; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Moc09g34610 (gene) of Bitter gourd (OHB3-1) v2 genome

Gene IDMoc09g34610
OrganismMomordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
DescriptionRNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein
Genome locationchr9:26489566..26491955
RNA-Seq ExpressionMoc09g34610
SyntenyMoc09g34610
Gene Ontology termsGO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003723 - RNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000504 - RNA recognition motif domain
IPR012677 - Nucleotide-binding alpha-beta plait domain superfamily
IPR035979 - RNA-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004143608.1 probable RNA-binding protein ARP1 isoform X1 [Cucumis sativus]2.2e-12187.21Show/hide
Query:  SNNSNNAGLMFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDAAPIINGRRANCNLASLGARRGS
        +N+S NAGL FGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHF KFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACED+APIINGRRANCNLASLGARRG 
Subjt:  SNNSNNAGLMFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDAAPIINGRRANCNLASLGARRGS

Query:  RSASAATPPQAPPLPGSNGGGGARSTSAASP-NHVQWYYPAGTPPTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKLSYMNGGGHYSQVYPGQAMVGAN
          +++ATPPQAP  PGSN GG   +++A +P NHVQWYYPAGT PTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKL YMN  GHY+Q+YPGQAMVGAN
Subjt:  RSASAATPPQAPPLPGSNGGGGARSTSAASP-NHVQWYYPAGTPPTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKLSYMNGGGHYSQVYPGQAMVGAN

Query:  TLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPTAAGPFAAVPPTSIMSKPASVGPNPGTVGG
        TLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPT AGPFAAVPPTSIMSKP +VGPNPGTVGG
Subjt:  TLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPTAAGPFAAVPPTSIMSKPASVGPNPGTVGG

XP_008445852.2 PREDICTED: probable RNA-binding protein ARP1 isoform X1 [Cucumis melo]1.4e-12086.87Show/hide
Query:  SNNSNNAGLMFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDAAPIINGRRANCNLASLGARRGS
        +N++ NAGL FGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHF+KFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACED+APIINGRRANCNLASLGARRG 
Subjt:  SNNSNNAGLMFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDAAPIINGRRANCNLASLGARRGS

Query:  RSASAATPPQAPPLPGSNGGGGARSTSAASP-NHVQWYYPAGTPPTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKLSYMNGGGHYSQVYPGQ-AMVGA
          +++ATPPQAP  PGSNGGG   +T+A +P NHVQWYYPAGT PTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKL Y+N  GHY+Q+YPGQ AMVGA
Subjt:  RSASAATPPQAPPLPGSNGGGGARSTSAASP-NHVQWYYPAGTPPTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKLSYMNGGGHYSQVYPGQ-AMVGA

Query:  NTLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPTAAGPFAAVPPTSIMSKPASVGPNPGTVGG
        NTLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPT AGPFAAVPPTSIMSKP +VGPNPGTVGG
Subjt:  NTLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPTAAGPFAAVPPTSIMSKPASVGPNPGTVGG

XP_022139299.1 probable RNA-binding protein ARP1 [Momordica charantia]6.5e-142100Show/hide
Query:  MSNNSNNAGLMFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDAAPIINGRRANCNLASLGARRG
        MSNNSNNAGLMFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDAAPIINGRRANCNLASLGARRG
Subjt:  MSNNSNNAGLMFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDAAPIINGRRANCNLASLGARRG

Query:  SRSASAATPPQAPPLPGSNGGGGARSTSAASPNHVQWYYPAGTPPTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKLSYMNGGGHYSQVYPGQAMVGAN
        SRSASAATPPQAPPLPGSNGGGGARSTSAASPNHVQWYYPAGTPPTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKLSYMNGGGHYSQVYPGQAMVGAN
Subjt:  SRSASAATPPQAPPLPGSNGGGGARSTSAASPNHVQWYYPAGTPPTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKLSYMNGGGHYSQVYPGQAMVGAN

Query:  TLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPTAAGPFAAVPPTSIMSKPASVGPNP
        TLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPTAAGPFAAVPPTSIMSKPASVGPNP
Subjt:  TLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPTAAGPFAAVPPTSIMSKPASVGPNP

XP_038891949.1 probable RNA-binding protein ARP1 isoform X1 [Benincasa hispida]3.8e-12688.55Show/hide
Query:  SNNSNNAGLMFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDAAPIINGRRANCNLASLGARRGS
        ++N+NNAGL FGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACED+APIINGRRANCNLASLGARRG 
Subjt:  SNNSNNAGLMFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDAAPIINGRRANCNLASLGARRGS

Query:  RSASAATPPQAPPLPGSNGGGGARSTSAASP-NHVQWYYPAGTPPTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKLSYMNGGGHYSQVYPGQAMVGAN
          +++ATPPQAP  PGSNGGG   +++ A+P NHVQWYYPAGT PTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKL YMN  GHY+Q+YPGQAMVGAN
Subjt:  RSASAATPPQAPPLPGSNGGGGARSTSAASP-NHVQWYYPAGTPPTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKLSYMNGGGHYSQVYPGQAMVGAN

Query:  TLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPTAAGPFAAVPPTSIMSKPASVGPNPGTVGGGCRG
        TLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPT AGPFAAVPP+SIMSKPASVGPNPGTVGGGCRG
Subjt:  TLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPTAAGPFAAVPPTSIMSKPASVGPNPGTVGGGCRG

XP_038891950.1 probable RNA-binding protein ARP1 isoform X2 [Benincasa hispida]1.4e-12088.14Show/hide
Query:  SNNSNNAGLMFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDAAPIINGRRANCNLASLGARRGS
        ++N+NNAGL FGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACED+APIINGRRANCNLASLGARRG 
Subjt:  SNNSNNAGLMFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDAAPIINGRRANCNLASLGARRGS

Query:  RSASAATPPQAPPLPGSNGGGGARSTSAASP-NHVQWYYPAGTPPTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKLSYMNGGGHYSQVYPGQAMVGAN
          +++ATPPQAP  PGSNGGG   +++ A+P NHVQWYYPAGT PTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKL YMN  GHY+Q+YPGQAMVGAN
Subjt:  RSASAATPPQAPPLPGSNGGGGARSTSAASP-NHVQWYYPAGTPPTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKLSYMNGGGHYSQVYPGQAMVGAN

Query:  TLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPTAAGPFAAVPPTSIMSKPASVGPNP
        TLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPT AGPFAAVPP+SIMSKPASVGPNP
Subjt:  TLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPTAAGPFAAVPPTSIMSKPASVGPNP

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KNL6 RRM domain-containing protein1.1e-12187.21Show/hide
Query:  SNNSNNAGLMFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDAAPIINGRRANCNLASLGARRGS
        +N+S NAGL FGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHF KFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACED+APIINGRRANCNLASLGARRG 
Subjt:  SNNSNNAGLMFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDAAPIINGRRANCNLASLGARRGS

Query:  RSASAATPPQAPPLPGSNGGGGARSTSAASP-NHVQWYYPAGTPPTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKLSYMNGGGHYSQVYPGQAMVGAN
          +++ATPPQAP  PGSN GG   +++A +P NHVQWYYPAGT PTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKL YMN  GHY+Q+YPGQAMVGAN
Subjt:  RSASAATPPQAPPLPGSNGGGGARSTSAASP-NHVQWYYPAGTPPTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKLSYMNGGGHYSQVYPGQAMVGAN

Query:  TLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPTAAGPFAAVPPTSIMSKPASVGPNPGTVGG
        TLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPT AGPFAAVPPTSIMSKP +VGPNPGTVGG
Subjt:  TLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPTAAGPFAAVPPTSIMSKPASVGPNPGTVGG

A0A1S3BD62 probable RNA-binding protein ARP1 isoform X24.1e-11886.61Show/hide
Query:  SNNSNNAGLMFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDAAPIINGRRANCNLASLGARRGS
        +N++ NAGL FGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHF+KFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACED+APIINGRRANCNLASLGARRG 
Subjt:  SNNSNNAGLMFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDAAPIINGRRANCNLASLGARRGS

Query:  RSASAATPPQAPPLPGSNGGGGARSTSAASP-NHVQWYYPAGTPPTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKLSYMNGGGHYSQVYPGQ-AMVGA
          +++ATPPQAP  PGSNGGG   +T+A +P NHVQWYYPAGT PTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKL Y+N  GHY+Q+YPGQ AMVGA
Subjt:  RSASAATPPQAPPLPGSNGGGGARSTSAASP-NHVQWYYPAGTPPTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKLSYMNGGGHYSQVYPGQ-AMVGA

