; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0000919 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0000919
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Descriptionshort-chain dehydrogenase TIC 32, chloroplastic-like
Genome locationchr09:722130..727116
RNA-Seq ExpressionPI0000919
SyntenyPI0000919
Gene Ontology termsGO:0016491 - oxidoreductase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002347 - Short-chain dehydrogenase/reductase SDR
IPR036291 - NAD(P)-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
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XP_004145894.1 short-chain dehydrogenase TIC 32, chloroplastic [Cucumis sativus]6.2e-15890.58Show/hide
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XP_022922240.1 short-chain dehydrogenase TIC 32, chloroplastic-like isoform X2 [Cucurbita moschata]6.6e-15285.71Show/hide
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A0A0A0KQF8 Uncharacterized protein3.0e-15890.58Show/hide
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A0A1S3AUS1 short-chain dehydrogenase TIC 32, chloroplastic-like1.6e-15991.19Show/hide
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A0A6J1E611 short-chain dehydrogenase TIC 32, chloroplastic-like isoform X13.2e-15285.71Show/hide
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A0A6J1E865 short-chain dehydrogenase TIC 32, chloroplastic-like isoform X23.2e-15285.71Show/hide
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A0A6J1IA71 short-chain dehydrogenase TIC 32, chloroplastic-like isoform X21.2e-15185.11Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A0A078IS66 Short-chain dehydrogenase TIC 32 A, chloroplastic1.8e-8351.23Show/hide
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A0A078ISJ6 Short-chain dehydrogenase TIC 32 B, chloroplastic2.1e-8451.7Show/hide
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A2RVM0 Short-chain dehydrogenase TIC 32, chloroplastic2.1e-10864.02Show/hide
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        MW F  KG SGFSS STAEEVT G+DGTGLTAIVTGASSGIG ETARVL+LRGVHV+M VRN ++G  V+E IVK+ P AK+D MELDLSSM SVRKFAS
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Query:  DYQSSGFPLNILINNAGIMATPFGLSKDNIELQFATNHIGKPFPLTNLLLENMKKTAAESKKEGRIVNVSSEAHRYTYPEGIRFDGINDESRYNKMQAYG
        +Y+S+G PLN+LINNAGIMA PF LSKDNIELQFATNH+G  F LT LLL+ MK T+ ESK+EGRIVN+SSEAHR++YPEG+RFD IND+S Y+ M+AYG
Subjt:  DYQSSGFPLNILINNAGIMATPFGLSKDNIELQFATNHIGKPFPLTNLLLENMKKTAAESKKEGRIVNVSSEAHRYTYPEGIRFDGINDESRYNKMQAYG

Query:  QSKLSNILHANELTRRFKTVVANHLNLVVSSCTGRGIKHNCKLTPPGIITTNLFRHFN-YGNGIVNTVGKIMFKNVQQGAATTCYVALHPQVKGVSGEYF
        QSKL N+LHANELT++ K                 G+        PG I TNL R+FN Y    V  V K + K+V QGAATTCYVAL+PQV GVSGEYF
Subjt:  QSKLSNILHANELTRRFKTVVANHLNLVVSSCTGRGIKHNCKLTPPGIITTNLFRHFN-YGNGIVNTVGKIMFKNVQQGAATTCYVALHPQVKGVSGEYF

Query:  MNSNLHKATQHGQDMDLAKKLWEFTTNL
         +SN+ K     +D +LAKK+W+F+T L
Subjt:  MNSNLHKATQHGQDMDLAKKLWEFTTNL

Q6RVV4 Short-chain dehydrogenase TIC 32, chloroplastic3.1e-12067.88Show/hide
Query:  MWLF-RRKGPSGFSSSSTAEEVTDGIDGTGLTAIVTGASSGIGSETARVLALRGVHVIMGVRNLEAGRNVRETIVKENPSAKIDAMELDLSSMASVRKFA
        MW F  +KG SGFS SSTAE+VT GID TGLTAIVTGASSGIG+ET RVLALRG HVIMGVRN+ A ++V++TI+K+ PSAK+DA+ELDLSS+ SV+KFA
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Query:  SDYQSSGFPLNILINNAGIMATPFGLSKDNIELQFATNHIGKPFPLTNLLLENMKKTAAESKKEGRIVNVSSEAHRYTYPEGIRFDGINDESRYNKMQAY
        S++ SSG PLNILINNAGIMA PF LSKDNIELQFATNHIG  F LTNLLL+ MKKT  ESKKEGRIVNV+SEAHR+ YPEGIRFD IND+S YN  +AY
Subjt:  SDYQSSGFPLNILINNAGIMATPFGLSKDNIELQFATNHIGKPFPLTNLLLENMKKTAAESKKEGRIVNVSSEAHRYTYPEGIRFDGINDESRYNKMQAY

Query:  GQSKLSNILHANELTRRFKTVVANHLNLVVSSCTGRGIKHNCKLTPPGIITTNLFRHFNYGNGIVNTVGKIMFKNVQQGAATTCYVALHPQVKGVSGEYF
        GQSKL+N+LHAN+LT+  K                 G+        PG I TNLFRH +  NG++N +GK++ KNVQQGAATTCYVALHPQVKGVSGEYF
Subjt:  GQSKLSNILHANELTRRFKTVVANHLNLVVSSCTGRGIKHNCKLTPPGIITTNLFRHFNYGNGIVNTVGKIMFKNVQQGAATTCYVALHPQVKGVSGEYF

Query:  MNSNLHKATQHGQDMDLAKKLWEFTTNLLK
         +SN++K T HG+D+DLAKKLW+F+ NL+K
Subjt:  MNSNLHKATQHGQDMDLAKKLWEFTTNLLK

Q91WL8 WW domain-containing oxidoreductase3.4e-4235.05Show/hide
Query:  FSSSSTAEEVTDGIDGTGLTAIVTGASSGIGSETARVLALRGVHVIMGVRNLEAGRNVRETIVKENPSAKIDAMELDLSSMASVRKFASDYQSSGFPLNI
        +  S+TA E+  G D TG   +VTGA+SGIG ETA+  AL G HVI+  RNL         I++E   AK++AM LDL+ + SV+ FA  +++    L++
Subjt:  FSSSSTAEEVTDGIDGTGLTAIVTGASSGIGSETARVLALRGVHVIMGVRNLEAGRNVRETIVKENPSAKIDAMELDLSSMASVRKFASDYQSSGFPLNI

Query:  LINNAGIMATPFGLSKDNIELQFATNHIGKPFPLTNLLLENMKKTAAESKKEGRIVNVSSEAHRYTYPEGIRFDGIND-------------ESRYNKMQA
        L+ NAG  A P+GL+KD +E  F  NH+G  F L  LL + + +++       R++ VSSE+HR+T         IND              S Y  M A
Subjt:  LINNAGIMATPFGLSKDNIELQFATNHIGKPFPLTNLLLENMKKTAAESKKEGRIVNVSSEAHRYTYPEGIRFDGIND-------------ESRYNKMQA

Query:  YGQSKLSNILHANELTRRFKTVVANHLNLVVSSCTGRGIKHNCKLTPPGIITTNLFRHFNYGNGIVNTVGKIMFKNVQQGAATTCYVALHPQVKGVSGEY
        Y +SKL NIL +NEL RR                + RG+  N     PG +  +     ++   ++ T+ +   K++QQGAATT Y A+ P+++G+ G Y
Subjt:  YGQSKLSNILHANELTRRFKTVVANHLNLVVSSCTGRGIKHNCKLTPPGIITTNLFRHFNYGNGIVNTVGKIMFKNVQQGAATTCYVALHPQVKGVSGEY

