; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Moc11g15060 (gene) of Bitter gourd (OHB3-1) v2 genome

Gene IDMoc11g15060
OrganismMomordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
DescriptionExtensin like
Genome locationchr11:11236685..11237302
RNA-Seq ExpressionMoc11g15060
SyntenyMoc11g15060
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG5525233.1 hypothetical protein RHGRI_031789 [Rhododendron griersonianum]1.7e-1252.53Show/hide
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        SMA L + +LVA++S+S PS T+  Y+ Y +PPPP    SPP    PPPPP HY  P       PPPPPVY Y  PPP     H     PPPP P     
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Query:  NSPPPPKKSPPPPWRRTRPPPPPPPKK---KTPPPPPPPKKRPSRPPPPPKKR---PSPPPPPKKNKHKSPPPPPPTKYEYKSPP--------PPPPPTK
        + PPPPKK    P+R   PPPPPP K    K+PPPPPP  K  S PPPPPK+     SPPP P   K+KSPPPPPP  Y+YKSPP        PPPPP K
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Query:  -YEYKSPPPPP-SPYYY
         Y YKSPPPPP  PY Y
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RVW12641.1 hypothetical protein CK203_115072 [Vitis vinifera]3.4e-1351.91Show/hide
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        G   SMA L+  +LV  +SLS PS T+  Y  Y +PPPP+ Y SPP         SPPPPP  YSPP          PPPPPVY     PPPP  YSP  
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Query:  HAPTDY--PPPPSPKKNEDNSPPPPKKSPPPPWRRTRPPPP--PPPKKKTPPP---------PPPPKKRPSR---PPPPPKKRPSPPPPPKKNKHKSPPP
        H P  Y  PPPP P  +  + PP   KSPPPP     PPPP  PP K K+PPP         PPPP K+P +   PPPPP K  SPPPPP   K+KSPPP
Subjt:  HAPTDY--PPPPSPKKNEDNSPPPPKKSPPPPWRRTRPPPP--PPPKKKTPPP---------PPPPKKRPSR---PPPPPKKRPSPPPPPKKNKHKSPPP

Query:  PPPTKYEYKSPPPPPPPTKYEYKSPPPPP-SPYYY
        PP   Y+YKSPPPPPP   Y+YKSPPPPP  PY Y
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XP_022039692.1 extensin-3-like [Helianthus annuus]9.9e-1351.45Show/hide
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        G+ S +  L++ +LV ++SLSFPS T   Y  Y +PPPP     PP +        PPPPPV+ SPP          SPPPPP    +Y SPPPP     
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Query:  HAPTDYPPPPSPKKN-EDNSPPPPK-------KSPPPPWRRT----RPPPPPPPK---KKTPPPPPPPKKR---PSRPPPPPK---KRPSPPPPPKKN-K
        H     PPPP PKK+ E  SPPPP        KSPPPP  +     + PPPPPPK   K   PPPPPPKK     S PPPPPK   K  SPPPPPKK+ +
Subjt:  HAPTDYPPPPSPKKN-EDNSPPPPK-------KSPPPPWRRT----RPPPPPPPK---KKTPPPPPPPKKR---PSRPPPPPK---KRPSPPPPPKKN-K

Query:  HKSPPPPPPTK-YEYKSPPPPPPPTKYEYKSPPPPPSPYYY
        +KSPPPPPP K YEYKSPPPPPP T Y+YKSPPPPP   +Y
Subjt:  HKSPPPPPPTK-YEYKSPPPPPPPTKYEYKSPPPPPSPYYY

XP_022936365.1 extensin-3-like isoform X1 [Cucurbita moschata]5.8e-1353.66Show/hide
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        M   S +  LV+AV V  LSLS  ST+A+GY++Y++PPPP  Y   P      PPPV YSPP    DD       Y SPPPP+      P   PPPP  K
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Query:  KNEDNSPPPPKKSPPPPWRRTRPPPPPPPKKKTPPPPPPPKKRPSRPPPPPKKRPSPPPPPKKNKHKSPPPPPPTKYEYKSPPPPPPPTKYEYKSPPPPP
        K+    PPPP+K PPPP    + PPPPPP+KK+PPPP P K   S PPPPPKK  SPPPPPK    KSPP P P     KSPPPP P     YKSPPPPP
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Query:  SPYYY
        SPYYY
Subjt:  SPYYY

XP_023535874.1 extensin-3-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.3e-1253.52Show/hide
Query:  MGSSSSMACLVMAVLVAVLSLSFPSTTAQGYEDYFTPPPPWVYDSPPDSDSPPPPPVHYSPPDSDSDDSPPPPPVYYSPPPPASYSPHAPTDYPPPPSPK
        MG  S +  LV+AV VA LSLS  +T+A+GY+DY++PPPP  Y         PPPPV YS           PP VYYSPPPP           PPPPSPK
Subjt:  MGSSSSMACLVMAVLVAVLSLSFPSTTAQGYEDYFTPPPPWVYDSPPDSDSPPPPPVHYSPPDSDSDDSPPPPPVYYSPPPPASYSPHAPTDYPPPPSPK

Query:  KNEDNSPPPPKKSPPPPWRRTRPPPPPPPKKKTPP------PPPPPKKRPSRPPPPPKKRPSPPPPPKKNKHKSPPPPP---PTKYEYKSPPPPPPPTKY
        K+     PPPKK+PPPP  +  PPPPPP KK  PP      PPPPP ++ S PPP PKK P PPPPPK    KSPPPPP   P + E K  PPPP P   
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Query:  EYKSPPPPPSPYY
        EYK PPPPPSPYY
Subjt:  EYKSPPPPPSPYY

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A2R6R2L8 Extensin like4.1e-1249.17Show/hide
Query:  GSSSSMACLVMAVLVAVLSLSFPSTTAQGYEDYFTPPPPWVYDSPPDSDSPPPPPVHYSPPDSDSDDSPPPPPVYYSPPP-PASYS--PHAPTDY----P
        G    MA L+  +LVA++SL+ P  T   Y  Y+  PPP     P  S  PPPPP HY  P       PPPPPV+YSPPP P  Y   P  P  Y    P
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Query:  PPPSPKK--NEDNSPPPPKK----SPPPPWRRTRPPPPPPPKK----KTPPP---------PPPPKKRP---SRPPPPPKKRPSPPPPPKKNKHKSPPPP
        PPP PKK     + PPPP K     PPPP  + + PPPPPPKK     +PPP         PPPP K+P   S PPPPP K  SPPPPP   K+KSPPPP
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Query:  PPTK-YEYKSPP--------PPPPPTKYEYKSPPPPPSPYYY
        PP K Y+Y SPP        PPPPP  Y+YKSPPPPP P++Y
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A0A2R6R2M5 Extensin like1.4e-1248.59Show/hide
Query:  GSSSSMACLVMAVLVAVLSLSFPSTTAQGYEDYFTPPPPWVYDSPPD-----SDSPPPPPVHYSPPDS--DSDDSPPPPPVY---------------YS-
        G    MA L+  +LVA++SL+ P  T   Y  Y +PPPP     PP         PPPPPVHYSPP         PPPPPVY               YS 
Subjt:  GSSSSMACLVMAVLVAVLSLSFPSTTAQGYEDYFTPPPPWVYDSPPD-----SDSPPPPPVHYSPPDS--DSDDSPPPPPVY---------------YS-

Query:  -PPPPASYSPHAPTDY-----PPPPSPKKNEDNSPPPPKK-----SPPPPWRRTRPPPPPPPKKKTPPPPPPPKK--RPSRPPPPPKKRPSPPPPPKKNK
         PPPP  YS   P  Y     PPPP   K +   PPPPKK     SPPPP  + + PPPPPP  K   PPPPPKK  + S PPPPP K  SPPPPP   K
Subjt:  -PPPPASYSPHAPTDY-----PPPPSPKKNEDNSPPPPKK-----SPPPPWRRTRPPPPPPPKKKTPPPPPPPKK--RPSRPPPPPKKRPSPPPPPKKNK

Query:  HKSPPPPPPTK-YEYKSPP--------PPPPPTKYEYKSPPPPPSPYYY
        +KSPPPPPP K Y+Y SPP        PPPPP  Y+YKSPPPPP P++Y
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A0A438BNV7 Extensin_2 domain-containing protein1.7e-1351.91Show/hide
Query:  GSSSSMACLVMAVLVAVLSLSFPSTTAQGYEDYFTPPPPWVYDSPPDS------DSPPPPPVHYSPPDSDS---DDSPPPPPVY---YSPPPPASYSP--
        G   SMA L+  +LV  +SLS PS T+  Y  Y +PPPP+ Y SPP         SPPPPP  YSPP          PPPPPVY     PPPP  YSP  
Subjt:  GSSSSMACLVMAVLVAVLSLSFPSTTAQGYEDYFTPPPPWVYDSPPDS------DSPPPPPVHYSPPDSDS---DDSPPPPPVY---YSPPPPASYSP--

Query:  HAPTDY--PPPPSPKKNEDNSPPPPKKSPPPPWRRTRPPPP--PPPKKKTPPP---------PPPPKKRPSR---PPPPPKKRPSPPPPPKKNKHKSPPP
        H P  Y  PPPP P  +  + PP   KSPPPP     PPPP  PP K K+PPP         PPPP K+P +   PPPPP K  SPPPPP   K+KSPPP
Subjt:  HAPTDY--PPPPSPKKNEDNSPPPPKKSPPPPWRRTRPPPP--PPPKKKTPPP---------PPPPKKRPSR---PPPPPKKRPSPPPPPKKNKHKSPPP

Query:  PPPTKYEYKSPPPPPPPTKYEYKSPPPPP-SPYYY
        PP   Y+YKSPPPPPP   Y+YKSPPPPP  PY Y
Subjt:  PPPTKYEYKSPPPPPPPTKYEYKSPPPPP-SPYYY

A0A4V3WQ10 Uncharacterized protein8.2e-1350.22Show/hide
Query:  GSSSSMACLVMAVLVAVLSLSFPSTTAQGYEDYFTPPPPWVYDSPPD-----SDSPPPPPVHYSPPDS--DSDDSPPPPPVYYSPPPPASYSPHAPTDYP
        G  S+MA L+  VL+AV+SLS P  T   Y +Y +PPPP     PP         PPPPPVHYSPP         PPPPPVY    PP           P
Subjt:  GSSSSMACLVMAVLVAVLSLSFPSTTAQGYEDYFTPPPPWVYDSPPD-----SDSPPPPPVHYSPPDS--DSDDSPPPPPVYYSPPPPASYSPHAPTDYP

Query:  PPPSPKKNEDNSPPPPKK------SPPPPWRRTRPPPPPPPKKKTPPPPPPPKK--RPSRPPPPPKKRPSPPPPPKKNKHKSPPPPPPTKYEYKSPP---
        PPP   K +   PPPPKK       PPPP++   PPPPPP  K   PPPPPPKK  + S PPPPP K  SPPPPP   K+KSPPPPP   Y+Y SPP   
Subjt:  PPPSPKKNEDNSPPPPKK------SPPPPWRRTRPPPPPPPKKKTPPPPPPPKK--RPSRPPPPPKKRPSPPPPPKKNKHKSPPPPPPTKYEYKSPP---

Query:  -----PPPPPTKYEYKSPPPPP--SPYYY
             PPPPP  Y+YKSPPPPP   PY Y
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A0A6J1FDF6 extensin-3-like isoform X12.8e-1353.66Show/hide
Query:  MGSSSSMACLVMAVLVAVLSLSFPSTTAQGYEDYFTPPPPWVYDSPPDSDSPPPPPVHYSPPDSDSDDSPPPPPVYYSPPPPASYSPHAPTDYPPPPSPK
        M   S +  LV+AV V  LSLS  ST+A+GY++Y++PPPP  Y   P      PPPV YSPP    DD       Y SPPPP+      P   PPPP  K
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Query:  KNEDNSPPPPKKSPPPPWRRTRPPPPPPPKKKTPPPPPPPKKRPSRPPPPPKKRPSPPPPPKKNKHKSPPPPPPTKYEYKSPPPPPPPTKYEYKSPPPPP
        K+    PPPP+K PPPP    + PPPPPP+KK+PPPP P K   S PPPPPKK  SPPPPPK    KSPP P P     KSPPPP P     YKSPPPPP
Subjt:  KNEDNSPPPPKKSPPPPWRRTRPPPPPPPKKKTPPPPPPPKKRPSRPPPPPKKRPSPPPPPKKNKHKSPPPPPPTKYEYKSPPPPPPPTKYEYKSPPPPP

Query:  SPYYY
        SPYYY
Subjt:  SPYYY

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P06599 Extensin3.9e-0445.81Show/hide
Query:  SSMACLVMAVLVAVLSLSFPSTTAQGYEDYFTPPPPWVYDSPPDSDSPPPPPVHYSPPDSDSDDSPPPPPVY-YSPPPPASYSPHAPTDYPPPPSPKKNE
        S M+ L++++LV ++SL+  S T   Y  Y +PPPP    SPP  +  PPPP HY  P       PPP PVY Y  PPP  +SP  P  +  PP PK   
Subjt:  SSMACLVMAVLVAVLSLSFPSTTAQGYEDYFTPPPPWVYDSPPDSDSPPPPPVHYSPPDSDSDDSPPPPPVY-YSPPPPASYSPHAPTDYPPPPSPKKNE

Query:  DNSPPPPK-----KSPPPPWRRTRPPPPPPPKKKTPPPPPPPKKRPSRPPPPPKKRPSP--------PPPPK---------KNKHKSPPPPPPTKYEYKS
         +SPPPP      KSPPPP  +  P P    K K+PPPP P  K  S  PPPPK  P+P        PPPPK         K K+KSPPPP P  Y+YKS
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Query:  PPPPPPPTKYEYKSPPPP---PSPYYY
        PPPP P   Y+YKSPPPP   P+P ++
Subjt:  PPPPPPPTKYEYKSPPPP---PSPYYY

Q9T0K5 Leucine-rich repeat extensin-like protein 31.8e-0451.98Show/hide
Query:  PPPWVYDSPPDSDSPPPPPVHYSPPDSDSDDSPPPPPVYYSPPPPASYSPHAPTDYPPPPSPKKNEDNSPPPPKKSPPPPWRRTRPP----PPPPPKKKT
        PPP VY  PP    PPPPP  YSPP       PPPPPVY  PPPP    P  P   PPPPSP       PPPP  SPPPP     PP    PPPPP   +
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Query:  PPPPPPPKKRP---SRPPPPPKKRPSPP---PPPKKNKHKSPPPPPPTKYEYKSPPPP--PPPTKYEYKSPPPPPSP
        PPPPP P   P   +RPPPPP   P PP   PPP +  + S PPPP +     SPPPP  PPP  Y Y SPPPPP+P
Subjt:  PPPPPPPKKRP---SRPPPPPKKRPSPP---PPPKKNKHKSPPPPPPTKYEYKSPPPP--PPPTKYEYKSPPPPPSP

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G26240.1 Proline-rich extensin-like family protein1.3e-0549.48Show/hide
Query:  PPPPWVYDSPPDS----DSPPPPPVHYSPPDSDSDDSPPPPPVYYSPPPPA---SYSPHAPTDYPPPPSPKKNEDNSPPPP---KKSPPPPWRRTRPPPP
        PPPP+VY SPP       SPPPPP  YS P       PPPP +Y SPPPP    S  P  P  Y  PP P     + PPPP   K  PPPP+    PPPP
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Query:  PPPKKKTPPP------PPPPKKRPSRPPPPPKKRPSPPPPPKKNKHKSPPP-----PPPTKYEYKSPPPP------PPPTKYEYKSPPPPPSPY
        P   K  PPP      PPPP      PPPPP    SPPPPP   K   PPP     PPP  Y YKSPPPP      PPP  Y YKSPPPPP  Y
Subjt:  PPPKKKTPPP------PPPPKKRPSRPPPPPKKRPSPPPPPKKNKHKSPPP-----PPPTKYEYKSPPPP------PPPTKYEYKSPPPPPSPY

AT1G26250.1 Proline-rich extensin-like family protein1.4e-0445.41Show/hide
Query:  SSSSMACLVMAVLVAVLSLSFPSTTAQGYEDYFTPPPPWVYDSPPD--SDSPPPPPVHYSPPDSDSDDSPPPPPVYYSPPPPASYSPHAPTDYPPPPSPK
        +S +   L+M VL     +++ S         ++P PP+VY+SPP    +SP PPP  Y PP       PPPP VY SPPPP       P  Y  PP P 
Subjt:  SSSSMACLVMAVLVAVLSLSFPSTTAQGYEDYFTPPPPWVYDSPPD--SDSPPPPPVHYSPPDSDSDDSPPPPPVYYSPPPPASYSPHAPTDYPPPPSPK

Query:  KNEDNSPPPP---KKSPPPPWRRTRPPPPPPPKKKTPPP------PPPPKKRPSRPPPPPKKRPSPPPPPKKNKHKSPPPPPPTKYEYKSPPPP------
            + PPPP   K  PPPP+  + PPPPP   K  PPP      PPPP    S PPPPP    SPPPPP      SPPPPPP  Y Y+SPPPP      
Subjt:  KNEDNSPPPP---KKSPPPPWRRTRPPPPPPPKKKTPPP------PPPPKKRPSRPPPPPKKRPSPPPPPKKNKHKSPPPPPPTKYEYKSPPPP------

Query:  PPPTKYEYKSPPPPPSPY
        PPP  Y YKSPPPPP  Y
Subjt:  PPPTKYEYKSPPPPPSPY

AT2G43150.1 Proline-rich extensin-like family protein5.6e-0647.8Show/hide
Query:  LVAVLSLSFPSTTAQGYEDYFTPPPPWVYDSPPDSDSPPPPPVHYSPPDSDSDDSPPPPPVYYSPPPPASYSPHAPTDYPPPPSPKKNED-----NSPPP
        +VA+L+L   S  A     Y +PPPP+ Y SPP     PPPP  Y  P      SPPPP  Y+SPPPP   SP  P  Y  PP P K+       +SPPP
Subjt:  LVAVLSLSFPSTTAQGYEDYFTPPPPWVYDSPPDSDSPPPPPVHYSPPDSDSDDSPPPPPVYYSPPPPASYSPHAPTDYPPPPSPKKNED-----NSPPP

Query:  PKKSPPPPWRRTRPPPPPPPKKKTPPPP-----PPPKKRPSRPPPPPKKRPSPPP----PPKKNKHKSPPPP---PPTKYEYKSPPPP---PPPTKYEYK
        P KSPPPP+    PPPP     K+PPPP     PPP   P + PPPP    SPPP    PP    + SPPPP   PP  Y Y SPPPP   PPP  Y Y 
Subjt:  PKKSPPPPWRRTRPPPPPPPKKKTPPPP-----PPPKKRPSRPPPPPKKRPSPPP----PPKKNKHKSPPPP---PPTKYEYKSPPPP---PPPTKYEYK

Query:  SPPPP
        SPPPP
Subjt:  SPPPP

AT3G54580.1 Proline-rich extensin-like family protein9.0e-0446.22Show/hide
Query:  DYFTPPPPWVYDSPP----------DSDSPPPPPVHYSPPDSDSDDSP------PPPPVYYSPPPPASYSPHAPTDYPPPPSPKKNEDNSPPPP------
        +Y +PPPP+VY SPP          D  SPPPP V+ SPP      SP      PPPP  YS PPP +YSP    DY  PP P     +SPPPP      
Subjt:  DYFTPPPPWVYDSPP----------DSDSPPPPPVHYSPPDSDSDDSP------PPPPVYYSPPPPASYSPHAPTDYPPPPSPKKNEDNSPPPP------

Query:  ---KKSPPPPWRRTRPPPP---PPPK---KKTPPP-----PPPPKKRPS-----RPPPPPKKRPSPPP----PPKKNKHKSPPPPPPTKYEYKSPPPP--
            KSPPPP+  + PPPP   P PK   K  PPP     PPPP   PS     + PPPP    SPPP    P  K ++KSPPPP    Y Y SPPPP  
Subjt:  ---KKSPPPPWRRTRPPPP---PPPK---KKTPPP-----PPPPKKRPS-----RPPPPPKKRPSPPP----PPKKNKHKSPPPPPPTKYEYKSPPPP--

Query:  PPPTKYEYKSPPP------PPSPYY
         P  K EYKSPPP      PP PYY
Subjt:  PPPTKYEYKSPPP------PPSPYY

AT4G13340.1 Leucine-rich repeat (LRR) family protein1.3e-0551.98Show/hide
Query:  PPPWVYDSPPDSDSPPPPPVHYSPPDSDSDDSPPPPPVYYSPPPPASYSPHAPTDYPPPPSPKKNEDNSPPPPKKSPPPPWRRTRPP----PPPPPKKKT
        PPP VY  PP    PPPPP  YSPP       PPPPPVY  PPPP    P  P   PPPPSP       PPPP  SPPPP     PP    PPPPP   +
Subjt:  PPPWVYDSPPDSDSPPPPPVHYSPPDSDSDDSPPPPPVYYSPPPPASYSPHAPTDYPPPPSPKKNEDNSPPPPKKSPPPPWRRTRPP----PPPPPKKKT

Query:  PPPPPPPKKRP---SRPPPPPKKRPSPP---PPPKKNKHKSPPPPPPTKYEYKSPPPP--PPPTKYEYKSPPPPPSP
        PPPPP P   P   +RPPPPP   P PP   PPP +  + S PPPP +     SPPPP  PPP  Y Y SPPPPP+P
Subjt:  PPPPPPPKKRP---SRPPPPPKKRPSPP---PPPKKNKHKSPPPPPPTKYEYKSPPPP--PPPTKYEYKSPPPPPSP


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGTTCTTCTTCTTCAATGGCCTGCCTTGTTATGGCAGTTTTGGTGGCAGTTTTAAGCTTAAGCTTTCCCTCCACAACTGCCCAAGGCTATGAGGATTACTTCACCCC
TCCACCGCCATGGGTCTACGACTCTCCTCCAGACTCCGACTCTCCTCCTCCACCTCCCGTTCATTACTCTCCTCCAGACTCCGACTCCGACGACTCTCCTCCTCCACCTC
CCGTTTATTACTCTCCTCCACCACCAGCCTCGTACTCTCCTCATGCGCCTACTGATTATCCTCCTCCACCCTCACCGAAGAAGAATGAAGACAATTCTCCTCCGCCACCA
AAGAAGTCACCTCCTCCACCATGGAGGAGAACACGTCCACCACCACCGCCACCGCCAAAGAAGAAGACACCTCCTCCACCCCCGCCACCAAAGAAGAGACCATCACGACC
CCCACCCCCACCAAAGAAGAGGCCATCTCCACCTCCGCCACCAAAGAAAAACAAACACAAGTCGCCTCCCCCGCCCCCACCGACAAAGTACGAATACAAGTCACCTCCTC
CCCCGCCTCCACCGACAAAGTACGAGTACAAGTCGCCTCCTCCCCCGCCATCTCCATACTACTATTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGTTCTTCTTCTTCAATGGCCTGCCTTGTTATGGCAGTTTTGGTGGCAGTTTTAAGCTTAAGCTTTCCCTCCACAACTGCCCAAGGCTATGAGGATTACTTCACCCC
TCCACCGCCATGGGTCTACGACTCTCCTCCAGACTCCGACTCTCCTCCTCCACCTCCCGTTCATTACTCTCCTCCAGACTCCGACTCCGACGACTCTCCTCCTCCACCTC
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AAGAAGTCACCTCCTCCACCATGGAGGAGAACACGTCCACCACCACCGCCACCGCCAAAGAAGAAGACACCTCCTCCACCCCCGCCACCAAAGAAGAGACCATCACGACC
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CCCCGCCTCCACCGACAAAGTACGAGTACAAGTCGCCTCCTCCCCCGCCATCTCCATACTACTATTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGSSSSMACLVMAVLVAVLSLSFPSTTAQGYEDYFTPPPPWVYDSPPDSDSPPPPPVHYSPPDSDSDDSPPPPPVYYSPPPPASYSPHAPTDYPPPPSPKKNEDNSPPPP
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