; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Moc10g20000 (gene) of Bitter gourd (OHB3-1) v2 genome

Gene IDMoc10g20000
OrganismMomordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
DescriptionReverse transcriptase
Genome locationchr10:14771046..14773622
RNA-Seq ExpressionMoc10g20000
SyntenyMoc10g20000
Gene Ontology termsGO:0090304 - nucleic acid metabolic process (biological process)
GO:0110165 - cellular anatomical structure (cellular component)
GO:0016740 - transferase activity (molecular function)
GO:0016787 - hydrolase activity (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0046952.1 DNA/RNA polymerases superfamily protein [Cucumis melo var. makuwa]4.9e-1644.92Show/hide
Query:  AVQNWLGYSAALLTTQEHLIRDFEKFVIDVTIESVSSLLASLVLEPSLISRIKQAQLFDPALKKIIDDVSKAQRVDFSVSCYPVLWISDRLCVPNDPIIK
        A+   + YSAAL+T Q  L+RDFE+  I V++  V+S LA L ++P+L  RI  AQL DP L +    V   Q  DFS+S    L    RLCVP D ++K
Subjt:  AVQNWLGYSAALLTTQEHLIRDFEKFVIDVTIESVSSLLASLVLEPSLISRIKQAQLFDPALKKIIDDVSKAQRVDFSVSCYPVLWISDRLCVPNDPIIK

Query:  KKIMTEAHNTAYSVHPGS
         +++TEAHN+ +++HPGS
Subjt:  KKIMTEAHNTAYSVHPGS

TXG67662.1 hypothetical protein EZV62_008937 [Acer yangbiense]2.4e-1848.21Show/hide
Query:  GYSAALLTTQEHLIRDFEKFVIDVTIESVSSLLASLVLEPSLISRIKQAQLFDPALKKIIDDVSKAQRVDFSVSCYPVLWISDRLCVPNDPIIKKKIMTE
        G  A L+TTQ+ ++RD EK+ I +        LA L ++PSLI RIK+ Q  D  L KII +V K  R++F VS   VLW   RLCVP++  +KK+I+ E
Subjt:  GYSAALLTTQEHLIRDFEKFVIDVTIESVSSLLASLVLEPSLISRIKQAQLFDPALKKIIDDVSKAQRVDFSVSCYPVLWISDRLCVPNDPIIKKKIMTE

Query:  AHNTAYSVHPGS
        AH +AY+VHPGS
Subjt:  AHNTAYSVHPGS

TXG69298.1 hypothetical protein EZV62_004233 [Acer yangbiense]2.4e-1848.21Show/hide
Query:  GYSAALLTTQEHLIRDFEKFVIDVTIESVSSLLASLVLEPSLISRIKQAQLFDPALKKIIDDVSKAQRVDFSVSCYPVLWISDRLCVPNDPIIKKKIMTE
        G  A L+TTQ+ ++RD EK+ I +        LA L ++PSLI RIK+ Q  D  L KII +V K  R++F VS   VLW   RLCVP++  +KK+I+ E
Subjt:  GYSAALLTTQEHLIRDFEKFVIDVTIESVSSLLASLVLEPSLISRIKQAQLFDPALKKIIDDVSKAQRVDFSVSCYPVLWISDRLCVPNDPIIKKKIMTE

Query:  AHNTAYSVHPGS
        AH +AY+VHPGS
Subjt:  AHNTAYSVHPGS

TYK03199.1 pol protein [Cucumis melo var. makuwa]4.9e-1644.92Show/hide
Query:  AVQNWLGYSAALLTTQEHLIRDFEKFVIDVTIESVSSLLASLVLEPSLISRIKQAQLFDPALKKIIDDVSKAQRVDFSVSCYPVLWISDRLCVPNDPIIK
        A+   + YSAAL+T Q  L+RDFE+  I V++  V+S LA L ++P+L  RI  AQL DP L +    V   Q  DFS+S    L    RLCVP D ++K
Subjt:  AVQNWLGYSAALLTTQEHLIRDFEKFVIDVTIESVSSLLASLVLEPSLISRIKQAQLFDPALKKIIDDVSKAQRVDFSVSCYPVLWISDRLCVPNDPIIK

