; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Moc10g04760 (gene) of Bitter gourd (OHB3-1) v2 genome

Gene IDMoc10g04760
OrganismMomordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
Descriptionprotein SAMBA-like isoform X2
Genome locationchr10:3317942..3319959
RNA-Seq ExpressionMoc10g04760
SyntenyMoc10g04760
Gene Ontology termsGO:0046621 - negative regulation of organ growth (biological process)
GO:0010997 - anaphase-promoting complex binding (molecular function)
InterPro domainsIPR037547 - Protein SAMBA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004136198.1 protein SAMBA isoform X2 [Cucumis sativus]3.2e-3986.73Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEVMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSSINLMSRQGGPFLKKTEEEK
        MN+ SPANSS+STTAVAGRCSTNAA+S+DDFRFP+NLIS+PERKDE M+ALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRS INLMSRQGG FLKKTEE++
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEVMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSSINLMSRQGGPFLKKTEEEK

XP_022131248.1 protein SAMBA isoform X2 [Momordica charantia]3.4e-4193.88Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEVMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSSINLMSRQGGPFLKKTEEEK
        MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDE MSALKSNIMAALNKEVKSLDDD+WMFEGPRS INLMSRQGG FLKKTEE++
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEVMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSSINLMSRQGGPFLKKTEEEK

XP_022149249.1 protein SAMBA-like isoform X1 [Momordica charantia]1.2e-4183.9Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEVMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSSINLMSRQGGPFL---------
        MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEVMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRS INLMSRQG             
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEVMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSSINLMSRQGGPFL---------

Query:  --KKTEEEKIMGRIDNNY
          K   EEKIMGRIDNNY
Subjt:  --KKTEEEKIMGRIDNNY

XP_022149251.1 protein SAMBA-like isoform X2 [Momordica charantia]3.7e-4396.94Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEVMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSSINLMSRQGGPFLKKTEEEK
        MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEVMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRS INLMSRQGGPFLKKTEE++
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEVMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSSINLMSRQGGPFLKKTEEEK

XP_038888368.1 protein SAMBA isoform X2 [Benincasa hispida]5.0e-4089.8Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEVMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSSINLMSRQGGPFLKKTEEEK
        MN+SSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMS+DDFRFPANLIS+PERKDE M+ALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRS INLMS+QGG FLKKTEE++
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEVMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSSINLMSRQGGPFLKKTEEEK

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LK11 Uncharacterized protein1.6e-3986.73Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEVMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSSINLMSRQGGPFLKKTEEEK
        MN+ SPANSS+STTAVAGRCSTNAA+S+DDFRFP+NLIS+PERKDE M+ALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRS INLMSRQGG FLKKTEE++
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEVMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSSINLMSRQGGPFLKKTEEEK

A0A1S3CQ76 uncharacterized protein LOC103503566 isoform X21.0e-3885.71Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEVMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSSINLMSRQGGPFLKKTEEEK
        MN+ SPANSS STTAVAGRCSTNAA+S+DDFRFP+NLIS+PERKDE M+ALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRS INLMSRQGG FLKKT+E++
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEVMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSSINLMSRQGGPFLKKTEEEK

A0A6J1BST3 protein SAMBA isoform X21.7e-4193.88Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEVMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSSINLMSRQGGPFLKKTEEEK
        MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDE MSALKSNIMAALNKEVKSLDDD+WMFEGPRS INLMSRQGG FLKKTEE++
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEVMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSSINLMSRQGGPFLKKTEEEK

A0A6J1D582 protein SAMBA-like isoform X15.7e-4283.9Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEVMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSSINLMSRQGGPFL---------
        MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEVMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRS INLMSRQG             
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEVMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSSINLMSRQGGPFL---------

Query:  --KKTEEEKIMGRIDNNY
          K   EEKIMGRIDNNY
Subjt:  --KKTEEEKIMGRIDNNY

A0A6J1D7T9 protein SAMBA-like isoform X21.8e-4396.94Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEVMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSSINLMSRQGGPFLKKTEEEK
        MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEVMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRS INLMSRQGGPFLKKTEE++
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEVMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSSINLMSRQGGPFLKKTEEEK

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9C613 Protein SAMBA6.3e-2258Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVA-GRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEVMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSSINLMSRQGGPFLKKTEEEKI
        MN +SPA+S +STTAVA G  S+ AA  +DDF FP ++ S+ ERKDE M  LK+++M  L+KEVKSL++D+WMFEGPRS I+L+SR+G  FLKK  E K+
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVA-GRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEVMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSSINLMSRQGGPFLKKTEEEKI

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G32310.1 unknown protein4.5e-2358Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVA-GRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEVMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSSINLMSRQGGPFLKKTEEEKI
        MN +SPA+S +STTAVA G  S+ AA  +DDF FP ++ S+ ERKDE M  LK+++M  L+KEVKSL++D+WMFEGPRS I+L+SR+G  FLKK  E K+
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVA-GRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEVMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSSINLMSRQGGPFLKKTEEEKI


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAATAGCTCCTCACCAGCTAATTCTTCCATTTCTACCACAGCGGTTGCCGGAAGATGTAGCACCAATGCAGCAATGTCAGTTGATGATTTTCGCTTCCCCGCC
AATTTAATTTCGATACCAGAGCGCAAGGACGAGGTCATGAGCGCTCTTAAATCTAATATAATGGCTGCGCTGAACAAGGAGGTCAAATCCCTGGATGACGATAAC
TGGATGTTTGAAGGTCCTCGCTCCAGTATCAACCTTATGTCACGACAAGGTGGTCCTTTCCTCAAAAAGACAGAAGAGGAGAAGATAATGGGTCGGATTGATAAT
AATTATTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAATAGCTCCTCACCAGCTAATTCTTCCATTTCTACCACAGCGGTTGCCGGAAGATGTAGCACCAATGCAGCAATGTCAGTTGATGATTTTCGCTTCCCCGCC
AATTTAATTTCGATACCAGAGCGCAAGGACGAGGTCATGAGCGCTCTTAAATCTAATATAATGGCTGCGCTGAACAAGGAGGTCAAATCCCTGGATGACGATAAC
TGGATGTTTGAAGGTCCTCGCTCCAGTATCAACCTTATGTCACGACAAGGTGGTCCTTTCCTCAAAAAGACAGAAGAGGAGAAGATAATGGGTCGGATTGATAAT
AATTATTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEVMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSSINLMSRQGGPFLKKTEEEKIMGRIDN
NY