CuGenDBv2

Gene ID	PI0000720
Organism	Cucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Description	Cytochrome c biogenesis protein CcsA
Genome location	tig00003741:98972..100713
RNA-Seq Expression	PI0000720
Synteny	PI0000720
Gene Ontology terms	GO:0017004 - cytochrome complex assembly (biological process) GO:0009535 - chloroplast thylakoid membrane (cellular component) GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component) GO:0020037 - heme binding (molecular function)
InterPro domains	IPR002541 - Cytochrome c assembly protein IPR017562 - Cytochrome c-type biogenesis protein CcsA IPR045062 - Cytochrome c-type biogenesis protein CcsA/CcmC

Homology

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QZL38644.1 cytochrome c biogenesis protein [Citrullus naudinianus]

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A0A1P8C7U2 Cytochrome c biogenesis protein CcsA

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A0A1X9Q192 Cytochrome c biogenesis protein CcsA

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A0A218KGA3 Cytochrome c biogenesis protein CcsA

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A0A343UM82 Cytochrome c biogenesis protein CcsA

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W8E717 Cytochrome c biogenesis protein CcsA

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Q09WW9 Cytochrome c biogenesis protein CcsA

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Q0ZIW9 Cytochrome c biogenesis protein CcsA

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        +NTSF S +NYY++Q IQQLD+WSYR+ISLGF+FL+IGILSGAVWANE WGSYWNWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKN +  NSAIVASMGFLIIWI
Subjt:  RNTSFFSSKNYYKSQLIQQLDYWSYRIISLGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYWNWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKNFEGVNSAIVASMGFLIIWI

Query:  CYFGVNLLGIGLHSYGSFTLTSN
        CYFGVNLLGIGLHSYGSFT +SN
Subjt:  CYFGVNLLGIGLHSYGSFTLTSN

Q2QD41 Cytochrome c biogenesis protein CcsA

6.7e-176

98.14

Show/hide

Query:  MIFSTFEHILTHISFSVISIVITIQLITLLINETVGLYVSSEKGMIATFFCITGLLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSWGFSIIHLFTYFKKYKNHLSV
        MIFSTFEHILTHISFSVISIVITIQLITLLINETVGLYVSSEKGMIATFFCITGLLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSW FSIIHLFTYFKKYKNHLSV
Subjt:  MIFSTFEHILTHISFSVISIVITIQLITLLINETVGLYVSSEKGMIATFFCITGLLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSWGFSIIHLFTYFKKYKNHLSV

Query:  SAITAPSTIFTQGFATSGFLTEMHQSPLLVPALQSHWLMMHVSMMVLGYAALLCGSLFSVALIVITFQKAIRIFGKNNNLLNALFSFDKIQYINEGNSFV
        SAITAPSTIFTQGFATSGFLTEMHQSPLLVPALQSHWLMMHVSMMVLGYAALLCGSLFSVALIVITFQKAIRIF KNNNLLNALFSF++IQYINEGN FV
Subjt:  SAITAPSTIFTQGFATSGFLTEMHQSPLLVPALQSHWLMMHVSMMVLGYAALLCGSLFSVALIVITFQKAIRIFGKNNNLLNALFSFDKIQYINEGNSFV

Query:  RNTSFFSSKNYYKSQLIQQLDYWSYRIISLGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYWNWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKNFEGVNSAIVASMGFLIIWI
        RNTSFFSSKNYYKSQLIQQLD+WSYRIISLGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYWNWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKNFEGVNSAIVASMGFLIIWI
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Query:  CYFGVNLLGIGLHSYGSFTLTSN
        CYFGVNLLGIGLHSYGSFTLTSN
Subjt:  CYFGVNLLGIGLHSYGSFTLTSN

Q49KU9 Cytochrome c biogenesis protein CcsA

7.0e-141

79.69

Show/hide

Query:  MIFSTFEHILTHISFSVISIVITIQLITLLINETVGLYVSSEKGMIATFFCITGLLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSWGFSIIHLFTYFKKYKNHLSV
        MIFST EHILTHISFS+ISIVITI LI+L ++E VGLY SSEKGM ATFFCITGLLVTRWIY  H PLSDLYESL+FLSW FS+IH+  YFKK+KN+L  
Subjt:  MIFSTFEHILTHISFSVISIVITIQLITLLINETVGLYVSSEKGMIATFFCITGLLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSWGFSIIHLFTYFKKYKNHLSV

Query:  SAITAPSTIFTQGFATSGFLTEMHQSPLLVPALQSHWLMMHVSMMVLGYAALLCGSLFSVALIVITFQKAIRIFGKNNNLLNALFSFDKIQYINEGNSFV
        S ITAPSTIFTQGFATSG LTEMHQS ++VPALQS WLMMHVSMM+LGYAALLCGSL SVAL+VIT +KAIR+F K NN LN  FSF +IQY+NE ++ +
Subjt:  SAITAPSTIFTQGFATSGFLTEMHQSPLLVPALQSHWLMMHVSMMVLGYAALLCGSLFSVALIVITFQKAIRIFGKNNNLLNALFSFDKIQYINEGNSFV

Query:  RNTSFFSSKNYYKSQLIQQLDYWSYRIISLGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYWNWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKNFEGVNSAIVASMGFLIIWI
          TSF SS+NYY++QLIQQLD WSYRIISLGF+FL+IGILSGAVWANE WGSYWNWDPKETWAFITWT+FAIYLHTRTNKN+E  N AIVAS+GFLIIWI
Subjt:  RNTSFFSSKNYYKSQLIQQLDYWSYRIISLGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYWNWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKNFEGVNSAIVASMGFLIIWI

Query:  CYFGVNLLGIGLHSYGSFTL
        CYFGVNLLGIGLHSYGSF L
Subjt:  CYFGVNLLGIGLHSYGSFTL

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

ATCG01040.1 Cytochrome C assembly protein

5.6e-125

70.95

Show/hide

Query:  MIFSTFEHILTHISFSVISIVITIQLITLLIN--ETVGLYVSSEKGMIATFFCITGLLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSWGFSIIHLFTYFKKYKNHL
        MIFS  EHILTHISFSV+SIV+TI  +TLL+N  E +G + SS+KG+I TFF ITGLL+TRWIY  H PLS+LYESL+FLSW FSIIH+ +YF K K   
Subjt:  MIFSTFEHILTHISFSVISIVITIQLITLLIN--ETVGLYVSSEKGMIATFFCITGLLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSWGFSIIHLFTYFKKYKNHL

Query:  SVSAITAPSTIFTQGFATSGFLTEMHQSPLLVPALQSHWLMMHVSMMVLGYAALLCGSLFSVALIVITFQKAIRIFG----KNNNLLNALFSFDKIQYIN
         ++ ITAPS IF QGFATSG L +M QS +LVPALQS WLMMHVSMM+LGY ALLCGSL S+AL+VITF+K    F     K N LLN LFSFD + YIN
Subjt:  SVSAITAPSTIFTQGFATSGFLTEMHQSPLLVPALQSHWLMMHVSMMVLGYAALLCGSLFSVALIVITFQKAIRIFG----KNNNLLNALFSFDKIQYIN

Query:  EGNSFV--RNTSFFSSKNYYKSQLIQQLDYWSYRIISLGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYWNWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKNFEGVNSAIVAS
        E NS +  +N +F  S+NYY+ QLIQQLD+WS+RIISLGFIFL++GILSGAVWANETWGSYWNWDPKETWAFITWTIFAIYLH +TN+N  G+NSAIVA 
Subjt:  EGNSFV--RNTSFFSSKNYYKSQLIQQLDYWSYRIISLGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYWNWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKNFEGVNSAIVAS

Query:  MGFLIIWICYFGVNLLGIGLHSYGSFT
        +GF++IWICYFGVNLLGIGLHSYGSFT
Subjt:  MGFLIIWICYFGVNLLGIGLHSYGSFT

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGATATTTTCAACTTTCGAACATATATTAACTCATATATCTTTTTCGGTCATTTCAATTGTCATTACAATTCAGTTAATAACCTTATTAATCAATGAAACCGTAGGACT
CTACGTTTCGTCAGAAAAGGGCATGATAGCTACTTTTTTCTGTATAACAGGATTATTAGTTACTCGTTGGATTTATTTGAGGCATTTACCATTAAGTGATTTATATGAAT
CATTACTATTTCTTTCATGGGGTTTCTCCATTATTCATCTATTTACGTACTTTAAAAAATATAAAAACCATTTAAGTGTAAGCGCAATAACCGCGCCAAGTACTATTTTT
ACACAAGGTTTTGCTACTTCCGGTTTTTTAACTGAAATGCATCAATCCCCACTATTAGTTCCCGCTCTTCAATCTCATTGGTTAATGATGCACGTAAGTATGATGGTATT
AGGTTATGCAGCTCTTTTATGTGGATCATTATTTTCAGTAGCTCTTATAGTGATTACATTTCAAAAAGCTATAAGAATTTTTGGTAAAAACAATAATTTATTAAACGCGT
TATTTTCCTTTGATAAGATCCAATACATCAACGAAGGGAACTCTTTTGTAAGAAACACTTCCTTTTTTTCTTCGAAGAATTATTATAAGTCTCAACTGATTCAACAATTA
GATTATTGGAGTTATCGTATTATTAGTCTAGGGTTTATCTTTTTAAGCATAGGTATTCTTTCAGGGGCAGTATGGGCTAATGAGACATGGGGATCGTATTGGAATTGGGA
CCCAAAGGAAACTTGGGCATTTATTACTTGGACTATATTCGCAATTTATTTACATACGCGAACAAATAAAAATTTTGAAGGTGTAAATTCCGCAATTGTGGCCTCTATGG
GTTTTCTTATAATTTGGATATGCTATTTTGGGGTCAATCTATTAGGGATAGGGCTACATAGTTATGGTTCATTTACATTAACATCTAATTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

