; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Moctig00542g010 (gene) of Bitter gourd (OHB3-1) v2 genome

Gene IDMoctig00542g010
OrganismMomordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
DescriptionMetallocarboxypeptidase inhibitor
Genome locationtig00000542_pilon:411..3080
RNA-Seq ExpressionMoctig00542g010
SyntenyMoctig00542g010
Gene Ontology termsGO:0006412 - translation (biological process)
GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
GO:0015934 - large ribosomal subunit (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
GO:0019843 - rRNA binding (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAD4385168.1 hypothetical protein E3N88_25336 [Mikania micrantha]2.2e-73100Show/hide
Query:  NGSSRRDLLLNSQNFCRSIPAGAENPSLSRLCYRRLWGSRNRRALILGWAYYLDAFSSYPLRTWLPSVYRGHDNWYTRATALPLGTVGSLRPTFVPARRV
        NGSSRRDLLLNSQNFCRSIPAGAENPSLSRLCYRRLWGSRNRRALILGWAYYLDAFSSYPLRTWLPSVYRGHDNWYTRATALPLGTVGSLRPTFVPARRV
Subjt:  NGSSRRDLLLNSQNFCRSIPAGAENPSLSRLCYRRLWGSRNRRALILGWAYYLDAFSSYPLRTWLPSVYRGHDNWYTRATALPLGTVGSLRPTFVPARRV

Query:  GLAVKLPSAFALEGQSPSGPRKPLHASVTFWEAYAP
        GLAVKLPSAFALEGQSPSGPRKPLHASVTFWEAYAP
Subjt:  GLAVKLPSAFALEGQSPSGPRKPLHASVTFWEAYAP

KAG8363222.1 hypothetical protein BUALT_BualtPtG0005600 [Buddleja alternifolia]4.9e-7399.26Show/hide
Query:  NGSSRRDLLLNSQNFCRSIPAGAENPSLSRLCYRRLWGSRNRRALILGWAYYLDAFSSYPLRTWLPSVYRGHDNWYTRATALPLGTVGSLRPTFVPARRV
        NGSSRRDLLLNSQNFCRSIPAGAENPSLSRLCYR+LWGSRNRRALILGWAYYLDAFSSYPLRTWLPSVYRGHDNWYTRATALPLGTVGSLRPTFVPARRV
Subjt:  NGSSRRDLLLNSQNFCRSIPAGAENPSLSRLCYRRLWGSRNRRALILGWAYYLDAFSSYPLRTWLPSVYRGHDNWYTRATALPLGTVGSLRPTFVPARRV

Query:  GLAVKLPSAFALEGQSPSGPRKPLHASVTFWEAYAP
        GLAVKLPSAFALEGQSPSGPRKPLHASVTFWEAYAP
Subjt:  GLAVKLPSAFALEGQSPSGPRKPLHASVTFWEAYAP

KAG8363223.1 hypothetical protein BUALT_BualtPtG0005800 [Buddleja alternifolia]4.9e-7399.26Show/hide
Query:  NGSSRRDLLLNSQNFCRSIPAGAENPSLSRLCYRRLWGSRNRRALILGWAYYLDAFSSYPLRTWLPSVYRGHDNWYTRATALPLGTVGSLRPTFVPARRV
        NGSSRRDLLLNSQNFCRSIPAGAENPSLSRLCYR+LWGSRNRRALILGWAYYLDAFSSYPLRTWLPSVYRGHDNWYTRATALPLGTVGSLRPTFVPARRV
Subjt:  NGSSRRDLLLNSQNFCRSIPAGAENPSLSRLCYRRLWGSRNRRALILGWAYYLDAFSSYPLRTWLPSVYRGHDNWYTRATALPLGTVGSLRPTFVPARRV

Query:  GLAVKLPSAFALEGQSPSGPRKPLHASVTFWEAYAP
        GLAVKLPSAFALEGQSPSGPRKPLHASVTFWEAYAP
Subjt:  GLAVKLPSAFALEGQSPSGPRKPLHASVTFWEAYAP

KZV45021.1 Metallocarboxypeptidase inhibitor [Dorcoceras hygrometricum]9.3e-7298.53Show/hide
Query:  NGSSRRDLLLNSQNFCRSIPAGAENPSLSRLCYRRLWGSRNRRALILGWAYYLDAFSSYPLRTWLPSVYRGHDNWYTRATALPLGTVGSLRPTFVPARRV
        NGSSRRDLLLNSQNF RSIPAGAENPSLSRLCYR+LWGSRNRRALILGWAYYLDAFSSYPLRTWLPSVYRGHDNWYTRATALPLGTVGSLRPTFVPARRV
Subjt:  NGSSRRDLLLNSQNFCRSIPAGAENPSLSRLCYRRLWGSRNRRALILGWAYYLDAFSSYPLRTWLPSVYRGHDNWYTRATALPLGTVGSLRPTFVPARRV

Query:  GLAVKLPSAFALEGQSPSGPRKPLHASVTFWEAYAP
        GLAVKLPSAFALEGQSPSGPRKPLHASVTFWEAYAP
Subjt:  GLAVKLPSAFALEGQSPSGPRKPLHASVTFWEAYAP

QHN86532.1 uncharacterized protein DS421_16g547100 [Arachis hypogaea]6.0e-7197.79Show/hide
Query:  NGSSRRDLLLNSQNFCRSIPAGAENPSLSRLCYRRLWGSRNRRALILGWAYYLDAFSSYPLRTWLPSVYRGHDNWYTRATALPLGTVGSLRPTFVPARRV
        NGSSRRDLLLNSQ+F RSIPAGAENPSLSRLCYRRLWGSRNRRALILGWAYYLDAFSSYPLRTWLPSVYRGHDNW+TRATALPLGTVGSLRPTFVPARRV
Subjt:  NGSSRRDLLLNSQNFCRSIPAGAENPSLSRLCYRRLWGSRNRRALILGWAYYLDAFSSYPLRTWLPSVYRGHDNWYTRATALPLGTVGSLRPTFVPARRV

Query:  GLAVKLPSAFALEGQSPSGPRKPLHASVTFWEAYAP
        GLAVKLPSAFALEGQSPSGPRKPLHASVTFWEAYAP
Subjt:  GLAVKLPSAFALEGQSPSGPRKPLHASVTFWEAYAP

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A2N9GA72 Uncharacterized protein4.1e-7399.26Show/hide
Query:  NGSSRRDLLLNSQNFCRSIPAGAENPSLSRLCYRRLWGSRNRRALILGWAYYLDAFSSYPLRTWLPSVYRGHDNWYTRATALPLGTVGSLRPTFVPARRV
        NGSSRRDLLLNSQNFCRSIPAGAENPSLSRLCYRRLWGSRNRRALILGWAYYLDAFSSYPLRTWLPSVYRGHDNWYTRATALPLGTVGSLRPTFVPARRV
Subjt:  NGSSRRDLLLNSQNFCRSIPAGAENPSLSRLCYRRLWGSRNRRALILGWAYYLDAFSSYPLRTWLPSVYRGHDNWYTRATALPLGTVGSLRPTFVPARRV

Query:  GLAVKLPSAFALEGQSPSGPRKPLHASVTFWEAYAP
        GLAVKLPSAFALEGQSPSGPRKPLHASVTFWEAY P
Subjt:  GLAVKLPSAFALEGQSPSGPRKPLHASVTFWEAYAP

A0A2Z7CD85 Metallocarboxypeptidase inhibitor4.5e-7298.53Show/hide
Query:  NGSSRRDLLLNSQNFCRSIPAGAENPSLSRLCYRRLWGSRNRRALILGWAYYLDAFSSYPLRTWLPSVYRGHDNWYTRATALPLGTVGSLRPTFVPARRV
        NGSSRRDLLLNSQNF RSIPAGAENPSLSRLCYR+LWGSRNRRALILGWAYYLDAFSSYPLRTWLPSVYRGHDNWYTRATALPLGTVGSLRPTFVPARRV
Subjt:  NGSSRRDLLLNSQNFCRSIPAGAENPSLSRLCYRRLWGSRNRRALILGWAYYLDAFSSYPLRTWLPSVYRGHDNWYTRATALPLGTVGSLRPTFVPARRV

Query:  GLAVKLPSAFALEGQSPSGPRKPLHASVTFWEAYAP
        GLAVKLPSAFALEGQSPSGPRKPLHASVTFWEAYAP
Subjt:  GLAVKLPSAFALEGQSPSGPRKPLHASVTFWEAYAP

A0A445E746 Uncharacterized protein1.6e-6995.59Show/hide
Query:  NGSSRRDLLLNSQNFCRSIPAGAENPSLSRLCYRRLWGSRNRRALILGWAYYLDAFSSYPLRTWLPSVYRGHDNWYTRATALPLGTVGSLRPTFVPARRV
        NGSSRRDLLLNSQ+F RSIP GAENPSLSRLCY+RLWGSRN RALILGWAYYLDAFSSYPLRTWLPSVYRGHDNW+TRATALPLGTVGSLRPTFVPARRV
Subjt:  NGSSRRDLLLNSQNFCRSIPAGAENPSLSRLCYRRLWGSRNRRALILGWAYYLDAFSSYPLRTWLPSVYRGHDNWYTRATALPLGTVGSLRPTFVPARRV

Query:  GLAVKLPSAFALEGQSPSGPRKPLHASVTFWEAYAP
        GLAVKLPSAFALEGQSPSGPRKPLHASVTFWEAYAP
Subjt:  GLAVKLPSAFALEGQSPSGPRKPLHASVTFWEAYAP

A0A5N6N798 DNA-directed RNA polymerase1.1e-73100Show/hide
Query:  NGSSRRDLLLNSQNFCRSIPAGAENPSLSRLCYRRLWGSRNRRALILGWAYYLDAFSSYPLRTWLPSVYRGHDNWYTRATALPLGTVGSLRPTFVPARRV
        NGSSRRDLLLNSQNFCRSIPAGAENPSLSRLCYRRLWGSRNRRALILGWAYYLDAFSSYPLRTWLPSVYRGHDNWYTRATALPLGTVGSLRPTFVPARRV
Subjt:  NGSSRRDLLLNSQNFCRSIPAGAENPSLSRLCYRRLWGSRNRRALILGWAYYLDAFSSYPLRTWLPSVYRGHDNWYTRATALPLGTVGSLRPTFVPARRV

Query:  GLAVKLPSAFALEGQSPSGPRKPLHASVTFWEAYAP
        GLAVKLPSAFALEGQSPSGPRKPLHASVTFWEAYAP
Subjt:  GLAVKLPSAFALEGQSPSGPRKPLHASVTFWEAYAP

W9RPF7 Uncharacterized protein8.5e-7197.06Show/hide
Query:  NGSSRRDLLLNSQNFCRSIPAGAENPSLSRLCYRRLWGSRNRRALILGWAYYLDAFSSYPLRTWLPSVYRGHDNWYTRATALPLGTVGSLRPTFVPARRV
        NGSSRRDLLLNSQNFC S PAGAENPSLS LCYRRLWGSRNRRALILGWAYYLDAFSSYPLRTWLPSVYRGHDNWYTRATALP GTVGSLRPTFVPARRV
Subjt:  NGSSRRDLLLNSQNFCRSIPAGAENPSLSRLCYRRLWGSRNRRALILGWAYYLDAFSSYPLRTWLPSVYRGHDNWYTRATALPLGTVGSLRPTFVPARRV

Query:  GLAVKLPSAFALEGQSPSGPRKPLHASVTFWEAYAP
        GLAVKLPSAFALEGQSPSGPRKPLHASVTFWEAYAP
Subjt:  GLAVKLPSAFALEGQSPSGPRKPLHASVTFWEAYAP

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGTCCCGGGAGGTTTGTTGTTGCGCTTCTATCGAAATGCCATAGCCAGAGGTGCTGGAATGCTTTCAGCAGTTATCCGCTCCGCACTTGGCTACCTAGCGTTT
ACCGTGGGCACGATAACTGGTACACCAGAGGAGCTCATATTGGCCATGGCTGCATACATCACTGCACTTCCACTTGACACCTATCGTGATGATAACGGCTCATCT
CGCCGTGACCTTCTCTTGAATTCTCAAAACTTCTGTCGCTCCATCCCCGCAGGGGCAGAGAACCCATCGCTGTCTCGGCTGTGCTACCGGAGGCTCTGGGGAAGT
CGGAATAGGAGAGCACTCATCTTGGGGTGGGCTTACTACTTAGATGCTTTCAGCAGTTATCCGCTCCGCACTTGGCTACCCAGCGTTTACCGTGGGCACGATAAC
TGGTACACCAGAGCGACGGCCCTTCCACTCGGCACCGTCGGATCACTAAGGCCGACTTTCGTCCCTGCTCGACGGGTGGGTCTTGCAGTCAAGCTCCCTTCTGCC
TTTGCACTCGAGGGCCAATCTCCGTCTGGCCCGAGGAAACCTTTGCACGCCTCCGTTACCTTTTGGGAGGCCTACGCCCCATAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGTCCCGGGAGGTTTGTTGTTGCGCTTCTATCGAAATGCCATAGCCAGAGGTGCTGGAATGCTTTCAGCAGTTATCCGCTCCGCACTTGGCTACCTAGCGTTT
ACCGTGGGCACGATAACTGGTACACCAGAGGAGCTCATATTGGCCATGGCTGCATACATCACTGCACTTCCACTTGACACCTATCGTGATGATAACGGCTCATCT
CGCCGTGACCTTCTCTTGAATTCTCAAAACTTCTGTCGCTCCATCCCCGCAGGGGCAGAGAACCCATCGCTGTCTCGGCTGTGCTACCGGAGGCTCTGGGGAAGT
CGGAATAGGAGAGCACTCATCTTGGGGTGGGCTTACTACTTAGATGCTTTCAGCAGTTATCCGCTCCGCACTTGGCTACCCAGCGTTTACCGTGGGCACGATAAC
TGGTACACCAGAGCGACGGCCCTTCCACTCGGCACCGTCGGATCACTAAGGCCGACTTTCGTCCCTGCTCGACGGGTGGGTCTTGCAGTCAAGCTCCCTTCTGCC
TTTGCACTCGAGGGCCAATCTCCGTCTGGCCCGAGGAAACCTTTGCACGCCTCCGTTACCTTTTGGGAGGCCTACGCCCCATAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MVPGGLLLRFYRNAIARGAGMLSAVIRSALGYLAFTVGTITGTPEELILAMAAYITALPLDTYRDDNGSSRRDLLLNSQNFCRSIPAGAENPSLSRLCYRRLWGS
RNRRALILGWAYYLDAFSSYPLRTWLPSVYRGHDNWYTRATALPLGTVGSLRPTFVPARRVGLAVKLPSAFALEGQSPSGPRKPLHASVTFWEAYAP