Query:  KKIMTEAHNTAYSVHPGS
         +++TEAHN+ +++HPGS
Subjt:  KKIMTEAHNTAYSVHPGS

XP_041009366.1 uncharacterized protein LOC121253422 [Juglans microcarpa x Juglans regia]1.7e-1642.86Show/hide
Query:  LGYSAALLTTQEHLIRDFEKFVIDVTIESVSSLLASLVLEPSLISRIKQAQLFDPALKKIIDDVSKAQRVDFSVSCYPVLWISDRLCVPNDPIIKKKIMT
        +G + A LT+Q HLI D E+  I+V  +   +L+ASL ++P+LI RIK AQ  D  + ++I++V K  + +FSVS   VL   +R CVP++  IK+ I+ 
Subjt:  LGYSAALLTTQEHLIRDFEKFVIDVTIESVSSLLASLVLEPSLISRIKQAQLFDPALKKIIDDVSKAQRVDFSVSCYPVLWISDRLCVPNDPIIKKKIMT

Query:  EAHNTAYSVHPG
        EAH++ Y++HPG
Subjt:  EAHNTAYSVHPG

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A2N9EIW0 Uncharacterized protein1.7e-2247.86Show/hide
Query:  VQNWLGYSAALLTTQEHLIRDFEKFVIDVTIESVSSLLASLVLEPSLISRIKQAQLFDPALKKIIDDVSKAQRVDFSVSCYPVLWISDRLCVPNDPIIKK
        V+++LG +AALLTTQ+H+I D E+  ++V I+   S LASL ++P+LI +IK +Q  DP L KI+++V    R++F++S    L   DRLCVP D  IK+
Subjt:  VQNWLGYSAALLTTQEHLIRDFEKFVIDVTIESVSSLLASLVLEPSLISRIKQAQLFDPALKKIIDDVSKAQRVDFSVSCYPVLWISDRLCVPNDPIIKK

Query:  KIMTEAHNTAYSVHPGS
        +I+ EAH++ Y+VHPGS
Subjt:  KIMTEAHNTAYSVHPGS

A0A2N9IF60 Uncharacterized protein5.5e-2148.21Show/hide
Query:  GYSAALLTTQEHLIRDFEKFVIDVTIESVSSLLASLVLEPSLISRIKQAQLFDPALKKIIDDVSKAQRVDFSVSCYPVLWISDRLCVPNDPIIKKKIMTE
        G+SAALLTTQ+H+I D E+  ++V I    S LASL ++P+LI +IK +Q  DP L KI+++V    R++F++S    L   +RLCVP D  IK++I+ E
Subjt:  GYSAALLTTQEHLIRDFEKFVIDVTIESVSSLLASLVLEPSLISRIKQAQLFDPALKKIIDDVSKAQRVDFSVSCYPVLWISDRLCVPNDPIIKKKIMTE

Query:  AHNTAYSVHPGS
        AH++ Y+VHPGS
Subjt:  AHNTAYSVHPGS

A0A7N2LKR8 Reverse transcriptase3.2e-2149.11Show/hide
Query:  GYSAALLTTQEHLIRDFEKFVIDVTIESVSSLLASLVLEPSLISRIKQAQLFDPALKKIIDDVSKAQRVDFSVSCYPVLWISDRLCVPNDPIIKKKIMTE
        G+SAALLTTQ+H+I D +K  +D+      S LASL ++P+LI +IK AQ  DP L KI++ V    R+DF++    VL   +RLCVPND +IK++I+ E
Subjt:  GYSAALLTTQEHLIRDFEKFVIDVTIESVSSLLASLVLEPSLISRIKQAQLFDPALKKIIDDVSKAQRVDFSVSCYPVLWISDRLCVPNDPIIKKKIMTE

