; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0000421 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0000421
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Descriptionycf3-interacting protein 1, chloroplastic
Genome locationchr04:56585..59599
RNA-Seq ExpressionPI0000421
SyntenyPI0000421
Gene Ontology termsGO:0048564 - photosystem I assembly (biological process)
GO:0080183 - response to photooxidative stress (biological process)
GO:0009535 - chloroplast thylakoid membrane (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR040340 - Chloroplast enhancing stress tolerance protein


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0052411.1 ycf3-interacting protein 1 [Cucumis melo var. makuwa]2.9e-11894.29Show/hide
Query:  MAVMALQLRHFPLSPSPSPSSSIEHNYEVSRRFRHLPLPSHGPRHHLPVPSSRNRRSLACVGKEDTQLRQSSSTTDEQSDAQALEYIRQIQRVLELLKKN
        MAVMALQLRHF L  SPSPSSSIEHNYEV RRFR LPLPSHGP H L VPSSRNRRSLACVGKEDTQLRQSSSTTDEQ DAQALEYI QI+RVLELLKKN
Subjt:  MAVMALQLRHFPLSPSPSPSSSIEHNYEVSRRFRHLPLPSHGPRHHLPVPSSRNRRSLACVGKEDTQLRQSSSTTDEQSDAQALEYIRQIQRVLELLKKN

Query:  RDMLFNEVKLTVMIEDPREVERRRLLGIDEDDAPTRDDLAATLEEVNEGKFPKNRVALQMLAEEMTNWPNLEAEAPKKKRSKSLYAKATDTGVNPREAAK
        RDMLFNEVKLTVMIEDPREVERRRLLGIDEDDAPTRDDLAATLEEVNEGKFPKNRVALQMLAEEMT WPNLEAEAPKK+RSKSLYAKATDTGVNPREAAK
Subjt:  RDMLFNEVKLTVMIEDPREVERRRLLGIDEDDAPTRDDLAATLEEVNEGKFPKNRVALQMLAEEMTNWPNLEAEAPKKKRSKSLYAKATDTGVNPREAAK

Query:  RLNIDWDTAAEIEDADLSDDPEVPAAVGYGALYIVTAFPVIIGIS
        RLNIDWDTAAEIEDADL DDPEVPAAVGYGALYIVTAFPVIIGIS
Subjt:  RLNIDWDTAAEIEDADLSDDPEVPAAVGYGALYIVTAFPVIIGIS

XP_004134512.1 ycf3-interacting protein 1, chloroplastic isoform X1 [Cucumis sativus]1.4e-12595.31Show/hide
Query:  MAVMALQLRHFPLSPSPSPSSSIEHNYEVSRRFRHLPLPSHGPRHHLPVPSSRNRRSLACVGKEDTQLRQSSSTTDEQSDAQALEYIRQIQRVLELLKKN
        MAVMALQLRHFPL  S SPSSSIEHNY++SRRFR+LPLPSHG R HLPVPSSRNRRSLACVGKEDTQLRQ SSTTDEQ +AQ LEYIRQIQRVLELLKKN
Subjt:  MAVMALQLRHFPLSPSPSPSSSIEHNYEVSRRFRHLPLPSHGPRHHLPVPSSRNRRSLACVGKEDTQLRQSSSTTDEQSDAQALEYIRQIQRVLELLKKN

Query:  RDMLFNEVKLTVMIEDPREVERRRLLGIDEDDAPTRDDLAATLEEVNEGKFPKNRVALQMLAEEMTNWPNLEAEAPKKKRSKSLYAKATDTGVNPREAAK
        RDMLFNEVKLTVMIEDPREVERRRLLGIDEDDAPTRDDLAATLEEVNEGKFPKNRVALQMLAEEMTNWPNLEAEAPKKKRSKSLYAKATDTGVNPREAAK
Subjt:  RDMLFNEVKLTVMIEDPREVERRRLLGIDEDDAPTRDDLAATLEEVNEGKFPKNRVALQMLAEEMTNWPNLEAEAPKKKRSKSLYAKATDTGVNPREAAK

Query:  RLNIDWDTAAEIEDADLSDDPEVPAAVGYGALYIVTAFPVIIGISVVLILFYNSLQ
        RLNIDWDTAAEIEDADLSDDPEVPAAVGYGALYIVTAFPVIIGISVVLILFYNSLQ
Subjt:  RLNIDWDTAAEIEDADLSDDPEVPAAVGYGALYIVTAFPVIIGISVVLILFYNSLQ