CCCCACTAAACCAAAAAGTTTTTGTTTATTTTTTCATTTTATTACATATTTTAGATATTATATAGTAAATATAGAAGATCAAATAGTAAACTGAAACTCTTTATTAAAAA
TTTAATGAGACATTGAAACGATGACATTAGTTGATTAAGTTAAAACCTTCTTTTTGAATTCTATGAACCCTTACCTTATTTCTTTTTTCGAAATCATTATTACTATTATA
GAATATATCCCGCCGAATAATTGGTTTGCAAAATCCTATAAAATCAAACTATTTTTAAATGAATAAAATTGACACCTTAAATTCTTATTGAAATAAATGAAATCGGATAA
TATTTTTATTGGAAACGCTCAAATCTCCTATTATTTTCCCTTTAATGAATTTTTCATTTAAAGATATAGAATTTTTTATCCACGATAAATATTTTGTAAAAAATATTCCA
TTGAATTGCAAATTCATTCTATTTTTTCAATCTCGACGATTGAATAATAATAGGTTATTATGATTTCGAGAAAGCCGCTATGGTGAAATCGGTAGACACGCTGCTCTTAG
GAAGCAGTGCTAGAGCATCTCGGTTCGAGTCCGAGTGGCGGCATGCCATTTTTAATTATAAAAAAAAGTTCTATAATATAATTAATTCAAGTCCCAGATATTAATTCAAA
TAATTGAATTGAGGGACCTTTAAATTTATTTTTTTATGATATTTTCAACTTTCGAACATATATTAACTCATATATCTTTTTCGGTCATTTCAATTGTCATTACAATTCAG
TTAATAACCTTATTAATCAATGAAACCGTAGGACTCTACGTTTCGTCAGAAAAGGGCATGATAGCTACTTTTTTCTGTATAACAGGATTATTAGTTACTCGTTGGATTTA
TTTGAGGCATTTACCATTAAGTGATTTATATGAATCATTACTATTTCTTTCATGGGGTTTCTCCATTATTCATCTATTTACGTACTTTAAAAAATATAAAAACCATTTAA
GTGTAAGCGCAATAACCGCGCCAAGTACTATTTTTACACAAGGTTTTGCTACTTCCGGTTTTTTAACTGAAATGCATCAATCCCCACTATTAGTTCCCGCTCTTCAATCT
CATTGGTTAATGATGCACGTAAGTATGATGGTATTAGGTTATGCAGCTCTTTTATGTGGATCATTATTTTCAGTAGCTCTTATAGTGATTACATTTCAAAAAGCTATAAG
AATTTTTGGTAAAAACAATAATTTATTAAACGCGTTATTTTCCTTTGATAAGATCCAATACATCAACGAAGGGAACTCTTTTGTAAGAAACACTTCCTTTTTTTCTTCGA
AGAATTATTATAAGTCTCAACTGATTCAACAATTAGATTATTGGAGTTATCGTATTATTAGTCTAGGGTTTATCTTTTTAAGCATAGGTATTCTTTCAGGGGCAGTATGG
GCTAATGAGACATGGGGATCGTATTGGAATTGGGACCCAAAGGAAACTTGGGCATTTATTACTTGGACTATATTCGCAATTTATTTACATACGCGAACAAATAAAAATTT
TGAAGGTGTAAATTCCGCAATTGTGGCCTCTATGGGTTTTCTTATAATTTGGATATGCTATTTTGGGGTCAATCTATTAGGGATAGGGCTACATAGTTATGGTTCATTTA
CATTAACATCTAATTGAATAAAGGGCTTGACGAACACAAACATGGGAGAGTATAGATAATAAAACTGTGTGTAAGACATCGAGAACCCTTTG

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MIFSTFEHILTHISFSVISIVITIQLITLLINETVGLYVSSEKGMIATFFCITGLLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSWGFSIIHLFTYFKKYKNHLSVSAITAPSTIF
TQGFATSGFLTEMHQSPLLVPALQSHWLMMHVSMMVLGYAALLCGSLFSVALIVITFQKAIRIFGKNNNLLNALFSFDKIQYINEGNSFVRNTSFFSSKNYYKSQLIQQL
DYWSYRIISLGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYWNWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKNFEGVNSAIVASMGFLIIWICYFGVNLLGIGLHSYGSFTLTSN

PI0000720 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome