; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Moctig00543g100 (gene) of Bitter gourd (OHB3-1) v2 genome

Gene IDMoctig00543g100
OrganismMomordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
DescriptionPhotosystem II CP47 reaction center protein
Genome locationtig00000543_pilon:33997..35520
RNA-Seq ExpressionMoctig00543g100
SyntenyMoctig00543g100
Gene Ontology termsGO:0009772 - photosynthetic electron transport in photosystem II (biological process)
GO:0018298 - protein-chromophore linkage (biological process)
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GO:0016168 - chlorophyll binding (molecular function)
GO:0045156 - electron transporter, transferring electrons within the cyclic electron transport pathway of photosynthesis activity (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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A0A6H0EVC5 Photosystem II CP47 reaction center protein3.5e-30799.41Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
B1A961 Photosystem II CP47 reaction center protein3.4e-30798.62Show/hide
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Q09G20 Photosystem II CP47 reaction center protein2.6e-30798.62Show/hide
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Q09WZ1 Photosystem II CP47 reaction center protein2.6e-30798.62Show/hide
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Q0ZIZ3 Photosystem II CP47 reaction center protein5.2e-30898.82Show/hide
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Q49KX2 Photosystem II CP47 reaction center protein1.2e-30798.82Show/hide
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        PTTRR V
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
ATCG00280.1 photosystem II reaction center protein C5.6e-2323.5Show/hide
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        G  W+  +  ++N  G+LL  H+ H  L+  WAG+M L+E+A F P      PM+ QG+ ++P +  L       GW +  GG + +   +   GV   H
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Query:  IVFSGLCFLAAIWHWVYWDLEIFCDER------TGKPSLDLPKIFGIHLFLSGLGCF--GFGAFHVTGLY---GPGIWVSDPYGLTGRVQAVNPAWGVEG
        ++ S +     I+H +     +  +E         K    +  I GIHL L G+G F   F A +  G+Y    PG    D   +T    + +  +G   
Subjt:  IVFSGLCFLAAIWHWVYWDLEIFCDER------TGKPSLDLPKIFGIHLFLSGLGCF--GFGAFHVTGLY---GPGIWVSDPYGLTGRVQAVNPAWGVEG

Query:  FDPFVPGG----------IASHHIAAGTLGILAGLFHLSVRPPQRLYKGLRMGNIETVLSSSIAAVFFAAFVVAGTMWYGSATTPIELFGPTRYQWDQGY
          PF   G          I   H+  G++ I  G++H+  +P     + L + + E  LS S+AA+    F+    +W+ +   P E +GPT  +  Q  
Subjt:  FDPFVPGG----------IASHHIAAGTLGILAGLFHLSVRPPQRLYKGLRMGNIETVLSSSIAAVFFAAFVVAGTMWYGSATTPIELFGPTRYQWDQGY

Query:  FQQEIYR--RVGAGLAENQSLSEAWSKIPEKLAFYDYIGNNPAKGGLFRAGSMDNGDGIAVGWLGHPIFRDKEGRELFVRRMPTFFETFPVVLVDGDGIV
            + R  R+GA +   Q         P  L    Y+  +P    +F   +M   D +   WL  P+ R   G +L                      +
Subjt:  FQQEIYR--RVGAGLAENQSLSEAWSKIPEKLAFYDYIGNNPAKGGLFRAGSMDNGDGIAVGWLGHPIFRDKEGRELFVRRMPTFFETFPVVLVDGDGIV

Query:  RADV-PFRRAESKYSVEQVGVTVEFYGGELNGVSYSDPATVKKYARRAQLGEIFELDRATLKSDGVFRSSPRGWFTFGHASFALLFFFGHIWHGARTLFR
        + D+ P++   S                              +Y   A LG +  +     + + V   SPR W +  H       F GH+WH  R   R
Subjt:  RADV-PFRRAESKYSVEQVGVTVEFYGGELNGVSYSDPATVKKYARRAQLGEIFELDRATLKSDGVFRSSPRGWFTFGHASFALLFFFGHIWHGARTLFR

Query:  DVFAGIDPDLDAQVE
           AG +  +D   E
Subjt:  DVFAGIDPDLDAQVE

ATCG00680.1 photosystem II reaction center protein B5.0e-30697.62Show/hide
Query:  MGLPWYRVHTVVLNDPGRLLSVHIMHTALVAGWAGSMALYELAVFDPSDPVLDPMWRQGMFVIPFMTRLGITNSWGGWSITGGTITNPGIWSYEGVAGAH
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Subjt:  MGLPWYRVHTVVLNDPGRLLSVHIMHTALVAGWAGSMALYELAVFDPSDPVLDPMWRQGMFVIPFMTRLGITNSWGGWSITGGTITNPGIWSYEGVAGAH

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        IVFSGLCFLAAIWHWVYWDLEIFCDERTGKPSLDLPKIFGIHLFLSG+ CFGFGAFHVTGLYGPGIWVSDPYGLTG+VQ VNPAWGVEGFDPFVPGGIAS
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Query:  PTTRR
        PTT+R
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Sequences Show/hide sequences
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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