Query:  FMNSNLHKATQHGQDMDLAKKLWEFTTNLLK
        F N      ++  Q  + A+ LWE +  L++
Subjt:  FMNSNLHKATQHGQDMDLAKKLWEFTTNLLK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G11410.1 NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein6.1e-11164.83Show/hide
Query:  MWLFRRKGPSGFSSSSTAEEVTDGIDGTGLTAIVTGASSGIGSETARVLALRGVHVIMGVRNLEAGRNVRETIVKENPSAKIDAMELDLSSMASVRKFAS
        MW F  KG SGFS+ STAEEVT GIDGTGLTAIVTGASSGIG ET RVLALRGVHV+M VRN ++G  VR+ I+KE P AKID M+LDLSSMASVR FAS
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Query:  DYQSSGFPLNILINNAGIMATPFGLSKDNIELQFATNHIGKPFPLTNLLLENMKKTAAESKKEGRIVNVSSEAHRYTYPEGIRFDGINDESRYNKMQAYG
        +YQS   PLN+LINNAGIMA PF LS DNIELQFATNH+G  F LTNLLLE MKKTA+ES +EGRIV VSSE HR+ Y EG++FD INDE+RYN +QAYG
Subjt:  DYQSSGFPLNILINNAGIMATPFGLSKDNIELQFATNHIGKPFPLTNLLLENMKKTAAESKKEGRIVNVSSEAHRYTYPEGIRFDGINDESRYNKMQAYG

Query:  QSKLSNILHANELTRRFKTVVANHLNLVVSSCTGRGIKHNCKLTPPGIITTNLFRHFNYGNGIVNTVGKIMFKNVQQGAATTCYVALHPQVKGVSGEYFM
        QSKL NILHA EL R FK                +G+        PG I TNL R+ ++ N I N VGK + K++ QGAATTCY ALHPQ KGVSGEY M
Subjt:  QSKLSNILHANELTRRFKTVVANHLNLVVSSCTGRGIKHNCKLTPPGIITTNLFRHFNYGNGIVNTVGKIMFKNVQQGAATTCYVALHPQVKGVSGEYFM

Query:  NSNLHKATQHGQDMDLAKKLWEFTTNL
        ++N+      G+D DLAKKLWEF+  L
Subjt:  NSNLHKATQHGQDMDLAKKLWEFTTNL

AT4G23420.1 NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein6.1e-11164.94Show/hide
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        MW F  KG SGFSS STAEEVT G+DGTGLTAIVTGASSGIG ETARVLALRGVHV+M VRN  AG  V+E IVK+ P AK+D MEL+LSSM SVRKFAS
Subjt:  MWLFRRKGPSGFSSSSTAEEVTDGIDGTGLTAIVTGASSGIGSETARVLALRGVHVIMGVRNLEAGRNVRETIVKENPSAKIDAMELDLSSMASVRKFAS

Query:  DYQSSGFPLNILINNAGIMATPFGLSKDNIELQFATNHIGKPFPLTNLLLENMKKTAAESKKEGRIVNVSSEAHRYTYPEGIRFDGINDESRYNKMQAYG
        +Y+S+G PLN+LINNAGIMA PF LSKDNIELQFATNH+G  F LT LLL+ MK T+ ESK+EGRIVNVSSEAHRY+YPEG+RFD INDES Y+ ++AYG
Subjt:  DYQSSGFPLNILINNAGIMATPFGLSKDNIELQFATNHIGKPFPLTNLLLENMKKTAAESKKEGRIVNVSSEAHRYTYPEGIRFDGINDESRYNKMQAYG

Query:  QSKLSNILHANELTRRFKTVVANHLNLVVSSCTGRGIKHNCKLTPPGIITTNLFRHFN-YGNGIVNTVGKIMFKNVQQGAATTCYVALHPQVKGVSGEYF
        QSKL N+LHANEL ++ K                 G+        PG I TNL+ +FN Y  G V  V K M K+V QGAATTCYVAL+PQV GV+GEYF
Subjt:  QSKLSNILHANELTRRFKTVVANHLNLVVSSCTGRGIKHNCKLTPPGIITTNLFRHFN-YGNGIVNTVGKIMFKNVQQGAATTCYVALHPQVKGVSGEYF

Query:  MNSNLHKATQHGQDMDLAKKLWEFTTNL
         +SN+ K  +  +D +LAKKLW+F+T L
Subjt:  MNSNLHKATQHGQDMDLAKKLWEFTTNL

AT4G23420.2 NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein6.1e-11164.94Show/hide
Query:  MWLFRRKGPSGFSSSSTAEEVTDGIDGTGLTAIVTGASSGIGSETARVLALRGVHVIMGVRNLEAGRNVRETIVKENPSAKIDAMELDLSSMASVRKFAS
        MW F  KG SGFSS STAEEVT G+DGTGLTAIVTGASSGIG ETARVLALRGVHV+M VRN  AG  V+E IVK+ P AK+D MEL+LSSM SVRKFAS
Subjt:  MWLFRRKGPSGFSSSSTAEEVTDGIDGTGLTAIVTGASSGIGSETARVLALRGVHVIMGVRNLEAGRNVRETIVKENPSAKIDAMELDLSSMASVRKFAS

Query:  DYQSSGFPLNILINNAGIMATPFGLSKDNIELQFATNHIGKPFPLTNLLLENMKKTAAESKKEGRIVNVSSEAHRYTYPEGIRFDGINDESRYNKMQAYG
        +Y+S+G PLN+LINNAGIMA PF LSKDNIELQFATNH+G  F LT LLL+ MK T+ ESK+EGRIVNVSSEAHRY+YPEG+RFD INDES Y+ ++AYG
Subjt:  DYQSSGFPLNILINNAGIMATPFGLSKDNIELQFATNHIGKPFPLTNLLLENMKKTAAESKKEGRIVNVSSEAHRYTYPEGIRFDGINDESRYNKMQAYG

Query:  QSKLSNILHANELTRRFKTVVANHLNLVVSSCTGRGIKHNCKLTPPGIITTNLFRHFN-YGNGIVNTVGKIMFKNVQQGAATTCYVALHPQVKGVSGEYF
        QSKL N+LHANEL ++ K                 G+        PG I TNL+ +FN Y  G V  V K M K+V QGAATTCYVAL+PQV GV+GEYF
Subjt:  QSKLSNILHANELTRRFKTVVANHLNLVVSSCTGRGIKHNCKLTPPGIITTNLFRHFN-YGNGIVNTVGKIMFKNVQQGAATTCYVALHPQVKGVSGEYF

Query:  MNSNLHKATQHGQDMDLAKKLWEFTTNL
         +SN+ K  +  +D +LAKKLW+F+T L
Subjt:  MNSNLHKATQHGQDMDLAKKLWEFTTNL

AT4G23430.1 NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein1.8e-10763.72Show/hide
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        MW F  KG SGFSS STAEEVT G+DGTGLTAIVTGASSGIG ETARVL+LRGVHV+M VRN ++G  V+E IVK+ P AK+D MELDLSSM SVRKFAS
Subjt:  MWLFRRKGPSGFSSSSTAEEVTDGIDGTGLTAIVTGASSGIGSETARVLALRGVHVIMGVRNLEAGRNVRETIVKENPSAKIDAMELDLSSMASVRKFAS

Query:  DYQSSGFPLNILINNAGIMATPFGLSKDNIELQFATNHIGKPFPLTNLLLENMKKTAAESKKEGRIVNVSSEAHRYTYPEGIRFDGINDESRYNKMQAYG
        +Y+S+G PLN+LINNAGIMA PF LSKDNIELQFATNH+G  F LT LLL+ MK T+ ESK+EGRIVN+SSEAHR++YPEG+RFD IND+S  + M+AYG
Subjt:  DYQSSGFPLNILINNAGIMATPFGLSKDNIELQFATNHIGKPFPLTNLLLENMKKTAAESKKEGRIVNVSSEAHRYTYPEGIRFDGINDESRYNKMQAYG

Query:  QSKLSNILHANELTRRFKTVVANHLNLVVSSCTGRGIKHNCKLTPPGIITTNLFRHFN-YGNGIVNTVGKIMFKNVQQGAATTCYVALHPQVKGVSGEYF
        QSKL N+LHANELT++ K                 G+        PG I TNL R+FN Y    V  V K + K+V QGAATTCYVAL+PQV GVSGEYF
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Query:  MNSNLHKATQHGQDMDLAKKLWEFTTNL
         +SN+ K     +D +LAKK+W+F+T L
Subjt:  MNSNLHKATQHGQDMDLAKKLWEFTTNL

AT4G23430.2 NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein1.5e-10964.02Show/hide
Query:  MWLFRRKGPSGFSSSSTAEEVTDGIDGTGLTAIVTGASSGIGSETARVLALRGVHVIMGVRNLEAGRNVRETIVKENPSAKIDAMELDLSSMASVRKFAS
        MW F  KG SGFSS STAEEVT G+DGTGLTAIVTGASSGIG ETARVL+LRGVHV+M VRN ++G  V+E IVK+ P AK+D MELDLSSM SVRKFAS
Subjt:  MWLFRRKGPSGFSSSSTAEEVTDGIDGTGLTAIVTGASSGIGSETARVLALRGVHVIMGVRNLEAGRNVRETIVKENPSAKIDAMELDLSSMASVRKFAS

Query:  DYQSSGFPLNILINNAGIMATPFGLSKDNIELQFATNHIGKPFPLTNLLLENMKKTAAESKKEGRIVNVSSEAHRYTYPEGIRFDGINDESRYNKMQAYG
        +Y+S+G PLN+LINNAGIMA PF LSKDNIELQFATNH+G  F LT LLL+ MK T+ ESK+EGRIVN+SSEAHR++YPEG+RFD IND+S Y+ M+AYG
Subjt:  DYQSSGFPLNILINNAGIMATPFGLSKDNIELQFATNHIGKPFPLTNLLLENMKKTAAESKKEGRIVNVSSEAHRYTYPEGIRFDGINDESRYNKMQAYG

Query:  QSKLSNILHANELTRRFKTVVANHLNLVVSSCTGRGIKHNCKLTPPGIITTNLFRHFN-YGNGIVNTVGKIMFKNVQQGAATTCYVALHPQVKGVSGEYF
        QSKL N+LHANELT++ K                 G+        PG I TNL R+FN Y    V  V K + K+V QGAATTCYVAL+PQV GVSGEYF
Subjt:  QSKLSNILHANELTRRFKTVVANHLNLVVSSCTGRGIKHNCKLTPPGIITTNLFRHFN-YGNGIVNTVGKIMFKNVQQGAATTCYVALHPQVKGVSGEYF

Query:  MNSNLHKATQHGQDMDLAKKLWEFTTNL
         +SN+ K     +D +LAKK+W+F+T L
Subjt:  MNSNLHKATQHGQDMDLAKKLWEFTTNL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTGGTTATTCAGAAGAAAAGGGCCATCTGGATTTTCGTCTTCTTCCACTGCCGAGGAAGTTACTGATGGAATCGATGGCACTGGTCTTACCGCCATTGTTACAGGAGC
ATCAAGCGGTATTGGCTCTGAAACTGCGCGTGTTCTCGCACTACGTGGAGTCCATGTCATTATGGGTGTTAGGAATTTAGAAGCTGGTAGAAATGTCAGAGAAACCATCG
TCAAGGAGAATCCCTCTGCAAAAATTGATGCCATGGAGTTGGATCTTAGTTCTATGGCGTCTGTAAGAAAATTTGCCTCAGATTACCAGTCGTCTGGGTTTCCACTTAAC
ATCCTCATTAACAATGCAGGAATAATGGCAACCCCTTTTGGACTTTCAAAAGATAACATAGAGCTGCAATTTGCGACAAACCACATAGGTAAGCCATTTCCTTTGACAAA
TCTACTTTTGGAAAATATGAAGAAAACTGCCGCTGAAAGTAAGAAAGAAGGAAGAATTGTAAATGTCTCCTCGGAAGCTCATCGTTACACATATCCTGAAGGCATCCGAT
TCGATGGAATTAATGATGAATCAAGGTATAATAAAATGCAGGCTTATGGCCAGTCGAAGTTATCTAATATTCTGCATGCCAATGAACTTACCAGACGTTTCAAGACGGTT
GTGGCAAACCATTTAAATTTGGTGGTTTCTTCTTGCACAGGAAGAGGGATTAAACATAACTGCAAACTCACTCCACCGGGGATAATCACCACAAATCTTTTCCGCCACTT
CAATTATGGCAATGGTATAGTAAACACCGTCGGGAAAATCATGTTTAAAAATGTTCAACAGGGTGCAGCAACAACCTGCTATGTGGCATTGCATCCACAAGTAAAGGGAG
TGAGTGGTGAATATTTTATGAATAGTAACCTACACAAGGCAACCCAACATGGCCAGGATATGGACTTGGCTAAGAAACTTTGGGAGTTTACCACCAATTTACTCAAATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTGGTTATTCAGAAGAAAAGGGCCATCTGGATTTTCGTCTTCTTCCACTGCCGAGGAAGTTACTGATGGAATCGATGGCACTGGTCTTACCGCCATTGTTACAGGAGC
ATCAAGCGGTATTGGCTCTGAAACTGCGCGTGTTCTCGCACTACGTGGAGTCCATGTCATTATGGGTGTTAGGAATTTAGAAGCTGGTAGAAATGTCAGAGAAACCATCG
TCAAGGAGAATCCCTCTGCAAAAATTGATGCCATGGAGTTGGATCTTAGTTCTATGGCGTCTGTAAGAAAATTTGCCTCAGATTACCAGTCGTCTGGGTTTCCACTTAAC
ATCCTCATTAACAATGCAGGAATAATGGCAACCCCTTTTGGACTTTCAAAAGATAACATAGAGCTGCAATTTGCGACAAACCACATAGGTAAGCCATTTCCTTTGACAAA
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TCGATGGAATTAATGATGAATCAAGGTATAATAAAATGCAGGCTTATGGCCAGTCGAAGTTATCTAATATTCTGCATGCCAATGAACTTACCAGACGTTTCAAGACGGTT
GTGGCAAACCATTTAAATTTGGTGGTTTCTTCTTGCACAGGAAGAGGGATTAAACATAACTGCAAACTCACTCCACCGGGGATAATCACCACAAATCTTTTCCGCCACTT
CAATTATGGCAATGGTATAGTAAACACCGTCGGGAAAATCATGTTTAAAAATGTTCAACAGGGTGCAGCAACAACCTGCTATGTGGCATTGCATCCACAAGTAAAGGGAG
TGAGTGGTGAATATTTTATGAATAGTAACCTACACAAGGCAACCCAACATGGCCAGGATATGGACTTGGCTAAGAAACTTTGGGAGTTTACCACCAATTTACTCAAATAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MWLFRRKGPSGFSSSSTAEEVTDGIDGTGLTAIVTGASSGIGSETARVLALRGVHVIMGVRNLEAGRNVRETIVKENPSAKIDAMELDLSSMASVRKFASDYQSSGFPLN
ILINNAGIMATPFGLSKDNIELQFATNHIGKPFPLTNLLLENMKKTAAESKKEGRIVNVSSEAHRYTYPEGIRFDGINDESRYNKMQAYGQSKLSNILHANELTRRFKTV
VANHLNLVVSSCTGRGIKHNCKLTPPGIITTNLFRHFNYGNGIVNTVGKIMFKNVQQGAATTCYVALHPQVKGVSGEYFMNSNLHKATQHGQDMDLAKKLWEFTTNLLK