CuGenDBv2

Gene ID	Moc09g29350
Organism	Momordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
Description	Unknown protein
Genome location	chr9:22089454..22090041
RNA-Seq Expression	Moc09g29350
Synteny	Moc09g29350
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	NA

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

XP_022143515.1 uncharacterized protein LOC111013388 [Momordica charantia]

2.5e-29

80.41

Show/hide

Query:  MEELNAELKKIRDEIHERVMEELNTELKKIRYEIQEQVIKVQDVELKKMRQDIDKIQGQVTEIFNVLKNIVTVGDISQPNNLIESHDNSSPRVDPPL
        MEE NAELKKIRDEIHERV+EELN ELK+IR EIQE V +V +VELKKMRQDIDKIQGQVT I NVLK IVTVGDISQPNNL+E H+NSS RV P L
Subjt:  MEELNAELKKIRDEIHERVMEELNTELKKIRYEIQEQVIKVQDVELKKMRQDIDKIQGQVTEIFNVLKNIVTVGDISQPNNLIESHDNSSPRVDPPL

XP_022153553.1 uncharacterized protein LOC111021029 [Momordica charantia]

1.8e-59

69.15

Show/hide

Query:  MEELNAELKKIRDEIHERVMEELNTELKKIRYEIQEQVIKVQDVELKKMRQDIDKIQGQVTEIFNVLKNIVTVGDISQPNNLIESHDNSSPRVDPPL--P
        MEE NAELK I DEIHERV+EELN ELKKIR EIQEQV++VQ+VELKKMRQDID IQ QV +I NVLKNIVTVG  SQPNNL+E ++NSSPRVDPPL   
Subjt:  MEELNAELKKIRDEIHERVMEELNTELKKIRYEIQEQVIKVQDVELKKMRQDIDKIQGQVTEIFNVLKNIVTVGDISQPNNLIESHDNSSPRVDPPL--P

Query:  IEGFFLHYLSHEAQLSKKGQQAPTICQVEFTLQDGQTSKTINS----GKEKENVTNGNAEGTAGKEYAQKWGKAIEQLPVPLINKEPHSETNRSSVKRKN
         EGF  H  SH+AQLSKKGQQ PT CQVEFT +D QT K   S    G+EKENVT             Q+WGKAIEQLPVPLINKEPH + N+SS+KRKN
Subjt:  IEGFFLHYLSHEAQLSKKGQQAPTICQVEFTLQDGQTSKTINS----GKEKENVTNGNAEGTAGKEYAQKWGKAIEQLPVPLINKEPHSETNRSSVKRKN

Query:  K
        K
Subjt:  K

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A6J1CP05 uncharacterized protein LOC111013388

1.2e-29

80.41

Show/hide

Query:  MEELNAELKKIRDEIHERVMEELNTELKKIRYEIQEQVIKVQDVELKKMRQDIDKIQGQVTEIFNVLKNIVTVGDISQPNNLIESHDNSSPRVDPPL
        MEE NAELKKIRDEIHERV+EELN ELK+IR EIQE V +V +VELKKMRQDIDKIQGQVT I NVLK IVTVGDISQPNNL+E H+NSS RV P L
Subjt:  MEELNAELKKIRDEIHERVMEELNTELKKIRYEIQEQVIKVQDVELKKMRQDIDKIQGQVTEIFNVLKNIVTVGDISQPNNLIESHDNSSPRVDPPL

A0A6J1DHS7 uncharacterized protein LOC111021029

8.5e-60

69.15

Show/hide

Query:  MEELNAELKKIRDEIHERVMEELNTELKKIRYEIQEQVIKVQDVELKKMRQDIDKIQGQVTEIFNVLKNIVTVGDISQPNNLIESHDNSSPRVDPPL--P
        MEE NAELK I DEIHERV+EELN ELKKIR EIQEQV++VQ+VELKKMRQDID IQ QV +I NVLKNIVTVG  SQPNNL+E ++NSSPRVDPPL   
Subjt:  MEELNAELKKIRDEIHERVMEELNTELKKIRYEIQEQVIKVQDVELKKMRQDIDKIQGQVTEIFNVLKNIVTVGDISQPNNLIESHDNSSPRVDPPL--P

Query:  IEGFFLHYLSHEAQLSKKGQQAPTICQVEFTLQDGQTSKTINS----GKEKENVTNGNAEGTAGKEYAQKWGKAIEQLPVPLINKEPHSETNRSSVKRKN
         EGF  H  SH+AQLSKKGQQ PT CQVEFT +D QT K   S    G+EKENVT             Q+WGKAIEQLPVPLINKEPH + N+SS+KRKN
Subjt:  IEGFFLHYLSHEAQLSKKGQQAPTICQVEFTLQDGQTSKTINS----GKEKENVTNGNAEGTAGKEYAQKWGKAIEQLPVPLINKEPHSETNRSSVKRKN

Query:  K
        K
Subjt:  K

SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGAAGAACTTAATGCTGAGCTAAAGAAAATTAGAGATGAAATCCACGAACGAGTCATGGAAGAATTGAATACTGAGCTAAAGAAAATAAGATACGAGATTCAA
GAACAGGTCATAAAGGTTCAGGATGTAGAGCTAAAGAAGATGAGACAGGACATTGATAAGATTCAGGGGCAAGTCACAGAAATTTTCAATGTCTTAAAGAATATT
GTTACAGTTGGGGACATTTCTCAACCTAACAATTTAATCGAATCTCATGATAATTCATCACCTAGGGTGGACCCACCTCTGCCAATAGAGGGTTTCTTCCTGCAT
TATTTGTCACATGAAGCTCAGCTGTCCAAGAAAGGCCAACAAGCTCCTACAATATGTCAGGTTGAATTTACACTCCAAGATGGACAAACATCAAAGACCATTAAC
TCAGGTAAAGAAAAAGAAAATGTTACCAATGGAAATGCTGAAGGAACTGCAGGGAAAGAATATGCTCAAAAATGGGGAAAAGCAATAGAACAATTGCCAGTGCCT
TTAATTAATAAAGAGCCACATTCTGAAACGAATAGAAGCTCTGTTAAAAGGAAAAATAAGTAA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MEELNAELKKIRDEIHERVMEELNTELKKIRYEIQEQVIKVQDVELKKMRQDIDKIQGQVTEIFNVLKNIVTVGDISQPNNLIESHDNSSPRVDPPLPIEGFFLH
YLSHEAQLSKKGQQAPTICQVEFTLQDGQTSKTINSGKEKENVTNGNAEGTAGKEYAQKWGKAIEQLPVPLINKEPHSETNRSSVKRKNK

Moc09g29350 (gene) of Bitter gourd (OHB3-1) v2 genome