; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Moc10g04490 (gene) of Bitter gourd (OHB3-1) v2 genome

Gene IDMoc10g04490
OrganismMomordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
DescriptionMYB transcription factor
Genome locationchr10:3115653..3116363
RNA-Seq ExpressionMoc10g04490
SyntenyMoc10g04490
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR001005 - SANT/Myb domain
IPR009057 - Homeobox-like domain superfamily
IPR017930 - Myb domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7030966.1 Transcription factor MYB44, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]4.6e-7868.33Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1D686 transcription factor MYB44-like1.0e-131100Show/hide
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A0A6J1E4J2 transcription factor MYB44-like2.3e-7569.64Show/hide
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A0A6J1FV84 transcription factor MYB44-like2.0e-7969.17Show/hide
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A0A6J1IWV0 transcription factor MYB44-like9.3e-7768.07Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O04192 Transcription factor MYB252.5e-3464.08Show/hide
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O23160 Transcription factor MYB736.7e-5647.08Show/hide
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Query:  ----------------GTYSS---PPRRQQSISSPAEEKR---PNFGPEFLSAMQEMIREEVRNYMAECKEREV
                        G Y++   P R+++ +    EE +     FG EF++ +QEMIR EVR+YMA+ +   V
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Q42575 Transcription factor MYB12.8e-3851.85Show/hide
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Q9FDW1 Transcription factor MYB442.2e-5146.72Show/hide
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        LKRK     D+ G    E         S GS   V+   +   SP+GSD SDS                            T S + +P T L+LSLPG 
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                         T SS      ++S            EE   +F   G EF++ +QEMI+ EVR+YM E
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Q9SN12 Transcription factor MYB779.9e-5246.1Show/hide
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Query:  LKRKFS---SISDYGGTAADEPPEKKTECTSQGSTISVSNRCL-----SPSGSDTSDST---------------------------------PSLNIEPS
        LKRK S   +++    T  D+   KK    S  S  +  +  L     SP+G D SDS+                                  S + +P 
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Query:  TQLTLSLPGTYSSP------------PRRQQSISSPAEEKRPNFGPEFLSAMQEMIREEVRNYMAECKE
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G23290.1 myb domain protein 704.4e-5547.94Show/hide
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        STLKRK               F     Y G   DE P K+   +  G  + V+   LSP+GSD S+ + S                              
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Query:  -----EPSTQLTLSLPGTYSS--PPRRQQSISSPAEEKR---PNFGPEFLSAMQEMIREEVRNYMAE
             +P T L LSLP    S  PP          EEK       G +F++ +QEMI+ EVR+YMA+
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AT3G50060.1 myb domain protein 777.1e-5346.1Show/hide
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        LKRK S   +++    T  D+   KK    S  S  +  +  L     SP+G D SDS+                                  S + +P 
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AT3G55730.1 myb domain protein 1091.2e-3963.96Show/hide
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Query:  KRKFSSISDYG
        +RK++ + + G
Subjt:  KRKFSSISDYG

AT4G37260.1 myb domain protein 734.7e-5747.08Show/hide
Query:  DVDRVKGPWSPEEDELLRMLVQRHGARNWSAISQSIHGRSGKSCRLRWCNQLSPGLEHRPFTAEEDEIIVGAHTRYGNKWATIARLLNGRTDNAIKNHWN
        +++R+KGPWSPEED+LL+ LVQ+HG RNWS IS+SI GRSGKSCRLRWCNQLSP +EHR F+ EEDE I+ AH R+GNKWATI+RLLNGRTDNAIKNHWN
Subjt:  DVDRVKGPWSPEEDELLRMLVQRHGARNWSAISQSIHGRSGKSCRLRWCNQLSPGLEHRPFTAEEDEIIVGAHTRYGNKWATIARLLNGRTDNAIKNHWN

Query:  STLKRK---------FSSISDYGGTAADEPPEKKTECTSQGSTISVSNRCLSPSGSDTSDST--------PSLNIE---------PSTQLTLSLP-----
        STLKRK         F     Y G   +E P K+T     G +  +     SPSGSD S+ +        P++  E         P T L+LSLP     
Subjt:  STLKRK---------FSSISDYGGTAADEPPEKKTECTSQGSTISVSNRCLSPSGSDTSDST--------PSLNIE---------PSTQLTLSLP-----

Query:  ----------------GTYSS---PPRRQQSISSPAEEKR---PNFGPEFLSAMQEMIREEVRNYMAECKEREV
                        G Y++   P R+++ +    EE +     FG EF++ +QEMIR EVR+YMA+ +   V
Subjt:  ----------------GTYSS---PPRRQQSISSPAEEKR---PNFGPEFLSAMQEMIREEVRNYMAECKEREV

AT5G67300.1 myb domain protein r11.6e-5246.72Show/hide
Query:  DRVKGPWSPEEDELLRMLVQRHGARNWSAISQSIHGRSGKSCRLRWCNQLSPGLEHRPFTAEEDEIIVGAHTRYGNKWATIARLLNGRTDNAIKNHWNST
        DR+KGPWSPEEDE LR LV ++G RNW+ IS+SI GRSGKSCRLRWCNQLSP +EHRPF+AEEDE I  AH ++GNKWATIARLLNGRTDNA+KNHWNST
Subjt:  DRVKGPWSPEEDELLRMLVQRHGARNWSAISQSIHGRSGKSCRLRWCNQLSPGLEHRPFTAEEDEIIVGAHTRYGNKWATIARLLNGRTDNAIKNHWNST

Query:  LKRKFSSISDYGGTAADEPPEKKTECTSQGSTISVSNRCL---SPSGSDTSDS----------------------------TPSLNIEPSTQLTLSLPG-
        LKRK     D+ G    E         S GS   V+   +   SP+GSD SDS                            T S + +P T L+LSLPG 
Subjt:  LKRKFSSISDYGGTAADEPPEKKTECTSQGSTISVSNRCL---SPSGSDTSDS----------------------------TPSLNIEPSTQLTLSLPG-

Query:  -----------------TYSSPPRRQQSIS---------SPAEEKRPNF---GPEFLSAMQEMIREEVRNYMAE
                         T SS      ++S            EE   +F   G EF++ +QEMI+ EVR+YM E
Subjt:  -----------------TYSSPPRRQQSIS---------SPAEEKRPNF---GPEFLSAMQEMIREEVRNYMAE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGTGGACGTCGATCGGGTCAAGGGACCATGGAGCCCCGAGGAAGACGAGTTGCTGCGAATGCTCGTGCAACGGCACGGCGCTCGGAACTGGTCCGCTATAAGCCAGTC
GATCCACGGCCGGTCGGGCAAATCTTGTCGTCTGCGGTGGTGCAACCAGCTCTCCCCTGGCTTGGAGCACCGGCCGTTCACGGCGGAGGAGGACGAGATCATCGTCGGGG
CCCACACCAGGTACGGCAACAAGTGGGCGACGATCGCGAGGCTACTCAACGGACGGACGGATAATGCGATTAAGAATCACTGGAACTCGACATTGAAGCGGAAGTTCTCT
TCGATTTCGGACTATGGCGGCACCGCCGCGGACGAGCCTCCGGAGAAGAAAACAGAGTGCACCAGTCAAGGATCGACGATTTCCGTCTCGAATCGATGTTTGAGCCCGTC
GGGATCCGACACGAGCGATTCGACGCCGAGTCTGAACATCGAGCCGTCGACTCAGCTGACACTGTCTCTTCCCGGAACGTACTCCTCCCCTCCGCGACGGCAGCAGAGTA
TATCCTCACCGGCGGAGGAGAAACGGCCGAATTTTGGGCCGGAATTTTTGTCTGCGATGCAGGAGATGATTAGAGAAGAGGTGAGGAATTACATGGCGGAATGTAAAGAA
CGGGAGGTGTGTTATGGAAGGAACGACGAAGAATTCAGGAACGCAGGGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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SISDYGGTAADEPPEKKTECTSQGSTISVSNRCLSPSGSDTSDSTPSLNIEPSTQLTLSLPGTYSSPPRRQQSISSPAEEKRPNFGPEFLSAMQEMIREEVRNYMAECKE
REVCYGRNDEEFRNAG