; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Moc10g02830 (gene) of Bitter gourd (OHB3-1) v2 genome

Gene IDMoc10g02830
OrganismMomordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
DescriptionGTP-binding protein YPTM2
Genome locationchr10:1949700..1950945
RNA-Seq ExpressionMoc10g02830
SyntenyMoc10g02830
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6600205.1 hypothetical protein SDJN03_05438, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.2e-3665.71Show/hide
Query:  MYRSVSWNRFSDEYYSRSSPALVLSSKPDQALGLSSSFGANELPTNDPVAVMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNPEIDVGMRGETIAA
        M+RSVSWNRFSDEYYS SSP+  LSS P QAL L  SF  NE PT+ P   +VKREKARVKFA TAVHVIPLVL+LCAI+LWFFSNPEID GMR + +AA
Subjt:  MYRSVSWNRFSDEYYSRSSPALVLSSKPDQALGLSSSFGANELPTNDPVAVMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNPEIDVGMRGETIAA

Query:  RIEGLTIEGELESEIPILDTASSHHSNQLDDPSSILKIKR
        RIEGL +EGE+E E      A +     LD   S LKIKR
Subjt:  RIEGLTIEGELESEIPILDTASSHHSNQLDDPSSILKIKR

KAG7030866.1 hypothetical protein SDJN02_04903, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.2e-3665.71Show/hide
Query:  MYRSVSWNRFSDEYYSRSSPALVLSSKPDQALGLSSSFGANELPTNDPVAVMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNPEIDVGMRGETIAA
        M+RSVSWNRFSDEYYS SSP+  LSS P QAL L  SF  NE PT+ P   +VKREKARVKFA TAVHVIPLVL+LCAI+LWFFSNPEID GMR + +AA
Subjt:  MYRSVSWNRFSDEYYSRSSPALVLSSKPDQALGLSSSFGANELPTNDPVAVMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNPEIDVGMRGETIAA

Query:  RIEGLTIEGELESEIPILDTASSHHSNQLDDPSSILKIKR
        RIEGL +EGE+E E      A +     LD   S LKIKR
Subjt:  RIEGLTIEGELESEIPILDTASSHHSNQLDDPSSILKIKR

XP_022140815.1 uncharacterized protein LOC111011394 isoform X1 [Momordica charantia]7.2e-71100Show/hide
Query:  MYRSVSWNRFSDEYYSRSSPALVLSSKPDQALGLSSSFGANELPTNDPVAVMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNPEIDVGMRGETIAA
        MYRSVSWNRFSDEYYSRSSPALVLSSKPDQALGLSSSFGANELPTNDPVAVMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNPEIDVGMRGETIAA
Subjt:  MYRSVSWNRFSDEYYSRSSPALVLSSKPDQALGLSSSFGANELPTNDPVAVMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNPEIDVGMRGETIAA

Query:  RIEGLTIEGELESEIPILDTASSHHSNQLDDPSSILKIKRFI
        RIEGLTIEGELESEIPILDTASSHHSNQLDDPSSILKIKRFI
Subjt:  RIEGLTIEGELESEIPILDTASSHHSNQLDDPSSILKIKRFI

XP_022140816.1 uncharacterized protein LOC111011394 isoform X2 [Momordica charantia]2.5e-39100Show/hide
Query:  MYRSVSWNRFSDEYYSRSSPALVLSSKPDQALGLSSSFGANELPTNDPVAVMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNP
        MYRSVSWNRFSDEYYSRSSPALVLSSKPDQALGLSSSFGANELPTNDPVAVMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNP
Subjt:  MYRSVSWNRFSDEYYSRSSPALVLSSKPDQALGLSSSFGANELPTNDPVAVMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNP

XP_022986879.1 uncharacterized protein LOC111484483 [Cucurbita maxima]1.5e-3967.86Show/hide
Query:  MYRSVSWNRFSDEYYSRSSPALVLSSKPDQALGLSSSFGANELPTNDPVAVMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNPEIDVGMRGETIAA
        M+RSVSWNRFSDEYYS SSP+  LSS P QAL L+SSF  NE PT+ P   MVKREKARVKFA TAVHVIPLVL+LCAI+LWFFSNPEIDVGMR + +AA
Subjt:  MYRSVSWNRFSDEYYSRSSPALVLSSKPDQALGLSSSFGANELPTNDPVAVMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNPEIDVGMRGETIAA

Query:  RIEGLTIEGELESEIPILDTASSHHSNQLDDPSSILKIKR
        RIEGL +EGE+E E      A +     LD   S LKIKR
Subjt:  RIEGLTIEGELESEIPILDTASSHHSNQLDDPSSILKIKR

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S4E0H1 uncharacterized protein LOC1034944522.8e-3667.67Show/hide
Query:  MYRSVSWNRFSDEYYSRSSPALVLSSKPDQALGLSSSF--GANELPTNDPVAVMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNPEIDVGMRGETI
        MYRS SWNRFSDEYYS S+P    SSKP Q+L LSSSF  G NELP NDPV  MVKREKARVKFAE AVHVIP VLL+C IVLWFFSNPE+DV MRG T+
Subjt:  MYRSVSWNRFSDEYYSRSSPALVLSSKPDQALGLSSSF--GANELPTNDPVAVMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNPEIDVGMRGETI

Query:  AARIEGLTIEGELES-----EIPILDTASSHHS
         + I GLT+EGE+ES       P L+   SH S
Subjt:  AARIEGLTIEGELES-----EIPILDTASSHHS

A0A6J1CG79 uncharacterized protein LOC111011394 isoform X13.5e-71100Show/hide
Query:  MYRSVSWNRFSDEYYSRSSPALVLSSKPDQALGLSSSFGANELPTNDPVAVMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNPEIDVGMRGETIAA
        MYRSVSWNRFSDEYYSRSSPALVLSSKPDQALGLSSSFGANELPTNDPVAVMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNPEIDVGMRGETIAA
Subjt:  MYRSVSWNRFSDEYYSRSSPALVLSSKPDQALGLSSSFGANELPTNDPVAVMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNPEIDVGMRGETIAA

Query:  RIEGLTIEGELESEIPILDTASSHHSNQLDDPSSILKIKRFI
        RIEGLTIEGELESEIPILDTASSHHSNQLDDPSSILKIKRFI
Subjt:  RIEGLTIEGELESEIPILDTASSHHSNQLDDPSSILKIKRFI

A0A6J1CH63 uncharacterized protein LOC111011394 isoform X21.2e-39100Show/hide
Query:  MYRSVSWNRFSDEYYSRSSPALVLSSKPDQALGLSSSFGANELPTNDPVAVMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNP
        MYRSVSWNRFSDEYYSRSSPALVLSSKPDQALGLSSSFGANELPTNDPVAVMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNP
Subjt:  MYRSVSWNRFSDEYYSRSSPALVLSSKPDQALGLSSSFGANELPTNDPVAVMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNP

A0A6J1FWX5 uncharacterized protein LOC1114477111.6e-3665.71Show/hide
Query:  MYRSVSWNRFSDEYYSRSSPALVLSSKPDQALGLSSSFGANELPTNDPVAVMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNPEIDVGMRGETIAA
        M+RSVSWNRFSDEYYS SSP   LSS P QAL L  SF  NE PT+ P   +VKREKARVKFA TAVHVIPLVL+LCAI+LWFFSNPEIDVGMR + +AA
Subjt:  MYRSVSWNRFSDEYYSRSSPALVLSSKPDQALGLSSSFGANELPTNDPVAVMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNPEIDVGMRGETIAA

Query:  RIEGLTIEGELESEIPILDTASSHHSNQLDDPSSILKIKR
         IEGL +EGE+E E      A +     LD   S LKIKR
Subjt:  RIEGLTIEGELESEIPILDTASSHHSNQLDDPSSILKIKR

A0A6J1JHB4 uncharacterized protein LOC1114844837.1e-4067.86Show/hide
Query:  MYRSVSWNRFSDEYYSRSSPALVLSSKPDQALGLSSSFGANELPTNDPVAVMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNPEIDVGMRGETIAA
        M+RSVSWNRFSDEYYS SSP+  LSS P QAL L+SSF  NE PT+ P   MVKREKARVKFA TAVHVIPLVL+LCAI+LWFFSNPEIDVGMR + +AA
Subjt:  MYRSVSWNRFSDEYYSRSSPALVLSSKPDQALGLSSSFGANELPTNDPVAVMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNPEIDVGMRGETIAA

Query:  RIEGLTIEGELESEIPILDTASSHHSNQLDDPSSILKIKR
        RIEGL +EGE+E E      A +     LD   S LKIKR
Subjt:  RIEGLTIEGELESEIPILDTASSHHSNQLDDPSSILKIKR

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G35658.1 unknown protein7.1e-0840.91Show/hide
Query:  MYRSVSWNRFSDEYYSRS-SPALVLSSKPDQALGLSSSFGANELPTNDPVAVMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNP
        M RS S +  SD+  + S SP+    S P       S      LP  DP +   K+ K+R + AE A+H IP+VL+LCA++LW FSNP
Subjt:  MYRSVSWNRFSDEYYSRS-SPALVLSSKPDQALGLSSSFGANELPTNDPVAVMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNP

AT2G35658.2 unknown protein1.9e-0835.92Show/hide
Query:  MYRSVSWNRFSDEYYSRS-SPALVLSSKPDQALGLSSSFGANELPTNDPVAVMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNPEIDVGMRGETIA
        M RS S +  SD+  + S SP+    S P       S      LP  DP +   K+ K+R + AE A+H IP+VL+LCA++LW FSNP   +   G+  +
Subjt:  MYRSVSWNRFSDEYYSRS-SPALVLSSKPDQALGLSSSFGANELPTNDPVAVMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNPEIDVGMRGETIA

Query:  ARI
          +
Subjt:  ARI

AT2G35658.3 unknown protein7.1e-0840.91Show/hide
Query:  MYRSVSWNRFSDEYYSRS-SPALVLSSKPDQALGLSSSFGANELPTNDPVAVMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNP
        M RS S +  SD+  + S SP+    S P       S      LP  DP +   K+ K+R + AE A+H IP+VL+LCA++LW FSNP
Subjt:  MYRSVSWNRFSDEYYSRS-SPALVLSSKPDQALGLSSSFGANELPTNDPVAVMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNP

AT5G07490.1 unknown protein4.9e-2551.72Show/hide
Query:  MYRSVSWNRFSDEYYSRSSPALVLSSKPDQA-LGLSSSFGANELPTNDPVA-VMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNPEIDVGMRGETI
        MYRS SWNR +++Y           S P  A  GL      +E    DP    M K+EK+R KFAE AVH+IP VLL CA+VLWFFSNP++DVG++G++I
Subjt:  MYRSVSWNRFSDEYYSRSSPALVLSSKPDQA-LGLSSSFGANELPTNDPVA-VMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNPEIDVGMRGETI

Query:  AARIEGLTIEGELESE
        AARIEGLTIEG+++++
Subjt:  AARIEGLTIEGELESE

AT5G61630.1 unknown protein9.5e-2950Show/hide
Query:  MYRSVSWNRFSDEYYSRSSPALVLSSKPDQALGLSSSFG---ANELPT-NDPVAVMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNPEIDVGMRGE
        MYRS SWNR  ++Y          SS P + L + S  G    NELP+ N+P   MVK+EK+R KFAE A+H+IP VLL CA+VLW FSNP++DVGMR E
Subjt:  MYRSVSWNRFSDEYYSRSSPALVLSSKPDQALGLSSSFG---ANELPT-NDPVAVMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNPEIDVGMRGE

Query:  TIAARIEGLTIEGELESEIPILDTASSHHSNQLDDP
        +IAA+IEGLTIEG+++++     T     + +L DP
Subjt:  TIAARIEGLTIEGELESEIPILDTASSHHSNQLDDP


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTACCGATCGGTGAGCTGGAACCGATTCTCCGACGAATACTACTCGCGGTCGTCCCCGGCGCTGGTGCTGTCCTCCAAGCCCGATCAGGCATTGGGATTGTCGTCGTC
GTTTGGCGCTAATGAGCTGCCGACGAACGATCCCGTCGCTGTGATGGTGAAGCGAGAGAAAGCGCGAGTCAAGTTCGCTGAAACTGCTGTGCATGTGATTCCTCTCGTTT
TGCTTCTCTGCGCCATTGTTCTCTGGTTCTTCTCCAATCCAGAAATAGATGTGGGGATGAGAGGGGAAACAATTGCAGCAAGAATAGAAGGATTGACAATAGAAGGAGAA
CTTGAGAGTGAAATTCCAATTTTGGACACAGCCTCCTCTCACCATTCAAACCAACTTGATGATCCATCCTCTATCCTCAAGATCAAGAGATTTATTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTACCGATCGGTGAGCTGGAACCGATTCTCCGACGAATACTACTCGCGGTCGTCCCCGGCGCTGGTGCTGTCCTCCAAGCCCGATCAGGCATTGGGATTGTCGTCGTC
GTTTGGCGCTAATGAGCTGCCGACGAACGATCCCGTCGCTGTGATGGTGAAGCGAGAGAAAGCGCGAGTCAAGTTCGCTGAAACTGCTGTGCATGTGATTCCTCTCGTTT
TGCTTCTCTGCGCCATTGTTCTCTGGTTCTTCTCCAATCCAGAAATAGATGTGGGGATGAGAGGGGAAACAATTGCAGCAAGAATAGAAGGATTGACAATAGAAGGAGAA
CTTGAGAGTGAAATTCCAATTTTGGACACAGCCTCCTCTCACCATTCAAACCAACTTGATGATCCATCCTCTATCCTCAAGATCAAGAGATTTATTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MYRSVSWNRFSDEYYSRSSPALVLSSKPDQALGLSSSFGANELPTNDPVAVMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNPEIDVGMRGETIAARIEGLTIEGE
LESEIPILDTASSHHSNQLDDPSSILKIKRFI