/hide
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        L  +L E +  K+Y++V+DDVW      W E+   L  G  GS++++T RD  VA+    + S    +E L+E  +W LF N AF    E     NL  +
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         ++++ +C G+PL I  +G ++ +K  E EW            NN  LK+V+      SI+ L ++ L   LK+CF
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AT3G14460.1 LRR and NB-ARC domains-containing disease resistance protein3.9e-2130.41Show/hide
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        + +L  +L++ + GK+++LV+DD W+ES+ +W   +        GSKI++T R S++ + +     ++ ++ +     W L    AF        N  L 
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         +GK I  +C G+PL  R I   L SK + ++W +   N         N +  +LKL YD L P LK+CFA
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AT3G14470.1 NB-ARC domain-containing disease resistance protein8.2e-1929.07Show/hide
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        ++ L  +L+E + G    ++LV+DD+WNE+   W  L+   +  A+GS+IL+T R  +VA+ I     +  L+ L + + WSLF    F   +   N  +
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          L + I+ KC G+PL ++ +G +L  +    EW    ++ +  +    +++  +L++ Y +L  +LK+CFA
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AT3G50950.1 HOPZ-ACTIVATED RESISTANCE 17.4e-2035.09Show/hide
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        L R++Q+ + GK+Y++VMDDVW+++   W ++   L  G +G  +++T R   VA  +++        E L   NSW LF NVAF         P L  +
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        GKEI+ KC G+PL I+ +G LL  K     EW        +EL     + +++ S L+L YD L  +LK C
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AT3G50950.2 HOPZ-ACTIVATED RESISTANCE 17.4e-2035.09Show/hide
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        L R++Q+ + GK+Y++VMDDVW+++   W ++   L  G +G  +++T R   VA  +++        E L   NSW LF NVAF         P L  +
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        GKEI+ KC G+PL I+ +G LL  K     EW        +EL     + +++ S L+L YD L  +LK C
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAGCTTTACACAGAGAGCTTCAAGAAGTGATTGGAGGAAAGAAGTATATGTTAGTTATGGATGATGTATGGAATGAAAGTGAAGAGAAATGGCATGAGTTAAAACC
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAAGCTTTACACAGAGAGCTTCAAGAAGTGATTGGAGGAAAGAAGTATATGTTAGTTATGGATGATGTATGGAATGAAAGTGAAGAGAAATGGCATGAGTTAAAACC
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEALHRELQEVIGGKKYMLVMDDVWNESEEKWHELKPLLMGGARGSKILITKRDSKVATEIESMTSLFTLEGLRESNSWSLFRNVAFKEGKEPANPNLTKLGKEILVKCG
GVPLVIRHIGRLLYSKTSEEEWMSFKNNELLKVVQQDNDMTSILKLRYDHLSPNLKQCFA