CuGenDBv2

Gene ID	PI0000458
Organism	Cucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Description	DUF1279 domain-containing protein
Genome location	chr05:21379297..21381206
RNA-Seq Expression	PI0000458
Synteny	PI0000458
Gene Ontology terms	GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domains	IPR009688 - Protein FAM210A/B-like domain

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

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Alignment

KAA0061727.1 FAM210B-like protein [Cucumis melo var. makuwa]

2.5e-90

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XP_004140165.1 uncharacterized protein LOC101219558 [Cucumis sativus]

7.8e-92

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XP_008449587.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103491427 [Cucumis melo]

2.1e-89

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XP_023512163.1 uncharacterized protein LOC111776967 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

1.6e-73

81.82

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XP_038901803.1 uncharacterized protein LOC120088508 [Benincasa hispida]

3.7e-86

92.5

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TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0KEW3 DUF1279 domain-containing protein

3.8e-92

95.88

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A0A1S3BN10 uncharacterized protein LOC103491427

1.0e-89

94.33

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A0A5A7V4A0 FAM210B-like protein

1.2e-90

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A0A5D3B9U1 DUF1279 domain-containing protein

1.0e-89

94.33

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A0A6J1JG12 uncharacterized protein LOC111484182

1.0e-73

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SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

Q96KR6 Protein FAM210B, mitochondrial

1.9e-08

33.98

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        E K +SK  Q K++  +YG   ++  I +SLIS  + Y ++S+GVD+ A+L K+G        K+     TF +AYA HK  +P+R   T+   P++  +
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Query:  IGK
          K
Subjt:  IGK

Q9D8B6 Protein FAM210B, mitochondrial

4.7e-07

31.68

Show/hide

Query:  GEGKNKSKGDQAKELLAKYGGAYLATSITLSLISFSLCYALISAGVDVQALLQKVGISLDETGEKV----GTFALAYAAHKAASPIRFPPTVALTPIVAS
        G  K  S+  Q K++  +YG   ++  I +SL+S  + Y ++S+G+D+ A+L K+G        K+     TF +AYA HK  +P+R   T+   P V  
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Query:  W
        +
Subjt:  W

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT2G20940.1 Protein of unknown function (DUF1279)

5.9e-05

30.77

Show/hide

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        KE++ KYG   L    ++S +S S  Y  I   VDV++LL+K               + + L+E G                G  ALA   +KA  PIR 
Subjt:  KELLAKYGGAYLATSITLSLISFSLCYALISAGVDVQALLQK---------------VGISLDETGEKV-------------GTFALAYAAHKAASPIRF

Query:  PPTVALTPIVASWIGKK
        P T+ALTP +A ++ ++
Subjt:  PPTVALTPIVASWIGKK

AT2G27290.1 Protein of unknown function (DUF1279)

4.8e-55

64.92

Show/hide

Query:  SSSNISFTHPNFRFLFNFPNPPLKFNSKPFRVQALKQNTGEIER---PSPSSSSSSSADEVTKKYGLEAGLWKIFSSKEEGEG------KNKSKGDQAKE
        SSS ++  +   RF     +  +  +SK FR +A+++   +I++   P  SS    SA+EVTKKYGLE GLWKI SSK++ EG      K KSK D+AKE
Subjt:  SSSNISFTHPNFRFLFNFPNPPLKFNSKPFRVQALKQNTGEIER---PSPSSSSSSSADEVTKKYGLEAGLWKIFSSKEEGEG------KNKSKGDQAKE

