; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0001192 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0001192
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Description40S ribosomal protein S8
Genome locationchr05:5494145..5496563
RNA-Seq ExpressionPI0001192
SyntenyPI0001192
Gene Ontology termsGO:0000462 - maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) (biological process)
GO:0006412 - translation (biological process)
GO:0022627 - cytosolic small ribosomal subunit (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domainsIPR001047 - Ribosomal protein S8e
IPR018283 - Ribosomal protein S8e, conserved site
IPR022309 - Ribosomal protein S8e/ribosomal biogenesis NSA2


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0055563.1 40S ribosomal protein S8-like [Cucumis melo var. makuwa]7.4e-115100Show/hide
Query:  ISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKSAI
        ISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKSAI
Subjt:  ISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKSAI

Query:  VQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKELE
        VQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKELE
Subjt:  VQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKELE

Query:  FYMKKLQRKKGKGAGAA
        FYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  FYMKKLQRKKGKGAGAA

XP_004148331.1 40S ribosomal protein S8 [Cucumis sativus]1.9e-11599.09Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTR+LDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSAS KKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

XP_008451649.1 PREDICTED: 40S ribosomal protein S8-like [Cucumis melo]3.9e-116100Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

XP_022929761.1 40S ribosomal protein S8-like [Cucurbita moschata]4.0e-11397.72Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRR TGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTK+SSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRK+RILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKT ASAKKEEEGDA TEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

XP_038891236.1 40S ribosomal protein S8 [Benincasa hispida]3.1e-11397.72Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRR TGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKT ASAKK+EEGDA TEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQF SGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LJA0 40S ribosomal protein S89.4e-11699.09Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTR+LDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSAS KKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

A0A1S3BRZ4 40S ribosomal protein S81.9e-116100Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

A0A5A7UI08 40S ribosomal protein S83.6e-115100Show/hide
Query:  ISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKSAI
        ISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKSAI
Subjt:  ISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKSAI

Query:  VQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKELE
        VQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKELE
Subjt:  VQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKELE

Query:  FYMKKLQRKKGKGAGAA
        FYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  FYMKKLQRKKGKGAGAA

A0A5D3BT12 40S ribosomal protein S81.9e-116100Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

A0A6J1K537 40S ribosomal protein S82.0e-11397.72Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRR TGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTK+SSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRK+RILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKT ASAKKEEEGDA TEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O81361 40S ribosomal protein S84.4e-10286.82Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRR TGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSS+K++RRIRVRGGNVKWRA RLDTGN+SWGSEAVTRKTR+LDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAK-KEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGK
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGV+IGRKKKT+A+ K   EEG+A TEE KKSNHV  K+EKRQQ R LD HIEEQF  G+L+ACISSRPGQCG+ADG ILEGK
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAK-KEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGK

Query:  ELEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        ELEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  ELEFYMKKLQRKKGKGAGAA

P49199 40S ribosomal protein S82.6e-10287.78Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRR TGGK+KAWRKKRKYELGRQPANTKLSS+K++RR+RVRGGNVKWRA RLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKEEEG---DAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILE
        AIVQVDAAPFKQWYL HYGVDIGRKKK  A AKK+ EG   +A TEE KKSNHV RK+EKRQQ R LD HIEEQF SGRL+ACISSRPGQCGRADGYILE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKEEEG---DAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILE

Query:  GKELEFYMKKLQRKKGKGAGA
        GKELEFYMKKLQRKKGKGA A
Subjt:  GKELEFYMKKLQRKKGKGAGA

Q08069 40S ribosomal protein S89.7e-10285.97Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRR TGGK+KAWRKKRKYELGRQPANTKLSS+K++RR+RVRGGNVKWRA RLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKEEEG---DAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILE
        AIVQVDAAPFKQWYL HYGVDIGRKKKT A+ K   EG   +A  EE KKSNHV RK+EKR++ R LDPHIEEQF SGRL+ACISSRPGQCGRADGYILE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKEEEG---DAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILE

Query:  GKELEFYMKKLQRKKGKGAGA
        GKELEFYMKKLQRKKGK A A
Subjt:  GKELEFYMKKLQRKKGKGAGA

Q93VG5 40S ribosomal protein S8-13.2e-9781.45Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDS+HKRR TGGK+K WRKKRKYE+GRQPANTKLSS+K++RRIRVRGGNVKWRA RLDTGNYSWGSEA TRKTR+LDVVYNASNNELVRT+TLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKE-EEGD----AGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYI
        AIVQVDAAPFKQWYL HYGV++GRKKK+++S KK+ EEG+    A  EEVKKSNH+ RKI  RQ+ R LD HIE+QF+SGRL+ACISSRPGQCGRADGYI
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKE-EEGD----AGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYI

Query:  LEGKELEFYMKKLQRKKGKGA
        LEGKELEFYMKK+Q+KKGKGA
Subjt:  LEGKELEFYMKKLQRKKGKGA

Q9FIF3 40S ribosomal protein S8-22.5e-9784.02Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDS+HKRR TGGK+K WRKKRKYELGRQPANTKLSS+K++RRIRVRGGNVKWRA RLDTGN+SWGSEAVTRKTRILDV YNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQ YLQHYGVDIGRKKK  A           TEEVKKSNHVQRK+E RQ+ R LD H+EEQFSSGRL+ACI+SRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQ+KKGK AGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G20290.1 Ribosomal protein S8e family protein2.3e-9881.45Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDS+HKRR TGGK+K WRKKRKYE+GRQPANTKLSS+K++RRIRVRGGNVKWRA RLDTGNYSWGSEA TRKTR+LDVVYNASNNELVRT+TLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKE-EEGD----AGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYI
        AIVQVDAAPFKQWYL HYGV++GRKKK+++S KK+ EEG+    A  EEVKKSNH+ RKI  RQ+ R LD HIE+QF+SGRL+ACISSRPGQCGRADGYI
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKE-EEGD----AGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYI

Query:  LEGKELEFYMKKLQRKKGKGA
        LEGKELEFYMKK+Q+KKGKGA
Subjt:  LEGKELEFYMKKLQRKKGKGA

AT5G59240.1 Ribosomal protein S8e family protein1.8e-9884.02Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDS+HKRR TGGK+K WRKKRKYELGRQPANTKLSS+K++RRIRVRGGNVKWRA RLDTGN+SWGSEAVTRKTRILDV YNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQ YLQHYGVDIGRKKK  A           TEEVKKSNHVQRK+E RQ+ R LD H+EEQFSSGRL+ACI+SRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQ+KKGK AGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGTATTTCCCGTGATTCTATGCACAAAAGGCGTGAAACTGGAGGCAAGAAGAAGGCTTGGAGGAAGAAGCGAAAGTATGAGCTTGGAAGGCAACCTGCCAACACAAA
GTTATCCAGTGACAAGTCAATCAGGAGGATTAGAGTTCGAGGGGGTAATGTGAAGTGGCGTGCATTTAGGCTGGATACTGGAAACTACTCTTGGGGTAGTGAGGCCGTGA
CTAGAAAGACCCGTATTCTTGATGTGGTCTACAATGCATCTAACAATGAGCTTGTTCGTACTCAAACCTTAGTGAAGAGTGCCATAGTTCAAGTTGATGCAGCTCCATTT
AAGCAGTGGTATCTTCAGCATTATGGAGTGGATATTGGCAGGAAGAAGAAGACCTCTGCATCTGCTAAGAAGGAAGAGGAAGGTGATGCTGGCACTGAGGAGGTAAAAAA
GAGTAACCATGTCCAGCGCAAAATAGAGAAACGTCAGCAGGACCGTAAGCTCGACCCACATATTGAAGAACAATTCAGCAGTGGTCGTTTGATGGCTTGTATCTCATCAA
GGCCCGGTCAATGTGGCCGAGCAGATGGATATATTTTGGAGGGCAAAGAGCTCGAATTCTATATGAAGAAGCTCCAAAGAAAGAAGGGAAAAGGAGCTGGTGCTGCTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AACCTAACCCTCGCCGCATCAAAACCCCTCTTAGTCCCCTTCCAATCTCTCTCTCGACCTTCTCTGGATCGTTCAAGGAACCCTAGACTCGTCTTTACGCCGAGAGCTCT
CGTCTTACAAAGATGGGTATTTCCCGTGATTCTATGCACAAAAGGCGTGAAACTGGAGGCAAGAAGAAGGCTTGGAGGAAGAAGCGAAAGTATGAGCTTGGAAGGCAACC
TGCCAACACAAAGTTATCCAGTGACAAGTCAATCAGGAGGATTAGAGTTCGAGGGGGTAATGTGAAGTGGCGTGCATTTAGGCTGGATACTGGAAACTACTCTTGGGGTA
GTGAGGCCGTGACTAGAAAGACCCGTATTCTTGATGTGGTCTACAATGCATCTAACAATGAGCTTGTTCGTACTCAAACCTTAGTGAAGAGTGCCATAGTTCAAGTTGAT
GCAGCTCCATTTAAGCAGTGGTATCTTCAGCATTATGGAGTGGATATTGGCAGGAAGAAGAAGACCTCTGCATCTGCTAAGAAGGAAGAGGAAGGTGATGCTGGCACTGA
GGAGGTAAAAAAGAGTAACCATGTCCAGCGCAAAATAGAGAAACGTCAGCAGGACCGTAAGCTCGACCCACATATTGAAGAACAATTCAGCAGTGGTCGTTTGATGGCTT
GTATCTCATCAAGGCCCGGTCAATGTGGCCGAGCAGATGGATATATTTTGGAGGGCAAAGAGCTCGAATTCTATATGAAGAAGCTCCAAAGAAAGAAGGGAAAAGGAGCT
GGTGCTGCTTAAATTTTGTTATGGTTTTGGCCAGTATTTCCTGTTCACTCTTTTTCTTATGAAGACAACGAGCTGTTGCAGCTATTTTGGAACTTTGATTTTGCTGGTAA
TAGTTTAATTATAGTACTTTTGACCCTTTTCATGGTAACAACAGTTTGCTTATTAGCTTGAGTTTAAGTTCAAATTTTTCTTAGTCAATTTATGTAAGCGGGTTGGTTTG
GTGTTTGATCTAGAATTTACAGAAGTACAAATGGATTAGAGAGTTATTTAAACTCACATTGCTTCTTTTAAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGISRDSMHKRRETGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKSAIVQVDAAPF
KQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKEEEGDAGTEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKELEFYMKKLQRKKGKGAGAA