; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Moc09g40510 (gene) of Bitter gourd (OHB3-1) v2 genome

Gene IDMoc09g40510
OrganismMomordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
DescriptionATP citrate synthase
Genome locationchr9:30922572..30925810
RNA-Seq ExpressionMoc09g40510
SyntenyMoc09g40510
Gene Ontology termsGO:0000166 - nucleotide binding (molecular function)
GO:0003878 - ATP citrate synthase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR013650 - ATP-grasp fold, succinyl-CoA synthetase-type
IPR016102 - Succinyl-CoA synthetase-like
IPR032263 - ATP-citrate synthase, citrate-binding domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7012803.1 ATP-citrate synthase alpha chain protein 2 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.4e-23395.74Show/hide
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O22718 ATP-citrate synthase alpha chain protein 23.7e-22287.71Show/hide
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        MARKKIRE DSKRL+KEHFKR+SG++LPI+S Q+++ TD NEL E+EPWL S KLVVKPDMLFGKRGKSGLVALNLD A+V  FVKERLGK VEMSGCKG
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        PITTFIVEPF+PHNEEFYLNIVS+RLGCS+SFSECGGIDIEENWDKVKTI +PTGASLT EICAPLVATLPLEIKGE+EDF++ +F+LF+DLDFTFLEMN
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        PFTLVDGKPYPLDMRGELDDTA+FKNFKKWGD+EFP+PFGRVMS+TESFIHGLDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
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        YAEYSGAP E+EVLQYARVVIDCATA+PDG+SRALVIGGGIANFTDVAATFNGIIRALKEKEAKLKAARM+I+VRRGGPNYQ+GLAKMR+LG+E+G+PIE
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        VYGPEATMTGICK+AI+ ITAAA
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O80526 ATP-citrate synthase alpha chain protein 33.7e-20681.62Show/hide
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        MARKKIRE DSKRLLKEH KR++  DL I+SAQV+ESTDF EL  +E WL S+KLVVKPDMLFGKRGKSGLVAL LDLAEV +FVK RLG  VEM GCK 
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        PITTFIVEPF+PH++E+YL+IVS+RLGC++SFSECGGI+IEENWDKVKTIF+P   S+T E+CAPL+ATLPLE++ +I +F+   F++FQDLDF+F+EMN
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        PFTLVDG+P+PLDMRGELDDTA+FKNF KWGD+EFPLPFGRV+S+TE+FIHGLDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
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        YAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCAT DPDGR RAL+IGGGIANFTDVAATFNGIIRAL+EKE +LKA+RM+IYVRRGGPNYQ GLA+MRALGEELG+P+E
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        VYGPEATMTGICK+AI+CI
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Q2QNG7 ATP-citrate synthase alpha chain protein 31.1e-20581.56Show/hide
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        MARKKIRE DSKRLL+EH KR++  DL I SAQV+ESTDF EL  +EPWL S KLVVKPDMLFGKRGKSGLVALNLDLA+V  FVKERLG  VEM GCK 
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        PITTFIVEPF+PH++E+YL+IVSERLG ++SFSECGGI+IEENWDKVKT+F+PT  ++T + CAPL+ATLPLE++ +I DF++ V+S+FQDLDF+FLEMN
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        PFT+V+G+PYPLDMRGELDDTA+FKNFKKWG+++FPLPFGRV+S +ESFIH LDEKTS+SLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
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        YAEYSGAPNEEEVLQYARVV+DCATADPDGR RAL+IGGGIANFTDVAATF+GIIRAL+EKE+KLKAARMNIYVRRGGPNYQ GLAKMR LG ELG+PIE
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        VYGPEATMTGICKQAI+CI A A
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Q2QZ86 ATP-citrate synthase alpha chain protein 25.7e-20782.03Show/hide
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        MARKKIRE DSKRLLKEH KR++G DL I SAQV++STDF EL  ++PWL + KLVVKPDMLFGKRGKSGLVALNLD+A+V  FVKERLG  VEM GCK 
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        PITTFIVEPF+PH++E+YL+IVSERLG ++SFSECGGI+IEENWDKVKTIF+PT   +T + CAPL+ATLPLE +G+I DF+K VF++FQDLDF+FLEMN
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        PFT+V+G+PYPLDMRGELDDTA+FKNFKKWG++EFPLPFGRV+S+TE FIH LDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
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Query:  YAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCATADPDGRSRALVIGGGIANFTDVAATFNGIIRALKEKEAKLKAARMNIYVRRGGPNYQRGLAKMRALGEELGIPIE
        YAEYSGAPNEEEVLQYARVV+DCATADPDGR RAL+IGGGIANFTDV ATF+GIIRAL+EKE+KLKAARM+IYVRRGGPNYQ GLAKMR LG ELG+PIE
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        VYGPEATMTGICKQAIEC+ AAA
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Q9SGY2 ATP-citrate synthase alpha chain protein 11.4e-22187.71Show/hide
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        MARKKIRE DSKRL+KEHFKR+SG++LPI+S Q++E+TD NEL EKEPWL S KLVVKPDMLFGKRGKSGLVAL LD A+V  FVKERLGK VEMSGCKG
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        PITTFIVEPF+PHNEE+YLN+VS+RLGCS+SFSECGGI+IEENWDKVKTIF+PTGASLT EICAPLVATLPLEIK EIE+F+K +F+LFQDLDFTFLEMN
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        PFTLVDG PYPLDMRGELDDTA+FKNFKKWGD+EFPLPFGRVMS TESFIHGLDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
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        YAEYSGAP E+EVLQYARVVIDCATA+PDG+SRALVIGGGIANFTDVAATFNGIIRALKEKEAKLKAARM+I+VRRGGPNYQ+GLAKMRALG+++G+PIE
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        VYGPEATMTGICK+AI+ ITAAA
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G10670.1 ATP-citrate lyase A-19.9e-22387.71Show/hide
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        MARKKIRE DSKRL+KEHFKR+SG++LPI+S Q++E+TD NEL EKEPWL S KLVVKPDMLFGKRGKSGLVAL LD A+V  FVKERLGK VEMSGCKG
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        PITTFIVEPF+PHNEE+YLN+VS+RLGCS+SFSECGGI+IEENWDKVKTIF+PTGASLT EICAPLVATLPLEIK EIE+F+K +F+LFQDLDFTFLEMN
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        PFTLVDG PYPLDMRGELDDTA+FKNFKKWGD+EFPLPFGRVMS TESFIHGLDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
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Query:  YAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCATADPDGRSRALVIGGGIANFTDVAATFNGIIRALKEKEAKLKAARMNIYVRRGGPNYQRGLAKMRALGEELGIPIE
        YAEYSGAP E+EVLQYARVVIDCATA+PDG+SRALVIGGGIANFTDVAATFNGIIRALKEKEAKLKAARM+I+VRRGGPNYQ+GLAKMRALG+++G+PIE
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        VYGPEATMTGICK+AI+ ITAAA
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AT1G10670.2 ATP-citrate lyase A-19.9e-22387.71Show/hide
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        MARKKIRE DSKRL+KEHFKR+SG++LPI+S Q++E+TD NEL EKEPWL S KLVVKPDMLFGKRGKSGLVAL LD A+V  FVKERLGK VEMSGCKG
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        PITTFIVEPF+PHNEE+YLN+VS+RLGCS+SFSECGGI+IEENWDKVKTIF+PTGASLT EICAPLVATLPLEIK EIE+F+K +F+LFQDLDFTFLEMN
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        PFTLVDG PYPLDMRGELDDTA+FKNFKKWGD+EFPLPFGRVMS TESFIHGLDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
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Query:  YAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCATADPDGRSRALVIGGGIANFTDVAATFNGIIRALKEKEAKLKAARMNIYVRRGGPNYQRGLAKMRALGEELGIPIE
        YAEYSGAP E+EVLQYARVVIDCATA+PDG+SRALVIGGGIANFTDVAATFNGIIRALKEKEAKLKAARM+I+VRRGGPNYQ+GLAKMRALG+++G+PIE
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Query:  VYGPEATMTGICKQAIECITAAA
        VYGPEATMTGICK+AI+ ITAAA
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AT1G10670.3 ATP-citrate lyase A-13.9e-21983.75Show/hide
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        MARKKIRE DSKRL+KEHFKR+SG++LPI+S Q                    ++E+TD NEL EKEPWL S KLVVKPDMLFGKRGKSGLVAL LD A+
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Query:  VTNFVKERLGKVVEMSGCKGPITTFIVEPFIPHNEEFYLNIVSERLGCSLSFSECGGIDIEENWDKVKTIFVPTGASLTSEICAPLVATLPLEIKGEIED
        V  FVKERLGK VEMSGCKGPITTFIVEPF+PHNEE+YLN+VS+RLGCS+SFSECGGI+IEENWDKVKTIF+PTGASLT EICAPLVATLPLEIK EIE+
Subjt:  VTNFVKERLGKVVEMSGCKGPITTFIVEPFIPHNEEFYLNIVSERLGCSLSFSECGGIDIEENWDKVKTIFVPTGASLTSEICAPLVATLPLEIKGEIED

Query:  FLKSVFSLFQDLDFTFLEMNPFTLVDGKPYPLDMRGELDDTASFKNFKKWGDVEFPLPFGRVMSATESFIHGLDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGG
        F+K +F+LFQDLDFTFLEMNPFTLVDG PYPLDMRGELDDTA+FKNFKKWGD+EFPLPFGRVMS TESFIHGLDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGG
Subjt:  FLKSVFSLFQDLDFTFLEMNPFTLVDGKPYPLDMRGELDDTASFKNFKKWGDVEFPLPFGRVMSATESFIHGLDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGG

Query:  ASVIYADTVGDLGYASELGNYAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCATADPDGRSRALVIGGGIANFTDVAATFNGIIRALKEKEAKLKAARMNIYVRRGGPN
        ASVIYADTVGDLGYASELGNYAEYSGAP E+EVLQYARVVIDCATA+PDG+SRALVIGGGIANFTDVAATFNGIIRALKEKEAKLKAARM+I+VRRGGPN
Subjt:  ASVIYADTVGDLGYASELGNYAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCATADPDGRSRALVIGGGIANFTDVAATFNGIIRALKEKEAKLKAARMNIYVRRGGPN

Query:  YQRGLAKMRALGEELGIPIEVYGPEATMTGICKQAIECITAAA
        YQ+GLAKMRALG+++G+PIEVYGPEATMTGICK+AI+ ITAAA
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AT1G10670.4 ATP-citrate lyase A-19.9e-22387.71Show/hide
Query:  MARKKIRENDSKRLLKEHFKRISGRDLPIKSAQVSESTDFNELAEKEPWLLSSKLVVKPDMLFGKRGKSGLVALNLDLAEVTNFVKERLGKVVEMSGCKG
        MARKKIRE DSKRL+KEHFKR+SG++LPI+S Q++E+TD NEL EKEPWL S KLVVKPDMLFGKRGKSGLVAL LD A+V  FVKERLGK VEMSGCKG
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Query:  PITTFIVEPFIPHNEEFYLNIVSERLGCSLSFSECGGIDIEENWDKVKTIFVPTGASLTSEICAPLVATLPLEIKGEIEDFLKSVFSLFQDLDFTFLEMN
        PITTFIVEPF+PHNEE+YLN+VS+RLGCS+SFSECGGI+IEENWDKVKTIF+PTGASLT EICAPLVATLPLEIK EIE+F+K +F+LFQDLDFTFLEMN
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Query:  PFTLVDGKPYPLDMRGELDDTASFKNFKKWGDVEFPLPFGRVMSATESFIHGLDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
        PFTLVDG PYPLDMRGELDDTA+FKNFKKWGD+EFPLPFGRVMS TESFIHGLDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
Subjt:  PFTLVDGKPYPLDMRGELDDTASFKNFKKWGDVEFPLPFGRVMSATESFIHGLDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN

Query:  YAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCATADPDGRSRALVIGGGIANFTDVAATFNGIIRALKEKEAKLKAARMNIYVRRGGPNYQRGLAKMRALGEELGIPIE
        YAEYSGAP E+EVLQYARVVIDCATA+PDG+SRALVIGGGIANFTDVAATFNGIIRALKEKEAKLKAARM+I+VRRGGPNYQ+GLAKMRALG+++G+PIE
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Query:  VYGPEATMTGICKQAIECITAAA
        VYGPEATMTGICK+AI+ ITAAA
Subjt:  VYGPEATMTGICKQAIECITAAA

AT1G60810.1 ATP-citrate lyase A-22.6e-22387.71Show/hide
Query:  MARKKIRENDSKRLLKEHFKRISGRDLPIKSAQVSESTDFNELAEKEPWLLSSKLVVKPDMLFGKRGKSGLVALNLDLAEVTNFVKERLGKVVEMSGCKG
        MARKKIRE DSKRL+KEHFKR+SG++LPI+S Q+++ TD NEL E+EPWL S KLVVKPDMLFGKRGKSGLVALNLD A+V  FVKERLGK VEMSGCKG
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Query:  PITTFIVEPFIPHNEEFYLNIVSERLGCSLSFSECGGIDIEENWDKVKTIFVPTGASLTSEICAPLVATLPLEIKGEIEDFLKSVFSLFQDLDFTFLEMN
        PITTFIVEPF+PHNEEFYLNIVS+RLGCS+SFSECGGIDIEENWDKVKTI +PTGASLT EICAPLVATLPLEIKGE+EDF++ +F+LF+DLDFTFLEMN
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Query:  VYGPEATMTGICKQAIECITAAA
        VYGPEATMTGICK+AI+ ITAAA
Subjt:  VYGPEATMTGICKQAIECITAAA


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGCGCAAGAAGATCAGAGAGAACGATTCCAAGAGATTGTTGAAGGAGCATTTTAAAAGAATTTCTGGCCGTGATTTACCGATCAAATCAGCGCAGGTTAGTGAATC
GACCGATTTCAATGAGCTAGCTGAGAAGGAACCCTGGCTGTTATCGTCAAAATTGGTTGTGAAGCCTGACATGTTGTTTGGAAAGCGTGGTAAAAGCGGTTTAGTTGCAC
TAAATCTAGACTTGGCTGAAGTAACTAATTTTGTGAAGGAACGTCTGGGGAAAGTGGTGGAGATGAGCGGATGCAAGGGACCCATTACAACATTTATAGTGGAGCCTTTT
ATCCCACACAACGAAGAATTTTATCTGAATATTGTCTCAGAAAGGCTTGGCTGTAGTCTAAGCTTTTCAGAATGTGGAGGAATTGATATTGAAGAGAACTGGGATAAGGT
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CTGTTTTTTCTCTATTTCAAGATTTGGACTTCACTTTTCTGGAAATGAATCCCTTCACATTGGTTGATGGAAAGCCTTATCCACTGGACATGAGAGGCGAACTGGATGAT
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