XP_008439415.1 PREDICTED: ycf3-interacting protein 1, chloroplastic isoform X1 [Cucumis melo]3.0e-12394.14Show/hide
Query:  MAVMALQLRHFPLSPSPSPSSSIEHNYEVSRRFRHLPLPSHGPRHHLPVPSSRNRRSLACVGKEDTQLRQSSSTTDEQSDAQALEYIRQIQRVLELLKKN
        MAVMALQLRHF L  SPSPSSSIEHNYEV RRFR LPLPSHGP H L VPSSRNRRSLACVGKEDTQ RQSSSTTDEQ DAQALEYI QI+RVLELLKKN
Subjt:  MAVMALQLRHFPLSPSPSPSSSIEHNYEVSRRFRHLPLPSHGPRHHLPVPSSRNRRSLACVGKEDTQLRQSSSTTDEQSDAQALEYIRQIQRVLELLKKN

Query:  RDMLFNEVKLTVMIEDPREVERRRLLGIDEDDAPTRDDLAATLEEVNEGKFPKNRVALQMLAEEMTNWPNLEAEAPKKKRSKSLYAKATDTGVNPREAAK
        RDMLFNEVKLTVMIEDPREVERRRLLGIDEDDAPTRDDLAATLEEVNEGKFPKNRVALQMLAEEMT WPNLEAEAPKK+RSKSLYAKATDTGVNPREAAK
Subjt:  RDMLFNEVKLTVMIEDPREVERRRLLGIDEDDAPTRDDLAATLEEVNEGKFPKNRVALQMLAEEMTNWPNLEAEAPKKKRSKSLYAKATDTGVNPREAAK

Query:  RLNIDWDTAAEIEDADLSDDPEVPAAVGYGALYIVTAFPVIIGISVVLILFYNSLQ
        RLNIDWDTAAEIEDADL DDPEVPAAVGYGALYIVTAFPVIIGISVVLILFYNSLQ
Subjt:  RLNIDWDTAAEIEDADLSDDPEVPAAVGYGALYIVTAFPVIIGISVVLILFYNSLQ

XP_022925592.1 ycf3-interacting protein 1, chloroplastic [Cucurbita moschata]3.5e-11688.28Show/hide
Query:  MAVMALQLRHFPLSPSPSPSSSIEHNYEVSRRFRHLPLPSHGPRHHLPVPSSRNRRSLACVGKEDTQLRQSSSTTDEQSDAQALEYIRQIQRVLELLKKN
        M VMALQLRHFPLSPSP   SSI+HNY+ SR FRHLPLP++  RHHLPV SSRNRR + CVGKE+TQL QSSST DEQ DAQ LEYIRQIQRVLELLKKN
Subjt:  MAVMALQLRHFPLSPSPSPSSSIEHNYEVSRRFRHLPLPSHGPRHHLPVPSSRNRRSLACVGKEDTQLRQSSSTTDEQSDAQALEYIRQIQRVLELLKKN

Query:  RDMLFNEVKLTVMIEDPREVERRRLLGIDEDDAPTRDDLAATLEEVNEGKFPKNRVALQMLAEEMTNWPNLEAEAPKKKRSKSLYAKATDTGVNPREAAK
        RDMLFNEVKLTVMIEDPREVERRRLLGID++DAPTRDDLA TLEEVNEGKFPKNR ALQMLAEEMTNWPNLE EAPKKKRSKSLYA  TDTGVNPREAAK
Subjt:  RDMLFNEVKLTVMIEDPREVERRRLLGIDEDDAPTRDDLAATLEEVNEGKFPKNRVALQMLAEEMTNWPNLEAEAPKKKRSKSLYAKATDTGVNPREAAK

Query:  RLNIDWDTAAEIEDADLSDDPEVPAAVGYGALYIVTAFPVIIGISVVLILFYNSLQ
        RLNIDWDTAAE+EDADLS+DPEVPAAVGYGALYIVTAFPVIIGISVVLILFYNSLQ
Subjt:  RLNIDWDTAAEIEDADLSDDPEVPAAVGYGALYIVTAFPVIIGISVVLILFYNSLQ

XP_038877519.1 ycf3-interacting protein 1, chloroplastic [Benincasa hispida]1.9e-12292.58Show/hide
Query:  MAVMALQLRHFPLSPSPSPSSSIEHNYEVSRRFRHLPLPSHGPRHHLPVPSSRNRRSLACVGKEDTQLRQSSSTTDEQSDAQALEYIRQIQRVLELLKKN
        M VMALQLRHFPLSPS   SSSIEHNY+   RFRHLPLPS+  RHHLPVP+SRNR+SLACVGKEDTQLRQSSST DEQ DAQALEY+RQIQRVLELLKKN
Subjt:  MAVMALQLRHFPLSPSPSPSSSIEHNYEVSRRFRHLPLPSHGPRHHLPVPSSRNRRSLACVGKEDTQLRQSSSTTDEQSDAQALEYIRQIQRVLELLKKN

Query:  RDMLFNEVKLTVMIEDPREVERRRLLGIDEDDAPTRDDLAATLEEVNEGKFPKNRVALQMLAEEMTNWPNLEAEAPKKKRSKSLYAKATDTGVNPREAAK
        RDMLFNEVKLTVMIEDPR+VERRRLLGID+DDAPTRDDLAATLEEVNEGKFPKNRVALQMLAEEMTNWPNLEAEAPKKKR KSLYAKATDTGVNPREAAK
Subjt:  RDMLFNEVKLTVMIEDPREVERRRLLGIDEDDAPTRDDLAATLEEVNEGKFPKNRVALQMLAEEMTNWPNLEAEAPKKKRSKSLYAKATDTGVNPREAAK

Query:  RLNIDWDTAAEIEDADLSDDPEVPAAVGYGALYIVTAFPVIIGISVVLILFYNSLQ
        RLNIDWDTAAEIEDADLSDDPEVPAAVGYGALYIVTAFPVIIGISVVLILFYNSLQ
Subjt:  RLNIDWDTAAEIEDADLSDDPEVPAAVGYGALYIVTAFPVIIGISVVLILFYNSLQ

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KJ48 Uncharacterized protein6.9e-12695.31Show/hide
Query:  MAVMALQLRHFPLSPSPSPSSSIEHNYEVSRRFRHLPLPSHGPRHHLPVPSSRNRRSLACVGKEDTQLRQSSSTTDEQSDAQALEYIRQIQRVLELLKKN
        MAVMALQLRHFPL  S SPSSSIEHNY++SRRFR+LPLPSHG R HLPVPSSRNRRSLACVGKEDTQLRQ SSTTDEQ +AQ LEYIRQIQRVLELLKKN
Subjt:  MAVMALQLRHFPLSPSPSPSSSIEHNYEVSRRFRHLPLPSHGPRHHLPVPSSRNRRSLACVGKEDTQLRQSSSTTDEQSDAQALEYIRQIQRVLELLKKN

Query:  RDMLFNEVKLTVMIEDPREVERRRLLGIDEDDAPTRDDLAATLEEVNEGKFPKNRVALQMLAEEMTNWPNLEAEAPKKKRSKSLYAKATDTGVNPREAAK
        RDMLFNEVKLTVMIEDPREVERRRLLGIDEDDAPTRDDLAATLEEVNEGKFPKNRVALQMLAEEMTNWPNLEAEAPKKKRSKSLYAKATDTGVNPREAAK
Subjt:  RDMLFNEVKLTVMIEDPREVERRRLLGIDEDDAPTRDDLAATLEEVNEGKFPKNRVALQMLAEEMTNWPNLEAEAPKKKRSKSLYAKATDTGVNPREAAK

Query:  RLNIDWDTAAEIEDADLSDDPEVPAAVGYGALYIVTAFPVIIGISVVLILFYNSLQ
        RLNIDWDTAAEIEDADLSDDPEVPAAVGYGALYIVTAFPVIIGISVVLILFYNSLQ
Subjt:  RLNIDWDTAAEIEDADLSDDPEVPAAVGYGALYIVTAFPVIIGISVVLILFYNSLQ

A0A1S3AYB4 ycf3-interacting protein 1, chloroplastic isoform X11.4e-12394.14Show/hide
Query:  MAVMALQLRHFPLSPSPSPSSSIEHNYEVSRRFRHLPLPSHGPRHHLPVPSSRNRRSLACVGKEDTQLRQSSSTTDEQSDAQALEYIRQIQRVLELLKKN
        MAVMALQLRHF L  SPSPSSSIEHNYEV RRFR LPLPSHGP H L VPSSRNRRSLACVGKEDTQ RQSSSTTDEQ DAQALEYI QI+RVLELLKKN
Subjt:  MAVMALQLRHFPLSPSPSPSSSIEHNYEVSRRFRHLPLPSHGPRHHLPVPSSRNRRSLACVGKEDTQLRQSSSTTDEQSDAQALEYIRQIQRVLELLKKN

Query:  RDMLFNEVKLTVMIEDPREVERRRLLGIDEDDAPTRDDLAATLEEVNEGKFPKNRVALQMLAEEMTNWPNLEAEAPKKKRSKSLYAKATDTGVNPREAAK
        RDMLFNEVKLTVMIEDPREVERRRLLGIDEDDAPTRDDLAATLEEVNEGKFPKNRVALQMLAEEMT WPNLEAEAPKK+RSKSLYAKATDTGVNPREAAK
Subjt:  RDMLFNEVKLTVMIEDPREVERRRLLGIDEDDAPTRDDLAATLEEVNEGKFPKNRVALQMLAEEMTNWPNLEAEAPKKKRSKSLYAKATDTGVNPREAAK

Query:  RLNIDWDTAAEIEDADLSDDPEVPAAVGYGALYIVTAFPVIIGISVVLILFYNSLQ
        RLNIDWDTAAEIEDADL DDPEVPAAVGYGALYIVTAFPVIIGISVVLILFYNSLQ
Subjt:  RLNIDWDTAAEIEDADLSDDPEVPAAVGYGALYIVTAFPVIIGISVVLILFYNSLQ

A0A5A7UFW0 Ycf3-interacting protein 11.4e-11894.29Show/hide
Query:  MAVMALQLRHFPLSPSPSPSSSIEHNYEVSRRFRHLPLPSHGPRHHLPVPSSRNRRSLACVGKEDTQLRQSSSTTDEQSDAQALEYIRQIQRVLELLKKN
        MAVMALQLRHF L  SPSPSSSIEHNYEV RRFR LPLPSHGP H L VPSSRNRRSLACVGKEDTQLRQSSSTTDEQ DAQALEYI QI+RVLELLKKN
Subjt:  MAVMALQLRHFPLSPSPSPSSSIEHNYEVSRRFRHLPLPSHGPRHHLPVPSSRNRRSLACVGKEDTQLRQSSSTTDEQSDAQALEYIRQIQRVLELLKKN

Query:  RDMLFNEVKLTVMIEDPREVERRRLLGIDEDDAPTRDDLAATLEEVNEGKFPKNRVALQMLAEEMTNWPNLEAEAPKKKRSKSLYAKATDTGVNPREAAK
        RDMLFNEVKLTVMIEDPREVERRRLLGIDEDDAPTRDDLAATLEEVNEGKFPKNRVALQMLAEEMT WPNLEAEAPKK+RSKSLYAKATDTGVNPREAAK
Subjt:  RDMLFNEVKLTVMIEDPREVERRRLLGIDEDDAPTRDDLAATLEEVNEGKFPKNRVALQMLAEEMTNWPNLEAEAPKKKRSKSLYAKATDTGVNPREAAK

Query:  RLNIDWDTAAEIEDADLSDDPEVPAAVGYGALYIVTAFPVIIGIS
        RLNIDWDTAAEIEDADL DDPEVPAAVGYGALYIVTAFPVIIGIS
Subjt:  RLNIDWDTAAEIEDADLSDDPEVPAAVGYGALYIVTAFPVIIGIS

A0A6J1EC41 ycf3-interacting protein 1, chloroplastic1.7e-11688.28Show/hide
Query:  MAVMALQLRHFPLSPSPSPSSSIEHNYEVSRRFRHLPLPSHGPRHHLPVPSSRNRRSLACVGKEDTQLRQSSSTTDEQSDAQALEYIRQIQRVLELLKKN
        M VMALQLRHFPLSPSP   SSI+HNY+ SR FRHLPLP++  RHHLPV SSRNRR + CVGKE+TQL QSSST DEQ DAQ LEYIRQIQRVLELLKKN
Subjt:  MAVMALQLRHFPLSPSPSPSSSIEHNYEVSRRFRHLPLPSHGPRHHLPVPSSRNRRSLACVGKEDTQLRQSSSTTDEQSDAQALEYIRQIQRVLELLKKN

Query:  RDMLFNEVKLTVMIEDPREVERRRLLGIDEDDAPTRDDLAATLEEVNEGKFPKNRVALQMLAEEMTNWPNLEAEAPKKKRSKSLYAKATDTGVNPREAAK
        RDMLFNEVKLTVMIEDPREVERRRLLGID++DAPTRDDLA TLEEVNEGKFPKNR ALQMLAEEMTNWPNLE EAPKKKRSKSLYA  TDTGVNPREAAK
Subjt:  RDMLFNEVKLTVMIEDPREVERRRLLGIDEDDAPTRDDLAATLEEVNEGKFPKNRVALQMLAEEMTNWPNLEAEAPKKKRSKSLYAKATDTGVNPREAAK

Query:  RLNIDWDTAAEIEDADLSDDPEVPAAVGYGALYIVTAFPVIIGISVVLILFYNSLQ
        RLNIDWDTAAE+EDADLS+DPEVPAAVGYGALYIVTAFPVIIGISVVLILFYNSLQ
Subjt:  RLNIDWDTAAEIEDADLSDDPEVPAAVGYGALYIVTAFPVIIGISVVLILFYNSLQ

A0A6J1IQU0 ycf3-interacting protein 1, chloroplastic1.1e-11588.28Show/hide
Query:  MAVMALQLRHFPLSPSPSPSSSIEHNYEVSRRFRHLPLPSHGPRHHLPVPSSRNRRSLACVGKEDTQLRQSSSTTDEQSDAQALEYIRQIQRVLELLKKN
        M VMALQLRHFPLSPSP   SSI+HNY+ SR FRHLPLP++  RHHLPV SSRNR  + CVGKEDTQL QSSST  EQ DAQ LEYIRQIQRVLELLKKN
Subjt:  MAVMALQLRHFPLSPSPSPSSSIEHNYEVSRRFRHLPLPSHGPRHHLPVPSSRNRRSLACVGKEDTQLRQSSSTTDEQSDAQALEYIRQIQRVLELLKKN

Query:  RDMLFNEVKLTVMIEDPREVERRRLLGIDEDDAPTRDDLAATLEEVNEGKFPKNRVALQMLAEEMTNWPNLEAEAPKKKRSKSLYAKATDTGVNPREAAK
        RDMLFNEVKLTVMIEDPREVERRRLLGID+DDAPTRDDLA TLEEVNEGKFPKNR ALQMLAEEMTNWPNLE EAPKKKRSKSLYA  TDTGVNPREAAK
Subjt:  RDMLFNEVKLTVMIEDPREVERRRLLGIDEDDAPTRDDLAATLEEVNEGKFPKNRVALQMLAEEMTNWPNLEAEAPKKKRSKSLYAKATDTGVNPREAAK

Query:  RLNIDWDTAAEIEDADLSDDPEVPAAVGYGALYIVTAFPVIIGISVVLILFYNSLQ
        RLNIDWDTAAE+EDADLS+DPEVPAAVGYGALYIVTAFPVIIGISVVLILFYNSLQ
Subjt:  RLNIDWDTAAEIEDADLSDDPEVPAAVGYGALYIVTAFPVIIGISVVLILFYNSLQ

SwissProt top hitse value%identityAlignment
B8AAV3 Protein CHLOROPLAST ENHANCING STRESS TOLERANCE, chloroplastic1.4e-6252.65Show/hide
Query:  LRHFPLSPS-------PSPSSSIEHNYEVSRRFRHLPLPSHGPRHHLPVPSSRNRRSLACVGKEDTQLRQ------------------------SSSTTD
        LR  P SP+       PS   S+ H +        LPLPS          S R RR  A +G+++  +                          +SS   
Subjt:  LRHFPLSPS-------PSPSSSIEHNYEVSRRFRHLPLPSHGPRHHLPVPSSRNRRSLACVGKEDTQLRQ------------------------SSSTTD

