; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Moc11g29170 (gene) of Bitter gourd (OHB3-1) v2 genome

Gene IDMoc11g29170
OrganismMomordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
DescriptionRibonuclease H
Genome locationchr11:21241056..21242023
RNA-Seq ExpressionMoc11g29170
SyntenyMoc11g29170
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_022151719.1 uncharacterized protein LOC111019634 [Momordica charantia]5.0e-5359.9Show/hide
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        M TQM TM++MY+EMVQA+G +SR E++     MHEQ   HL PV + +P   E+ EY+ Q+ DLR+H NR RS SLR+G++P+CS ++SNQQAESSYNP
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        +                     V+ALKA+CE K + FDD +LGESPFTSDILEA IP KFKTP+MKPYD SKDPKDYVEVFEGLMDFQAATDAIKC+
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XP_022152854.1 uncharacterized protein LOC111020479 [Momordica charantia]1.4e-3943.22Show/hide
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              +  YN +                                                                  TP    +    Q +S ++  V
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        +ALKARCE K + FDD +LGE  F+SDILEA IPPKFKTP+MKPYD SKDPKDYVEVFE LMDFQAATDAIKC
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XP_022155128.1 uncharacterized protein LOC111022267 [Momordica charantia]1.1e-3660.42Show/hide
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        E+ EY+ Q+ DLR+H NR RS SLR+G++P+ S ++SNQQAESSYNP+                     V+ALKA CE K + FDD +LGE PFT DILE
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        API PKFKTP+MKPYD SK+PKDYV+VFEGLM+FQAATDAIKC+
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XP_022156088.1 uncharacterized protein LOC111023060 [Momordica charantia]1.2e-5161Show/hide
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        MEAM TQM TM+EMYN+MVQ +G +SR  DQ +HE +HEQGDLH DPVDEE+              DLRDH NR R+ S R  RT     K+SNQQAESS
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XP_022159327.1 uncharacterized protein LOC111025738 [Momordica charantia]4.0e-8764.51Show/hide
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        MVQP +STNT DRRA VANDGHQREVGAEV EGQI EGL TE   RSARITTP LSPAH KP KANRGRGGASRR T    PAP++ENFDALQKEMEAM 
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Query:  TQMHTMKEMYNEMVQASGVQSRFEDQAMHEGMHEQGDLHLDPVDEEYPRADENAEYSRQKSDLRDHFNRNRSLSLRRGRTPACSPKSSNQQAESSYNPM-
        TQM TM+EMYNEMVQA G  SR ED+A  +                            ++ DLRDH +R RS SLR+GR+P+CS K+SNQQAESSYNP+ 
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Query:  --------------------VKALKARCEVKGNVFDDDNLGESPFTSDILEAPIPPKFKTPSMKPYDESKDPKDYVEVFEGLMDFQAATDAIK
                            V+ LKARCEVKG+ FDD +LGESPFTSDILEA IP KFKTP+MKPYD SKDPKDYVEVFEGLM FQAATDAIK
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1DDW5 uncharacterized protein LOC1110196342.4e-5359.9Show/hide
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        M TQM TM++MY+EMVQA+G +SR E++     MHEQ   HL PV + +P   E+ EY+ Q+ DLR+H NR RS SLR+G++P+CS ++SNQQAESSYNP
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Query:  M---------------------VKALKARCEVKGNVFDDDNLGESPFTSDILEAPIPPKFKTPSMKPYDESKDPKDYVEVFEGLMDFQAATDAIKCQ
        +                     V+ALKA+CE K + FDD +LGESPFTSDILEA IP KFKTP+MKPYD SKDPKDYVEVFEGLMDFQAATDAIKC+
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A0A6J1DHB3 uncharacterized protein LOC1110204796.8e-4043.22Show/hide
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Query:  TQMHTMKEMYNEMVQASGVQSRFEDQAMHEGMHEQGDLHLDPVDEEYPRADENAEYSRQKSDLRDHFNRNRSLSLRRGRTPACSPKSSNQQAESSYNPMV
              +  YN +                                                                  TP    +    Q +S ++  V
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A0A6J1DM55 uncharacterized protein LOC1110222675.4e-3760.42Show/hide
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A0A6J1DPN4 uncharacterized protein LOC1110230605.9e-5261Show/hide
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A0A6J1DZJ1 uncharacterized protein LOC1110257381.9e-8764.51Show/hide
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        TQM TM+EMYNEMVQA G  SR ED+A  +                            ++ DLRDH +R RS SLR+GR+P+CS K+SNQQAESSYNP+ 
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                            V+ LKARCEVKG+ FDD +LGESPFTSDILEA IP KFKTP+MKPYD SKDPKDYVEVFEGLM FQAATDAIK
Subjt:  --------------------VKALKARCEVKGNVFDDDNLGESPFTSDILEAPIPPKFKTPSMKPYDESKDPKDYVEVFEGLMDFQAATDAIK

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CAGGAAGGCCTATGGACCGAGCAGCTCCGTAGGTCAGCACGCATCACCACACCTGTTCTGTCACCAGCACATCTTAAACCAACTAAGGCCAATCGTGGCCGAGGT
GGTGCCTCTAGGAGAGCCACCCGAGCTCCGGTCCCAGCTCCTACTAAGGAGAATTTTGATGCCCTTCAAAAAGAGATGGAGGCAATGTGCACCCAGATGCACACC
ATGAAAGAAATGTATAACGAAATGGTGCAAGCTTCTGGTGTCCAGTCCCGATTTGAGGACCAAGCGATGCACGAAGGAATGCACGAGCAAGGGGATCTTCACCTC
GACCCAGTCGACGAGGAGTACCCCAGAGCCGATGAAAATGCGGAGTATAGTCGTCAAAAGAGCGATCTCCGTGATCATTTTAACAGAAACAGAAGCTTGTCCCTC
CGAAGAGGACGAACTCCAGCATGCTCGCCCAAAAGCTCCAACCAGCAGGCCGAATCTTCTTACAACCCAATGGTTAAAGCCTTAAAGGCAAGGTGCGAGGTAAAA
GGGAATGTGTTTGATGATGACAACCTGGGGGAATCACCATTCACCTCAGATATCTTGGAGGCTCCAATCCCTCCGAAGTTCAAAACTCCCTCTATGAAGCCATAC
GACGAGTCTAAGGACCCAAAAGATTATGTTGAGGTCTTTGAAGGCCTCATGGATTTTCAAGCGGCCACTGATGCCATAAAGTGCCAGCCTTCCAGATCGCGCTTA
CCGGCAGCGCACGCTTGTGGTACCGAAGATTACCGGCTAGGTCGATCTCGACTTACTCCCAGCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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CCGGCAGCGCACGCTTGTGGTACCGAAGATTACCGGCTAGGTCGATCTCGACTTACTCCCAGCTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MVQPANSTNTADRRATVANDGHQREVGAEVAEGQIQEGLWTEQLRRSARITTPVLSPAHLKPTKANRGRGGASRRATRAPVPAPTKENFDALQKEMEAMCTQMHT
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