Query:  AHNTAYSVHPGS
        AH + Y++HPGS
Subjt:  AHNTAYSVHPGS

A0A7N2MJ90 Reverse transcriptase9.4e-2149.11Show/hide
Query:  GYSAALLTTQEHLIRDFEKFVIDVTIESVSSLLASLVLEPSLISRIKQAQLFDPALKKIIDDVSKAQRVDFSVSCYPVLWISDRLCVPNDPIIKKKIMTE
        G+SAALLTTQ+ +I D E+  I++ +      +ASL ++P+LI +IK +Q+ D  + KII++V + +R +F+VS   VL    RLCVPND  +KK+IM E
Subjt:  GYSAALLTTQEHLIRDFEKFVIDVTIESVSSLLASLVLEPSLISRIKQAQLFDPALKKIIDDVSKAQRVDFSVSCYPVLWISDRLCVPNDPIIKKKIMTE

Query:  AHNTAYSVHPGS
        AH T YSVHPGS
Subjt:  AHNTAYSVHPGS

A0A7N2NA02 Uncharacterized protein4.2e-2149.11Show/hide
Query:  GYSAALLTTQEHLIRDFEKFVIDVTIESVSSLLASLVLEPSLISRIKQAQLFDPALKKIIDDVSKAQRVDFSVSCYPVLWISDRLCVPNDPIIKKKIMTE
        G+SAALLTTQ+ +I+D E+  I++ +      +ASL ++P+LI +IK +Q+ D  + KII++V + +R +F+VS   VL    RLCVPND  +KK+IM E
Subjt:  GYSAALLTTQEHLIRDFEKFVIDVTIESVSSLLASLVLEPSLISRIKQAQLFDPALKKIIDDVSKAQRVDFSVSCYPVLWISDRLCVPNDPIIKKKIMTE

Query:  AHNTAYSVHPGS
        AH T YSVHPGS
Subjt:  AHNTAYSVHPGS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATCAAGAGAAGGAAGCAAGGCTTGATGATTTTGGTGGAGAAGTTGCTGGAATTTATAGCTGTGCAGAATTGGTTAGGTTACTCAGCAGCCTTACTCACAACT
CAGGAGCATCTAATCAGAGATTTTGAGAAGTTTGTGATTGATGTGACTATAGAGAGTGTATCATCGTTGTTGGCTAGCTTGGTACTTGAACCATCTTTGATTAGC
AGGATCAAGCAAGCTCAACTTTTTGATCCAGCTTTGAAGAAAATTATTGATGATGTTAGCAAAGCTCAAAGGGTTGACTTTTCAGTATCATGTTATCCAGTGTTA
TGGATAAGTGATCGTCTTTGCGTACCAAACGATCCAATTATTAAGAAGAAGATAATGACTGAAGCTCATAATACTGCATACTCGGTTCACCCTGGGAGTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGATCAAGAGAAGGAAGCAAGGCTTGATGATTTTGGTGGAGAAGTTGCTGGAATTTATAGCTGTGCAGAATTGGTTAGGTTACTCAGCAGCCTTACTCACAACT
CAGGAGCATCTAATCAGAGATTTTGAGAAGTTTGTGATTGATGTGACTATAGAGAGTGTATCATCGTTGTTGGCTAGCTTGGTACTTGAACCATCTTTGATTAGC
AGGATCAAGCAAGCTCAACTTTTTGATCCAGCTTTGAAGAAAATTATTGATGATGTTAGCAAAGCTCAAAGGGTTGACTTTTCAGTATCATGTTATCCAGTGTTA
TGGATAAGTGATCGTCTTTGCGTACCAAACGATCCAATTATTAAGAAGAAGATAATGACTGAAGCTCATAATACTGCATACTCGGTTCACCCTGGGAGTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MIKRRKQGLMILVEKLLEFIAVQNWLGYSAALLTTQEHLIRDFEKFVIDVTIESVSSLLASLVLEPSLISRIKQAQLFDPALKKIIDDVSKAQRVDFSVSCYPVL
WISDRLCVPNDPIIKKKIMTEAHNTAYSVHPGS