; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Moc09g34800 (gene) of Bitter gourd (OHB3-1) v2 genome

Gene IDMoc09g34800
OrganismMomordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
DescriptionUnknown protein
Genome locationchr9:26667345..26670225
RNA-Seq ExpressionMoc09g34800
SyntenyMoc09g34800
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
GCB84583.1 hypothetical protein [Scyliorhinus torazame]2.1e-0623.39Show/hide
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        MS  + E MS  + E M  A+CE+ S ++ E+M  A+ ++ S ++ E MS  + E+ S A+ E+ S  + E +S T+ E+MS A+ E    E+   +  +
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Query:  YFDESSSLMSRGAALMGAHRCFDFDLSRTLGLRLELPGEKV--ILKGEV--FLLEQVFLEGKVIRSDKVSIGVGLPREKVI---LKSEVFLEGKVIRSDK
          +E S  +S   +                G   EL    V  ++ G V   +   V  E     S+++S  V      V+   +   V  E   + S++
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         S   G+  E +   +   + G+V         +E++  +     +    S E+S  ++ +++     E+M  GV   V  G   + +   V  E   + 
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         E M   + E  S A+ E+++ A+ +  S T+ E MS    E  S  + E     + ++M  T+ E+MS  +
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GCC19987.1 hypothetical protein [Chiloscyllium punctatum]1.2e-0628.28Show/hide
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        IG+ M   IG+LM   I +L    IG+L+   I +L    IG+LM   IG+L    I +L    IG+LM   IG+LM   I +  + E+ +D  M  F  
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           ++  G  +      F  D +   +G  +E+    ++   EVF+ +Q+  F+    +V   D + + +G P E  I    EVF+    +V   D   +
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         +G P E  I   +EVF+    EV   D + +F  DL +++    L+     +L + I   L  ++  +LM+                    IG+ M + 
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Query:  Y-ELMRSAICELKSSAIGELISLAIGKLRSSTIGELMSSAIGELRSSAICELKSSAIGKLMSLTIGELMSSVISCHVVILIHGEIYEKF
          +LM   I +L    IG+L+ + IG L    IG+LM   IG+     I +L    IG LM + IG+ M+ +I   V + I G++ E F
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KMZ98687.1 hypothetical protein PVNG_06127, partial [Plasmodium vivax North Korean]4.1e-0748.84Show/hide
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        S AI E  S  I E+   AI E+RS +I E+   AI E+RS +I E+ S AI E+RS AI E+RS AI E+ S  I E+ S AI E
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MQL99038.1 hypothetical protein [Colocasia esculenta]1.3e-0543.31Show/hide
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        M SAI E MSSL  E MRS + EL  S + ELMRS + EL  S + ELM S + EL  SA+ EL  S + ELM S + ELM SAI EL+R   + ++  S
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Query:  YFDESSSLMSRGAALMGAHRCFDFDLS
           E +  ++ G    G   C+D  +S
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XP_031663108.1 uncharacterized protein LOC116357829 [Oncorhynchus kisutch]6.2e-1124.18Show/hide
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        + E  +  + EL    + EL + ++ EL    + EL + ++GEL +  +GEL +  + EL +  + EL + T+ EL +  ++EL   + + ++     +E
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Query:  SSSLMSRGAALMGAHRCFDFDLSRTLGLRLELPGEKVILKGEVFLLEQVFLEGKVIRSDKVSIGVGLPREKVILKSEVFLEGKVIRSDKASLGVGLPREK
         ++  S                S+T+G       E++  +    L  Q   E   + +  V        E++  ++ V L  + +        V L   +
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Query:  VILKIEVFLKGEVIHNDKIFLFNEDLEKLWRRR--QLLMQNSTELSRPITWQLAKLTRYELMQGGVKGHVHYGRYDKAVRCRVIGERMSSSY-ELMRSAI
         + ++     GE+ +     L N+ +E+L  +   +L  Q   EL+     +L   T  EL    V            +  + +GE  S +  EL    +
Subjt:  VILKIEVFLKGEVIHNDKIFLFNEDLEKLWRRR--QLLMQNSTELSRPITWQLAKLTRYELMQGGVKGHVHYGRYDKAVRCRVIGERMSSSY-ELMRSAI

Query:  CELKSSAIGELISLAIGKLRSSTIGELMSSAIGELRSSAICELKSSAIGKLMSLTIGELMSSVI
         EL S  +GEL S  +G+L S T+GEL S  +GEL S  + EL +  +G+L S T+GEL S  +
Subjt:  CELKSSAIGELISLAIGKLRSSTIGELMSSAIGELRSSAICELKSSAIGKLMSLTIGELMSSVI

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0J9TV14 Uncharacterized protein (Fragment)2.0e-0748.84Show/hide
Query:  SSAIGEFMSSLIGELMRSAICELRSSSIGELMRSAICELRSSSIGELMSSAIGELRSSAICELRSSAIGELMSSTIGELMSSAIDE
        S AI E  S  I E+   AI E+RS +I E+   AI E+RS +I E+ S AI E+RS AI E+RS AI E+ S  I E+ S AI E
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A0A1B8XWD9 Uncharacterized protein4.5e-0753.93Show/hide
Query:  MSSAIGEFMSSLIGELMRSAICELRSSSIGELMRSAICELRSSSIGELMSSAIGELRSSAICELRSSAIGELMSSTIGELMSSAIDELL
        M S+IG  M S IG LM S+I  L  SSIG LM S+I  L  SSIG LM S+IG L  S+I  L  S+IG LM S+IG LM S+I  L+
Subjt:  MSSAIGEFMSSLIGELMRSAICELRSSSIGELMRSAICELRSSSIGELMSSAIGELRSSAICELRSSAIGELMSSTIGELMSSAIDELL

A0A401QGW4 Uncharacterized protein (Fragment)1.0e-0623.39Show/hide
Query:  MSSAIGEFMSSLIGELMRSAICELRSSSIGELMRSAICELRSSSIGELMSSAIGELRSSAICELRSSAIGELMSSTIGELMSSAIDELLRWELIVDVDMS
        MS  + E MS  + E M  A+CE+ S ++ E+M  A+ ++ S ++ E MS  + E+ S A+ E+ S  + E +S T+ E+MS A+ E    E+   +  +
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Query:  YFDESSSLMSRGAALMGAHRCFDFDLSRTLGLRLELPGEKV--ILKGEV--FLLEQVFLEGKVIRSDKVSIGVGLPREKVI---LKSEVFLEGKVIRSDK
          +E S  +S   +                G   EL    V  ++ G V   +   V  E     S+++S  V      V+   +   V  E   + S++
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Query:  ASLGVGLPREKVILKIEVFLKGEVIHNDKIFLFNEDLEKLWRRRQLLMQNSTELSRPITWQLAKLTRYELMQGGVKGHVHYGRYDKAVRCRVIGERMSSS
         S   G+  E +   +   + G+V         +E++  +     +    S E+S  ++ +++     E+M  GV   V  G   + +   V  E   + 
Subjt:  ASLGVGLPREKVILKIEVFLKGEVIHNDKIFLFNEDLEKLWRRRQLLMQNSTELSRPITWQLAKLTRYELMQGGVKGHVHYGRYDKAVRCRVIGERMSSS

Query:  YELMRSAICELKSSAIGELISLAIGKLRSSTIGELMSSAIGELRSSAICELKSSAIGKLMSLTIGELMSSVI
         E M   + E  S A+ E+++ A+ +  S T+ E MS    E  S  + E     + ++M  T+ E+MS  +
Subjt:  YELMRSAICELKSSAIGELISLAIGKLRSSTIGELMSSAIGELRSSAICELKSSAIGKLMSLTIGELMSSVI

A0A401RP73 Uncharacterized protein5.8e-0728.28Show/hide
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        IG+ M   IG+LM   I +L    IG+L+   I +L    IG+LM   IG+L    I +L    IG+LM   IG+LM   I +  + E+ +D  M  F  
Subjt:  IGEFMSSLIGELMRSAICELRSSSIGELMRSAICELRSSSIGELMSSAIGELRSSAICELRSSAIGELMSSTIGELMSSAIDELLRWELIVDVDMSYFDE

Query:  SSSLMSRGAALMGAHRCFDFD-LSRTLGLRLELPGEKVILKGEVFLLEQV--FLEG--KVIRSDKVSIGVGLPREKVILK-SEVFLEG--KVIRSDKASL
           ++  G  +      F  D +   +G  +E+    ++   EVF+ +Q+  F+    +V   D + + +G P E  I    EVF+    +V   D   +
Subjt:  SSSLMSRGAALMGAHRCFDFD-LSRTLGLRLELPGEKVILKGEVFLLEQV--FLEG--KVIRSDKVSIGVGLPREKVILK-SEVFLEG--KVIRSDKASL

Query:  GVGLPREKVILK-IEVFLKG--EVIHNDKIFLFNEDLEKLWRRRQLLMQNSTELSRPITWQLAKLTRYELMQGGVKGHVHYGRYDKAVRCRVIGERMSSS
         +G P E  I   +EVF+    EV   D + +F  DL +++    L+     +L + I   L  ++  +LM+                    IG+ M + 
Subjt:  GVGLPREKVILK-IEVFLKG--EVIHNDKIFLFNEDLEKLWRRRQLLMQNSTELSRPITWQLAKLTRYELMQGGVKGHVHYGRYDKAVRCRVIGERMSSS

Query:  Y-ELMRSAICELKSSAIGELISLAIGKLRSSTIGELMSSAIGELRSSAICELKSSAIGKLMSLTIGELMSSVISCHVVILIHGEIYEKF
          +LM   I +L    IG+L+ + IG L    IG+LM   IG+     I +L    IG LM + IG+ M+ +I   V + I G++ E F
Subjt:  Y-ELMRSAICELKSSAIGELISLAIGKLRSSTIGELMSSAIGELRSSAICELKSSAIGKLMSLTIGELMSSVISCHVVILIHGEIYEKF

A0A6H5GK15 Uncharacterized protein (Fragment)2.1e-0433.33Show/hide
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        MS  I E MS ++ E+MR  + ++ S  +GE M   + E+ S  + ELMS  + E+ S  I E+ S  + E+MS  + E+MS  + EL+  E++ +V   
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Query:  YFDESSSLMSR
           E  S + R
Subjt:  YFDESSSLMSR

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGCTCGGCAATAGGTGAGTTTATGAGCTCGCTAATAGGTGAGCTCATGAGGTCGGCAATATGTGAGCTAAGGAGCTCATCAATAGGTGAGCTCATGAGGTCGGCAAT
ATGTGAGCTAAGGAGCTCATCAATAGGTGAGCTCATGAGCTCGGCCATAGGTGAGCTTAGAAGCTCGGCAATATGTGAGCTAAGGAGCTCGGCCATAGGTGAGCTTATGA
GCTCGACAATAGGTGAGCTTATGAGTTCGGCAATAGATGAGCTGCTCCGATGGGAGCTCATCGTTGATGTTGATATGAGCTATTTTGATGAAAGTTCATCGTTGATGTCA
AGAGGAGCTGCTCTGATGGGAGCTCATCGTTGCTTTGATTTTGACCTAAGCCGAACGTTGGGTTTGAGATTGGAGCTTCCGGGAGAGAAAGTCATCCTCAAGGGTGAGGT
ATTCCTCTTGGAGCAGGTCTTCCTCGAGGGGAAGGTGATCCGTAGTGATAAAGTCTCTATTGGAGTAGGTCTTCCAAGAGAGAAAGTCATCCTCAAGAGTGAGGTCTTTC
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GATAAGATCTTTCTCTTCAACGAAGATCTTGAAAAGCTTTGGAGACGGCGCCAACTGTTGATGCAAAATTCTACTGAGCTGTCGAGGCCGATCACGTGGCAACTGGCCAA
GCTGACGAGGTACGAGCTCATGCAAGGCGGAGTGAAAGGACACGTCCATTATGGTCGTTACGACAAAGCGGTTAGATGTCGGGTCATAGGTGAGCGTATGAGCTCATCTT
ATGAGCTCATGAGGTCGGCAATATGTGAGCTAAAGAGCTCGGCAATAGGTGAGCTCATAAGCTTGGCCATAGGTAAGCTTAGGAGCTCGACAATAGGTGAGCTTATGAGC
TCGGCCATAGGTGAGCTAAGGAGCTCGGCAATATGTGAGCTAAAGAGCTCGGCCATAGGTAAGCTTATGAGCTTGACAATAGGTGAGCTCATGAGCTCGGTCATATCTTG
CCACGTGGTCATACTGATACATGGCGAAATCTATGAGAAGTTTGGTCATGCTCTCTTTTCTGTAAGGTCTTGTCGTCAAGACTTGAGCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAGCTCGGCAATAGGTGAGTTTATGAGCTCGCTAATAGGTGAGCTCATGAGGTCGGCAATATGTGAGCTAAGGAGCTCATCAATAGGTGAGCTCATGAGGTCGGCAAT
ATGTGAGCTAAGGAGCTCATCAATAGGTGAGCTCATGAGCTCGGCCATAGGTGAGCTTAGAAGCTCGGCAATATGTGAGCTAAGGAGCTCGGCCATAGGTGAGCTTATGA
GCTCGACAATAGGTGAGCTTATGAGTTCGGCAATAGATGAGCTGCTCCGATGGGAGCTCATCGTTGATGTTGATATGAGCTATTTTGATGAAAGTTCATCGTTGATGTCA
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GATAAGATCTTTCTCTTCAACGAAGATCTTGAAAAGCTTTGGAGACGGCGCCAACTGTTGATGCAAAATTCTACTGAGCTGTCGAGGCCGATCACGTGGCAACTGGCCAA
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TCGGCCATAGGTGAGCTAAGGAGCTCGGCAATATGTGAGCTAAAGAGCTCGGCCATAGGTAAGCTTATGAGCTTGACAATAGGTGAGCTCATGAGCTCGGTCATATCTTG
CCACGTGGTCATACTGATACATGGCGAAATCTATGAGAAGTTTGGTCATGCTCTCTTTTCTGTAAGGTCTTGTCGTCAAGACTTGAGCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSSAIGEFMSSLIGELMRSAICELRSSSIGELMRSAICELRSSSIGELMSSAIGELRSSAICELRSSAIGELMSSTIGELMSSAIDELLRWELIVDVDMSYFDESSSLMS
RGAALMGAHRCFDFDLSRTLGLRLELPGEKVILKGEVFLLEQVFLEGKVIRSDKVSIGVGLPREKVILKSEVFLEGKVIRSDKASLGVGLPREKVILKIEVFLKGEVIHN
DKIFLFNEDLEKLWRRRQLLMQNSTELSRPITWQLAKLTRYELMQGGVKGHVHYGRYDKAVRCRVIGERMSSSYELMRSAICELKSSAIGELISLAIGKLRSSTIGELMS
SAIGELRSSAICELKSSAIGKLMSLTIGELMSSVISCHVVILIHGEIYEKFGHALFSVRSCRQDLS