Query:  EQSDAQALEYIRQIQRVLELLKKNRDMLFNEVKLTVMIEDPREVERRRLLGIDEDDAPTRDDLAATLEEVNEGKFPKNRVALQMLAEEMTNWPNLEAEAP
         ++  + LE IRQ++RVLELL+KNRDM F EVKLT+MIEDPR++ER+RLLGI++ D  TRDDLA  L EVNEG+ P+NRVALQ+LA+EMT WP+LE EAP
Subjt:  EQSDAQALEYIRQIQRVLELLKKNRDMLFNEVKLTVMIEDPREVERRRLLGIDEDDAPTRDDLAATLEEVNEGKFPKNRVALQMLAEEMTNWPNLEAEAP

Query:  KKKR--SKSLYAKATDTGVNPREAAKRLNIDWDTAAEIEDADLSDD-PEVPAAVGYGALYIVTAFPVIIGISVVLILFYNSLQ
        KKK    KS+YAKATDTG++P  AAKRLNIDWD+AA+++D +  DD  EVP+AVGY ALY++TAFPVIIGISVVLILFYNSLQ
Subjt:  KKKR--SKSLYAKATDTGVNPREAAKRLNIDWDTAAEIEDADLSDD-PEVPAAVGYGALYIVTAFPVIIGISVVLILFYNSLQ

E5KCJ8 Ycf3-interacting protein 1, chloroplastic9.7e-6958.43Show/hide
Query:  MALQLRHFPLSPSPSPSSSIEHNYEVSRRFRHLPLPSHGPRH--HLPVPSSRNRRSLAC------VGKEDTQ-----LRQSSSTTDEQSDAQALEYIRQI
        MA  +    L P  S SSS+     +S     LP  +H  RH     V + R R S +       V KE+         +     D+  D Q+LEY+ QI
Subjt:  MALQLRHFPLSPSPSPSSSIEHNYEVSRRFRHLPLPSHGPRH--HLPVPSSRNRRSLAC------VGKEDTQ-----LRQSSSTTDEQSDAQALEYIRQI

Query:  QRVLELLKKNRDMLFNEVKLTVMIEDPREVERRRLLGIDEDDAPTRDDLAATLEEVNEGKFPKNRVALQMLAEEMTNWPNLEAEAPKK-KRSKSLYAKAT
        +RVLELLK+NRDMLF EVKLT+MIEDPR+VERRRLLGID+++APTRDDLAA LEE+NEGK PK+  ALQMLAEEM +WPNLE EA K+ K  +SLYAKAT
Subjt:  QRVLELLKKNRDMLFNEVKLTVMIEDPREVERRRLLGIDEDDAPTRDDLAATLEEVNEGKFPKNRVALQMLAEEMTNWPNLEAEAPKK-KRSKSLYAKAT

Query:  DTGVNPREAAKRLNIDWDTAAEIEDADLSDDPEVPAAVGYGALYIVTAFPVIIGISVVLILFYNSLQ
        DTG++P+EAAKRL IDWD+AAEI+++  SD+P+VP A+GYGALY+V+AFP+IIGISVVLILFYNSLQ
Subjt:  DTGVNPREAAKRLNIDWDTAAEIEDADLSDDPEVPAAVGYGALYIVTAFPVIIGISVVLILFYNSLQ

Q5VQK9 Protein CHLOROPLAST ENHANCING STRESS TOLERANCE, chloroplastic1.4e-6252.3Show/hide
Query:  LRHFPLSPS-------PSPSSSIEHNYEVSRRFRHLPLPSHGPRHHLPVPSSRNRRSLACVGKEDTQLRQSSSTTDEQSDAQA-----------------
        LR  P SP+       PS   S+ H +        LPLPS          S R RR  A +G+++  +  ++   + + D++                  
Subjt:  LRHFPLSPS-------PSPSSSIEHNYEVSRRFRHLPLPSHGPRHHLPVPSSRNRRSLACVGKEDTQLRQSSSTTDEQSDAQA-----------------

Query:  -------LEYIRQIQRVLELLKKNRDMLFNEVKLTVMIEDPREVERRRLLGIDEDDAPTRDDLAATLEEVNEGKFPKNRVALQMLAEEMTNWPNLEAEAP
               LE IRQ++RVLELL+KNRDM F EVKLT+MIEDPR++ER+RLLGI++ D  TRDDLA  L EVNEG+ P+NRVALQ+LA+EMT WP+LE EAP
Subjt:  -------LEYIRQIQRVLELLKKNRDMLFNEVKLTVMIEDPREVERRRLLGIDEDDAPTRDDLAATLEEVNEGKFPKNRVALQMLAEEMTNWPNLEAEAP

Query:  KKKR--SKSLYAKATDTGVNPREAAKRLNIDWDTAAEIEDADLSDD-PEVPAAVGYGALYIVTAFPVIIGISVVLILFYNSLQ
        KKK    KS+YAKATDTG++P  AAKRLNIDWD+AA+++D +  DD  EVP+AVGY ALY++TAFPVIIGISVVLILFYNSLQ
Subjt:  KKKR--SKSLYAKATDTGVNPREAAKRLNIDWDTAAEIEDADLSDD-PEVPAAVGYGALYIVTAFPVIIGISVVLILFYNSLQ

Q9LU01 Ycf3-interacting protein 1, chloroplastic2.8e-6051.15Show/hide
Query:  RHFPLSPSPSP-----SSSIEHNYEVSRRFRHLPLPSHGPRH--------HLPVPSSRNRRSLACVGKEDTQLRQSSSTTDEQSDAQALEYIRQIQRVLE
        R++  S SPSP     S+ I     V RR  +    S   +          +PVP +  ++      ++D    +     +   D + L+Y+ +I+RV+E
Subjt:  RHFPLSPSPSP-----SSSIEHNYEVSRRFRHLPLPSHGPRH--------HLPVPSSRNRRSLACVGKEDTQLRQSSSTTDEQSDAQALEYIRQIQRVLE

Query:  LLKKNRDMLFNEVKLTVMIEDPREVERRRLLGIDEDDAPTRDDLAATLEEVNEGKFPKNRVALQMLAEEMTNWPNLEAEAPKKKRSKSLYAKATDTGVNP
        LL++NRDM+F+EVKLT+MIEDPRE+ERRRLLGI++ D P+RDDLA  LE+VN+GK PK+R  L+ML EEM  WPNLE E  KK+R KS+YAK+TDTG++P
Subjt:  LLKKNRDMLFNEVKLTVMIEDPREVERRRLLGIDEDDAPTRDDLAATLEEVNEGKFPKNRVALQMLAEEMTNWPNLEAEAPKKKRSKSLYAKATDTGVNP

Query:  REAAKRLNIDWDTAAEIEDADLSDDPEVPAAV-GYGALYIVTAFPVIIGISVVLILFYNSLQ
        +EAAKRLN++WD+AA IE+ D+ D+  V   V GYGALY V+A PVIIGISVVLILFYNSLQ
Subjt:  REAAKRLNIDWDTAAEIEDADLSDDPEVPAAV-GYGALYIVTAFPVIIGISVVLILFYNSLQ

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G44650.1 Encodes a chloroplast protein that induces tolerance to multiple environmental stresses and reduces photooxidative damage.2.0e-6151.15Show/hide
Query:  RHFPLSPSPSP-----SSSIEHNYEVSRRFRHLPLPSHGPRH--------HLPVPSSRNRRSLACVGKEDTQLRQSSSTTDEQSDAQALEYIRQIQRVLE
        R++  S SPSP     S+ I     V RR  +    S   +          +PVP +  ++      ++D    +     +   D + L+Y+ +I+RV+E
Subjt:  RHFPLSPSPSP-----SSSIEHNYEVSRRFRHLPLPSHGPRH--------HLPVPSSRNRRSLACVGKEDTQLRQSSSTTDEQSDAQALEYIRQIQRVLE

Query:  LLKKNRDMLFNEVKLTVMIEDPREVERRRLLGIDEDDAPTRDDLAATLEEVNEGKFPKNRVALQMLAEEMTNWPNLEAEAPKKKRSKSLYAKATDTGVNP
        LL++NRDM+F+EVKLT+MIEDPRE+ERRRLLGI++ D P+RDDLA  LE+VN+GK PK+R  L+ML EEM  WPNLE E  KK+R KS+YAK+TDTG++P
Subjt:  LLKKNRDMLFNEVKLTVMIEDPREVERRRLLGIDEDDAPTRDDLAATLEEVNEGKFPKNRVALQMLAEEMTNWPNLEAEAPKKKRSKSLYAKATDTGVNP

Query:  REAAKRLNIDWDTAAEIEDADLSDDPEVPAAV-GYGALYIVTAFPVIIGISVVLILFYNSLQ
        +EAAKRLN++WD+AA IE+ D+ D+  V   V GYGALY V+A PVIIGISVVLILFYNSLQ
Subjt:  REAAKRLNIDWDTAAEIEDADLSDDPEVPAAV-GYGALYIVTAFPVIIGISVVLILFYNSLQ


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCAGTGATGGCTCTTCAACTCCGCCACTTCCCACTCTCCCCTTCCCCTTCCCCTTCTTCGTCCATCGAACACAATTACGAAGTTTCTCGTCGCTTCCGCCATCTTCC
CCTTCCCAGTCATGGCCCTCGCCACCATCTCCCAGTTCCCTCTAGCCGCAATCGACGCTCTCTGGCCTGCGTTGGCAAGGAAGATACCCAGTTGCGTCAATCATCGTCCA
CCACAGATGAACAGTCTGACGCCCAAGCCCTAGAATACATTCGTCAGATTCAAAGGGTACTGGAGCTTCTCAAGAAAAACAGAGACATGCTCTTCAATGAGGTTAAACTT
ACCGTAATGATTGAAGACCCCCGGGAAGTTGAACGCCGGAGATTACTTGGAATTGACGAGGATGACGCCCCAACAAGGGATGATTTAGCCGCCACTCTTGAAGAAGTCAA
TGAAGGAAAGTTCCCAAAAAATCGAGTGGCTCTCCAAATGCTAGCTGAAGAGATGACCAATTGGCCCAATTTGGAGGCCGAGGCACCCAAGAAGAAACGCAGTAAGTCGT
TATATGCAAAAGCCACAGACACTGGTGTGAATCCTCGAGAGGCTGCAAAAAGACTAAACATCGATTGGGACACTGCAGCTGAGATTGAAGATGCCGATTTGAGTGATGAC
CCAGAAGTGCCTGCCGCTGTGGGATATGGAGCACTGTACATAGTGACAGCGTTTCCGGTGATAATTGGCATCTCAGTAGTTCTAATCCTTTTCTACAATTCTCTTCAATA
G
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCAGTGATGGCTCTTCAACTCCGCCACTTCCCACTCTCCCCTTCCCCTTCCCCTTCTTCGTCCATCGAACACAATTACGAAGTTTCTCGTCGCTTCCGCCATCTTCC
CCTTCCCAGTCATGGCCCTCGCCACCATCTCCCAGTTCCCTCTAGCCGCAATCGACGCTCTCTGGCCTGCGTTGGCAAGGAAGATACCCAGTTGCGTCAATCATCGTCCA
CCACAGATGAACAGTCTGACGCCCAAGCCCTAGAATACATTCGTCAGATTCAAAGGGTACTGGAGCTTCTCAAGAAAAACAGAGACATGCTCTTCAATGAGGTTAAACTT
ACCGTAATGATTGAAGACCCCCGGGAAGTTGAACGCCGGAGATTACTTGGAATTGACGAGGATGACGCCCCAACAAGGGATGATTTAGCCGCCACTCTTGAAGAAGTCAA
TGAAGGAAAGTTCCCAAAAAATCGAGTGGCTCTCCAAATGCTAGCTGAAGAGATGACCAATTGGCCCAATTTGGAGGCCGAGGCACCCAAGAAGAAACGCAGTAAGTCGT
TATATGCAAAAGCCACAGACACTGGTGTGAATCCTCGAGAGGCTGCAAAAAGACTAAACATCGATTGGGACACTGCAGCTGAGATTGAAGATGCCGATTTGAGTGATGAC
CCAGAAGTGCCTGCCGCTGTGGGATATGGAGCACTGTACATAGTGACAGCGTTTCCGGTGATAATTGGCATCTCAGTAGTTCTAATCCTTTTCTACAATTCTCTTCAATA
G
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAVMALQLRHFPLSPSPSPSSSIEHNYEVSRRFRHLPLPSHGPRHHLPVPSSRNRRSLACVGKEDTQLRQSSSTTDEQSDAQALEYIRQIQRVLELLKKNRDMLFNEVKL
TVMIEDPREVERRRLLGIDEDDAPTRDDLAATLEEVNEGKFPKNRVALQMLAEEMTNWPNLEAEAPKKKRSKSLYAKATDTGVNPREAAKRLNIDWDTAAEIEDADLSDD
PEVPAAVGYGALYIVTAFPVIIGISVVLILFYNSLQ