Query:  LLAKYGGAYLATSITLSLISFSLCYALISAGVDVQALLQKVGISLDETGEKVGTFALAYAAHKAASPIRFPPTVALTPIVASWIGKKVEKE
        LLAKYGGAYLATSITLSLISFSLCY L+++GVDVQALL KVGIS +ETGEKVG FALAYAAHKAASPIRFPPTVALTPIVA+WIGKKV+KE
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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGCAACTGCTTCTTCTCTAATTGCCTTTTCATCTTCTTCCAACATTTCCTTTACTCATCCAAATTTCAGATTTCTCTTCAATTTTCCTAACCCACCTCTCAAATTCAA
CTCTAAACCTTTCAGGGTTCAAGCCCTTAAACAGAATACCGGCGAAATCGAACGCCCATCTCCATCTTCCTCCTCTTCTTCTTCTGCAGATGAAGTTACCAAGAAATACG
GACTTGAAGCTGGTCTTTGGAAGATATTTAGCTCTAAGGAGGAGGGTGAAGGGAAAAACAAATCAAAGGGTGATCAAGCAAAAGAGTTGCTAGCAAAATATGGTGGTGCA
TATTTAGCCACCTCCATAACTCTATCCTTGATCTCTTTCTCTCTATGTTACGCTCTCATCAGTGCTGGTGTCGATGTTCAAGCTCTTCTGCAGAAGGTAGGAATTTCACT
TGATGAGACAGGAGAGAAAGTTGGAACATTTGCTTTGGCATATGCAGCACATAAAGCTGCTTCTCCAATAAGGTTTCCTCCAACAGTGGCTCTCACTCCAATTGTTGCAA
GTTGGATTGGGAAGAAAGTTGAGAAAGAGAATTAG

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

TTTTGTGTTTGAAAGTGTGTGAAGAACAATGGTGGTGACGACAGACGATTAAGCTTGGAAGCAAATATCTGGCTTACAATGCTTCACATAAATTTCTCTTTCTCTCTTGA
TTTTGTGGGATCCTTGTTTTTCCCTAAACCCAAACTCTCAATTCAGAGCCTATGTCTCATTAATAGATTTTGAGATTCCAACCTTTTATTTTCTGATAATGGCAACTGCT
TCTTCTCTAATTGCCTTTTCATCTTCTTCCAACATTTCCTTTACTCATCCAAATTTCAGATTTCTCTTCAATTTTCCTAACCCACCTCTCAAATTCAACTCTAAACCTTT
CAGGGTTCAAGCCCTTAAACAGAATACCGGCGAAATCGAACGCCCATCTCCATCTTCCTCCTCTTCTTCTTCTGCAGATGAAGTTACCAAGAAATACGGACTTGAAGCTG
GTCTTTGGAAGATATTTAGCTCTAAGGAGGAGGGTGAAGGGAAAAACAAATCAAAGGGTGATCAAGCAAAAGAGTTGCTAGCAAAATATGGTGGTGCATATTTAGCCACC
TCCATAACTCTATCCTTGATCTCTTTCTCTCTATGTTACGCTCTCATCAGTGCTGGTGTCGATGTTCAAGCTCTTCTGCAGAAGGTAGGAATTTCACTTGATGAGACAGG
AGAGAAAGTTGGAACATTTGCTTTGGCATATGCAGCACATAAAGCTGCTTCTCCAATAAGGTTTCCTCCAACAGTGGCTCTCACTCCAATTGTTGCAAGTTGGATTGGGA
AGAAAGTTGAGAAAGAGAATTAGTATGTCTTACTTTGAGAGTACAAAGTTATTTGTTAGAGTTGTTATCTAAAGTTACTTGATAGTGTATATTGGGTTTAATCCTAATCC
CATGTAGATTGTATACTAATGAGTTATAATGTATCCATCCTTTTTGAATCATAGCTAATGGTTCCGGCATTTAGGAGTCTTTAAGATTGATGATTTTACTCAATCATTTG
GTCATTTAGTTCCACCCATTTCCAAATGATGCATTGAGGAAAATGGAGAATAGCGACACAAATGAAGAATGAACAAAAGAAAATTAAGAATCATTTCGGATAATGATGAT
GTAAATAAGAGAGCAAAATTCTTCAAGTGTCAAAAATGGGGCAATAACCATTTCTGTTGTTCAA

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MATASSLIAFSSSSNISFTHPNFRFLFNFPNPPLKFNSKPFRVQALKQNTGEIERPSPSSSSSSSADEVTKKYGLEAGLWKIFSSKEEGEGKNKSKGDQAKELLAKYGGA
YLATSITLSLISFSLCYALISAGVDVQALLQKVGISLDETGEKVGTFALAYAAHKAASPIRFPPTVALTPIVASWIGKKVEKEN

PI0000458 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome