CuGenDBv2

Gene ID	PI0000908
Organism	Cucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Description	PIG-H domain-containing protein
Genome location	chr06:30744664..30747246
RNA-Seq Expression	PI0000908
Synteny	PI0000908
Gene Ontology terms	GO:0006506 - GPI anchor biosynthetic process (biological process) GO:0000506 - glycosylphosphatidylinositol-N-acetylglucosaminyltransferase (GPI-GnT) complex (cellular component) GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component) GO:0017176 - phosphatidylinositol N-acetylglucosaminyltransferase activity (molecular function)
InterPro domains	IPR019328 - GPI-GlcNAc transferase complex, PIG-H component, conserved domain IPR044215 - Phosphatidylinositol N-acetylglucosaminyltransferase subunit H

Homology

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GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAA0052912.1 phosphatidylinositol N-acetylglucosaminyltransferase subunit H [Cucumis melo var. makuwa]

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XP_004146178.1 uncharacterized protein LOC101204797 isoform X2 [Cucumis sativus]

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XP_008448466.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103490645 [Cucumis melo]

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XP_031738140.1 uncharacterized protein LOC101204797 isoform X1 [Cucumis sativus]

1.0e-90

86.6

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XP_038876673.1 uncharacterized protein LOC120069067 [Benincasa hispida]

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        M KFSI+D RYGYFSD KWPSEAV +HHVVVLRN + E GFLFC FAAL FCFFLLKGQSIFVALWCLVLNVFF KKLFKG VEKE+V+V+PNFGVQLET
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TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0L3J5 PIG-H domain-containing protein

6.4e-94

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A0A1S3BKL9 uncharacterized protein LOC103490645

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A0A5A7UB03 Phosphatidylinositol N-acetylglucosaminyltransferase subunit H

3.0e-91

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A0A6J1G4Q1 uncharacterized protein LOC111450501

1.5e-74

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        MAKFSI+D RYGYFSD KW SEAV +HHVVVLRN +   GFLF + AAL FCFF+LKGQSIFV LWC +LNV F KKLFKG V+KESV+VMPNFGVQLET
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        H+ SGKVI RFVPVDKILKPVLLEC+TPVTCYWSLSLI+QGED+LLLVFKELRPP KML+PIWKALC      KN DACS
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A0A6J1I1U0 uncharacterized protein LOC111470129

3.3e-74

78.89

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        MAKFSI+D RYGYFSD KW SEAV +HHVVVLRN +   GFLF + AAL FCFF+LKGQSIFV LWC VLNV F KKLFKG VEKESV+VMPNFGVQLET
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        H+ SGKVI RFVPVDKILKPVL EC+TPVTCYWSLSLI+QGED+LLLVFKELRPP KML+PIWKALC      KN DACS
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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT4G35530.1 phosphatidylinositolglycan-related

5.1e-43

47.31

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        M   S+S++RY Y   S  K   EA+ +HHV++  N ++  G+        F VF A    F L K        W  +L+ F      +  V+KESV+++
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Query:  PNFGVQLETHFRSGKVIRRFVPVDKILKPVLLECLTPVTCYWSLSLIVQGEDELLLVFKELRPPAKMLIPIWKALCTATGDDKNGD
        P FG+QLET + SGK + RF+P+DKILKPVL+EC+TP+TCYWSLSL ++GE++L LVFKELRPP KML+PIWKALC A G D   +
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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGCCAAGTTTTCCATTTCGGATCGGAGATATGGCTACTTTTCCGATTGTAAATGGCCTTCTGAAGCAGTTCATGTCCACCACGTTGTTGTTCTTAGGAATACGACTGC
TGAAAATGGTTTCCTCTTCTGCGTTTTTGCAGCCCTTGTCTTCTGTTTTTTCCTACTCAAGGGCCAATCGATCTTTGTTGCCTTATGGTGCTTGGTCTTGAATGTATTCT
TTTTCAAGAAGTTGTTCAAGGGGAGGGTTGAGAAAGAGAGTGTTGTGGTTATGCCAAATTTTGGAGTCCAACTTGAAACTCACTTTCGTAGTGGAAAAGTCATTCGTCGG
TTTGTGCCTGTTGATAAAATTTTAAAACCAGTTCTCCTTGAATGCCTAACTCCAGTTACTTGTTACTGGAGTCTGTCTTTGATTGTACAAGGGGAAGACGAACTATTGTT
GGTTTTCAAGGAATTACGTCCACCAGCGAAAATGCTGATCCCTATCTGGAAGGCTTTATGTACAGCTACCGGTGATGATAAAAATGGAGATGCTTGTTCATAA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

CAATTCTCGATTACTCCGGTGGCGAAGCGGGAAGTGCTGGCGGCGGTCTAAGAGAGCTCTCTCGTCCAGCCATCACTATTACTGAACCTCATCTCAATCTTCTTCAGGTC
ACACCATCAATTTCAAGTTTCAACTTCTTTTTACAATTCTCAATTGCCTCGATAATATGGATCATTCCTCTTATCTTGATCTTCTTCCTCGAACATTTTGAAGAATGCTA
AATGGCCAAGTTTTCCATTTCGGATCGGAGATATGGCTACTTTTCCGATTGTAAATGGCCTTCTGAAGCAGTTCATGTCCACCACGTTGTTGTTCTTAGGAATACGACTG
CTGAAAATGGTTTCCTCTTCTGCGTTTTTGCAGCCCTTGTCTTCTGTTTTTTCCTACTCAAGGGCCAATCGATCTTTGTTGCCTTATGGTGCTTGGTCTTGAATGTATTC
TTTTTCAAGAAGTTGTTCAAGGGGAGGGTTGAGAAAGAGAGTGTTGTGGTTATGCCAAATTTTGGAGTCCAACTTGAAACTCACTTTCGTAGTGGAAAAGTCATTCGTCG
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CGGCAATTGTAGTTCCAGTGTATCATGTGAATTTGCCAACTCAATTTCTTCCTTTAGTCATGTATGTAAATGTATTAATTTTAGTAGTAACCTTGATTTTTTTCTCTTCC
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TTTAAATATTTAAATGTTAGTAGAACAAATTTAATATATAAAACCAAAAAACTAAACCGTTGTCAAGATTTGTTTTCAATACAATAATTGAGATCTCATTTTGAGTCTCC
CTTATTTTTAA

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MAKFSISDRRYGYFSDCKWPSEAVHVHHVVVLRNTTAENGFLFCVFAALVFCFFLLKGQSIFVALWCLVLNVFFFKKLFKGRVEKESVVVMPNFGVQLETHFRSGKVIRR
FVPVDKILKPVLLECLTPVTCYWSLSLIVQGEDELLLVFKELRPPAKMLIPIWKALCTATGDDKNGDACS

PI0000908 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome