; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0000628 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0000628
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Descriptionglycine-rich cell wall structural protein 1-like
Genome locationchr05:20489800..20490793
RNA-Seq ExpressionPI0000628
SyntenyPI0000628
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8647333.1 hypothetical protein Csa_003353 [Cucumis sativus]1.1e-3563.49Show/hide
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        G  A G+IFGRGG+  G+IL RGGEA+GE +GRGGEA+GEI GRGG KATGEI GRGGEA+GE +GRGGKA+GEIFGRGG AIGEIVGRG    +G   G
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          +GRGG+ +GEI+G GG   G+  G GG       G GG  +G   GRG      GGGGGGGRG+GGGGGR  GGGGGGGR +GGGGG
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TYK13397.1 glycine-rich cell wall structural protein 1.8-like [Cucumis melo var. makuwa]2.1e-5075.37Show/hide
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        L  GG AMGEI GRGGEAMGEILGRGGEA+GE++GRGGEA+GEIIGRGGE A GEI GRGGEAMGEILGRGGKAMGEI GRGGEAIGEIVGRGG D IGE
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        IFGRG        GRGGEA+GEI+GRGG+  AIGEI+GRGGK +GEI GRGG+AIGEI GRGV IG ++G GG  GG  IGG   GG VIGG G  GG V
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        IGG
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XP_011658456.2 chromatin target of PRMT1 protein [Cucumis sativus]9.0e-3865.52Show/hide
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        G  A G+IFGRGG+  G+IL RGGEA+GE +GRGGEA+GEI GRGG KATGEI GRGGEA+GE +GRGGKA+GEI GRGG A+GEI              
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          +GRGGE +GE +GRGG+AIGEI GRGG+ MGEILGRGGE +GE
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XP_016900727.1 PREDICTED: glycine-rich cell wall structural protein 1-like [Cucumis melo]3.2e-5174.23Show/hide
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        L  GG A GEI GRGGEAMGEILGRGG+A+GE++GRGGEAIGEI+GRGG K  GEIFGRGGEAMGEI GRGG+AMGEI GRGG+AIGEI+GRGG +AIGE
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        IFGRGVGRGG+AIGEI GRGG+AIGEI GRG  + G +LGRGG+         V+GGI GGGGGGGRGIGGGGGR   VIGG   GG VIGG G
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XP_031742894.1 glycine-rich cell wall structural protein 1.8-like [Cucumis sativus]2.1e-5055.32Show/hide
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        +  GG A+GEIFGRGG AMGEILGRGGE +GE +GRGG+AIGEI GRGG +A GEI GRGGE +GE +GRGGKA+GEIFGRGG A+GEI+GRGG + +GE
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          GRG        GRGG A+GEI+GRGGE +GE +GRGGK +GEI GRGG AIGEIVGRGV  G M                              GGGG
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        GGGRG+GGGGGR  GGGGGGGR +GGGGG                            VVSEEEE    EEE+G    RR  R
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KHS4 Pollen coat oleosin-glycine rich protein3.7e-5365.3Show/hide
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        +  GG A+GEIFGRGG AMGE+LGRGGE +GE +GRGG+AIGEI GRGG +A GEI GRGGE +GE +GRGGKA+GEIFGRGG A+GEI+GRGG+     
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              AIGEIFGRG       +GRGGE +GE +GRGG+AIGEI GRGG+ MGEILGRGGE +GE +GRG          GG  GGGGGGGRG+  GGGG
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        GR +GGGGGGGR +GGGGG
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A0A1S4DXM4 glycine-rich cell wall structural protein 1-like1.5e-5174.23Show/hide
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        L  GG A GEI GRGGEAMGEILGRGG+A+GE++GRGGEAIGEI+GRGG K  GEIFGRGGEAMGEI GRGG+AMGEI GRGG+AIGEI+GRGG +AIGE
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        IFGRGVGRGG+AIGEI GRGG+AIGEI GRG  + G +LGRGG+         V+GGI GGGGGGGRGIGGGGGR   VIGG   GG VIGG G
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A0A5A7UQF2 Glycine-rich cell wall structural protein 1.8-like1.5e-2257.29Show/hide
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        GG   GE  GRG + +GE   RGG+ IGE   RGG+ IGE  GR G K  GE  GRG EA+GEILGR G+A+GEIFGRGGEA+GEI+GR G +A+GEI  
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          +GRGGEA+GE++GRGGEAIGEI+GRGG  MGEILGRGG   G ++G   +GGI+ GG       G  GG VIGG   G R I G  G ++
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A0A5D3BMR9 Glycine-rich cell wall structural protein 1-like2.8e-2985.11Show/hide
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A0A5D3CNE0 Glycine-rich cell wall structural protein 1.8-like1.0e-5075.37Show/hide
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        IGG
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G23450.1 unknown protein1.1e-0645.88Show/hide
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        G  +G   G+GG  +G  +G+GG  IG  +G+GG  IG  IG+GG    G   G+GG   G I   GG   G  FG+GG  IG  +G+GG    G  FG+
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        G G G     G  IG   G+GG   G I G GG   G   G+GG  IG  +G+G  GG  GGGG G G GIGGGGG   GGG GGG   GGGGG
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AT4G01985.1 unknown protein5.3e-0440.91Show/hide
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        GG   G   G GG   G + G  G A+G  VG GG   G  +G GG  + G   G  G A G   G GG   A G + G  G  +G  VG G   A+G  
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         G  VG GG   G  VG GG   G   G   GG   G   G  G A G + G G  GG +G GGG G G+GGG G  +GG  GG  G  +GGGGG  V
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCTATTGGTGAGATATTTGGACGAGGGTGGTAATGCTATGGGTGAGATATTTGGACGAGGGGGTGAAGCTATGGGTGAAATATTGGGACGAGGGGGTGAAGCTATTGG
TGAAATGGTGGGACGAGGCGGTGAAGCTATTGGTGAAATAATAGGTCGAGGCGGTGAAAAAGCTACTGGTGAGATATTTGGACGCGGAGGTGAAGCTATGGGTGAAATAT
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GAGGAGGAGGAGGAGGCGGACGTGTTATCGGAGGAGGAGGAGGGGCGGACGTTGTATCGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGACGAAGAGGAAAAAGGGTGGGAATCTTAT
AGGAGGAATAATAGGAGGGAGACGAATAGGAGTTATAGGAGGGAGACGAATAGGAGTTATTGGAGGGAGACGAATAGGAGTTATAGGGGGGAGACGAATAGGAGTTATAG
GGGGGAGACGAATAATAGGTGTGAATGGAGTGAATATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCTATTGGTGAGATATTTGGACGAGGGTGGTAATGCTATGGGTGAGATATTTGGACGAGGGGGTGAAGCTATGGGTGAAATATTGGGACGAGGGGGTGAAGCTATTGG
TGAAATGGTGGGACGAGGCGGTGAAGCTATTGGTGAAATAATAGGTCGAGGCGGTGAAAAAGCTACTGGTGAGATATTTGGACGCGGAGGTGAAGCTATGGGTGAAATAT
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GAGGAGGAGGAGGAGGCGGACGTGTTATCGGAGGAGGAGGAGGGGCGGACGTTGTATCGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGACGAAGAGGAAAAAGGGTGGGAATCTTAT
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
MLLVRYLDEGGNAMGEIFGRGGEAMGEILGRGGEAIGEMVGRGGEAIGEIIGRGGEKATGEIFGRGGEAMGEILGRGGKAMGEIFGRGGEAIGEIVGRGGDDAIGEIFGR
GVGRGGEAIGEIVGRGGEAIGEILGRGGKVMGEILGRGGEAIGEIVGRGVIGGIMGGGGGGGRGIGGGGGRVIGGGGGGGRVIGGGGGADVVSEEEEEEEDEEEKGWESY
RRNNRRETNRSYRRETNRSYWRETNRSYRGETNRSYRGETNNRCEWSEY