Query:  NTLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPTAAGPFAAVPPTSIMSKPASVGPNP
        NTLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPT AGPFAAVPPTSIMSKP +VGPNP
Subjt:  NTLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPTAAGPFAAVPPTSIMSKPASVGPNP

A0A1S3BEI0 probable RNA-binding protein ARP1 isoform X16.8e-12186.87Show/hide
Query:  SNNSNNAGLMFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDAAPIINGRRANCNLASLGARRGS
        +N++ NAGL FGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHF+KFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACED+APIINGRRANCNLASLGARRG 
Subjt:  SNNSNNAGLMFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDAAPIINGRRANCNLASLGARRGS

Query:  RSASAATPPQAPPLPGSNGGGGARSTSAASP-NHVQWYYPAGTPPTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKLSYMNGGGHYSQVYPGQ-AMVGA
          +++ATPPQAP  PGSNGGG   +T+A +P NHVQWYYPAGT PTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKL Y+N  GHY+Q+YPGQ AMVGA
Subjt:  RSASAATPPQAPPLPGSNGGGGARSTSAASP-NHVQWYYPAGTPPTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKLSYMNGGGHYSQVYPGQ-AMVGA

Query:  NTLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPTAAGPFAAVPPTSIMSKPASVGPNPGTVGG
        NTLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPT AGPFAAVPPTSIMSKP +VGPNPGTVGG
Subjt:  NTLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPTAAGPFAAVPPTSIMSKPASVGPNPGTVGG

A0A5A7SY01 Putative RNA-binding protein ARP1 isoform X13.2e-11886.27Show/hide
Query:  SNNSNNAGLMFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDAAPIINGRRANCNLASLGARRGS
        +N++ NAGL FGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHF+KFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACED+APIINGRRANCNLASLGARRG 
Subjt:  SNNSNNAGLMFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDAAPIINGRRANCNLASLGARRGS

Query:  RSASAATPPQAPPLPGSNGGGGARSTSAASP-NHVQWYYPAGTPPTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKLSYMNGGGHYSQVYPGQ-AMVGA
          +++ATPPQAP  PGSNGGG   +T+A +P NHVQWYYPAGT PTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKL Y+N  GHY+Q+YPGQ AMVG 
Subjt:  RSASAATPPQAPPLPGSNGGGGARSTSAASP-NHVQWYYPAGTPPTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKLSYMNGGGHYSQVYPGQ-AMVGA

Query:  NTLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPTAAGPFAAVPPTSIMSKPASVGPNPG
        NTLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPT AGPFAAVPPTSIMSKP +VGPNPG
Subjt:  NTLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPTAAGPFAAVPPTSIMSKPASVGPNPG

A0A6J1CCJ5 probable RNA-binding protein ARP13.1e-142100Show/hide
Query:  MSNNSNNAGLMFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDAAPIINGRRANCNLASLGARRG
        MSNNSNNAGLMFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDAAPIINGRRANCNLASLGARRG
Subjt:  MSNNSNNAGLMFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDAAPIINGRRANCNLASLGARRG

Query:  SRSASAATPPQAPPLPGSNGGGGARSTSAASPNHVQWYYPAGTPPTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKLSYMNGGGHYSQVYPGQAMVGAN
        SRSASAATPPQAPPLPGSNGGGGARSTSAASPNHVQWYYPAGTPPTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKLSYMNGGGHYSQVYPGQAMVGAN
Subjt:  SRSASAATPPQAPPLPGSNGGGGARSTSAASPNHVQWYYPAGTPPTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKLSYMNGGGHYSQVYPGQAMVGAN

Query:  TLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPTAAGPFAAVPPTSIMSKPASVGPNP
        TLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPTAAGPFAAVPPTSIMSKPASVGPNP
Subjt:  TLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPTAAGPFAAVPPTSIMSKPASVGPNP

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q5ZJX4 RNA-binding protein 383.1e-2257.65Show/hide
Query:  DTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDAAPIINGRRANCNLASLGAR
        DTT TK+FVGGL + T   ++R +FE FG+I EAV+I+D+ TG+S+GYGFVT  D  +A++AC+D  PII+GR+AN NLA LGA+
Subjt:  DTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDAAPIINGRRANCNLASLGAR

Q6GQD3 RNA-binding protein 24-A4.1e-2257.65Show/hide
Query:  DTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDAAPIINGRRANCNLASLGAR
        DTT TK+FVGGL + T   ++R +FE FG+I EAV+I+D+ TG+S+GYGFVT  D  +A++AC+D  PII+GR+AN NLA LGA+
Subjt:  DTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDAAPIINGRRANCNLASLGAR

Q76LC6 RNA-binding protein 242.4e-2258.82Show/hide
Query:  DTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDAAPIINGRRANCNLASLGAR
        DTT TK+FVGGL + T   ++R +FE FGEI EAV+I+D+ TG+S+GYGFVT  D  +A +AC+D  PII+GR+AN NLA LGA+
Subjt:  DTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDAAPIINGRRANCNLASLGAR

Q9BX46 RNA-binding protein 242.4e-2258.82Show/hide
Query:  DTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDAAPIINGRRANCNLASLGAR
        DTT TK+FVGGL + T   ++R +FE FGEI EAV+I+D+ TG+S+GYGFVT  D  +A++AC+D  PII+GR+AN NLA LGA+
Subjt:  DTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDAAPIINGRRANCNLASLGAR

Q9M1S3 Probable RNA-binding protein ARP13.7e-5549.64Show/hide
Query:  SNNAGLMFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDAAPIINGRRANCNLASLGARRGSRSA
        SNN    FGDT LTKVFVGGLAW+T KEAM DHF K+G+ILEAVIISDKLT RSKGYGFVTFKDA++A +ACED+ PIINGRRANCNLASLG R   R +
Subjt:  SNNAGLMFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDAAPIINGRRANCNLASLGARRGSRSA

Query:  SAATPPQAPPLPGSNGGGGARSTSAASPNHVQWYYPAGTPPTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKLSYMNG---GGHYSQVYP---------
           T PQ  P  G+      R+T     NH QWYYP+G        Q HQ VPFYGY PS  Y+A ++++N K+ Y+ G    G+Y+Q+ P         
Subjt:  SAATPPQAPPLPGSNGGGGARSTSAASPNHVQWYYPAGTPPTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKLSYMNG---GGHYSQVYP---------

Query:  ---------GQAMVG-ANTLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPTAAGPFAAVPPTSIMSKPASVGPNP--GTVGG
                 G+ MVG A+ ++P Y +Y YHQS A+G P   F                   SKP S    P  GTVGG
Subjt:  ---------GQAMVG-ANTLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPTAAGPFAAVPPTSIMSKPASVGPNP--GTVGG

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G22910.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein3.8e-3944.72Show/hide
Query:  GLMFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDAAPIINGRRANCNLASLGARRGSRSASAAT
        G+  GDTT TKVFVGGLAWET KE M+ HFE+FGEILEAV+I+DK +GRSKGYGFVTF++AE+A+ AC DA P+I+GRRANCNLASLG +R        +
Subjt:  GLMFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDAAPIINGRRANCNLASLGARRGSRSASAAT

Query:  PPQAPPLPGSNGGGGARSTSAASPNHVQWYYPAGTPPTP--FHHQPHQPVPFYGYSP-SPTYIATDISYNHKLSYMNG---GGHYSQVY------PGQAM
         P  P    ++GGGG  +      + +Q  +    PP P  F H PH P+  +GYSP SP Y     S+   L  M G   GG Y  VY       G   
Subjt:  PPQAPPLPGSNGGGGARSTSAASPNHVQWYYPAGTPPTP--FHHQPHQPVPFYGYSP-SPTYIATDISYNHKLSYMNG---GGHYSQVY------PGQAM

Query:  VGANTLMPMY---------------PLYHYHQSHAMGMPAHIFPPS
          A +  P Y               P YH+  S+    P H  PP+
Subjt:  VGANTLMPMY---------------PLYHYHQSHAMGMPAHIFPPS

AT1G22910.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein1.9e-3844.31Show/hide
Query:  GLMFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDAAPIINGRRANCNLASLGARRGSRSASAAT
        G+  GDTT TKVFVGGLAWET KE M+ HFE+FGEILEAV+I+DK +GRSKGYGFVTF++AE+A+ AC DA P+I+GRRANCNLASLG +R        +
Subjt:  GLMFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDAAPIINGRRANCNLASLGARRGSRSASAAT

Query:  PPQAPPLPGSNGGGGARSTSAASPNHVQWYYPAGTPPTP--FHHQPHQPVPFYGYSP-SPTYIATDISYNHKLSYMNG---GGHYSQVY------PGQAM
         P  P    ++GGGG  +      + +Q  +    PP P  F H PH P+  +GYSP SP Y     S+   L  M G   GG Y  VY       G   
Subjt:  PPQAPPLPGSNGGGGARSTSAASPNHVQWYYPAGTPPTP--FHHQPHQPVPFYGYSP-SPTYIATDISYNHKLSYMNG---GGHYSQVY------PGQAM

Query:  VGANTLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPTAAGPFAAVPPTSIMSKPASVGP
          A +  P YP    H       P   F    ++  P    PPT  M +   V P
Subjt:  VGANTLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPTAAGPFAAVPPTSIMSKPASVGP

AT1G22910.3 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein3.8e-3944.72Show/hide
Query:  GLMFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDAAPIINGRRANCNLASLGARRGSRSASAAT
        G+  GDTT TKVFVGGLAWET KE M+ HFE+FGEILEAV+I+DK +GRSKGYGFVTF++AE+A+ AC DA P+I+GRRANCNLASLG +R        +
Subjt:  GLMFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDAAPIINGRRANCNLASLGARRGSRSASAAT

Query:  PPQAPPLPGSNGGGGARSTSAASPNHVQWYYPAGTPPTP--FHHQPHQPVPFYGYSP-SPTYIATDISYNHKLSYMNG---GGHYSQVY------PGQAM
         P  P    ++GGGG  +      + +Q  +    PP P  F H PH P+  +GYSP SP Y     S+   L  M G   GG Y  VY       G   
Subjt:  PPQAPPLPGSNGGGGARSTSAASPNHVQWYYPAGTPPTP--FHHQPHQPVPFYGYSP-SPTYIATDISYNHKLSYMNG---GGHYSQVY------PGQAM

Query:  VGANTLMPMY---------------PLYHYHQSHAMGMPAHIFPPS
          A +  P Y               P YH+  S+    P H  PP+
Subjt:  VGANTLMPMY---------------PLYHYHQSHAMGMPAHIFPPS

AT3G54770.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein2.6e-5649.64Show/hide
Query:  SNNAGLMFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDAAPIINGRRANCNLASLGARRGSRSA
        SNN    FGDT LTKVFVGGLAW+T KEAM DHF K+G+ILEAVIISDKLT RSKGYGFVTFKDA++A +ACED+ PIINGRRANCNLASLG R   R +
Subjt:  SNNAGLMFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDAAPIINGRRANCNLASLGARRGSRSA

Query:  SAATPPQAPPLPGSNGGGGARSTSAASPNHVQWYYPAGTPPTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKLSYMNG---GGHYSQVYP---------
           T PQ  P  G+      R+T     NH QWYYP+G        Q HQ VPFYGY PS  Y+A ++++N K+ Y+ G    G+Y+Q+ P         
Subjt:  SAATPPQAPPLPGSNGGGGARSTSAASPNHVQWYYPAGTPPTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKLSYMNG---GGHYSQVYP---------

Query:  ---------GQAMVG-ANTLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPTAAGPFAAVPPTSIMSKPASVGPNP--GTVGG
                 G+ MVG A+ ++P Y +Y YHQS A+G P   F                   SKP S    P  GTVGG
Subjt:  ---------GQAMVG-ANTLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPTAAGPFAAVPPTSIMSKPASVGPNP--GTVGG

AT3G54770.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein1.3e-4244.98Show/hide
Query:  MRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDAAPIINGRRANCNLASLGARRGSRSASAATPPQAPPLPGSNGGGGARSTSAASPN
        M DHF K+G+ILEAVIISDKLT RSKGYGFVTFKDA++A +ACED+ PIINGRRANCNLASLG R   ++ + ATPP                      N
Subjt:  MRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDAAPIINGRRANCNLASLGARRGSRSASAATPPQAPPLPGSNGGGGARSTSAASPN

Query:  HVQWYYPAGTPPTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKLSYMNG---GGHYSQVYP------------------GQAMVG-ANTLMPMYPLYHY
        H QWYYP+G        Q HQ VPFYGY PS  Y+A ++++N K+ Y+ G    G+Y+Q+ P                  G+ MVG A+ ++P Y +Y Y
Subjt:  HVQWYYPAGTPPTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKLSYMNG---GGHYSQVYP------------------GQAMVG-ANTLMPMYPLYHY

Query:  HQSHAMGMPAHIFPPSPTAAGPFAAVPPTSIMSKPASVGPNP--GTVGG
        HQS A+G P   F                   SKP S    P  GTVGG
Subjt:  HQSHAMGMPAHIFPPSPTAAGPFAAVPPTSIMSKPASVGPNP--GTVGG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGCAACAATAGTAACAATGCAGGTTTAATGTTCGGCGACACCACGCTCACGAAGGTGTTCGTCGGCGGATTGGCGTGGGAGACTCCCAAGGAAGCTATGCGAGATCA
CTTCGAGAAGTTCGGCGAGATCTTGGAGGCTGTAATCATCTCCGATAAGCTCACCGGCAGATCCAAGGGCTACGGATTCGTCACGTTTAAGGACGCGGAATCGGCGAAGA
AGGCTTGCGAGGACGCCGCGCCGATCATCAACGGCCGCCGAGCCAACTGTAATCTGGCGTCGCTCGGAGCTCGCCGCGGCTCTCGCTCCGCATCGGCTGCTACTCCTCCC
CAAGCTCCTCCGCTACCAGGATCCAACGGCGGTGGGGGGGCGAGGTCCACGTCAGCAGCATCGCCCAACCACGTGCAGTGGTACTACCCGGCCGGGACTCCTCCGACGCC
GTTTCATCATCAGCCTCATCAGCCCGTCCCGTTCTACGGTTACTCCCCAAGCCCCACCTACATCGCCACGGATATCAGTTACAACCATAAGCTGAGCTATATGAACGGCG
GGGGGCATTACTCGCAGGTGTATCCGGGGCAGGCTATGGTGGGAGCGAACACATTGATGCCGATGTACCCGCTGTATCACTACCATCAATCACACGCCATGGGGATGCCG
GCCCACATATTCCCGCCAAGCCCGACGGCGGCCGGCCCATTCGCCGCCGTCCCACCCACATCCATCATGTCCAAACCGGCCTCGGTTGGTCCAAATCCAGGTACAGTTGG
AGGAGGATGCAGAGGATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAGCAACAATAGTAACAATGCAGGTTTAATGTTCGGCGACACCACGCTCACGAAGGTGTTCGTCGGCGGATTGGCGTGGGAGACTCCCAAGGAAGCTATGCGAGATCA
CTTCGAGAAGTTCGGCGAGATCTTGGAGGCTGTAATCATCTCCGATAAGCTCACCGGCAGATCCAAGGGCTACGGATTCGTCACGTTTAAGGACGCGGAATCGGCGAAGA
AGGCTTGCGAGGACGCCGCGCCGATCATCAACGGCCGCCGAGCCAACTGTAATCTGGCGTCGCTCGGAGCTCGCCGCGGCTCTCGCTCCGCATCGGCTGCTACTCCTCCC
CAAGCTCCTCCGCTACCAGGATCCAACGGCGGTGGGGGGGCGAGGTCCACGTCAGCAGCATCGCCCAACCACGTGCAGTGGTACTACCCGGCCGGGACTCCTCCGACGCC
GTTTCATCATCAGCCTCATCAGCCCGTCCCGTTCTACGGTTACTCCCCAAGCCCCACCTACATCGCCACGGATATCAGTTACAACCATAAGCTGAGCTATATGAACGGCG
GGGGGCATTACTCGCAGGTGTATCCGGGGCAGGCTATGGTGGGAGCGAACACATTGATGCCGATGTACCCGCTGTATCACTACCATCAATCACACGCCATGGGGATGCCG
GCCCACATATTCCCGCCAAGCCCGACGGCGGCCGGCCCATTCGCCGCCGTCCCACCCACATCCATCATGTCCAAACCGGCCTCGGTTGGTCCAAATCCAGGTACAGTTGG
AGGAGGATGCAGAGGATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSNNSNNAGLMFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFEKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDAAPIINGRRANCNLASLGARRGSRSASAATPP
QAPPLPGSNGGGGARSTSAASPNHVQWYYPAGTPPTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKLSYMNGGGHYSQVYPGQAMVGANTLMPMYPLYHYHQSHAMGMP
AHIFPPSPTAAGPFAAVPPTSIMSKPASVGPNPGTVGGGCRG